MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Lactobacillus paracasei subsp. paracasei 8700:2

Total Repeats: 47092

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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29502	NC_022112	ATC	2	6	1836641	1836646	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	532357226
29503	NC_022112	GAT	2	6	1836661	1836666	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	532357226
29504	NC_022112	A	6	6	1836734	1836739	100 %	0 %	0 %	0 %	532357226
29505	NC_022112	A	6	6	1836779	1836784	100 %	0 %	0 %	0 %	532357226
29506	NC_022112	TCA	2	6	1836790	1836795	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	532357226
29507	NC_022112	TG	3	6	1836843	1836848	0 %	50 %	50 %	0 %	532357226
29508	NC_022112	TCA	2	6	1836850	1836855	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	532357226
29509	NC_022112	CG	3	6	1837073	1837078	0 %	0 %	50 %	50 %	532357227
29510	NC_022112	TTG	2	6	1837554	1837559	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	532357228
29511	NC_022112	T	6	6	1837584	1837589	0 %	100 %	0 %	0 %	532357228
29512	NC_022112	T	6	6	1837623	1837628	0 %	100 %	0 %	0 %	532357228
29513	NC_022112	CCG	3	9	1837658	1837666	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	532357228
29514	NC_022112	AAGTTT	2	12	1837737	1837748	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	532357228
29515	NC_022112	TTG	2	6	1837763	1837768	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	532357228
29516	NC_022112	CCTTG	2	10	1837808	1837817	0 %	40 %	20 %	40 %	532357228
29517	NC_022112	ATGA	2	8	1838083	1838090	50 %	25 %	25 %	0 %	532357228
29518	NC_022112	ATTCG	2	10	1838450	1838459	20 %	40 %	20 %	20 %	532357229
29519	NC_022112	TGT	2	6	1838540	1838545	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	532357229
29520	NC_022112	TTGCT	2	10	1838627	1838636	0 %	60 %	20 %	20 %	532357229
29521	NC_022112	GCA	2	6	1838639	1838644	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	532357229
29522	NC_022112	TGT	2	6	1838687	1838692	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	532357229
29523	NC_022112	CAA	2	6	1838697	1838702	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	532357229
29524	NC_022112	TCT	2	6	1838731	1838736	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532357229
29525	NC_022112	TGA	2	6	1838747	1838752	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	532357229
29526	NC_022112	ACC	2	6	1838763	1838768	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	532357229
29527	NC_022112	AT	3	6	1838815	1838820	50 %	50 %	0 %	0 %	532357229
29528	NC_022112	TGA	2	6	1838852	1838857	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	532357229
29529	NC_022112	AAT	2	6	1838883	1838888	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	532357229
29530	NC_022112	GCC	2	6	1838902	1838907	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	532357229
29531	NC_022112	GTC	2	6	1838974	1838979	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	532357229
29532	NC_022112	TCA	2	6	1838993	1838998	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	532357229
29533	NC_022112	TCA	2	6	1839013	1839018	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	532357229
29534	NC_022112	CCG	2	6	1839058	1839063	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	532357229
29535	NC_022112	TGCT	2	8	1839424	1839431	0 %	50 %	25 %	25 %	532357230
29536	NC_022112	CAA	2	6	1839439	1839444	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	532357230
29537	NC_022112	TGT	2	6	1839454	1839459	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	532357230
29538	NC_022112	ACC	2	6	1839460	1839465	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	532357230
29539	NC_022112	ATCA	2	8	1839481	1839488	50 %	25 %	0 %	25 %	532357230
29540	NC_022112	AGC	2	6	1839547	1839552	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	532357230
29541	NC_022112	T	6	6	1839568	1839573	0 %	100 %	0 %	0 %	532357230
29542	NC_022112	TGA	2	6	1839637	1839642	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	532357230
29543	NC_022112	AGC	2	6	1839754	1839759	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	532357230
29544	NC_022112	CACATT	2	12	1839787	1839798	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	532357230
29545	NC_022112	GTT	2	6	1839897	1839902	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	532357230
29546	NC_022112	GGC	2	6	1840024	1840029	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	532357230
29547	NC_022112	TGA	2	6	1840110	1840115	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	532357230
29548	NC_022112	TGA	2	6	1840178	1840183	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	532357231
29549	NC_022112	TCT	2	6	1840187	1840192	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532357231
29550	NC_022112	CGA	2	6	1840218	1840223	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	532357231
29551	NC_022112	GCT	2	6	1840226	1840231	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	532357231
29552	NC_022112	TTC	2	6	1840342	1840347	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532357231
29553	NC_022112	GCC	2	6	1840615	1840620	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	532357231
29554	NC_022112	GCCA	2	8	1840630	1840637	25 %	0 %	25 %	50 %	532357231
29555	NC_022112	TGG	2	6	1840659	1840664	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	532357231
