MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Lactobacillus paracasei subsp. paracasei 8700:2

Total Repeats: 47092

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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27502	NC_022112	ACA	2	6	1720050	1720055	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	532357111
27503	NC_022112	AACAG	2	10	1720103	1720112	60 %	0 %	20 %	20 %	532357111
27504	NC_022112	ACC	2	6	1720126	1720131	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	532357111
27505	NC_022112	TGAT	2	8	1720204	1720211	25 %	50 %	25 %	0 %	532357111
27506	NC_022112	TTC	2	6	1720326	1720331	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532357112
27507	NC_022112	ACA	2	6	1720351	1720356	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	532357112
27508	NC_022112	CGA	2	6	1720405	1720410	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	532357112
27509	NC_022112	CTT	4	12	1720424	1720435	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532357112
27510	NC_022112	AGT	2	6	1720499	1720504	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	532357112
27511	NC_022112	TAA	2	6	1720509	1720514	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	532357112
27512	NC_022112	AATC	2	8	1720601	1720608	50 %	25 %	0 %	25 %	532357112
27513	NC_022112	GC	3	6	1720671	1720676	0 %	0 %	50 %	50 %	532357113
27514	NC_022112	CAATT	2	10	1720704	1720713	40 %	40 %	0 %	20 %	532357113
27515	NC_022112	CTT	2	6	1720721	1720726	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532357113
27516	NC_022112	CAA	2	6	1720799	1720804	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	532357113
27517	NC_022112	TCA	2	6	1720813	1720818	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	532357113
27518	NC_022112	TGAA	2	8	1720900	1720907	50 %	25 %	25 %	0 %	532357113
27519	NC_022112	ACA	2	6	1720918	1720923	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	532357113
27520	NC_022112	CAA	2	6	1720950	1720955	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	532357113
27521	NC_022112	AAT	2	6	1720977	1720982	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	532357113
27522	NC_022112	TCAC	2	8	1721206	1721213	25 %	25 %	0 %	50 %	532357113
27523	NC_022112	ATCA	2	8	1721317	1721324	50 %	25 %	0 %	25 %	532357114
27524	NC_022112	CCAC	2	8	1721334	1721341	25 %	0 %	0 %	75 %	532357114
27525	NC_022112	CCA	2	6	1721445	1721450	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	532357114
27526	NC_022112	AAT	2	6	1721461	1721466	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	532357114
27527	NC_022112	ATA	2	6	1721470	1721475	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	532357114
27528	NC_022112	TCG	2	6	1721539	1721544	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	532357114
27529	NC_022112	TCCAA	2	10	1721558	1721567	40 %	20 %	0 %	40 %	532357114
27530	NC_022112	GGT	2	6	1721648	1721653	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	532357114
27531	NC_022112	ATAAA	2	10	1721666	1721675	80 %	20 %	0 %	0 %	532357114
27532	NC_022112	GCT	2	6	1721702	1721707	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	532357114
27533	NC_022112	CCA	2	6	1721750	1721755	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	532357114
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27535	NC_022112	GCGT	2	8	1721870	1721877	0 %	25 %	50 %	25 %	532357115
27536	NC_022112	GAT	2	6	1721899	1721904	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	532357115
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27538	NC_022112	ACA	2	6	1721928	1721933	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	532357115
27539	NC_022112	GAT	2	6	1721945	1721950	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	532357115
27540	NC_022112	GCC	2	6	1721976	1721981	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	532357115
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27542	NC_022112	AGC	2	6	1722017	1722022	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	532357115
27543	NC_022112	ACGC	2	8	1722326	1722333	25 %	0 %	25 %	50 %	532357116
27544	NC_022112	CAG	2	6	1722383	1722388	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	532357116
27545	NC_022112	TGG	2	6	1722492	1722497	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	532357116
27546	NC_022112	ATC	2	6	1722531	1722536	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	532357116
27547	NC_022112	TTCA	2	8	1722657	1722664	25 %	50 %	0 %	25 %	532357116
27548	NC_022112	TGA	2	6	1722683	1722688	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	532357116
27549	NC_022112	ATGA	2	8	1722750	1722757	50 %	25 %	25 %	0 %	532357116
27550	NC_022112	ATCA	2	8	1722768	1722775	50 %	25 %	0 %	25 %	532357116
27551	NC_022112	CAT	2	6	1722785	1722790	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	532357116
27552	NC_022112	CGT	2	6	1722816	1722821	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	532357116
27553	NC_022112	GAT	2	6	1722935	1722940	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	532357116
27554	NC_022112	TCA	2	6	1722970	1722975	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	532357116
27555	NC_022112	T	6	6	1722987	1722992	0 %	100 %	0 %	0 %	532357116
27556	NC_022112	CTG	3	9	1723041	1723049	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	532357116
27557	NC_022112	TTC	2	6	1723057	1723062	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532357116
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27559	NC_022112	A	6	6	1723237	1723242	100 %	0 %	0 %	0 %	532357116
27560	NC_022112	CGTC	2	8	1723247	1723254	0 %	25 %	25 %	50 %	532357116
27561	NC_022112	TCA	2	6	1723318	1723323	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	532357116
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27565	NC_022112	CAC	2	6	1723624	1723629	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	532357117
