MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Lactobacillus paracasei subsp. paracasei 8700:2

Total Repeats: 47092

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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9002	NC_022112	GTGAA	2	10	569827	569836	40 %	20 %	40 %	0 %	532356011
9003	NC_022112	GAA	2	6	569844	569849	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532356011
9004	NC_022112	TGA	2	6	569857	569862	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	532356011
9005	NC_022112	GCT	2	6	569889	569894	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	532356011
9006	NC_022112	GAA	2	6	569900	569905	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532356011
9007	NC_022112	ATT	2	6	569937	569942	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	532356011
9008	NC_022112	TGG	2	6	569951	569956	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	532356011
9009	NC_022112	GAT	2	6	570030	570035	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	532356011
9010	NC_022112	TGAT	2	8	570061	570068	25 %	50 %	25 %	0 %	532356011
9011	NC_022112	GTC	2	6	570096	570101	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	532356011
9012	NC_022112	ATG	2	6	570127	570132	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	532356011
9013	NC_022112	GGAA	2	8	570170	570177	50 %	0 %	50 %	0 %	532356011
9014	NC_022112	AAG	2	6	570205	570210	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532356011
9015	NC_022112	GAT	2	6	570281	570286	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	532356011
9016	NC_022112	ATT	2	6	570291	570296	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	532356011
9017	NC_022112	ATT	2	6	570387	570392	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	532356011
9018	NC_022112	TTG	2	6	570433	570438	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	532356011
9019	NC_022112	TTG	2	6	570478	570483	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	532356011
9020	NC_022112	TAT	2	6	570485	570490	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	532356011
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9026	NC_022112	TCT	2	6	570730	570735	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532356011
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9033	NC_022112	CTT	2	6	571325	571330	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532356011
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9055	NC_022112	TGG	2	6	572623	572628	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	532356012
9056	NC_022112	TTG	2	6	572705	572710	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	532356012
9057	NC_022112	TGT	2	6	572769	572774	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	532356012
9058	NC_022112	GGC	2	6	572785	572790	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	532356012
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9064	NC_022112	GATT	2	8	573293	573300	25 %	50 %	25 %	0 %	532356013
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9102	NC_022112	T	6	6	575139	575144	0 %	100 %	0 %	0 %	532356014
9103	NC_022112	ATG	2	6	575149	575154	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	532356014
9104	NC_022112	AGC	2	6	575160	575165	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	532356014
9105	NC_022112	CGCT	2	8	575176	575183	0 %	25 %	25 %	50 %	532356014
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9109	NC_022112	TG	3	6	575500	575505	0 %	50 %	50 %	0 %	532356014
9110	NC_022112	TTTC	2	8	575507	575514	0 %	75 %	0 %	25 %	532356014
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9121	NC_022112	T	6	6	576164	576169	0 %	100 %	0 %	0 %	532356015
9122	NC_022112	AGC	2	6	576172	576177	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	532356015
9123	NC_022112	T	6	6	576184	576189	0 %	100 %	0 %	0 %	532356015
9124	NC_022112	AT	3	6	576226	576231	50 %	50 %	0 %	0 %	532356015
9125	NC_022112	GAC	2	6	576451	576456	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	532356015
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9129	NC_022112	GC	3	6	576611	576616	0 %	0 %	50 %	50 %	532356015
9130	NC_022112	GC	3	6	576657	576662	0 %	0 %	50 %	50 %	532356015
9131	NC_022112	TGGC	2	8	576783	576790	0 %	25 %	50 %	25 %	532356015
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9133	NC_022112	GAG	2	6	576848	576853	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	532356015
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9139	NC_022112	TGC	2	6	577336	577341	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	532356015
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9152	NC_022112	CGC	2	6	578166	578171	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	532356017
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9227	NC_022112	GAC	2	6	583339	583344	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	532356022
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9233	NC_022112	CAC	2	6	583786	583791	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	532356022
9234	NC_022112	GCTGA	2	10	583864	583873	20 %	20 %	40 %	20 %	532356022
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9237	NC_022112	CTG	2	6	583989	583994	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	532356022
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9241	NC_022112	GCC	2	6	584119	584124	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	532356022
9242	NC_022112	ATC	2	6	584165	584170	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	532356022
9243	NC_022112	AAGG	2	8	584254	584261	50 %	0 %	50 %	0 %	532356022
9244	NC_022112	CCA	2	6	584302	584307	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	532356022
9245	NC_022112	CAA	4	12	584349	584360	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	532356022
9246	NC_022112	ATG	2	6	584507	584512	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	532356022
9247	NC_022112	GCT	2	6	584617	584622	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	532356022
9248	NC_022112	CAT	2	6	585012	585017	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	532356023
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9251	NC_022112	AAG	2	6	585088	585093	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532356023
9252	NC_022112	AGC	2	6	585134	585139	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	532356023
9253	NC_022112	CAAA	2	8	585153	585160	75 %	0 %	0 %	25 %	532356023
9254	NC_022112	ACA	2	6	585199	585204	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	532356023
9255	NC_022112	CAG	2	6	585244	585249	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	532356023
9256	NC_022112	GCAA	2	8	585252	585259	50 %	0 %	25 %	25 %	532356023
9257	NC_022112	CAC	2	6	585278	585283	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	532356023
9258	NC_022112	AGC	3	9	585291	585299	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	532356023
