MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Lactobacillus paracasei subsp. paracasei 8700:2

Total Repeats: 47092

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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41503	NC_022112	TCCATG	2	12	2592549	2592560	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	532357889
41504	NC_022112	CAA	2	6	2592604	2592609	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	532357889
41505	NC_022112	CTT	2	6	2592637	2592642	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532357889
41506	NC_022112	ATC	2	6	2592743	2592748	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	532357889
41507	NC_022112	TAT	2	6	2592781	2592786	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	532357889
41508	NC_022112	AAT	2	6	2592859	2592864	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	532357889
41509	NC_022112	CGAA	2	8	2592947	2592954	50 %	0 %	25 %	25 %	532357889
41510	NC_022112	TGT	2	6	2592959	2592964	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	532357889
41511	NC_022112	CCA	2	6	2592976	2592981	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	532357889
41512	NC_022112	CTG	2	6	2593033	2593038	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	532357889
41513	NC_022112	T	7	7	2593069	2593075	0 %	100 %	0 %	0 %	532357889
41514	NC_022112	TCA	2	6	2593104	2593109	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	532357889
41515	NC_022112	CTT	2	6	2593174	2593179	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532357889
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41517	NC_022112	TTA	2	6	2593221	2593226	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	532357889
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41519	NC_022112	TTC	2	6	2593269	2593274	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532357890
41520	NC_022112	GTTCAA	2	12	2593341	2593352	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	532357890
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41617	NC_022112	CGG	2	6	2599965	2599970	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	532357895
41618	NC_022112	AGA	2	6	2599973	2599978	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532357895
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41623	NC_022112	GAT	2	6	2600069	2600074	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	532357895
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41677	NC_022112	ATCTG	2	10	2603746	2603755	20 %	40 %	20 %	20 %	532357898
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41689	NC_022112	GAAA	2	8	2604241	2604248	75 %	0 %	25 %	0 %	532357898
41690	NC_022112	GTA	2	6	2604252	2604257	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	532357898
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41692	NC_022112	TGA	2	6	2604340	2604345	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	532357898
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41713	NC_022112	GTC	2	6	2605890	2605895	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	532357899
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41719	NC_022112	CAG	2	6	2606456	2606461	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	532357899
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41729	NC_022112	ACTG	2	8	2606944	2606951	25 %	25 %	25 %	25 %	532357900
41730	NC_022112	TTC	2	6	2607032	2607037	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532357900
41731	NC_022112	CCGAT	2	10	2607078	2607087	20 %	20 %	20 %	40 %	532357900
41732	NC_022112	GCA	3	9	2607160	2607168	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	532357900
41733	NC_022112	ACC	2	6	2607228	2607233	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	532357900
41734	NC_022112	TGC	3	9	2607273	2607281	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	532357900
41735	NC_022112	TGCGAT	2	12	2607304	2607315	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	532357900
41736	NC_022112	GGC	2	6	2607324	2607329	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	532357900
41737	NC_022112	TGT	2	6	2607338	2607343	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	532357900
41738	NC_022112	T	6	6	2607370	2607375	0 %	100 %	0 %	0 %	532357900
41739	NC_022112	CTG	2	6	2607449	2607454	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	532357900
41740	NC_022112	CGC	2	6	2607529	2607534	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	532357900
41741	NC_022112	CGT	2	6	2607569	2607574	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	532357900
41742	NC_022112	CCT	2	6	2607711	2607716	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	532357901
41743	NC_022112	TTC	2	6	2607770	2607775	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532357901
41744	NC_022112	AAC	2	6	2607911	2607916	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	532357901
41745	NC_022112	ATC	2	6	2607922	2607927	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	532357901
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41748	NC_022112	AAATC	2	10	2608109	2608118	60 %	20 %	0 %	20 %	532357901
41749	NC_022112	ATGG	2	8	2608127	2608134	25 %	25 %	50 %	0 %	532357901
41750	NC_022112	GTT	2	6	2608213	2608218	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	532357901
41751	NC_022112	AGCA	2	8	2608255	2608262	50 %	0 %	25 %	25 %	532357901
41752	NC_022112	TGT	2	6	2608304	2608309	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	532357901
41753	NC_022112	AAG	2	6	2608403	2608408	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532357901
41754	NC_022112	GCT	2	6	2608673	2608678	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	532357901
41755	NC_022112	CGC	2	6	2608702	2608707	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	532357901
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41758	NC_022112	AGGA	2	8	2608905	2608912	50 %	0 %	50 %	0 %	532357901
41759	NC_022112	AT	3	6	2608931	2608936	50 %	50 %	0 %	0 %	532357901
