MICAS: Microsatellite Analysis Server

All Coding Repeats of Listeria monocytogenes strain J1926 plasmid

Total Repeats: 1107

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1001	NC_022051	A	7	7	48506	48512	100 %	0 %	0 %	0 %	530341513
1002	NC_022051	AAG	2	6	48534	48539	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	530341513
1003	NC_022051	TGA	2	6	48622	48627	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	530341513
1004	NC_022051	ATT	2	6	48640	48645	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	530341513
1005	NC_022051	CGA	2	6	48670	48675	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	530341513
1006	NC_022051	CTA	2	6	48711	48716	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	530341513
1007	NC_022051	CAAT	2	8	48786	48793	50 %	25 %	0 %	25 %	530341513
1008	NC_022051	GATG	2	8	48816	48823	25 %	25 %	50 %	0 %	530341513
1009	NC_022051	TGG	2	6	48910	48915	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	530341513
1010	NC_022051	ACT	2	6	48946	48951	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	530341513
1011	NC_022051	A	6	6	49001	49006	100 %	0 %	0 %	0 %	530341513
1012	NC_022051	AAT	2	6	49031	49036	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	530341513
1013	NC_022051	ACA	2	6	49074	49079	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	530341513
1014	NC_022051	CAA	2	6	49195	49200	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	530341513
1015	NC_022051	TA	3	6	49230	49235	50 %	50 %	0 %	0 %	530341513
1016	NC_022051	A	6	6	49235	49240	100 %	0 %	0 %	0 %	530341513
1017	NC_022051	TAG	2	6	49276	49281	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	530341513
1018	NC_022051	ATG	2	6	49283	49288	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	530341513
1019	NC_022051	CTT	2	6	49421	49426	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	530341513
1020	NC_022051	AT	3	6	49467	49472	50 %	50 %	0 %	0 %	530341513
1021	NC_022051	ATG	2	6	49493	49498	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	530341513
1022	NC_022051	GAA	2	6	49571	49576	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	530341459
1023	NC_022051	A	6	6	49575	49580	100 %	0 %	0 %	0 %	530341459
1024	NC_022051	ATT	2	6	49617	49622	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	530341459
1025	NC_022051	AAT	2	6	49673	49678	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	530341459
1026	NC_022051	TGTA	2	8	49729	49736	25 %	50 %	25 %	0 %	530341459
1027	NC_022051	TGA	2	6	49789	49794	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	530341459
1028	NC_022051	GAT	2	6	49796	49801	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	530341459
1029	NC_022051	TAA	2	6	49918	49923	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	530341459
1030	NC_022051	ATA	2	6	49935	49940	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	530341459
1031	NC_022051	TAG	2	6	49963	49968	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	530341459
1032	NC_022051	ACA	2	6	50003	50008	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	530341459
1033	NC_022051	TAA	2	6	50047	50052	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	530341459
1034	NC_022051	A	6	6	50134	50139	100 %	0 %	0 %	0 %	530341459
1035	NC_022051	ATG	2	6	50160	50165	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	530341459
1036	NC_022051	TGG	2	6	50215	50220	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	530341459
1037	NC_022051	TAA	2	6	50285	50290	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	530341514
1038	NC_022051	TTAGT	2	10	50300	50309	20 %	60 %	20 %	0 %	530341514
1039	NC_022051	AAG	2	6	50360	50365	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	530341514
1040	NC_022051	TTG	2	6	50368	50373	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	530341514
1041	NC_022051	GTAT	2	8	50379	50386	25 %	50 %	25 %	0 %	530341514
1042	NC_022051	GAA	2	6	50434	50439	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	530341514
1043	NC_022051	GCA	2	6	50443	50448	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	530341514
1044	NC_022051	AAT	2	6	50470	50475	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	530341514
1045	NC_022051	ATTT	2	8	50476	50483	25 %	75 %	0 %	0 %	530341514
1046	NC_022051	AGA	2	6	50490	50495	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	530341514
1047	NC_022051	A	8	8	50560	50567	100 %	0 %	0 %	0 %	530341514
1048	NC_022051	TTAA	2	8	50632	50639	50 %	50 %	0 %	0 %	530341514
1049	NC_022051	TAT	2	6	50671	50676	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	530341514
1050	NC_022051	ATGT	2	8	50740	50747	25 %	50 %	25 %	0 %	530341514
1051	NC_022051	CTT	2	6	50761	50766	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	530341514
1052	NC_022051	TCAT	2	8	50770	50777	25 %	50 %	0 %	25 %	530341514