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27567	NC_022112	CAC	2	6	1723768	1723773	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	532357117
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27569	NC_022112	GAT	2	6	1723833	1723838	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	532357117
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27574	NC_022112	TGGG	2	8	1724589	1724596	0 %	25 %	75 %	0 %	532357118
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27576	NC_022112	ATTA	2	8	1724800	1724807	50 %	50 %	0 %	0 %	532357118
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27588	NC_022112	TGACA	2	10	1725437	1725446	40 %	20 %	20 %	20 %	532357119
27589	NC_022112	TTC	2	6	1725447	1725452	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532357119
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27598	NC_022112	TTTG	2	8	1726070	1726077	0 %	75 %	25 %	0 %	532357119
27599	NC_022112	CAA	2	6	1726084	1726089	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	532357119
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27601	NC_022112	ATG	2	6	1726120	1726125	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	532357119
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27613	NC_022112	GAA	3	9	1726812	1726820	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532357120
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27618	NC_022112	AAGTT	2	10	1727056	1727065	40 %	40 %	20 %	0 %	532357121
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27717	NC_022112	GAT	2	6	1734118	1734123	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	532357129
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27720	NC_022112	AG	3	6	1734306	1734311	50 %	0 %	50 %	0 %	532357129
27721	NC_022112	TCCG	2	8	1734339	1734346	0 %	25 %	25 %	50 %	532357129
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27728	NC_022112	ATG	2	6	1734621	1734626	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	532357130
27729	NC_022112	TCG	2	6	1734636	1734641	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	532357130
27730	NC_022112	ATC	2	6	1734674	1734679	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	532357130
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27732	NC_022112	GTT	2	6	1734731	1734736	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	532357130
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27840	NC_022112	ATTG	2	8	1740766	1740773	25 %	50 %	25 %	0 %	532357135
27841	NC_022112	T	6	6	1740790	1740795	0 %	100 %	0 %	0 %	532357135
27842	NC_022112	AAT	2	6	1740857	1740862	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	532357135
27843	NC_022112	GTC	2	6	1740963	1740968	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	532357135
27844	NC_022112	TCG	2	6	1741000	1741005	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	532357135
27845	NC_022112	AAT	2	6	1741104	1741109	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	532357135
27846	NC_022112	GTC	2	6	1741197	1741202	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	532357135
27847	NC_022112	CTA	2	6	1741219	1741224	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	532357135
27848	NC_022112	AGC	2	6	1741226	1741231	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	532357135
27849	NC_022112	TGT	2	6	1741267	1741272	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	532357135
27850	NC_022112	TA	3	6	1741333	1741338	50 %	50 %	0 %	0 %	532357135
27851	NC_022112	A	6	6	1741343	1741348	100 %	0 %	0 %	0 %	532357135
27852	NC_022112	TAA	3	9	1741379	1741387	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	532357135
27853	NC_022112	TTTTG	2	10	1741388	1741397	0 %	80 %	20 %	0 %	532357135
27854	NC_022112	ATT	2	6	1741571	1741576	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	532357136
27855	NC_022112	AAG	2	6	1741623	1741628	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532357136
27856	NC_022112	CAT	2	6	1741690	1741695	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	532357136
27857	NC_022112	GTG	2	6	1741701	1741706	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	532357136
27858	NC_022112	TTC	2	6	1741716	1741721	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532357136
27859	NC_022112	CAG	2	6	1741781	1741786	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	532357136
27860	NC_022112	ATG	3	9	1741827	1741835	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	532357136
27861	NC_022112	A	6	6	1742072	1742077	100 %	0 %	0 %	0 %	532357136
27862	NC_022112	A	6	6	1742110	1742115	100 %	0 %	0 %	0 %	532357136
27863	NC_022112	GAA	2	6	1742231	1742236	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532357136
27864	NC_022112	ACA	2	6	1742259	1742264	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	532357136
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27866	NC_022112	GCA	2	6	1742528	1742533	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	532357137
27867	NC_022112	TGA	2	6	1742551	1742556	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	532357137
27868	NC_022112	TCGGA	2	10	1742593	1742602	20 %	20 %	40 %	20 %	532357137
27869	NC_022112	TGCG	2	8	1742698	1742705	0 %	25 %	50 %	25 %	532357137
27870	NC_022112	AAT	2	6	1742733	1742738	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	532357137
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27874	NC_022112	GAT	2	6	1742817	1742822	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	532357137
27875	NC_022112	GCGACC	2	12	1742920	1742931	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	532357137
27876	NC_022112	GCT	2	6	1743018	1743023	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	532357137
27877	NC_022112	ATC	2	6	1743060	1743065	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	532357137