29556	NC_022112	CG	3	6	1840773	1840778	0 %	0 %	50 %	50 %	532357231
29557	NC_022112	AGC	2	6	1840807	1840812	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	532357231
29558	NC_022112	GAA	2	6	1840831	1840836	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532357231
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29560	NC_022112	CTG	2	6	1840903	1840908	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	532357231
29561	NC_022112	CGA	2	6	1840997	1841002	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	532357231
29562	NC_022112	TTC	3	9	1841023	1841031	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532357231
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29565	NC_022112	GCT	2	6	1841160	1841165	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	532357231
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29568	NC_022112	CGG	2	6	1841229	1841234	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	532357231
29569	NC_022112	ATC	2	6	1841311	1841316	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	532357231
29570	NC_022112	GAT	2	6	1841385	1841390	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	532357231
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29572	NC_022112	TTGC	2	8	1841413	1841420	0 %	50 %	25 %	25 %	532357231
29573	NC_022112	CTG	2	6	1841424	1841429	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	532357231
29574	NC_022112	TAA	2	6	1841686	1841691	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	532357231
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29577	NC_022112	CTT	2	6	1841835	1841840	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532357231
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29579	NC_022112	CTG	2	6	1841935	1841940	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	532357231
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29583	NC_022112	ATA	2	6	1842031	1842036	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	532357231
29584	NC_022112	TAT	2	6	1842039	1842044	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	532357231
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29590	NC_022112	GTA	2	6	1842593	1842598	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	532357232
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29600	NC_022112	CTGC	2	8	1843122	1843129	0 %	25 %	25 %	50 %	532357232
29601	NC_022112	CTGC	2	8	1843221	1843228	0 %	25 %	25 %	50 %	532357232
29602	NC_022112	TTC	2	6	1843229	1843234	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532357232
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29606	NC_022112	TGAC	2	8	1843585	1843592	25 %	25 %	25 %	25 %	532357233
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29612	NC_022112	A	6	6	1843942	1843947	100 %	0 %	0 %	0 %	532357233
29613	NC_022112	TGC	2	6	1843952	1843957	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	532357233
29614	NC_022112	T	6	6	1844009	1844014	0 %	100 %	0 %	0 %	532357233
29615	NC_022112	ACC	2	6	1844151	1844156	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	532357233
29616	NC_022112	AT	3	6	1844226	1844231	50 %	50 %	0 %	0 %	532357233
29617	NC_022112	GCT	2	6	1844280	1844285	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	532357233
29618	NC_022112	TAA	2	6	1844453	1844458	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	532357233
29619	NC_022112	CAGTC	2	10	1844495	1844504	20 %	20 %	20 %	40 %	532357233
29620	NC_022112	CGC	2	6	1844551	1844556	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	532357233
29621	NC_022112	A	6	6	1844560	1844565	100 %	0 %	0 %	0 %	532357233
29622	NC_022112	AAC	2	6	1844583	1844588	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	532357233
29623	NC_022112	GCC	2	6	1844603	1844608	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	532357233
29624	NC_022112	TAAA	2	8	1844621	1844628	75 %	25 %	0 %	0 %	532357233
29625	NC_022112	GCC	2	6	1844684	1844689	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	532357233
29626	NC_022112	GTA	2	6	1844711	1844716	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	532357233
29627	NC_022112	ATT	2	6	1844822	1844827	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	532357233
29628	NC_022112	CG	3	6	1845189	1845194	0 %	0 %	50 %	50 %	532357234
29629	NC_022112	TTG	2	6	1845214	1845219	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	532357234
29630	NC_022112	GCGG	2	8	1845228	1845235	0 %	0 %	75 %	25 %	532357234
29631	NC_022112	CCG	2	6	1845244	1845249	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	532357234
29632	NC_022112	TAA	2	6	1845269	1845274	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	532357234
29633	NC_022112	ATTG	2	8	1845348	1845355	25 %	50 %	25 %	0 %	532357234
29634	NC_022112	AC	3	6	1845431	1845436	50 %	0 %	0 %	50 %	532357234
29635	NC_022112	ATC	2	6	1845532	1845537	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	532357234
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29637	NC_022112	GAC	2	6	1845843	1845848	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	532357234
29638	NC_022112	AAGC	2	8	1845915	1845922	50 %	0 %	25 %	25 %	532357234
29639	NC_022112	ATT	2	6	1846053	1846058	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	532357234
29640	NC_022112	CAA	2	6	1846082	1846087	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	532357234
