MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Lactobacillus paracasei subsp. paracasei 8700:2

Total Repeats: 47092

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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8002	NC_022112	CCTT	2	8	508808	508815	0 %	50 %	0 %	50 %	532355971
8003	NC_022112	AAC	2	6	508834	508839	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	532355971
8004	NC_022112	CTA	2	6	508967	508972	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	532355971
8005	NC_022112	TTG	2	6	508973	508978	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	532355971
8006	NC_022112	ATC	2	6	509032	509037	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	532355971
8007	NC_022112	GCT	2	6	509060	509065	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	532355971
8008	NC_022112	TGG	2	6	509076	509081	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	532355971
8009	NC_022112	GTC	2	6	509138	509143	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	532355971
8010	NC_022112	CCTT	2	8	509183	509190	0 %	50 %	0 %	50 %	532355971
8011	NC_022112	CAA	2	6	509223	509228	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	532355971
8012	NC_022112	GTC	2	6	509233	509238	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	532355971
8013	NC_022112	TCG	2	6	509292	509297	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	532355971
8014	NC_022112	TCA	2	6	509324	509329	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	532355971
8015	NC_022112	TCA	2	6	509345	509350	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	532355971
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8017	NC_022112	ACT	2	6	509381	509386	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	532355971
8018	NC_022112	GCT	2	6	509408	509413	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	532355971
8019	NC_022112	GTG	2	6	509432	509437	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	532355971
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8021	NC_022112	GGT	2	6	509476	509481	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	532355971
8022	NC_022112	TG	3	6	509486	509491	0 %	50 %	50 %	0 %	532355971
8023	NC_022112	TCA	2	6	509597	509602	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	532355971
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8029	NC_022112	CAT	2	6	509802	509807	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	532355971
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8032	NC_022112	TGC	2	6	509989	509994	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	532355971
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8039	NC_022112	CAT	2	6	510183	510188	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	532355971
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8043	NC_022112	GCATG	2	10	510340	510349	20 %	20 %	40 %	20 %	532355971
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8048	NC_022112	GCA	2	6	510614	510619	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	532355971
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8052	NC_022112	TGA	2	6	510750	510755	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	532355971
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8054	NC_022112	GTTTT	2	10	511055	511064	0 %	80 %	20 %	0 %	532355971
8055	NC_022112	TGC	2	6	511083	511088	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	532355971
8056	NC_022112	TTACC	2	10	511128	511137	20 %	40 %	0 %	40 %	532355971
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8060	NC_022112	GATT	2	8	511528	511535	25 %	50 %	25 %	0 %	532355971
8061	NC_022112	TGC	2	6	511557	511562	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	532355971
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8105	NC_022112	CAT	2	6	513778	513783	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	532355971
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8107	NC_022112	TCT	2	6	514465	514470	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532355972
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8110	NC_022112	CGT	2	6	514591	514596	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	532355972
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8116	NC_022112	T	7	7	514861	514867	0 %	100 %	0 %	0 %	532355972
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8120	NC_022112	GAA	2	6	515019	515024	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532355972
8121	NC_022112	AGC	2	6	515036	515041	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	532355972
8122	NC_022112	TTC	2	6	515045	515050	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532355972
8123	NC_022112	GCT	2	6	515060	515065	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	532355972
8124	NC_022112	GTCA	2	8	515126	515133	25 %	25 %	25 %	25 %	532355972
8125	NC_022112	TCA	2	6	515169	515174	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	532355972
8126	NC_022112	GCT	2	6	515214	515219	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	532355972
8127	NC_022112	CAT	2	6	515224	515229	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	532355972
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8131	NC_022112	TCA	2	6	515403	515408	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	532355972
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8135	NC_022112	GTCA	2	8	515723	515730	25 %	25 %	25 %	25 %	532355972
8136	NC_022112	CGCCGT	2	12	515731	515742	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	532355972
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8139	NC_022112	GTTC	2	8	515960	515967	0 %	50 %	25 %	25 %	532355972
8140	NC_022112	GCCT	2	8	515975	515982	0 %	25 %	25 %	50 %	532355972
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8143	NC_022112	TGC	2	6	516043	516048	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	532355972
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8148	NC_022112	GAAG	2	8	516211	516218	50 %	0 %	50 %	0 %	532355972
8149	NC_022112	TTCTT	2	10	516276	516285	0 %	80 %	0 %	20 %	532355972
8150	NC_022112	CTG	2	6	516325	516330	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	532355972
8151	NC_022112	CAT	2	6	516442	516447	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	532355972
8152	NC_022112	CTA	2	6	516472	516477	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	532355972
8153	NC_022112	TGT	2	6	516487	516492	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	532355972
8154	NC_022112	TTG	2	6	516520	516525	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	532355972
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8158	NC_022112	CTT	2	6	516813	516818	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532355972
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8161	NC_022112	GCT	2	6	517049	517054	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	532355972
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8209	NC_022112	GCTGG	2	10	519611	519620	0 %	20 %	60 %	20 %	532355972
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8225	NC_022112	CAAAC	2	10	521000	521009	60 %	0 %	0 %	40 %	532355973
