MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Lactococcus lactis subsp. lactis Il1403 chromosome

Total Repeats: 9129

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
8001	NC_002662	ATTT	2	8	2131626	2131633	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
8002	NC_002662	A	7	7	2131639	2131645	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
8003	NC_002662	T	7	7	2131665	2131671	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
8004	NC_002662	A	7	7	2132586	2132592	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
8005	NC_002662	TAC	2	6	2132717	2132722	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
8006	NC_002662	CAA	2	6	2132755	2132760	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
8007	NC_002662	TCT	2	6	2132774	2132779	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
8008	NC_002662	T	8	8	2133627	2133634	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
8009	NC_002662	TAATA	2	10	2134539	2134548	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
8010	NC_002662	TAT	2	6	2134557	2134562	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
8011	NC_002662	GC	3	6	2134572	2134577	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
8012	NC_002662	ATT	2	6	2134619	2134624	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
8013	NC_002662	GGA	2	6	2134669	2134674	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
8014	NC_002662	A	6	6	2137690	2137695	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
8015	NC_002662	T	6	6	2137708	2137713	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
8016	NC_002662	TGG	2	6	2137715	2137720	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
8017	NC_002662	T	7	7	2137721	2137727	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
8018	NC_002662	TAAAA	2	10	2137790	2137799	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
8019	NC_002662	GAG	2	6	2137820	2137825	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
8020	NC_002662	T	8	8	2138700	2138707	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
8021	NC_002662	T	6	6	2138719	2138724	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
8022	NC_002662	ACTC	2	8	2138732	2138739	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
8023	NC_002662	AAAG	2	8	2138743	2138750	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
8024	NC_002662	TC	3	6	2140092	2140097	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
8025	NC_002662	TAA	2	6	2140159	2140164	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
8026	NC_002662	TAT	2	6	2140188	2140193	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
8027	NC_002662	CTT	2	6	2141678	2141683	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
8028	NC_002662	ACT	2	6	2141725	2141730	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
8029	NC_002662	TC	3	6	2142354	2142359	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
8030	NC_002662	CAAAAT	2	12	2142382	2142393	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
8031	NC_002662	GTA	2	6	2142418	2142423	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
8032	NC_002662	TAC	2	6	2143383	2143388	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
8033	NC_002662	T	6	6	2143427	2143432	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
8034	NC_002662	TTTAT	2	10	2143462	2143471	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
8035	NC_002662	TATT	2	8	2143520	2143527	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
8036	NC_002662	GAT	2	6	2143543	2143548	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
8037	NC_002662	AATT	2	8	2143581	2143588	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
8038	NC_002662	T	7	7	2144120	2144126	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
8039	NC_002662	ACTA	2	8	2145207	2145214	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
8040	NC_002662	TA	3	6	2145219	2145224	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
8041	NC_002662	TAAAA	2	10	2145267	2145276	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
8042	NC_002662	A	6	6	2145273	2145278	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
8043	NC_002662	TAA	2	6	2145296	2145301	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
8044	NC_002662	TCT	2	6	2145991	2145996	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
8045	NC_002662	TCC	2	6	2147089	2147094	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
8046	NC_002662	TATT	2	8	2147202	2147209	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
8047	NC_002662	TTA	2	6	2147229	2147234	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
8048	NC_002662	T	6	6	2147247	2147252	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
8049	NC_002662	T	6	6	2148276	2148281	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
8050	NC_002662	T	6	6	2148327	2148332	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
8051	NC_002662	TTA	2	6	2150513	2150518	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
8052	NC_002662	A	6	6	2150621	2150626	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
8053	NC_002662	TAGT	2	8	2150627	2150634	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
8054	NC_002662	CAT	2	6	2150636	2150641	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
8055	NC_002662	TCC	2	6	2150882	2150887	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
8056	NC_002662	ATT	3	9	2150965	2150973	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
8057	NC_002662	TCA	2	6	2150991	2150996	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
8058	NC_002662	TCT	2	6	2151007	2151012	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
8059	NC_002662	A	7	7	2151072	2151078	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
8060	NC_002662	TAAA	2	8	2151365	2151372	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
8061	NC_002662	TTAT	2	8	2151378	2151385	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
8062	NC_002662	AT	3	6	2151409	2151414	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
8063	NC_002662	A	7	7	2151421	2151427	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
8064	NC_002662	TGC	2	6	2151474	2151479	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
8065	NC_002662	ATAA	2	8	2151507	2151514	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
8066	NC_002662	TAATC	2	10	2151543	2151552	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
8067	NC_002662	AG	3	6	2151588	2151593	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
8068	NC_002662	CAT	2	6	2151637	2151642	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
