MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Listeria monocytogenes serotype 4b str. F2365 chromosome

Total Repeats: 8804

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_002973	AC	3	6	36	41	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
2	NC_002973	T	6	6	221	226	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3	NC_002973	TACAT	2	10	291	300	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
4	NC_002973	A	6	6	301	306	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5	NC_002973	G	7	7	307	313	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
6	NC_002973	CTATTA	2	12	1787	1798	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
7	NC_002973	T	6	6	1805	1810	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
8	NC_002973	ATTA	3	12	1811	1822	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
9	NC_002973	A	7	7	1849	1855	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
10	NC_002973	T	7	7	3055	3061	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
11	NC_002973	A	7	7	4475	4481	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
12	NC_002973	T	8	8	4504	4511	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
13	NC_002973	AATA	2	8	4512	4519	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
14	NC_002973	C	6	6	4524	4529	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
15	NC_002973	A	7	7	4542	4548	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
16	NC_002973	AT	3	6	4561	4566	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
17	NC_002973	TAT	2	6	4581	4586	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
18	NC_002973	A	7	7	4620	4626	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
19	NC_002973	TGA	2	6	5999	6004	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
20	NC_002973	AAAG	2	8	6006	6013	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
21	NC_002973	AAT	2	6	6022	6027	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
22	NC_002973	TAA	2	6	7986	7991	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
23	NC_002973	TTA	2	6	7997	8002	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
24	NC_002973	T	6	6	10643	10648	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
25	NC_002973	AT	3	6	15879	15884	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
26	NC_002973	AAC	2	6	15896	15901	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
27	NC_002973	GTT	2	6	15914	15919	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
28	NC_002973	CTTTT	2	10	16170	16179	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
29	NC_002973	ATA	2	6	16210	16215	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
30	NC_002973	AATTTA	2	12	16219	16230	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
31	NC_002973	T	6	6	16247	16252	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
32	NC_002973	ACC	3	9	16271	16279	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
33	NC_002973	CAAA	2	8	16289	16296	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
34	NC_002973	T	7	7	16325	16331	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
35	NC_002973	C	6	6	16384	16389	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
36	NC_002973	CAA	2	6	16408	16413	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
37	NC_002973	CCA	2	6	16445	16450	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
38	NC_002973	TA	3	6	16466	16471	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
39	NC_002973	T	6	6	16475	16480	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
40	NC_002973	AAG	2	6	16490	16495	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
41	NC_002973	TAT	2	6	16529	16534	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
42	NC_002973	TCA	2	6	16566	16571	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
43	NC_002973	ATCT	2	8	16595	16602	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
44	NC_002973	CTTCAA	2	12	16606	16617	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
45	NC_002973	AATT	2	8	16706	16713	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
46	NC_002973	AAT	2	6	16721	16726	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
47	NC_002973	TTC	2	6	16730	16735	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
48	NC_002973	T	6	6	16759	16764	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
49	NC_002973	CCAA	2	8	16790	16797	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
50	NC_002973	ATC	2	6	16841	16846	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
51	NC_002973	TCA	2	6	16857	16862	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
52	NC_002973	TTG	2	6	16874	16879	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
53	NC_002973	AAT	2	6	16882	16887	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
54	NC_002973	ATT	2	6	16895	16900	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
55	NC_002973	TAT	2	6	16915	16920	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
56	NC_002973	A	6	6	16939	16944	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
57	NC_002973	AACC	2	8	17013	17020	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
58	NC_002973	TAT	2	6	17029	17034	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
59	NC_002973	ATA	2	6	17048	17053	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
60	NC_002973	TTG	2	6	17062	17067	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
61	NC_002973	ATT	2	6	17082	17087	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
62	NC_002973	AATT	2	8	17123	17130	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
63	NC_002973	ATA	2	6	17297	17302	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
64	NC_002973	CCAA	2	8	17507	17514	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
65	NC_002973	CT	3	6	17567	17572	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
66	NC_002973	T	7	7	17588	17594	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
67	NC_002973	AAG	2	6	17599	17604	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
68	NC_002973	AAT	2	6	17641	17646	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
69	NC_002973	ATTGT	2	10	17721	17730	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
70	NC_002973	GTT	2	6	17736	17741	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
71	NC_002973	CAT	2	6	17798	17803	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
72	NC_002973	ATC	2	6	17820	17825	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
73	NC_002973	TAT	2	6	17879	17884	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
74	NC_002973	ATT	2	6	17927	17932	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
75	NC_002973	T	6	6	17931	17936	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
