MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Lactobacillus paracasei subsp. paracasei 8700:2

Total Repeats: 47092

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
19501	NC_022112	GCA	2	6	1231314	1231319	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	532356646
19502	NC_022112	AGTTAA	2	12	1231326	1231337	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	532356646
19503	NC_022112	ATG	2	6	1231392	1231397	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	532356646
19504	NC_022112	AGA	2	6	1231416	1231421	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532356646
19505	NC_022112	GGA	2	6	1231435	1231440	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	532356646
19506	NC_022112	CAA	2	6	1231517	1231522	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	532356646
19507	NC_022112	ATG	2	6	1231560	1231565	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	532356646
19508	NC_022112	GCA	2	6	1231578	1231583	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	532356646
19509	NC_022112	TGA	2	6	1231600	1231605	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	532356646
19510	NC_022112	CAG	2	6	1231676	1231681	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	532356646
19511	NC_022112	CAA	2	6	1231685	1231690	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	532356646
19512	NC_022112	A	6	6	1231707	1231712	100 %	0 %	0 %	0 %	532356646
19513	NC_022112	TAA	2	6	1231723	1231728	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	532356646
19514	NC_022112	ATC	2	6	1231737	1231742	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	532356646
19515	NC_022112	TGA	2	6	1231774	1231779	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	532356646
19516	NC_022112	GGC	2	6	1231783	1231788	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	532356646
19517	NC_022112	GCG	2	6	1231792	1231797	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	532356646
19518	NC_022112	TGA	2	6	1231912	1231917	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	532356646
19519	NC_022112	TGC	3	9	1232086	1232094	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	532356646
19520	NC_022112	CAGA	2	8	1232147	1232154	50 %	0 %	25 %	25 %	532356646
19521	NC_022112	TCGA	2	8	1232234	1232241	25 %	25 %	25 %	25 %	532356646
19522	NC_022112	CCA	2	6	1232319	1232324	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	532356646
19523	NC_022112	AGC	2	6	1232349	1232354	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	532356646
19524	NC_022112	AAAG	2	8	1232386	1232393	75 %	0 %	25 %	0 %	532356646
19525	NC_022112	CAA	2	6	1232407	1232412	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	532356646
19526	NC_022112	GCAG	2	8	1232413	1232420	25 %	0 %	50 %	25 %	532356646
19527	NC_022112	ACCT	2	8	1232472	1232479	25 %	25 %	0 %	50 %	532356646
19528	NC_022112	A	6	6	1232624	1232629	100 %	0 %	0 %	0 %	532356646
19529	NC_022112	TTGA	2	8	1232642	1232649	25 %	50 %	25 %	0 %	532356646
19530	NC_022112	AGA	2	6	1232665	1232670	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532356646
19531	NC_022112	ACA	2	6	1232699	1232704	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	532356646
19532	NC_022112	AAGC	2	8	1232765	1232772	50 %	0 %	25 %	25 %	532356646
19533	NC_022112	AAG	2	6	1232822	1232827	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532356646
19534	NC_022112	GAA	2	6	1232851	1232856	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532356646
19535	NC_022112	GAT	2	6	1233180	1233185	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	532356647
19536	NC_022112	ATA	2	6	1233194	1233199	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	532356647
19537	NC_022112	CGA	3	9	1233203	1233211	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	532356647
19538	NC_022112	TAA	2	6	1233240	1233245	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	532356647
19539	NC_022112	T	7	7	1233258	1233264	0 %	100 %	0 %	0 %	532356647
19540	NC_022112	GTG	2	6	1233380	1233385	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	532356647
19541	NC_022112	CGGC	2	8	1233441	1233448	0 %	0 %	50 %	50 %	532356647
19542	NC_022112	ATC	2	6	1233542	1233547	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	532356647
19543	NC_022112	GAT	2	6	1233565	1233570	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	532356647
19544	NC_022112	AGC	2	6	1233576	1233581	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	532356647
19545	NC_022112	CAA	2	6	1233621	1233626	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	532356647
19546	NC_022112	TTG	2	6	1233650	1233655	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	532356647
19547	NC_022112	AGC	2	6	1233657	1233662	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	532356647
19548	NC_022112	GCAG	2	8	1233711	1233718	25 %	0 %	50 %	25 %	532356647