8226	NC_022112	CTTTG	2	10	521018	521027	0 %	60 %	20 %	20 %	532355973
8227	NC_022112	CCTC	2	8	521194	521201	0 %	25 %	0 %	75 %	532355973
8228	NC_022112	GTG	2	6	521279	521284	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	532355973
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8231	NC_022112	ATG	2	6	521319	521324	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	532355973
8232	NC_022112	CCG	2	6	521458	521463	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	532355973
8233	NC_022112	CGA	2	6	521543	521548	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	532355973
8234	NC_022112	GGCT	2	8	521558	521565	0 %	25 %	50 %	25 %	532355973
8235	NC_022112	TGG	2	6	521713	521718	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	532355973
8236	NC_022112	TTC	2	6	521748	521753	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532355973
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8238	NC_022112	CAA	2	6	521909	521914	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	532355973
8239	NC_022112	TGA	2	6	521947	521952	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	532355973
8240	NC_022112	GCT	2	6	522020	522025	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	532355973
8241	NC_022112	TGC	2	6	522067	522072	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	532355973
8242	NC_022112	TGC	2	6	522080	522085	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	532355973
8243	NC_022112	GAA	2	6	522137	522142	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532355973
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8245	NC_022112	TGA	2	6	522242	522247	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	532355973
8246	NC_022112	TGA	2	6	522254	522259	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	532355973
8247	NC_022112	GTT	2	6	522335	522340	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	532355973
8248	NC_022112	TGAAG	2	10	522404	522413	40 %	20 %	40 %	0 %	532355973
8249	NC_022112	GCT	2	6	522443	522448	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	532355973
8250	NC_022112	GCT	2	6	522633	522638	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	532355973
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8321	NC_022112	TATCA	2	10	526977	526986	40 %	40 %	0 %	20 %	532355978
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8328	NC_022112	TGA	2	6	527378	527383	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	532355978
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8340	NC_022112	TGA	2	6	528402	528407	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	532355979
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8350	NC_022112	CGC	2	6	529014	529019	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	532355980
8351	NC_022112	GCG	2	6	529039	529044	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	532355980
8352	NC_022112	GCA	2	6	529132	529137	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	532355980
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8358	NC_022112	AGC	2	6	529401	529406	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	532355980
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8360	NC_022112	T	6	6	529790	529795	0 %	100 %	0 %	0 %	532355981
8361	NC_022112	GCACTG	2	12	529803	529814	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	532355981
8362	NC_022112	CAA	2	6	529896	529901	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	532355981
8363	NC_022112	GCG	2	6	529947	529952	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	532355981
8364	NC_022112	TCT	2	6	530053	530058	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532355981
8365	NC_022112	CAT	2	6	530066	530071	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	532355981
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8367	NC_022112	TCT	2	6	530198	530203	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532355981
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8369	NC_022112	GGC	2	6	530253	530258	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	532355981
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8374	NC_022112	TGCCAT	2	12	530324	530335	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	532355981
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8380	NC_022112	AAAG	2	8	530598	530605	75 %	0 %	25 %	0 %	532355981
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8384	NC_022112	CAA	2	6	530746	530751	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	532355981
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8393	NC_022112	GGT	2	6	531204	531209	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	532355982
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8470	NC_022112	GACA	2	8	535543	535550	50 %	0 %	25 %	25 %	532355986
8471	NC_022112	AAG	2	6	535596	535601	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532355986
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8479	NC_022112	ATA	2	6	535983	535988	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	532355986
8480	NC_022112	TGC	3	9	536116	536124	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	532355986
8481	NC_022112	CCA	2	6	536148	536153	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	532355986
8482	NC_022112	ATT	2	6	536364	536369	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	532355987
8483	NC_022112	GGC	2	6	536581	536586	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	532355987
8484	NC_022112	T	6	6	536677	536682	0 %	100 %	0 %	0 %	532355987
8485	NC_022112	GCA	2	6	536690	536695	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	532355987
8486	NC_022112	CAA	2	6	536715	536720	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	532355987
8487	NC_022112	GTG	2	6	536807	536812	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	532355987
8488	NC_022112	CTG	2	6	537086	537091	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	532355987
8489	NC_022112	AACG	2	8	537121	537128	50 %	0 %	25 %	25 %	532355987
8490	NC_022112	CAA	2	6	537138	537143	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	532355987
8491	NC_022112	TAA	2	6	537148	537153	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	532355987
8492	NC_022112	CGTGA	2	10	537243	537252	20 %	20 %	40 %	20 %	532355988
8493	NC_022112	AAAGC	2	10	537304	537313	60 %	0 %	20 %	20 %	532355988
8494	NC_022112	AAT	2	6	537330	537335	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	532355988
8495	NC_022112	CAG	2	6	537349	537354	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	532355988
8496	NC_022112	CTG	2	6	537359	537364	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	532355988
8497	NC_022112	CGA	2	6	537382	537387	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	532355988
8498	NC_022112	GCC	2	6	537399	537404	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	532355988
8499	NC_022112	CAG	2	6	537554	537559	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	532355988
8500	NC_022112	CGC	2	6	537560	537565	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	532355988

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