MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Lactobacillus paracasei subsp. paracasei 8700:2

Total Repeats: 47092

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
47001	NC_022112	GAT	2	6	2931955	2931960	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	532358212
47002	NC_022112	ATG	2	6	2932064	2932069	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	532358212
47003	NC_022112	CAA	2	6	2932241	2932246	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	532358212
47004	NC_022112	ATC	2	6	2932310	2932315	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	532358212
47005	NC_022112	ATC	2	6	2932317	2932322	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	532358212
47006	NC_022112	CGC	2	6	2932382	2932387	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	532358212
47007	NC_022112	GCCA	2	8	2932394	2932401	25 %	0 %	25 %	50 %	532358212
47008	NC_022112	GCT	2	6	2932416	2932421	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	532358212
47009	NC_022112	GCA	2	6	2932582	2932587	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	532358212
47010	NC_022112	TCT	2	6	2932602	2932607	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532358212
47011	NC_022112	ACGA	2	8	2932700	2932707	50 %	0 %	25 %	25 %	532358212
47012	NC_022112	AAT	2	6	2932793	2932798	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	532358212
47013	NC_022112	CGT	2	6	2932868	2932873	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	532358212
47014	NC_022112	CGG	2	6	2932952	2932957	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	532358212
47015	NC_022112	CGC	2	6	2932974	2932979	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	532358212
47016	NC_022112	TTA	2	6	2933034	2933039	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	532358212
47017	NC_022112	GAT	2	6	2933066	2933071	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	532358212
47018	NC_022112	ACA	2	6	2933106	2933111	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	532358212
47019	NC_022112	GCC	2	6	2933139	2933144	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	532358212
47020	NC_022112	CGA	2	6	2933170	2933175	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	532358212
47021	NC_022112	TGC	2	6	2933239	2933244	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	532358212
47022	NC_022112	AT	3	6	2933325	2933330	50 %	50 %	0 %	0 %	532358212
47023	NC_022112	CAC	2	6	2933356	2933361	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	532358212
47024	NC_022112	GCC	2	6	2933402	2933407	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	532358212
47025	NC_022112	CG	3	6	2933481	2933486	0 %	0 %	50 %	50 %	532358212
47026	NC_022112	CAA	2	6	2933524	2933529	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	532358212
47027	NC_022112	CAT	2	6	2933536	2933541	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	532358212
47028	NC_022112	T	6	6	2933558	2933563	0 %	100 %	0 %	0 %	532358212
47029	NC_022112	CGC	2	6	2933704	2933709	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	532358213
47030	NC_022112	TTG	2	6	2933780	2933785	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	532358213
47031	NC_022112	TGT	2	6	2933830	2933835	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	532358213
47032	NC_022112	GCC	2	6	2933851	2933856	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	532358213
47033	NC_022112	GAA	2	6	2933857	2933862	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532358213
47034	NC_022112	TGA	2	6	2933922	2933927	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	532358213
47035	NC_022112	CAA	2	6	2933950	2933955	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	532358213
47036	NC_022112	GGT	2	6	2933959	2933964	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	532358213
47037	NC_022112	T	6	6	2934010	2934015	0 %	100 %	0 %	0 %	532358213
47038	NC_022112	TG	3	6	2934098	2934103	0 %	50 %	50 %	0 %	532358213
47039	NC_022112	CACG	2	8	2934195	2934202	25 %	0 %	25 %	50 %	532358213
47040	NC_022112	CTC	2	6	2934211	2934216	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	532358213
47041	NC_022112	CAA	2	6	2934315	2934320	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	532358213
47042	NC_022112	CCTTG	2	10	2934348	2934357	0 %	40 %	20 %	40 %	532358213
47043	NC_022112	AGC	2	6	2934413	2934418	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	532358213
47044	NC_022112	TGG	2	6	2934423	2934428	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	532358213
47045	NC_022112	TCA	2	6	2934434	2934439	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	532358213