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29642	NC_022112	TCG	2	6	1846154	1846159	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	532357234
29643	NC_022112	CAA	2	6	1846172	1846177	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	532357234
29644	NC_022112	CAT	2	6	1846193	1846198	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	532357234
29645	NC_022112	CAA	2	6	1846217	1846222	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	532357234
29646	NC_022112	TTC	2	6	1846234	1846239	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532357234
29647	NC_022112	GCC	2	6	1846251	1846256	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	532357234
29648	NC_022112	TGA	2	6	1846278	1846283	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	532357234
29649	NC_022112	TCACG	2	10	1846364	1846373	20 %	20 %	20 %	40 %	532357234
29650	NC_022112	TGT	2	6	1846409	1846414	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	532357234
29651	NC_022112	AGTT	2	8	1846416	1846423	25 %	50 %	25 %	0 %	532357234
29652	NC_022112	T	6	6	1846422	1846427	0 %	100 %	0 %	0 %	532357234
29653	NC_022112	TGC	2	6	1846477	1846482	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	532357234
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29656	NC_022112	CTG	2	6	1846562	1846567	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	532357234
29657	NC_022112	TAG	2	6	1846574	1846579	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	532357234
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29664	NC_022112	AGAA	2	8	1846842	1846849	75 %	0 %	25 %	0 %	532357234
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29670	NC_022112	AC	3	6	1847162	1847167	50 %	0 %	0 %	50 %	532357234
29671	NC_022112	TTA	2	6	1847254	1847259	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	532357234
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29674	NC_022112	AAATC	2	10	1849415	1849424	60 %	20 %	0 %	20 %	532357235
29675	NC_022112	TAA	2	6	1849447	1849452	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	532357235
29676	NC_022112	TG	3	6	1849570	1849575	0 %	50 %	50 %	0 %	532357235
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29686	NC_022112	TTA	2	6	1850965	1850970	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	532357237
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29692	NC_022112	CGC	2	6	1851129	1851134	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	532357237
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29704	NC_022112	GTTT	2	8	1851634	1851641	0 %	75 %	25 %	0 %	532357237
29705	NC_022112	TTA	2	6	1851667	1851672	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	532357237
29706	NC_022112	CA	3	6	1851706	1851711	50 %	0 %	0 %	50 %	532357237
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29720	NC_022112	CAT	3	9	1852478	1852486	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	532357238
29721	NC_022112	TTTG	2	8	1852574	1852581	0 %	75 %	25 %	0 %	532357238
29722	NC_022112	AGC	2	6	1852640	1852645	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	532357238
29723	NC_022112	GCA	2	6	1852740	1852745	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	532357238
29724	NC_022112	CAC	2	6	1852788	1852793	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	532357238
29725	NC_022112	TAT	2	6	1852917	1852922	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	532357238
29726	NC_022112	TGGAC	2	10	1852933	1852942	20 %	20 %	40 %	20 %	532357238
29727	NC_022112	TATG	2	8	1853016	1853023	25 %	50 %	25 %	0 %	532357238
29728	NC_022112	ATTG	2	8	1853039	1853046	25 %	50 %	25 %	0 %	532357238
29729	NC_022112	GAT	2	6	1853091	1853096	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	532357238
29730	NC_022112	TAT	3	9	1853121	1853129	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	532357238
29731	NC_022112	CAA	2	6	1853130	1853135	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	532357238
29732	NC_022112	CAA	2	6	1853166	1853171	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	532357238
29733	NC_022112	GCG	2	6	1853223	1853228	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	532357238
29734	NC_022112	ACTG	2	8	1853310	1853317	25 %	25 %	25 %	25 %	532357238
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29780	NC_022112	ATA	2	6	1856775	1856780	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	532357242
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29790	NC_022112	CGAT	2	8	1857510	1857517	25 %	25 %	25 %	25 %	532357242
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29802	NC_022112	T	6	6	1857939	1857944	0 %	100 %	0 %	0 %	532357242
29803	NC_022112	CATC	2	8	1857979	1857986	25 %	25 %	0 %	50 %	532357242
29804	NC_022112	GCC	2	6	1858009	1858014	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	532357242
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29806	NC_022112	CCA	2	6	1858069	1858074	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	532357242
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29809	NC_022112	AAC	2	6	1858275	1858280	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	532357242
29810	NC_022112	TGA	2	6	1858441	1858446	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	532357243
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29812	NC_022112	A	8	8	1858650	1858657	100 %	0 %	0 %	0 %	532357243
29813	NC_022112	CTTG	2	8	1858674	1858681	0 %	50 %	25 %	25 %	532357243