76	NC_002973	A	6	6	17943	17948	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
77	NC_002973	T	6	6	17993	17998	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
78	NC_002973	AT	3	6	18057	18062	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
79	NC_002973	A	6	6	18146	18151	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
80	NC_002973	T	7	7	18161	18167	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
81	NC_002973	T	6	6	18191	18196	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
82	NC_002973	CTT	2	6	18221	18226	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
83	NC_002973	G	6	6	19411	19416	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
84	NC_002973	CTC	2	6	23513	23518	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
85	NC_002973	T	8	8	23581	23588	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
86	NC_002973	A	6	6	23643	23648	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
87	NC_002973	ATT	2	6	23655	23660	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
88	NC_002973	GAG	2	6	23717	23722	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
89	NC_002973	TCA	2	6	25187	25192	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
90	NC_002973	AAATG	2	10	26105	26114	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
91	NC_002973	TTA	2	6	26154	26159	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
92	NC_002973	A	6	6	26202	26207	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
93	NC_002973	CG	3	6	26246	26251	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
94	NC_002973	AAG	2	6	27926	27931	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
95	NC_002973	GGA	2	6	29561	29566	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
96	NC_002973	ATT	2	6	30304	30309	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
97	NC_002973	T	6	6	30317	30322	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
98	NC_002973	GGA	2	6	30323	30328	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
99	NC_002973	AAAT	2	8	30985	30992	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
100	NC_002973	A	8	8	31000	31007	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
101	NC_002973	AT	3	6	31032	31037	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
102	NC_002973	TCA	2	6	31043	31048	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
103	NC_002973	A	6	6	31149	31154	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
104	NC_002973	AGGA	2	8	31163	31170	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
105	NC_002973	GTC	2	6	31172	31177	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
106	NC_002973	TAA	2	6	33093	33098	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
107	NC_002973	TCT	2	6	34865	34870	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
108	NC_002973	ATG	2	6	34873	34878	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
109	NC_002973	AAT	3	9	34885	34893	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
110	NC_002973	TTTCT	2	10	34906	34915	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
111	NC_002973	ATC	2	6	34951	34956	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
112	NC_002973	TCA	2	6	34973	34978	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
113	NC_002973	T	6	6	35050	35055	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
114	NC_002973	T	6	6	35059	35064	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
115	NC_002973	ATA	2	6	35142	35147	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
116	NC_002973	ATA	2	6	35198	35203	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
117	NC_002973	ATG	2	6	35233	35238	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
118	NC_002973	TAT	2	6	35247	35252	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
119	NC_002973	TTG	2	6	35271	35276	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
120	NC_002973	T	6	6	35327	35332	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
121	NC_002973	AAT	2	6	35367	35372	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
122	NC_002973	T	8	8	35403	35410	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
123	NC_002973	TCC	2	6	35438	35443	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
124	NC_002973	AAAGG	2	10	37664	37673	60 %	0 %	40 %	0 %	Non-Coding
125	NC_002973	CTATT	2	10	38160	38169	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
126	NC_002973	T	7	7	38222	38228	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
127	NC_002973	T	6	6	38323	38328	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
128	NC_002973	A	6	6	38361	38366	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
129	NC_002973	A	7	7	38721	38727	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
130	NC_002973	T	7	7	38746	38752	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
131	NC_002973	CCTT	2	8	39569	39576	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
132	NC_002973	ATA	2	6	40730	40735	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
133	NC_002973	CAA	2	6	40789	40794	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
134	NC_002973	TCT	2	6	46704	46709	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
135	NC_002973	A	7	7	46774	46780	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
136	NC_002973	ATG	2	6	46814	46819	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
137	NC_002973	AAAT	2	8	46867	46874	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
138	NC_002973	AGG	2	6	47929	47934	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
139	NC_002973	AGA	2	6	47935	47940	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
140	NC_002973	C	6	6	47960	47965	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
141	NC_002973	AGG	2	6	51495	51500	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
142	NC_002973	ATAA	2	8	53429	53436	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
143	NC_002973	GACTT	2	10	53458	53467	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
144	NC_002973	A	7	7	53492	53498	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
145	NC_002973	AGTG	2	8	53507	53514	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
146	NC_002973	T	7	7	54188	54194	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
147	NC_002973	TC	3	6	54208	54213	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
148	NC_002973	TTAG	2	8	54240	54247	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
149	NC_002973	GTTA	2	8	55605	55612	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
150	NC_002973	ATA	2	6	55623	55628	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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