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9260	NC_022112	CAA	2	6	585375	585380	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	532356023
9261	NC_022112	CAA	3	9	585393	585401	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	532356023
9262	NC_022112	A	7	7	585433	585439	100 %	0 %	0 %	0 %	532356023
9263	NC_022112	GCA	2	6	585450	585455	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	532356023
9264	NC_022112	CAG	2	6	585472	585477	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	532356023
9265	NC_022112	AGC	2	6	585584	585589	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	532356023
9266	NC_022112	CAGA	2	8	585601	585608	50 %	0 %	25 %	25 %	532356023
9267	NC_022112	AAG	2	6	585619	585624	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532356023
9268	NC_022112	CAA	2	6	585702	585707	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	532356023
9269	NC_022112	CGG	2	6	585806	585811	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	532356023
9270	NC_022112	CGAC	2	8	585848	585855	25 %	0 %	25 %	50 %	532356023
9271	NC_022112	CAG	2	6	585869	585874	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	532356023
9272	NC_022112	AGC	2	6	585964	585969	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	532356023
9273	NC_022112	ATG	2	6	586037	586042	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	532356023
9274	NC_022112	TGA	2	6	586083	586088	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	532356023
9275	NC_022112	CGA	3	9	586158	586166	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	532356023
9276	NC_022112	AGC	2	6	586272	586277	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	532356023
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9280	NC_022112	GAAT	2	8	586443	586450	50 %	25 %	25 %	0 %	532356023
9281	NC_022112	TTG	2	6	586583	586588	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	532356023
9282	NC_022112	TGC	2	6	586593	586598	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	532356023
9283	NC_022112	GCA	2	6	586704	586709	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	532356023
9284	NC_022112	GC	3	6	586725	586730	0 %	0 %	50 %	50 %	532356023
9285	NC_022112	GGTC	2	8	586887	586894	0 %	25 %	50 %	25 %	532356023
9286	NC_022112	CCAAA	2	10	586909	586918	60 %	0 %	0 %	40 %	532356023
9287	NC_022112	ATGAC	2	10	586925	586934	40 %	20 %	20 %	20 %	532356023
9288	NC_022112	CAA	2	6	586965	586970	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	532356023
9289	NC_022112	TGAA	2	8	587283	587290	50 %	25 %	25 %	0 %	532356024
9290	NC_022112	CGAA	2	8	587344	587351	50 %	0 %	25 %	25 %	532356024
9291	NC_022112	GCG	2	6	587387	587392	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	532356024
9292	NC_022112	TCA	2	6	587446	587451	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	532356024
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9295	NC_022112	A	6	6	587550	587555	100 %	0 %	0 %	0 %	532356024
9296	NC_022112	CTG	2	6	587647	587652	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	532356024
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9299	NC_022112	ATG	2	6	587852	587857	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	532356024
9300	NC_022112	GCT	2	6	587935	587940	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	532356024
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9302	NC_022112	CAT	2	6	588107	588112	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	532356024
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9312	NC_022112	CAGT	2	8	588652	588659	25 %	25 %	25 %	25 %	532356024
9313	NC_022112	AAT	2	6	588860	588865	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	532356024
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9318	NC_022112	ATG	2	6	589125	589130	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	532356024
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9322	NC_022112	AG	3	6	589632	589637	50 %	0 %	50 %	0 %	532356025
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9332	NC_022112	ACG	2	6	590282	590287	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	532356026
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9335	NC_022112	TGA	2	6	590385	590390	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	532356026
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9339	NC_022112	AATCAG	2	12	590575	590586	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	532356027
9340	NC_022112	GCT	2	6	590596	590601	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	532356027
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9349	NC_022112	CTG	2	6	590912	590917	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	532356027
9350	NC_022112	AGTT	2	8	590944	590951	25 %	50 %	25 %	0 %	532356027
9351	NC_022112	GAC	2	6	590962	590967	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	532356027
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9354	NC_022112	GAT	2	6	591031	591036	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	532356027
9355	NC_022112	AAG	2	6	591075	591080	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532356027
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9357	NC_022112	CTG	2	6	591162	591167	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	532356027
9358	NC_022112	GCC	2	6	591181	591186	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	532356027
9359	NC_022112	AGC	2	6	591203	591208	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	532356027
9360	NC_022112	GAAAA	2	10	591299	591308	80 %	0 %	20 %	0 %	532356027
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9362	NC_022112	CAA	2	6	591331	591336	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	532356027
9363	NC_022112	TAA	2	6	591348	591353	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	532356027
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9367	NC_022112	TGA	2	6	591586	591591	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	532356028
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9459	NC_022112	CTG	2	6	599246	599251	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	532356034
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9479	NC_022112	GCA	2	6	600065	600070	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	532356035
9480	NC_022112	AGC	2	6	600076	600081	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	532356035
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9483	NC_022112	ATG	2	6	601718	601723	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	532356036
9484	NC_022112	ATT	2	6	601747	601752	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	532356036
9485	NC_022112	TAA	2	6	601852	601857	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	532356036
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