41760	NC_022112	AAT	2	6	2608978	2608983	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	532357901
41761	NC_022112	CAA	2	6	2609017	2609022	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	532357901
41762	NC_022112	GCA	3	9	2609070	2609078	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	532357901
41763	NC_022112	ATC	2	6	2609141	2609146	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	532357901
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41766	NC_022112	CGG	2	6	2609933	2609938	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	532357902
41767	NC_022112	CAAGG	2	10	2609952	2609961	40 %	0 %	40 %	20 %	532357902
41768	NC_022112	GCG	2	6	2609989	2609994	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	532357902
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41770	NC_022112	GC	4	8	2610288	2610295	0 %	0 %	50 %	50 %	532357902
41771	NC_022112	TATT	2	8	2610306	2610313	25 %	75 %	0 %	0 %	532357902
41772	NC_022112	CAG	2	6	2610350	2610355	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	532357902
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41779	NC_022112	GGCA	2	8	2610743	2610750	25 %	0 %	50 %	25 %	532357902
41780	NC_022112	ATT	2	6	2610801	2610806	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	532357902
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41799	NC_022112	T	6	6	2611616	2611621	0 %	100 %	0 %	0 %	532357902
41800	NC_022112	TTA	2	6	2611699	2611704	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	532357902
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41805	NC_022112	AC	3	6	2612144	2612149	50 %	0 %	0 %	50 %	532357902
41806	NC_022112	CCAG	2	8	2612392	2612399	25 %	0 %	25 %	50 %	532357903
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41812	NC_022112	CTG	2	6	2612494	2612499	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	532357903
41813	NC_022112	GCTG	2	8	2612528	2612535	0 %	25 %	50 %	25 %	532357903
41814	NC_022112	A	6	6	2612542	2612547	100 %	0 %	0 %	0 %	532357903
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41818	NC_022112	A	6	6	2612654	2612659	100 %	0 %	0 %	0 %	532357903
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41820	NC_022112	ATTTAG	2	12	2612734	2612745	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	532357903
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41828	NC_022112	TGC	2	6	2612944	2612949	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	532357903
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41830	NC_022112	GGCA	2	8	2612974	2612981	25 %	0 %	50 %	25 %	532357903
41831	NC_022112	TGC	2	6	2613058	2613063	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	532357903
41832	NC_022112	TAGA	2	8	2613103	2613110	50 %	25 %	25 %	0 %	532357903
41833	NC_022112	TTG	2	6	2613112	2613117	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	532357903
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41836	NC_022112	AGC	2	6	2613195	2613200	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	532357904
41837	NC_022112	TGCT	2	8	2613201	2613208	0 %	50 %	25 %	25 %	532357904
41838	NC_022112	CAA	2	6	2613309	2613314	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	532357904
41839	NC_022112	GGC	2	6	2613396	2613401	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	532357904
41840	NC_022112	GCG	2	6	2613556	2613561	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	532357904
41841	NC_022112	GCA	2	6	2613617	2613622	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	532357904
41842	NC_022112	TTG	2	6	2613771	2613776	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	532357904
41843	NC_022112	A	7	7	2613799	2613805	100 %	0 %	0 %	0 %	532357904
41844	NC_022112	ATC	2	6	2613898	2613903	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	532357904
41845	NC_022112	CGATG	2	10	2613930	2613939	20 %	20 %	40 %	20 %	532357904
41846	NC_022112	AGC	2	6	2614014	2614019	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	532357904
41847	NC_022112	CCT	2	6	2614024	2614029	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	532357904
41848	NC_022112	CTA	2	6	2614040	2614045	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	532357904
41849	NC_022112	TTG	2	6	2614592	2614597	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	532357905
41850	NC_022112	TTG	2	6	2614600	2614605	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	532357905
41851	NC_022112	AAGT	2	8	2614648	2614655	50 %	25 %	25 %	0 %	532357905
41852	NC_022112	CAAG	2	8	2614657	2614664	50 %	0 %	25 %	25 %	532357905
41853	NC_022112	CGC	2	6	2614667	2614672	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	532357905
41854	NC_022112	GAA	2	6	2614689	2614694	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532357905
41855	NC_022112	CGC	2	6	2614774	2614779	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	532357905
41856	NC_022112	TCA	2	6	2614799	2614804	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	532357905
41857	NC_022112	CTC	2	6	2614824	2614829	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	532357905
41858	NC_022112	CCA	2	6	2614840	2614845	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	532357905
41859	NC_022112	TAA	2	6	2614854	2614859	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	532357905
41860	NC_022112	TTGA	2	8	2614861	2614868	25 %	50 %	25 %	0 %	532357905
41861	NC_022112	TGA	2	6	2614952	2614957	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	532357905
41862	NC_022112	GTT	2	6	2615027	2615032	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	532357905
41863	NC_022112	GCA	2	6	2615065	2615070	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	532357905
41864	NC_022112	GCA	2	6	2615179	2615184	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	532357905
41865	NC_022112	CAA	2	6	2615189	2615194	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	532357905
41866	NC_022112	GAA	2	6	2615210	2615215	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532357905