47046	NC_022112	CAA	2	6	2934714	2934719	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	532358213
47047	NC_022112	TCA	2	6	2934797	2934802	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	532358213
47048	NC_022112	CGC	2	6	2934810	2934815	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	532358213
47049	NC_022112	AGTT	2	8	2935512	2935519	25 %	50 %	25 %	0 %	532358214
47050	NC_022112	ACGT	2	8	2935582	2935589	25 %	25 %	25 %	25 %	532358214
47051	NC_022112	ATG	2	6	2935628	2935633	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	532358214
47052	NC_022112	CGT	2	6	2935717	2935722	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	532358214
47053	NC_022112	TGA	2	6	2935811	2935816	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	532358214
47054	NC_022112	CTT	2	6	2935844	2935849	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532358214
47055	NC_022112	GTG	2	6	2935924	2935929	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	532358214
47056	NC_022112	TGG	2	6	2935985	2935990	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	532358214
47057	NC_022112	T	6	6	2936052	2936057	0 %	100 %	0 %	0 %	532358214
47058	NC_022112	TCG	2	6	2936083	2936088	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	532358214
47059	NC_022112	CGG	2	6	2936112	2936117	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	532358214
47060	NC_022112	CAAGC	2	10	2936217	2936226	40 %	0 %	20 %	40 %	532358214
47061	NC_022112	GTT	2	6	2936296	2936301	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	532358215
47062	NC_022112	T	6	6	2936321	2936326	0 %	100 %	0 %	0 %	532358215
47063	NC_022112	CGCT	2	8	2936330	2936337	0 %	25 %	25 %	50 %	532358215
47064	NC_022112	TTCTTT	2	12	2936348	2936359	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	532358215
47065	NC_022112	CTG	2	6	2936420	2936425	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	532358215
47066	NC_022112	ATC	2	6	2936517	2936522	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	532358215
47067	NC_022112	GCT	2	6	2936531	2936536	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	532358215
47068	NC_022112	GTTG	2	8	2936547	2936554	0 %	50 %	50 %	0 %	532358215
47069	NC_022112	CAT	2	6	2936558	2936563	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	532358215
47070	NC_022112	TGA	2	6	2936669	2936674	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	532358215
47071	NC_022112	TCA	2	6	2936784	2936789	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	532358215
47072	NC_022112	CTT	2	6	2936828	2936833	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532358215
47073	NC_022112	GCG	2	6	2936851	2936856	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	532358215
47074	NC_022112	CTG	2	6	2936864	2936869	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	532358215
47075	NC_022112	TTGA	2	8	2936883	2936890	25 %	50 %	25 %	0 %	532358215
47076	NC_022112	GAT	2	6	2936921	2936926	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	532358215
47077	NC_022112	AAT	2	6	2936939	2936944	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	532358215
47078	NC_022112	GCCA	2	8	2936976	2936983	25 %	0 %	25 %	50 %	532358215
47079	NC_022112	ACA	2	6	2937009	2937014	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	532358215
47080	NC_022112	TTTGA	2	10	2937116	2937125	20 %	60 %	20 %	0 %	532358215
47081	NC_022112	GCCA	2	8	2937311	2937318	25 %	0 %	25 %	50 %	532358216
47082	NC_022112	CATGA	2	10	2937323	2937332	40 %	20 %	20 %	20 %	532358216
47083	NC_022112	GCCA	2	8	2937350	2937357	25 %	0 %	25 %	50 %	532358216
47084	NC_022112	A	6	6	2937393	2937398	100 %	0 %	0 %	0 %	532358216
47085	NC_022112	TTC	2	6	2937492	2937497	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532358216
47086	NC_022112	CTT	2	6	2937607	2937612	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532358216
47087	NC_022112	T	6	6	2937611	2937616	0 %	100 %	0 %	0 %	532358216
47088	NC_022112	ATG	2	6	2937637	2937642	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	532358216
47089	NC_022112	TTG	2	6	2937707	2937712	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	532358216
47090	NC_022112	TGC	3	9	2937805	2937813	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	532358216
47091	NC_022112	ATA	2	6	2937974	2937979	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	532358217
47092	NC_022112	TTGG	2	8	2938079	2938086	0 %	50 %	50 %	0 %	532358217

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©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.