19549	NC_022112	TGC	2	6	1233735	1233740	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	532356647
19550	NC_022112	GATT	2	8	1233756	1233763	25 %	50 %	25 %	0 %	532356647
19551	NC_022112	AAGG	2	8	1233823	1233830	50 %	0 %	50 %	0 %	532356647
19552	NC_022112	GAT	2	6	1233834	1233839	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	532356647
19553	NC_022112	GTCA	2	8	1234003	1234010	25 %	25 %	25 %	25 %	532356647
19554	NC_022112	TGTGT	2	10	1234062	1234071	0 %	60 %	40 %	0 %	532356647
19555	NC_022112	A	6	6	1234162	1234167	100 %	0 %	0 %	0 %	532356647
19556	NC_022112	TGCA	2	8	1234617	1234624	25 %	25 %	25 %	25 %	532356648
19557	NC_022112	CGC	2	6	1234685	1234690	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	532356648
19558	NC_022112	GTT	2	6	1234772	1234777	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	532356648
19559	NC_022112	ATTT	2	8	1234829	1234836	25 %	75 %	0 %	0 %	532356648
19560	NC_022112	AGC	2	6	1234891	1234896	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	532356648
19561	NC_022112	GGC	2	6	1234910	1234915	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	532356648
19562	NC_022112	TGGC	2	8	1234929	1234936	0 %	25 %	50 %	25 %	532356648
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19564	NC_022112	CCAG	2	8	1234998	1235005	25 %	0 %	25 %	50 %	532356648
19565	NC_022112	CAA	2	6	1235014	1235019	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	532356648
19566	NC_022112	CAG	2	6	1235183	1235188	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	532356648
19567	NC_022112	TCGG	2	8	1235219	1235226	0 %	25 %	50 %	25 %	532356648
19568	NC_022112	GGC	2	6	1235257	1235262	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	532356648
19569	NC_022112	ATG	2	6	1235268	1235273	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	532356648
19570	NC_022112	ATT	2	6	1235288	1235293	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	532356648
19571	NC_022112	ATT	2	6	1235324	1235329	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	532356648
19572	NC_022112	TGC	2	6	1235384	1235389	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	532356648
19573	NC_022112	GCC	2	6	1235401	1235406	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	532356648
19574	NC_022112	CG	4	8	1235435	1235442	0 %	0 %	50 %	50 %	532356648
19575	NC_022112	CTGG	2	8	1235489	1235496	0 %	25 %	50 %	25 %	532356648
19576	NC_022112	ATCAAG	2	12	1235538	1235549	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	532356648
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19579	NC_022112	TAT	2	6	1235932	1235937	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	532356649
19580	NC_022112	GCA	2	6	1235955	1235960	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	532356649
19581	NC_022112	TGGCTA	2	12	1236066	1236077	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	532356649
19582	NC_022112	CTTG	2	8	1236087	1236094	0 %	50 %	25 %	25 %	532356649
19583	NC_022112	AGA	2	6	1236129	1236134	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532356649
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19585	NC_022112	AAT	2	6	1236184	1236189	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	532356649
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19588	NC_022112	TTGT	2	8	1236484	1236491	0 %	75 %	25 %	0 %	532356649
19589	NC_022112	ATC	2	6	1236494	1236499	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	532356649
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19591	NC_022112	AGCCA	2	10	1237013	1237022	40 %	0 %	20 %	40 %	532356650
19592	NC_022112	CGC	2	6	1237039	1237044	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	532356650
19593	NC_022112	CAGT	2	8	1237295	1237302	25 %	25 %	25 %	25 %	532356650
19594	NC_022112	AT	3	6	1237427	1237432	50 %	50 %	0 %	0 %	532356650
19595	NC_022112	TCAT	2	8	1237480	1237487	25 %	50 %	0 %	25 %	532356650
19596	NC_022112	GAT	2	6	1237491	1237496	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	532356650
19597	NC_022112	GAT	2	6	1237577	1237582	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	532356650
19598	NC_022112	CCG	2	6	1237591	1237596	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	532356650
19599	NC_022112	ATC	2	6	1237680	1237685	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	532356650
19600	NC_022112	ATGA	2	8	1237800	1237807	50 %	25 %	25 %	0 %	532356650
19601	NC_022112	TGG	2	6	1237876	1237881	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	532356650
19602	NC_022112	AAGG	2	8	1237893	1237900	50 %	0 %	50 %	0 %	532356650
19603	NC_022112	A	6	6	1238049	1238054	100 %	0 %	0 %	0 %	532356650
19604	NC_022112	ATGG	2	8	1238096	1238103	25 %	25 %	50 %	0 %	532356650
19605	NC_022112	TGG	2	6	1238139	1238144	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	532356650
19606	NC_022112	TCA	2	6	1238147	1238152	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	532356650
