MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Leptospira interrogans serovar Lai str. 56601 chromosome I

Total Repeats: 24096

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
14001	NC_004342	CTT	2	6	2710824	2710829	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
14002	NC_004342	TGGG	2	8	2711200	2711207	0 %	25 %	75 %	0 %	Non-Coding
14003	NC_004342	GGA	2	6	2711208	2711213	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
14004	NC_004342	TGT	2	6	2711499	2711504	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
14005	NC_004342	TA	3	6	2711531	2711536	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
14006	NC_004342	ATT	2	6	2711553	2711558	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
14007	NC_004342	TGT	2	6	2711560	2711565	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
14008	NC_004342	A	6	6	2711619	2711624	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
14009	NC_004342	AAAAT	2	10	2712276	2712285	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
14010	NC_004342	T	6	6	2712361	2712366	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
14011	NC_004342	ACA	2	6	2712429	2712434	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
14012	NC_004342	AAC	2	6	2712856	2712861	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
14013	NC_004342	A	6	6	2712876	2712881	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
14014	NC_004342	TATT	2	8	2712940	2712947	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
14015	NC_004342	ATG	2	6	2713008	2713013	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
14016	NC_004342	A	7	7	2713026	2713032	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
14017	NC_004342	GTA	3	9	2713089	2713097	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
14018	NC_004342	GAA	2	6	2713110	2713115	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
14019	NC_004342	AAAT	2	8	2713183	2713190	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
14020	NC_004342	T	6	6	2713286	2713291	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
14021	NC_004342	T	8	8	2713331	2713338	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
14022	NC_004342	A	6	6	2713340	2713345	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
14023	NC_004342	TCG	2	6	2713360	2713365	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
14024	NC_004342	AGT	2	6	2713390	2713395	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
14025	NC_004342	T	7	7	2713489	2713495	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
14026	NC_004342	AAC	2	6	2713516	2713521	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
14027	NC_004342	GAA	2	6	2713530	2713535	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
14028	NC_004342	ATT	3	9	2713550	2713558	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
14029	NC_004342	A	6	6	2713606	2713611	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
14030	NC_004342	T	6	6	2713660	2713665	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
14031	NC_004342	A	7	7	2713666	2713672	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
14032	NC_004342	GAA	2	6	2713678	2713683	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
14033	NC_004342	A	6	6	2713744	2713749	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
14034	NC_004342	T	7	7	2713774	2713780	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
14035	NC_004342	TA	3	6	2713792	2713797	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
14036	NC_004342	ATC	2	6	2713881	2713886	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
14037	NC_004342	A	7	7	2713898	2713904	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
14038	NC_004342	GAT	2	6	2713925	2713930	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
14039	NC_004342	TA	3	6	2716041	2716046	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
14040	NC_004342	GATAA	2	10	2716146	2716155	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
14041	NC_004342	A	7	7	2716171	2716177	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
14042	NC_004342	AGT	2	6	2716185	2716190	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
14043	NC_004342	A	6	6	2716205	2716210	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
14044	NC_004342	A	6	6	2716226	2716231	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
14045	NC_004342	A	8	8	2716250	2716257	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
14046	NC_004342	AAT	2	6	2716262	2716267	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
14047	NC_004342	T	6	6	2719052	2719057	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
14048	NC_004342	GAA	2	6	2719160	2719165	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
14049	NC_004342	GAA	2	6	2719252	2719257	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
14050	NC_004342	T	6	6	2720399	2720404	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
14051	NC_004342	CAA	2	6	2720415	2720420	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
14052	NC_004342	TTC	2	6	2720435	2720440	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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14054	NC_004342	T	7	7	2720487	2720493	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
14055	NC_004342	CATA	2	8	2720503	2720510	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
14056	NC_004342	CTC	2	6	2721406	2721411	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
14057	NC_004342	ACG	2	6	2721419	2721424	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
14058	NC_004342	TTC	2	6	2721500	2721505	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
14059	NC_004342	GAA	2	6	2721511	2721516	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
14060	NC_004342	CACG	2	8	2721556	2721563	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
14061	NC_004342	TTC	2	6	2723030	2723035	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
14062	NC_004342	A	7	7	2724322	2724328	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
14063	NC_004342	AGAAT	2	10	2724367	2724376	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
14064	NC_004342	T	7	7	2724376	2724382	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
14065	NC_004342	CAA	2	6	2724472	2724477	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
14066	NC_004342	T	6	6	2724505	2724510	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
14067	NC_004342	CATT	2	8	2724530	2724537	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
14068	NC_004342	AGTT	2	8	2724565	2724572	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