8069	NC_002662	TAT	2	6	2151662	2151667	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
8070	NC_002662	TCC	2	6	2152074	2152079	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
8071	NC_002662	CAT	2	6	2154004	2154009	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
8072	NC_002662	AATG	2	8	2154016	2154023	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
8073	NC_002662	CCT	2	6	2154258	2154263	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
8074	NC_002662	AT	3	6	2154281	2154286	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
8075	NC_002662	TA	4	8	2154289	2154296	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
8076	NC_002662	CAA	2	6	2154335	2154340	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
8077	NC_002662	TCTT	2	8	2154348	2154355	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
8078	NC_002662	TTA	2	6	2154398	2154403	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
8079	NC_002662	AG	3	6	2154466	2154471	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
8080	NC_002662	A	7	7	2154513	2154519	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
8081	NC_002662	CTGA	2	8	2154523	2154530	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
8082	NC_002662	ATG	2	6	2155439	2155444	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
8083	NC_002662	TAT	2	6	2155800	2155805	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
8084	NC_002662	ACAG	2	8	2157257	2157264	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
8085	NC_002662	TTTTTA	2	12	2157268	2157279	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
8086	NC_002662	A	6	6	2158031	2158036	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
8087	NC_002662	T	6	6	2159908	2159913	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
8088	NC_002662	AT	3	6	2159987	2159992	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
8089	NC_002662	TAT	2	6	2160016	2160021	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
8090	NC_002662	TCG	2	6	2160055	2160060	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
8091	NC_002662	AT	3	6	2160068	2160073	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
8092	NC_002662	TAT	2	6	2160076	2160081	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
8093	NC_002662	A	6	6	2160085	2160090	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
8094	NC_002662	T	6	6	2160103	2160108	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
8095	NC_002662	A	7	7	2160133	2160139	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
8096	NC_002662	T	8	8	2160166	2160173	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
8097	NC_002662	TA	3	6	2161256	2161261	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
8098	NC_002662	TGTC	2	8	2161342	2161349	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
8099	NC_002662	ACC	2	6	2161395	2161400	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
8100	NC_002662	T	6	6	2161415	2161420	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
8101	NC_002662	TAAA	2	8	2161423	2161430	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
8102	NC_002662	ATT	2	6	2161444	2161449	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
8103	NC_002662	TTTTA	2	10	2162075	2162084	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
8104	NC_002662	ATC	2	6	2162151	2162156	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
8105	NC_002662	TC	3	6	2162199	2162204	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
8106	NC_002662	GT	3	6	2162756	2162761	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
8107	NC_002662	T	6	6	2162767	2162772	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
8108	NC_002662	TCC	2	6	2163416	2163421	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
8109	NC_002662	AAT	2	6	2163463	2163468	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
8110	NC_002662	TAA	2	6	2163480	2163485	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
8111	NC_002662	A	8	8	2163500	2163507	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
8112	NC_002662	ATT	2	6	2164309	2164314	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
8113	NC_002662	TAA	3	9	2164697	2164705	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
8114	NC_002662	A	6	6	2164726	2164731	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
8115	NC_002662	TCC	2	6	2165143	2165148	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
8116	NC_002662	CTC	2	6	2167085	2167090	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
8117	NC_002662	TCC	2	6	2168368	2168373	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
8118	NC_002662	TCCTT	2	10	2169312	2169321	0 %	60 %	0 %	40 %	Non-Coding
8119	NC_002662	CTC	2	6	2170279	2170284	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
8120	NC_002662	GT	3	6	2170353	2170358	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
8121	NC_002662	TCG	2	6	2170373	2170378	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
8122	NC_002662	TCTAT	2	10	2170405	2170414	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
8123	NC_002662	T	7	7	2170450	2170456	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
8124	NC_002662	TTCT	2	8	2170459	2170466	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
8125	NC_002662	TTTG	2	8	2170546	2170553	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
8126	NC_002662	TAT	2	6	2170568	2170573	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
8127	NC_002662	AGG	2	6	2170576	2170581	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
8128	NC_002662	T	7	7	2170984	2170990	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
8129	NC_002662	TCAC	2	8	2172201	2172208	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
8130	NC_002662	AAT	2	6	2172236	2172241	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
8131	NC_002662	T	6	6	2173792	2173797	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
8132	NC_002662	T	7	7	2173851	2173857	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
8133	NC_002662	TATT	2	8	2174444	2174451	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
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8135	NC_002662	GAT	2	6	2174535	2174540	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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8403	NC_002662	TTC	2	6	2242396	2242401	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
8404	NC_002662	ATTTG	2	10	2242445	2242454	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
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