19607	NC_022112	ACA	2	6	1238167	1238172	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	532356650
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19609	NC_022112	CTA	2	6	1238327	1238332	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	532356650
19610	NC_022112	ATT	2	6	1238364	1238369	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	532356650
19611	NC_022112	GATG	2	8	1238510	1238517	25 %	25 %	50 %	0 %	532356650
19612	NC_022112	ACAA	2	8	1238599	1238606	75 %	0 %	0 %	25 %	532356650
19613	NC_022112	TGA	3	9	1238659	1238667	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	532356650
19614	NC_022112	CAA	2	6	1238691	1238696	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	532356650
19615	NC_022112	AACGA	2	10	1238748	1238757	60 %	0 %	20 %	20 %	532356650
19616	NC_022112	ATCT	2	8	1238773	1238780	25 %	50 %	0 %	25 %	532356650
19617	NC_022112	AAG	2	6	1238866	1238871	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532356650
19618	NC_022112	GCTT	2	8	1238990	1238997	0 %	50 %	25 %	25 %	532356650
19619	NC_022112	ATG	2	6	1239046	1239051	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	532356650
19620	NC_022112	ATC	2	6	1239090	1239095	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	532356650
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19633	NC_022112	GCA	2	6	1239536	1239541	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	532356650
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19643	NC_022112	TGG	2	6	1240277	1240282	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	532356651
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19648	NC_022112	GGC	2	6	1240463	1240468	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	532356651
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19651	NC_022112	GACT	2	8	1240555	1240562	25 %	25 %	25 %	25 %	532356651
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19731	NC_022112	TGC	2	6	1244973	1244978	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	532356656
19732	NC_022112	TAT	2	6	1245117	1245122	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	532356656
19733	NC_022112	TTA	2	6	1245127	1245132	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	532356656
19734	NC_022112	CAT	2	6	1245153	1245158	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	532356656
19735	NC_022112	ACC	2	6	1245209	1245214	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	532356656
19736	NC_022112	GTT	2	6	1245243	1245248	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	532356656
19737	NC_022112	GAA	2	6	1245295	1245300	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532356656
19738	NC_022112	GTC	2	6	1245326	1245331	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	532356657
19739	NC_022112	CAG	2	6	1245375	1245380	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	532356657
19740	NC_022112	GAA	2	6	1245431	1245436	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532356657
19741	NC_022112	GAG	2	6	1245491	1245496	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	532356657
19742	NC_022112	GTT	2	6	1245581	1245586	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	532356657
19743	NC_022112	CATCG	2	10	1245614	1245623	20 %	20 %	20 %	40 %	532356657
19744	NC_022112	TG	3	6	1245705	1245710	0 %	50 %	50 %	0 %	532356657
19745	NC_022112	GGC	2	6	1245743	1245748	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	532356657
19746	NC_022112	GTT	2	6	1245785	1245790	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	532356657
19747	NC_022112	GACC	2	8	1245866	1245873	25 %	0 %	25 %	50 %	532356657
19748	NC_022112	ATT	2	6	1245946	1245951	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	532356657
19749	NC_022112	GGC	2	6	1246007	1246012	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	532356658
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19751	NC_022112	CGT	2	6	1246114	1246119	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	532356658
19752	NC_022112	ATC	2	6	1246139	1246144	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	532356658
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19754	NC_022112	TTG	2	6	1246220	1246225	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	532356658
19755	NC_022112	TACT	2	8	1246226	1246233	25 %	50 %	0 %	25 %	532356658
19756	NC_022112	GTT	2	6	1246280	1246285	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	532356658
19757	NC_022112	TTG	2	6	1246290	1246295	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	532356658
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19764	NC_022112	TGA	2	6	1246635	1246640	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	532356658
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19770	NC_022112	CTG	2	6	1247641	1247646	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	532356659