1053	NC_022051	ATT	2	6	50890	50895	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	530341514
1054	NC_022051	AAAT	2	8	50897	50904	75 %	25 %	0 %	0 %	530341514
1055	NC_022051	GGAA	2	8	51030	51037	50 %	0 %	50 %	0 %	530341514
1056	NC_022051	CAA	2	6	51135	51140	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	530341514
1057	NC_022051	TAAA	2	8	51164	51171	75 %	25 %	0 %	0 %	530341514
1058	NC_022051	AT	3	6	51184	51189	50 %	50 %	0 %	0 %	530341514
1059	NC_022051	TTGA	2	8	51193	51200	25 %	50 %	25 %	0 %	530341514
1060	NC_022051	A	6	6	51237	51242	100 %	0 %	0 %	0 %	530341514
1061	NC_022051	AT	3	6	51275	51280	50 %	50 %	0 %	0 %	530341514
1062	NC_022051	AGATAA	2	12	51285	51296	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	530341514
1063	NC_022051	GTT	2	6	51307	51312	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	530341514
1064	NC_022051	AAT	2	6	51325	51330	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	530341514
1065	NC_022051	AGG	2	6	51350	51355	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	530341514
1066	NC_022051	TTG	2	6	51404	51409	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	530341514
1067	NC_022051	G	6	6	51499	51504	0 %	0 %	100 %	0 %	530341514
1068	NC_022051	GTT	2	6	51535	51540	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	530341514
1069	NC_022051	GTA	2	6	51554	51559	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	530341514
1070	NC_022051	A	8	8	51686	51693	100 %	0 %	0 %	0 %	530341515
1071	NC_022051	T	6	6	51696	51701	0 %	100 %	0 %	0 %	530341515
1072	NC_022051	GATA	2	8	51713	51720	50 %	25 %	25 %	0 %	530341515
1073	NC_022051	GTA	2	6	51759	51764	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	530341515
1074	NC_022051	AAG	2	6	51774	51779	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	530341515
1075	NC_022051	A	6	6	51801	51806	100 %	0 %	0 %	0 %	530341515
1076	NC_022051	GAT	2	6	51880	51885	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	530341516
1077	NC_022051	ATT	2	6	51911	51916	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	530341516
1078	NC_022051	AAT	2	6	51953	51958	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	530341516
1079	NC_022051	GAAT	2	8	52020	52027	50 %	25 %	25 %	0 %	530341516
1080	NC_022051	CTT	2	6	52044	52049	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	530341516
1081	NC_022051	TGC	2	6	52060	52065	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	530341516
1082	NC_022051	TAC	2	6	52162	52167	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	530341516
1083	NC_022051	ATC	2	6	52218	52223	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	530341516
1084	NC_022051	GTA	2	6	52229	52234	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	530341516
1085	NC_022051	ATGG	2	8	52304	52311	25 %	25 %	50 %	0 %	530341516
1086	NC_022051	GAT	2	6	52312	52317	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	530341516
1087	NC_022051	GTT	2	6	52364	52369	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	530341516
1088	NC_022051	AAG	3	9	52392	52400	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	530341516
1089	NC_022051	AGATG	2	10	52426	52435	40 %	20 %	40 %	0 %	530341516
1090	NC_022051	AAT	2	6	52448	52453	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	530341516
1091	NC_022051	TTA	2	6	52781	52786	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	530341517
1092	NC_022051	TATT	2	8	52850	52857	25 %	75 %	0 %	0 %	530341517
1093	NC_022051	CTT	2	6	52870	52875	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	530341517
1094	NC_022051	A	6	6	52922	52927	100 %	0 %	0 %	0 %	530341517
1095	NC_022051	AGG	2	6	52958	52963	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	530341517
1096	NC_022051	TCG	2	6	52997	53002	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	530341517
1097	NC_022051	TTTG	2	8	53205	53212	0 %	75 %	25 %	0 %	530341518
1098	NC_022051	CGA	2	6	53366	53371	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	530341518
1099	NC_022051	T	6	6	53427	53432	0 %	100 %	0 %	0 %	530341518
1100	NC_022051	T	7	7	53575	53581	0 %	100 %	0 %	0 %	530341519
1101	NC_022051	TTC	2	6	53588	53593	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	530341519
1102	NC_022051	GA	3	6	53630	53635	50 %	0 %	50 %	0 %	530341519
1103	NC_022051	CGTA	2	8	53704	53711	25 %	25 %	25 %	25 %	530341519
1104	NC_022051	TA	3	6	53830	53835	50 %	50 %	0 %	0 %	530341519
1105	NC_022051	TCT	3	9	53873	53881	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	530341519
1106	NC_022051	TTC	3	9	53896	53904	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	530341519
1107	NC_022051	GAA	2	6	53905	53910	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	530341519

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