MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Lactobacillus paracasei subsp. paracasei 8700:2

Total Repeats: 47092

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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28502	NC_022112	GGC	2	6	1780181	1780186	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	532357173
28503	NC_022112	GCC	2	6	1780211	1780216	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	532357173
28504	NC_022112	TTA	2	6	1780220	1780225	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	532357173
28505	NC_022112	TGCG	2	8	1780263	1780270	0 %	25 %	50 %	25 %	532357173
28506	NC_022112	TGAT	2	8	1780297	1780304	25 %	50 %	25 %	0 %	532357173
28507	NC_022112	GCG	2	6	1780316	1780321	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	532357173
28508	NC_022112	CGA	2	6	1780414	1780419	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	532357174
28509	NC_022112	TAC	2	6	1780556	1780561	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	532357174
28510	NC_022112	GTT	2	6	1780567	1780572	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	532357174
28511	NC_022112	AAC	2	6	1780606	1780611	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	532357174
28512	NC_022112	GCC	3	9	1780689	1780697	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	532357174
28513	NC_022112	AATC	2	8	1780719	1780726	50 %	25 %	0 %	25 %	532357174
28514	NC_022112	TTG	2	6	1780728	1780733	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	532357174
28515	NC_022112	TCA	2	6	1780804	1780809	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	532357174
28516	NC_022112	CAG	2	6	1780839	1780844	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	532357174
28517	NC_022112	GCC	2	6	1780912	1780917	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	532357174
28518	NC_022112	ATG	2	6	1780980	1780985	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	532357174
28519	NC_022112	CCA	2	6	1781020	1781025	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	532357174
28520	NC_022112	CTG	2	6	1781043	1781048	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	532357174
28521	NC_022112	AAC	2	6	1781070	1781075	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	532357174
28522	NC_022112	A	7	7	1781125	1781131	100 %	0 %	0 %	0 %	532357174
28523	NC_022112	CCA	2	6	1781305	1781310	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	532357174
28524	NC_022112	GTT	2	6	1781335	1781340	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	532357174
28525	NC_022112	CGC	2	6	1781352	1781357	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	532357174
28526	NC_022112	GCT	2	6	1781371	1781376	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	532357174
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28530	NC_022112	CT	3	6	1781565	1781570	0 %	50 %	0 %	50 %	532357175
28531	NC_022112	CGACT	2	10	1781600	1781609	20 %	20 %	20 %	40 %	532357175
28532	NC_022112	GCA	2	6	1781646	1781651	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	532357175
28533	NC_022112	GTC	2	6	1781664	1781669	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	532357175
28534	NC_022112	AATC	2	8	1781674	1781681	50 %	25 %	0 %	25 %	532357175
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28536	NC_022112	TTTG	2	8	1781767	1781774	0 %	75 %	25 %	0 %	532357175
28537	NC_022112	ATC	2	6	1781798	1781803	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	532357175
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28539	NC_022112	T	6	6	1781866	1781871	0 %	100 %	0 %	0 %	532357175
28540	NC_022112	GCA	2	6	1781973	1781978	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	532357175
28541	NC_022112	CGA	2	6	1782001	1782006	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	532357175
28542	NC_022112	CCG	2	6	1782019	1782024	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	532357175
28543	NC_022112	GTT	2	6	1782025	1782030	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	532357175
28544	NC_022112	CG	3	6	1782058	1782063	0 %	0 %	50 %	50 %	532357175
28545	NC_022112	GGGC	2	8	1782099	1782106	0 %	0 %	75 %	25 %	532357175
28546	NC_022112	TCG	2	6	1782148	1782153	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	532357175
28547	NC_022112	CAT	2	6	1782178	1782183	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	532357175
28548	NC_022112	CTGG	2	8	1782202	1782209	0 %	25 %	50 %	25 %	532357175
28549	NC_022112	CA	3	6	1782261	1782266	50 %	0 %	0 %	50 %	532357175
28550	NC_022112	GCC	2	6	1782272	1782277	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	532357175
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28553	NC_022112	GCC	2	6	1782499	1782504	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	532357175
28554	NC_022112	CTG	2	6	1782607	1782612	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	532357175
28555	NC_022112	GGC	2	6	1782635	1782640	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	532357175
28556	NC_022112	CAACCC	2	12	1782692	1782703	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	532357175
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28561	NC_022112	GGC	2	6	1782800	1782805	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	532357175
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28564	NC_022112	CTGT	2	8	1782891	1782898	0 %	50 %	25 %	25 %	532357176
28565	NC_022112	CAAT	2	8	1782972	1782979	50 %	25 %	0 %	25 %	532357176
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28570	NC_022112	TGC	2	6	1783214	1783219	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	532357176
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28578	NC_022112	TTCGT	2	10	1783430	1783439	0 %	60 %	20 %	20 %	532357176
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28588	NC_022112	TGA	2	6	1783854	1783859	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	532357176
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28600	NC_022112	CATC	2	8	1784295	1784302	25 %	25 %	0 %	50 %	532357176
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28602	NC_022112	GCT	2	6	1784351	1784356	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	532357176
28603	NC_022112	CAG	2	6	1784451	1784456	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	532357176
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28605	NC_022112	GTTT	2	8	1784542	1784549	0 %	75 %	25 %	0 %	532357176
28606	NC_022112	CGC	2	6	1784550	1784555	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	532357176
28607	NC_022112	ATTGC	2	10	1784573	1784582	20 %	40 %	20 %	20 %	532357176
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28612	NC_022112	GCTA	2	8	1784923	1784930	25 %	25 %	25 %	25 %	532357176
28613	NC_022112	CAC	2	6	1785058	1785063	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	532357176
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28615	NC_022112	CAT	2	6	1785161	1785166	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	532357177
28616	NC_022112	TGC	2	6	1785214	1785219	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	532357177