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19805	NC_022112	CGCT	2	8	1249349	1249356	0 %	25 %	25 %	50 %	532356661
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19830	NC_022112	A	6	6	1250626	1250631	100 %	0 %	0 %	0 %	532356662
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19834	NC_022112	GCG	2	6	1250825	1250830	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	532356662
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19839	NC_022112	T	6	6	1250959	1250964	0 %	100 %	0 %	0 %	532356662
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19842	NC_022112	GAA	2	6	1251182	1251187	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532356662
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19845	NC_022112	GGT	2	6	1251987	1251992	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	532356663
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19958	NC_022112	GGAA	2	8	1258645	1258652	50 %	0 %	50 %	0 %	532356670
19959	NC_022112	A	6	6	1258820	1258825	100 %	0 %	0 %	0 %	532356670
19960	NC_022112	TGGT	2	8	1258854	1258861	0 %	50 %	50 %	0 %	532356670
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19963	NC_022112	TGG	2	6	1259143	1259148	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	532356670
19964	NC_022112	ATG	2	6	1259172	1259177	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	532356670
19965	NC_022112	GGC	2	6	1259185	1259190	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	532356670
19966	NC_022112	TGA	2	6	1259311	1259316	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	532356670
19967	NC_022112	CCAT	2	8	1259321	1259328	25 %	25 %	0 %	50 %	532356670
19968	NC_022112	CGA	2	6	1259367	1259372	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	532356670
19969	NC_022112	TCA	4	12	1259434	1259445	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	532356670
19970	NC_022112	AGA	2	6	1259497	1259502	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532356670
19971	NC_022112	A	7	7	1259584	1259590	100 %	0 %	0 %	0 %	532356670
19972	NC_022112	TGA	2	6	1259628	1259633	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	532356670
19973	NC_022112	A	6	6	1259679	1259684	100 %	0 %	0 %	0 %	532356671
19974	NC_022112	GCA	2	6	1259715	1259720	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	532356671
19975	NC_022112	GC	3	6	1259728	1259733	0 %	0 %	50 %	50 %	532356671
19976	NC_022112	CAG	3	9	1259734	1259742	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	532356671
19977	NC_022112	CGC	2	6	1259744	1259749	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	532356671
19978	NC_022112	CGG	2	6	1259809	1259814	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	532356671
19979	NC_022112	CTG	2	6	1259854	1259859	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	532356671
19980	NC_022112	CAG	2	6	1259947	1259952	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	532356671
19981	NC_022112	GAT	3	9	1259977	1259985	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	532356671
19982	NC_022112	A	6	6	1260010	1260015	100 %	0 %	0 %	0 %	532356671
19983	NC_022112	GAA	2	6	1260180	1260185	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532356671
19984	NC_022112	T	6	6	1260218	1260223	0 %	100 %	0 %	0 %	532356671
19985	NC_022112	GAT	2	6	1260252	1260257	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	532356671
19986	NC_022112	TGC	2	6	1260263	1260268	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	532356671
19987	NC_022112	GTG	2	6	1260320	1260325	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	532356671
19988	NC_022112	ATGAAC	2	12	1260349	1260360	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	532356671
19989	NC_022112	TAT	2	6	1260412	1260417	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	532356671
19990	NC_022112	A	6	6	1260442	1260447	100 %	0 %	0 %	0 %	532356671
19991	NC_022112	GTC	2	6	1260504	1260509	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	532356671
19992	NC_022112	ACC	2	6	1260668	1260673	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	532356672
19993	NC_022112	TTG	2	6	1260687	1260692	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	532356672
19994	NC_022112	AATG	2	8	1260712	1260719	50 %	25 %	25 %	0 %	532356672
19995	NC_022112	GATC	2	8	1260841	1260848	25 %	25 %	25 %	25 %	532356672
19996	NC_022112	TGC	2	6	1260876	1260881	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	532356672
19997	NC_022112	GAT	2	6	1260901	1260906	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	532356672
19998	NC_022112	CGGT	2	8	1260909	1260916	0 %	25 %	50 %	25 %	532356672
19999	NC_022112	GGCAGC	2	12	1260958	1260969	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	532356672
20000	NC_022112	ACC	2	6	1260985	1260990	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	532356672

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