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27879	NC_022112	ATC	2	6	1743126	1743131	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	532357137
27880	NC_022112	C	6	6	1743131	1743136	0 %	0 %	0 %	100 %	532357137
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27886	NC_022112	GAT	2	6	1743521	1743526	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	532357137
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27888	NC_022112	GCA	3	9	1743607	1743615	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	532357137
27889	NC_022112	CCAATG	2	12	1743686	1743697	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	532357137
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27910	NC_022112	TAA	2	6	1744610	1744615	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	532357138
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27917	NC_022112	TGA	2	6	1745213	1745218	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	532357138
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27921	NC_022112	TGCCTT	2	12	1745357	1745368	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	532357138
27922	NC_022112	TGA	2	6	1745467	1745472	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	532357138
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27944	NC_022112	GAT	2	6	1746802	1746807	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	532357139
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27949	NC_022112	TTGT	2	8	1747042	1747049	0 %	75 %	25 %	0 %	532357139
27950	NC_022112	GCAA	2	8	1747074	1747081	50 %	0 %	25 %	25 %	532357139
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27952	NC_022112	AC	3	6	1747252	1747257	50 %	0 %	0 %	50 %	532357140
27953	NC_022112	AAC	2	6	1747389	1747394	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	532357140
27954	NC_022112	T	7	7	1747396	1747402	0 %	100 %	0 %	0 %	532357140
27955	NC_022112	TGC	2	6	1747430	1747435	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	532357140
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27957	NC_022112	GCT	2	6	1747759	1747764	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	532357141
27958	NC_022112	CGGC	2	8	1747772	1747779	0 %	0 %	50 %	50 %	532357141
27959	NC_022112	TAT	2	6	1747807	1747812	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	532357141
27960	NC_022112	CGTG	2	8	1747956	1747963	0 %	25 %	50 %	25 %	532357141
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27962	NC_022112	AAC	2	6	1748214	1748219	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	532357142
27963	NC_022112	GCA	2	6	1748242	1748247	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	532357142
27964	NC_022112	GCC	2	6	1748302	1748307	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	532357142
27965	NC_022112	T	6	6	1748308	1748313	0 %	100 %	0 %	0 %	532357142
27966	NC_022112	AAT	2	6	1748380	1748385	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	532357142
27967	NC_022112	T	6	6	1748447	1748452	0 %	100 %	0 %	0 %	532357142
27968	NC_022112	ATC	2	6	1748457	1748462	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	532357142
27969	NC_022112	ATC	2	6	1748631	1748636	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	532357142
27970	NC_022112	TGTT	2	8	1748670	1748677	0 %	75 %	25 %	0 %	532357142
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27972	NC_022112	GCT	2	6	1748887	1748892	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	532357143
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27975	NC_022112	CTA	2	6	1749071	1749076	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	532357143
27976	NC_022112	ACCG	2	8	1749083	1749090	25 %	0 %	25 %	50 %	532357143
27977	NC_022112	CCTG	2	8	1749091	1749098	0 %	25 %	25 %	50 %	532357143
27978	NC_022112	AGT	2	6	1749229	1749234	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	532357143
27979	NC_022112	TAA	2	6	1749282	1749287	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	532357143
27980	NC_022112	GTG	2	6	1749306	1749311	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	532357143
27981	NC_022112	CAT	2	6	1749345	1749350	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	532357143
27982	NC_022112	TTG	2	6	1749351	1749356	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	532357143
27983	NC_022112	CGC	2	6	1749418	1749423	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	532357143
27984	NC_022112	ACC	2	6	1749563	1749568	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	532357143
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27988	NC_022112	AGC	2	6	1750003	1750008	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	532357144
27989	NC_022112	AAC	2	6	1750009	1750014	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	532357144
27990	NC_022112	TCA	2	6	1750016	1750021	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	532357144
27991	NC_022112	GCC	2	6	1750036	1750041	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	532357144
27992	NC_022112	TCA	2	6	1750087	1750092	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	532357144
27993	NC_022112	GAA	3	9	1750098	1750106	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532357144
27994	NC_022112	AGAAT	2	10	1750136	1750145	60 %	20 %	20 %	0 %	532357144
27995	NC_022112	CCA	2	6	1750164	1750169	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	532357144
27996	NC_022112	CTTG	2	8	1750284	1750291	0 %	50 %	25 %	25 %	532357144
27997	NC_022112	CGA	2	6	1750327	1750332	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	532357144
27998	NC_022112	CAA	2	6	1750449	1750454	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	532357144
27999	NC_022112	TCAGCG	2	12	1750484	1750495	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	532357144
28000	NC_022112	A	7	7	1750534	1750540	100 %	0 %	0 %	0 %	532357144

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