MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Lactococcus lactis subsp. lactis Il1403 chromosome

Total Repeats: 9129

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1001	NC_002662	TAA	2	6	244002	244007	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1002	NC_002662	AAAG	2	8	245605	245612	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
1003	NC_002662	AGG	2	6	245686	245691	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1004	NC_002662	GA	4	8	246692	246699	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
1005	NC_002662	A	6	6	248381	248386	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1006	NC_002662	ATCC	2	8	248395	248402	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
1007	NC_002662	TAC	2	6	249859	249864	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1008	NC_002662	TA	3	6	249878	249883	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1009	NC_002662	TTA	2	6	249887	249892	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1010	NC_002662	TTC	2	6	249911	249916	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1011	NC_002662	AATG	2	8	249927	249934	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
1012	NC_002662	CAA	2	6	250653	250658	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1013	NC_002662	TCAT	2	8	250675	250682	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
1014	NC_002662	AAT	2	6	250695	250700	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1015	NC_002662	ACT	2	6	252608	252613	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1016	NC_002662	TGG	2	6	252626	252631	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1017	NC_002662	AAAAGA	2	12	252646	252657	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
1018	NC_002662	T	6	6	252664	252669	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1019	NC_002662	T	6	6	253872	253877	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1020	NC_002662	ATTA	2	8	253909	253916	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1021	NC_002662	TAA	2	6	253972	253977	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1022	NC_002662	T	6	6	253986	253991	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1023	NC_002662	A	6	6	256000	256005	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1024	NC_002662	A	7	7	256012	256018	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1025	NC_002662	CCA	2	6	256121	256126	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1026	NC_002662	ATG	2	6	257486	257491	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1027	NC_002662	TAAATT	2	12	257527	257538	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1028	NC_002662	AGCG	2	8	257540	257547	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
1029	NC_002662	A	7	7	258488	258494	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1030	NC_002662	TCC	2	6	258514	258519	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1031	NC_002662	T	7	7	258527	258533	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1032	NC_002662	TAAT	2	8	258550	258557	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1033	NC_002662	AAAT	2	8	258563	258570	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
1034	NC_002662	ATT	2	6	259038	259043	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1035	NC_002662	TGAA	2	8	259107	259114	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
1036	NC_002662	ACT	2	6	259136	259141	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1037	NC_002662	AGT	2	6	259145	259150	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1038	NC_002662	A	7	7	262887	262893	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1039	NC_002662	TGAT	2	8	262906	262913	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
1040	NC_002662	T	7	7	262913	262919	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1041	NC_002662	TTA	2	6	262922	262927	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1042	NC_002662	A	7	7	263640	263646	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1043	NC_002662	T	7	7	264785	264791	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1044	NC_002662	TAT	2	6	264822	264827	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1045	NC_002662	AGTA	2	8	264864	264871	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
1046	NC_002662	TTA	2	6	265537	265542	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1047	NC_002662	TCC	2	6	265548	265553	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1048	NC_002662	ATTCTA	2	12	265564	265575	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
1049	NC_002662	T	6	6	265584	265589	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1050	NC_002662	T	6	6	265600	265605	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1051	NC_002662	AAG	2	6	265650	265655	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1052	NC_002662	A	6	6	265667	265672	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1053	NC_002662	CAT	2	6	265681	265686	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1054	NC_002662	GAG	2	6	265700	265705	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1055	NC_002662	TGA	2	6	266194	266199	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1056	NC_002662	GTT	2	6	266203	266208	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1057	NC_002662	A	6	6	266232	266237	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1058	NC_002662	AAT	2	6	267088	267093	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1059	NC_002662	CAG	2	6	267138	267143	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1060	NC_002662	A	6	6	267163	267168	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1061	NC_002662	TAA	2	6	267215	267220	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1062	NC_002662	TTCCT	2	10	270076	270085	0 %	60 %	0 %	40 %	Non-Coding
1063	NC_002662	AATAA	2	10	270096	270105	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
1064	NC_002662	TAC	2	6	270107	270112	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1065	NC_002662	GAA	2	6	270134	270139	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1066	NC_002662	T	6	6	270172	270177	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1067	NC_002662	TTTGC	2	10	270274	270283	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
1068	NC_002662	TG	4	8	270325	270332	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
1069	NC_002662	TA	3	6	270349	270354	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1070	NC_002662	GAT	2	6	270385	270390	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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1072	NC_002662	TCT	2	6	273324	273329	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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1074	NC_002662	TAG	2	6	274026	274031	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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1080	NC_002662	T	7	7	275481	275487	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1081	NC_002662	AC	3	6	275555	275560	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
1082	NC_002662	TGTTT	2	10	275653	275662	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
1083	NC_002662	TAG	2	6	275685	275690	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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1085	NC_002662	TAA	2	6	276692	276697	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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1095	NC_002662	A	6	6	280141	280146	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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1102	NC_002662	AAG	2	6	282581	282586	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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1104	NC_002662	GA	3	6	282707	282712	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
1105	NC_002662	T	7	7	282813	282819	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1106	NC_002662	GA	3	6	282847	282852	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
1107	NC_002662	ATA	2	6	282882	282887	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1108	NC_002662	GAA	2	6	282910	282915	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1109	NC_002662	TTTAC	2	10	283025	283034	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
1110	NC_002662	AAG	2	6	283065	283070	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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1115	NC_002662	A	6	6	283422	283427	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1116	NC_002662	GAA	2	6	283428	283433	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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1121	NC_002662	AAATA	2	10	283731	283740	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
1122	NC_002662	GGA	2	6	283744	283749	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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1124	NC_002662	T	6	6	284423	284428	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1125	NC_002662	TGA	2	6	284463	284468	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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1127	NC_002662	T	7	7	286647	286653	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1128	NC_002662	AGG	2	6	286721	286726	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1129	NC_002662	T	6	6	287187	287192	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1130	NC_002662	TTC	2	6	287221	287226	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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1132	NC_002662	A	7	7	287299	287305	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1133	NC_002662	ATAAA	2	10	287319	287328	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
1134	NC_002662	GAT	2	6	287337	287342	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1135	NC_002662	A	6	6	287359	287364	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1136	NC_002662	ATA	2	6	287437	287442	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1137	NC_002662	T	7	7	288512	288518	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1138	NC_002662	TAT	2	6	288758	288763	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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1140	NC_002662	TAA	2	6	289219	289224	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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