14069	NC_004342	ACTC	2	8	2724586	2724593	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
14070	NC_004342	ATT	2	6	2724605	2724610	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
14071	NC_004342	T	7	7	2724609	2724615	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
14072	NC_004342	ACT	2	6	2724642	2724647	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
14073	NC_004342	TC	3	6	2724717	2724722	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
14074	NC_004342	CAG	2	6	2724757	2724762	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
14075	NC_004342	CAT	2	6	2724772	2724777	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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14077	NC_004342	CCCAC	2	10	2724851	2724860	20 %	0 %	0 %	80 %	Non-Coding
14078	NC_004342	TATC	2	8	2724945	2724952	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
14079	NC_004342	T	6	6	2725016	2725021	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
14080	NC_004342	GGTT	2	8	2725057	2725064	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
14081	NC_004342	ATT	2	6	2725107	2725112	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
14082	NC_004342	ATTG	2	8	2725134	2725141	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
14083	NC_004342	GTAA	2	8	2725289	2725296	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
14084	NC_004342	A	6	6	2725318	2725323	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
14085	NC_004342	A	6	6	2725329	2725334	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
14086	NC_004342	T	7	7	2725394	2725400	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
14087	NC_004342	CTAAAA	2	12	2725406	2725417	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
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14089	NC_004342	ATT	2	6	2725527	2725532	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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14091	NC_004342	T	6	6	2725595	2725600	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
14092	NC_004342	A	7	7	2725603	2725609	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
14093	NC_004342	ACAA	2	8	2725742	2725749	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
14094	NC_004342	TAA	2	6	2725919	2725924	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
14095	NC_004342	T	6	6	2725932	2725937	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
14096	NC_004342	TCA	2	6	2725960	2725965	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
14097	NC_004342	TAT	2	6	2725990	2725995	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
14098	NC_004342	ATTTT	2	10	2726018	2726027	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
14099	NC_004342	TTAT	2	8	2726028	2726035	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
14100	NC_004342	A	6	6	2726078	2726083	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
14101	NC_004342	T	6	6	2726094	2726099	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
14102	NC_004342	A	6	6	2726103	2726108	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
14103	NC_004342	AGG	2	6	2726115	2726120	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
14104	NC_004342	T	7	7	2729027	2729033	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
14105	NC_004342	ATT	2	6	2729036	2729041	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
14106	NC_004342	AAT	2	6	2729126	2729131	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
14107	NC_004342	A	6	6	2729144	2729149	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
14108	NC_004342	ATT	2	6	2729159	2729164	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
14109	NC_004342	T	7	7	2729163	2729169	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
14110	NC_004342	T	7	7	2729185	2729191	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
14111	NC_004342	ATT	2	6	2729192	2729197	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
14112	NC_004342	A	6	6	2729208	2729213	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
14113	NC_004342	A	6	6	2729232	2729237	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
14114	NC_004342	TA	3	6	2729288	2729293	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
14115	NC_004342	TATTT	2	10	2729521	2729530	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
14116	NC_004342	A	6	6	2729563	2729568	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
14117	NC_004342	ATT	2	6	2729589	2729594	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
14118	NC_004342	TTTTAC	2	12	2729773	2729784	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
14119	NC_004342	A	6	6	2729785	2729790	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
14120	NC_004342	AACA	2	8	2729799	2729806	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
14121	NC_004342	AAG	2	6	2729832	2729837	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
14122	NC_004342	ATA	2	6	2729855	2729860	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
14123	NC_004342	GAT	2	6	2729873	2729878	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
14124	NC_004342	CTACG	2	10	2729906	2729915	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
14125	NC_004342	GAT	2	6	2729950	2729955	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
14126	NC_004342	GCTAC	2	10	2729982	2729991	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
14127	NC_004342	T	6	6	2730031	2730036	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
14128	NC_004342	GCTAC	2	10	2730059	2730068	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
14129	NC_004342	GAT	2	6	2730104	2730109	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
14130	NC_004342	CTACG	2	10	2730137	2730146	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
14131	NC_004342	CTTT	2	8	2730591	2730598	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
14132	NC_004342	TA	3	6	2730607	2730612	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
14133	NC_004342	AAATA	2	10	2730668	2730677	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
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14254	NC_004342	GAAA	2	8	2746609	2746616	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
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14258	NC_004342	T	6	6	2747013	2747018	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
14259	NC_004342	T	7	7	2747026	2747032	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
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14261	NC_004342	GTTTT	2	10	2747048	2747057	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
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