41867	NC_022112	T	7	7	2615820	2615826	0 %	100 %	0 %	0 %	532357906
41868	NC_022112	TGAT	2	8	2615879	2615886	25 %	50 %	25 %	0 %	532357906
41869	NC_022112	TGT	2	6	2615899	2615904	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	532357906
41870	NC_022112	GTG	2	6	2615934	2615939	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	532357906
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41872	NC_022112	CATA	2	8	2615979	2615986	50 %	25 %	0 %	25 %	532357906
41873	NC_022112	CCAATG	2	12	2615996	2616007	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	532357906
41874	NC_022112	GC	3	6	2616137	2616142	0 %	0 %	50 %	50 %	532357906
41875	NC_022112	CTG	2	6	2616163	2616168	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	532357906
41876	NC_022112	GGC	3	9	2616169	2616177	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	532357906
41877	NC_022112	GCC	3	9	2616233	2616241	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	532357906
41878	NC_022112	ACA	2	6	2616245	2616250	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	532357906
41879	NC_022112	GTT	2	6	2616282	2616287	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	532357906
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41881	NC_022112	CCA	2	6	2616414	2616419	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	532357906
41882	NC_022112	CAGT	2	8	2616571	2616578	25 %	25 %	25 %	25 %	532357907
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41884	NC_022112	CAA	2	6	2616687	2616692	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	532357907
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41889	NC_022112	AAC	2	6	2617219	2617224	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	532357908
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41894	NC_022112	TGC	2	6	2617665	2617670	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	532357908
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41908	NC_022112	CAT	2	6	2618517	2618522	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	532357908
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41915	NC_022112	GCG	2	6	2619092	2619097	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	532357908
41916	NC_022112	GCA	2	6	2619141	2619146	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	532357908
41917	NC_022112	GCA	3	9	2619204	2619212	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	532357908
41918	NC_022112	CA	3	6	2619286	2619291	50 %	0 %	0 %	50 %	532357908
41919	NC_022112	AGCGC	2	10	2619366	2619375	20 %	0 %	40 %	40 %	532357908
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41923	NC_022112	GGC	2	6	2619681	2619686	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	532357908
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41927	NC_022112	ATGCCA	2	12	2619909	2619920	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	532357909
41928	NC_022112	CTT	2	6	2619973	2619978	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532357909
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41930	NC_022112	ACA	2	6	2620068	2620073	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	532357909
41931	NC_022112	TGT	2	6	2620167	2620172	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	532357909
41932	NC_022112	AACTG	2	10	2620173	2620182	40 %	20 %	20 %	20 %	532357909
41933	NC_022112	ATCGCA	2	12	2620217	2620228	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	532357909
41934	NC_022112	TCT	2	6	2620316	2620321	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532357909
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41942	NC_022112	A	7	7	2621081	2621087	100 %	0 %	0 %	0 %	532357910
41943	NC_022112	CAT	2	6	2621110	2621115	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	532357910
41944	NC_022112	CAG	2	6	2621191	2621196	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	532357910
41945	NC_022112	ATC	2	6	2621456	2621461	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	532357910
41946	NC_022112	GCT	2	6	2621520	2621525	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	532357910
41947	NC_022112	GGC	2	6	2621535	2621540	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	532357910
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41949	NC_022112	ATC	2	6	2621564	2621569	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	532357910
41950	NC_022112	CCG	2	6	2621617	2621622	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	532357910
41951	NC_022112	ATG	2	6	2621645	2621650	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	532357910
41952	NC_022112	AAT	2	6	2621693	2621698	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	532357910
41953	NC_022112	AAG	2	6	2621770	2621775	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532357910
41954	NC_022112	CGC	2	6	2621776	2621781	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	532357910
41955	NC_022112	ATG	2	6	2621828	2621833	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	532357910
41956	NC_022112	TAA	2	6	2621863	2621868	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	532357910
41957	NC_022112	CAA	2	6	2622055	2622060	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	532357911
41958	NC_022112	AGA	2	6	2622080	2622085	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532357911
41959	NC_022112	CAAG	2	8	2622123	2622130	50 %	0 %	25 %	25 %	532357911
41960	NC_022112	A	6	6	2622174	2622179	100 %	0 %	0 %	0 %	532357911
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41962	NC_022112	TGT	2	6	2622242	2622247	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	532357911
41963	NC_022112	TTGC	2	8	2622278	2622285	0 %	50 %	25 %	25 %	532357911
41964	NC_022112	GAAAAA	2	12	2622602	2622613	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	532357912
41965	NC_022112	GTT	2	6	2622632	2622637	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	532357912
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