28617	NC_022112	GCC	2	6	1785270	1785275	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	532357177
28618	NC_022112	GCC	2	6	1785497	1785502	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	532357177
28619	NC_022112	GCA	2	6	1785507	1785512	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	532357177
28620	NC_022112	CATC	2	8	1785526	1785533	25 %	25 %	0 %	50 %	532357177
28621	NC_022112	CAC	2	6	1785556	1785561	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	532357177
28622	NC_022112	GTAA	2	8	1785565	1785572	50 %	25 %	25 %	0 %	532357177
28623	NC_022112	CAT	2	6	1785607	1785612	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	532357177
28624	NC_022112	CTTG	2	8	1785822	1785829	0 %	50 %	25 %	25 %	532357178
28625	NC_022112	CTGC	2	8	1785845	1785852	0 %	25 %	25 %	50 %	532357178
28626	NC_022112	ATACA	2	10	1785877	1785886	60 %	20 %	0 %	20 %	532357178
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28632	NC_022112	CTTG	2	8	1786261	1786268	0 %	50 %	25 %	25 %	532357179
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28636	NC_022112	TCA	2	6	1786335	1786340	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	532357179
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28642	NC_022112	ATC	2	6	1786652	1786657	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	532357179
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28647	NC_022112	ATC	2	6	1786753	1786758	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	532357180
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28652	NC_022112	AGT	2	6	1786986	1786991	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	532357180
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28677	NC_022112	CAA	4	12	1788665	1788676	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	532357182
28678	NC_022112	CCA	2	6	1788706	1788711	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	532357182
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28693	NC_022112	CAT	2	6	1789976	1789981	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	532357183
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28704	NC_022112	TGA	2	6	1790554	1790559	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	532357183
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28711	NC_022112	GAT	2	6	1790803	1790808	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	532357183
28712	NC_022112	TG	3	6	1790809	1790814	0 %	50 %	50 %	0 %	532357183
28713	NC_022112	TGAT	2	8	1790819	1790826	25 %	50 %	25 %	0 %	532357183
28714	NC_022112	GTT	2	6	1791142	1791147	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	532357184
28715	NC_022112	TCA	2	6	1791169	1791174	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	532357184
28716	NC_022112	CTT	2	6	1791234	1791239	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532357184
28717	NC_022112	CAG	2	6	1791332	1791337	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	532357184
28718	NC_022112	CA	3	6	1791344	1791349	50 %	0 %	0 %	50 %	532357184
28719	NC_022112	CCTT	2	8	1791364	1791371	0 %	50 %	0 %	50 %	532357184
28720	NC_022112	AATC	2	8	1791380	1791387	50 %	25 %	0 %	25 %	532357184
28721	NC_022112	GGAT	2	8	1791407	1791414	25 %	25 %	50 %	0 %	532357184
28722	NC_022112	GAA	2	6	1791504	1791509	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532357184
28723	NC_022112	CTGCAG	2	12	1791542	1791553	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	532357184
28724	NC_022112	ATC	2	6	1791582	1791587	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	532357184
28725	NC_022112	TTC	2	6	1791624	1791629	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532357184
28726	NC_022112	TGCTT	2	10	1791640	1791649	0 %	60 %	20 %	20 %	532357184
28727	NC_022112	CAA	2	6	1791717	1791722	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	532357184
28728	NC_022112	GC	3	6	1791724	1791729	0 %	0 %	50 %	50 %	532357184
28729	NC_022112	TTC	2	6	1791801	1791806	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532357184
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28731	NC_022112	CTT	2	6	1791894	1791899	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532357184
28732	NC_022112	TCGG	2	8	1791922	1791929	0 %	25 %	50 %	25 %	532357184
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28847	NC_022112	TCA	2	6	1798410	1798415	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	532357190
28848	NC_022112	CGA	2	6	1798423	1798428	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	532357190
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28851	NC_022112	TGT	2	6	1798500	1798505	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	532357190
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28853	NC_022112	ATC	2	6	1798532	1798537	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	532357190
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28867	NC_022112	CTGAT	2	10	1799549	1799558	20 %	40 %	20 %	20 %	532357191
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28944	NC_022112	CCAA	2	8	1804139	1804146	50 %	0 %	0 %	50 %	532357196
28945	NC_022112	AAG	2	6	1804153	1804158	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532357196
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28958	NC_022112	GATT	2	8	1805239	1805246	25 %	50 %	25 %	0 %	532357197
28959	NC_022112	CGC	2	6	1805329	1805334	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	532357197
28960	NC_022112	TCGTA	2	10	1805366	1805375	20 %	40 %	20 %	20 %	532357197
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28962	NC_022112	AAT	2	6	1805431	1805436	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	532357197
28963	NC_022112	TTA	2	6	1805601	1805606	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	532357198
28964	NC_022112	GTC	3	9	1805650	1805658	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	532357198
28965	NC_022112	CGG	2	6	1805766	1805771	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	532357198
28966	NC_022112	ATC	2	6	1805783	1805788	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	532357198
28967	NC_022112	GTC	2	6	1805824	1805829	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	532357198
28968	NC_022112	CTGG	2	8	1805858	1805865	0 %	25 %	50 %	25 %	532357198
28969	NC_022112	CGA	2	6	1805885	1805890	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	532357198
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28974	NC_022112	AAG	2	6	1806155	1806160	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532357198
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28978	NC_022112	CTG	2	6	1806310	1806315	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	532357198
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28993	NC_022112	CAA	2	6	1807399	1807404	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	532357199
28994	NC_022112	TTAA	2	8	1807450	1807457	50 %	50 %	0 %	0 %	532357199
28995	NC_022112	TGA	2	6	1807479	1807484	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	532357199
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