29814	NC_022112	T	6	6	1858701	1858706	0 %	100 %	0 %	0 %	532357243
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29818	NC_022112	GTAA	2	8	1858772	1858779	50 %	25 %	25 %	0 %	532357243
29819	NC_022112	TTTA	2	8	1859013	1859020	25 %	75 %	0 %	0 %	532357244
29820	NC_022112	ATC	2	6	1859107	1859112	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	532357244
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29823	NC_022112	TGC	2	6	1859247	1859252	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	532357244
29824	NC_022112	AAAT	2	8	1859405	1859412	75 %	25 %	0 %	0 %	532357244
29825	NC_022112	CTG	2	6	1859469	1859474	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	532357244
29826	NC_022112	GCT	2	6	1859615	1859620	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	532357244
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29829	NC_022112	TGA	2	6	1859666	1859671	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	532357244
29830	NC_022112	ACCAA	2	10	1859674	1859683	60 %	0 %	0 %	40 %	532357244
29831	NC_022112	CCG	2	6	1859687	1859692	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	532357244
29832	NC_022112	ACA	2	6	1859702	1859707	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	532357244
29833	NC_022112	ATGC	2	8	1859761	1859768	25 %	25 %	25 %	25 %	532357244
29834	NC_022112	ATT	2	6	1860390	1860395	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	532357245
29835	NC_022112	AGG	2	6	1860430	1860435	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	532357245
29836	NC_022112	CAA	2	6	1860522	1860527	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	532357245
29837	NC_022112	CG	3	6	1860544	1860549	0 %	0 %	50 %	50 %	532357245
29838	NC_022112	GCAG	2	8	1860690	1860697	25 %	0 %	50 %	25 %	532357245
29839	NC_022112	A	6	6	1860701	1860706	100 %	0 %	0 %	0 %	532357245
29840	NC_022112	A	7	7	1860734	1860740	100 %	0 %	0 %	0 %	532357245
29841	NC_022112	GCT	3	9	1860750	1860758	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	532357245
29842	NC_022112	TTA	2	6	1860760	1860765	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	532357245
29843	NC_022112	GTT	2	6	1860797	1860802	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	532357245
29844	NC_022112	TACG	2	8	1860876	1860883	25 %	25 %	25 %	25 %	532357245
29845	NC_022112	GAT	2	6	1860906	1860911	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	532357245
29846	NC_022112	AC	3	6	1860937	1860942	50 %	0 %	0 %	50 %	532357245
29847	NC_022112	CATT	2	8	1861075	1861082	25 %	50 %	0 %	25 %	532357246
29848	NC_022112	TGA	2	6	1861087	1861092	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	532357246
29849	NC_022112	AACG	2	8	1861126	1861133	50 %	0 %	25 %	25 %	532357246
29850	NC_022112	AAC	3	9	1861257	1861265	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	532357246
29851	NC_022112	TTTA	2	8	1861271	1861278	25 %	75 %	0 %	0 %	532357246
29852	NC_022112	CAA	2	6	1861349	1861354	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	532357246
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29854	NC_022112	TCA	2	6	1861393	1861398	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	532357246
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29858	NC_022112	GATT	2	8	1861494	1861501	25 %	50 %	25 %	0 %	532357246
29859	NC_022112	TCAC	2	8	1861537	1861544	25 %	25 %	0 %	50 %	532357246
29860	NC_022112	CAA	2	6	1861555	1861560	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	532357246
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29880	NC_022112	CAT	2	6	1868724	1868729	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	532357248
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29952	NC_022112	GAC	2	6	1873032	1873037	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	532357250
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29966	NC_022112	ACC	2	6	1873680	1873685	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	532357251
29967	NC_022112	TAA	2	6	1873848	1873853	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	532357251
29968	NC_022112	ATG	2	6	1873873	1873878	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	532357251
29969	NC_022112	GCA	2	6	1873879	1873884	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	532357251
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29972	NC_022112	ACG	2	6	1874026	1874031	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	532357251
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29989	NC_022112	TGA	2	6	1875438	1875443	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	532357252
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29991	NC_022112	CAAT	2	8	1875514	1875521	50 %	25 %	0 %	25 %	532357252
29992	NC_022112	TGG	2	6	1875587	1875592	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	532357252
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29994	NC_022112	CG	3	6	1875608	1875613	0 %	0 %	50 %	50 %	532357252
29995	NC_022112	GCA	2	6	1875651	1875656	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	532357252
29996	NC_022112	T	6	6	1875691	1875696	0 %	100 %	0 %	0 %	532357252
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29999	NC_022112	TTC	2	6	1875902	1875907	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532357252
30000	NC_022112	CGC	2	6	1876068	1876073	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	532357253

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