MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Listeria monocytogenes EGD

Total Repeats: 58078

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
58001	NC_022568	TAAG	2	8	2903890	2903897	50 %	25 %	25 %	0 %	550899022
58002	NC_022568	ATA	2	6	2903927	2903932	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	550899022
58003	NC_022568	CTT	2	6	2903964	2903969	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	550899022
58004	NC_022568	GCT	2	6	2904046	2904051	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	550899022
58005	NC_022568	CCAT	2	8	2904068	2904075	25 %	25 %	0 %	50 %	550899022
58006	NC_022568	CCA	2	6	2904083	2904088	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	550899022
58007	NC_022568	ACTT	2	8	2904135	2904142	25 %	50 %	0 %	25 %	550899022
58008	NC_022568	ATC	2	6	2904146	2904151	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	550899022
58009	NC_022568	GAACC	2	10	2904186	2904195	40 %	0 %	20 %	40 %	550899022
58010	NC_022568	ATTT	2	8	2904263	2904270	25 %	75 %	0 %	0 %	550899023
58011	NC_022568	AAT	2	6	2904358	2904363	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	550899023
58012	NC_022568	TTTC	2	8	2904365	2904372	0 %	75 %	0 %	25 %	550899023
58013	NC_022568	GC	3	6	2904401	2904406	0 %	0 %	50 %	50 %	550899023
58014	NC_022568	TTTG	2	8	2904433	2904440	0 %	75 %	25 %	0 %	550899023
58015	NC_022568	AAT	2	6	2904493	2904498	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	550899023
58016	NC_022568	GTT	2	6	2904515	2904520	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	550899023
58017	NC_022568	TTA	2	6	2904521	2904526	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	550899023
58018	NC_022568	AATT	2	8	2904529	2904536	50 %	50 %	0 %	0 %	550899023
58019	NC_022568	CTT	2	6	2904633	2904638	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	550899023
58020	NC_022568	AATC	2	8	2904690	2904697	50 %	25 %	0 %	25 %	550899023
58021	NC_022568	TCT	2	6	2904713	2904718	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	550899023
58022	NC_022568	T	6	6	2904769	2904774	0 %	100 %	0 %	0 %	550899023
58023	NC_022568	GTT	2	6	2904812	2904817	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	550899023
58024	NC_022568	CTT	2	6	2904846	2904851	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	550899023
58025	NC_022568	TC	3	6	2904878	2904883	0 %	50 %	0 %	50 %	550899023
58026	NC_022568	CTTT	2	8	2904885	2904892	0 %	75 %	0 %	25 %	550899023
58027	NC_022568	CCT	2	6	2904898	2904903	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	550899024
58028	NC_022568	T	6	6	2904903	2904908	0 %	100 %	0 %	0 %	550899024
58029	NC_022568	GCT	2	6	2904925	2904930	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	550899024
58030	NC_022568	T	6	6	2904930	2904935	0 %	100 %	0 %	0 %	550899024
58031	NC_022568	AGC	3	9	2904960	2904968	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	550899024
58032	NC_022568	CCT	2	6	2904974	2904979	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	550899024
58033	NC_022568	GTTT	2	8	2904986	2904993	0 %	75 %	25 %	0 %	550899024
58034	NC_022568	ATT	2	6	2905002	2905007	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	550899024
58035	NC_022568	AGAGCA	2	12	2905057	2905068	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	550899024
58036	NC_022568	GTAAT	2	10	2905073	2905082	40 %	40 %	20 %	0 %	550899024
58037	NC_022568	ATG	2	6	2905108	2905113	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	550899024
58038	NC_022568	ATTT	2	8	2905133	2905140	25 %	75 %	0 %	0 %	550899024
58039	NC_022568	CAT	2	6	2905155	2905160	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	550899024
58040	NC_022568	TGA	2	6	2905170	2905175	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	550899024
58041	NC_022568	TGT	2	6	2905182	2905187	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	550899024
58042	NC_022568	CAA	2	6	2905196	2905201	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	550899024
58043	NC_022568	GAAT	2	8	2905248	2905255	50 %	25 %	25 %	0 %	550899024
58044	NC_022568	CTG	2	6	2905268	2905273	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	550899024
58045	NC_022568	CTA	2	6	2905276	2905281	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	550899024
58046	NC_022568	TAG	2	6	2905299	2905304	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	550899024
58047	NC_022568	TAA	2	6	2905320	2905325	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	550899024
58048	NC_022568	CAT	2	6	2905338	2905343	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	550899024
58049	NC_022568	TTG	2	6	2905383	2905388	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	550899024
58050	NC_022568	TGTTT	2	10	2905396	2905405	0 %	80 %	20 %	0 %	550899024
58051	NC_022568	AAC	2	6	2905530	2905535	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	550899024
58052	NC_022568	TCT	2	6	2905736	2905741	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	550899024
58053	NC_022568	CACT	2	8	2905783	2905790	25 %	25 %	0 %	50 %	550899025
58054	NC_022568	CTTCA	2	10	2905852	2905861	20 %	40 %	0 %	40 %	550899025
58055	NC_022568	GCC	2	6	2905877	2905882	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	550899025
58056	NC_022568	GAT	2	6	2905894	2905899	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	550899025
58057	NC_022568	AT	3	6	2905901	2905906	50 %	50 %	0 %	0 %	550899025
58058	NC_022568	GATT	2	8	2905917	2905924	25 %	50 %	25 %	0 %	550899025
58059	NC_022568	T	7	7	2905995	2906001	0 %	100 %	0 %	0 %	550899025
58060	NC_022568	CTT	2	6	2906037	2906042	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	550899025
58061	NC_022568	ACA	2	6	2906057	2906062	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	550899025
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58063	NC_022568	T	9	9	2906134	2906142	0 %	100 %	0 %	0 %	550899025
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58067	NC_022568	ATTA	2	8	2906368	2906375	50 %	50 %	0 %	0 %	550899026
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58070	NC_022568	TC	3	6	2906562	2906567	0 %	50 %	0 %	50 %	550899027
58071	NC_022568	CAG	2	6	2906644	2906649	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	550899027
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©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.