MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Listeria monocytogenes strain N1-011A plasmid

Total Repeats: 2987

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
2001	NC_022045	ATGG	2	8	96752	96759	25 %	25 %	50 %	0 %	530313981
2002	NC_022045	TCA	2	6	96796	96801	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	530313981
2003	NC_022045	CTT	2	6	96802	96807	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	530313981
2004	NC_022045	TTCT	2	8	96878	96885	0 %	75 %	0 %	25 %	530313981
2005	NC_022045	TTC	2	6	96911	96916	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	530313981
2006	NC_022045	CTT	2	6	96946	96951	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	530313981
2007	NC_022045	TGT	2	6	96971	96976	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	530313981
2008	NC_022045	ACA	2	6	96978	96983	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	530313981
2009	NC_022045	ATC	2	6	96986	96991	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	530313981
2010	NC_022045	TCT	3	9	97167	97175	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	530313981
2011	NC_022045	TCC	2	6	97212	97217	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	530313982
2012	NC_022045	TAAT	2	8	97218	97225	50 %	50 %	0 %	0 %	530313982
2013	NC_022045	T	7	7	97231	97237	0 %	100 %	0 %	0 %	530313982
2014	NC_022045	ATT	2	6	97244	97249	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	530313982
2015	NC_022045	T	6	6	97273	97278	0 %	100 %	0 %	0 %	530313982
2016	NC_022045	T	7	7	97338	97344	0 %	100 %	0 %	0 %	530313982
2017	NC_022045	AAT	2	6	97352	97357	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	530313982
2018	NC_022045	A	6	6	97379	97384	100 %	0 %	0 %	0 %	530313982
2019	NC_022045	GATC	2	8	97423	97430	25 %	25 %	25 %	25 %	530313982
2020	NC_022045	TAA	2	6	97439	97444	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	530313982
2021	NC_022045	ATC	2	6	97449	97454	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	530313982
2022	NC_022045	AAT	2	6	97532	97537	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	530313982
2023	NC_022045	TCA	2	6	97599	97604	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	530313982
2024	NC_022045	ATC	2	6	97622	97627	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	530313982
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2028	NC_022045	CGT	2	6	97761	97766	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	530313982
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2030	NC_022045	T	6	6	97842	97847	0 %	100 %	0 %	0 %	530313982
2031	NC_022045	TCG	2	6	97951	97956	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	530313982
2032	NC_022045	T	7	7	97959	97965	0 %	100 %	0 %	0 %	530313982
2033	NC_022045	T	7	7	97998	98004	0 %	100 %	0 %	0 %	530313982
2034	NC_022045	TCC	2	6	98038	98043	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	530313983
2035	NC_022045	TAAA	2	8	98112	98119	75 %	25 %	0 %	0 %	530313983
2036	NC_022045	ATA	2	6	98202	98207	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	530313983
2037	NC_022045	ATC	2	6	98263	98268	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	530313983
2038	NC_022045	A	6	6	98271	98276	100 %	0 %	0 %	0 %	530313983
2039	NC_022045	AT	4	8	98286	98293	50 %	50 %	0 %	0 %	530313983
2040	NC_022045	T	6	6	98296	98301	0 %	100 %	0 %	0 %	530313983
2041	NC_022045	CCT	2	6	98376	98381	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	530313984
2042	NC_022045	TTC	2	6	98400	98405	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	530313984
2043	NC_022045	CTA	2	6	98430	98435	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	530313984
2044	NC_022045	TTC	2	6	98448	98453	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	530313984
2045	NC_022045	CAC	2	6	98504	98509	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	530313984
2046	NC_022045	TTG	2	6	98609	98614	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	530313984
2047	NC_022045	TGGT	2	8	98617	98624	0 %	50 %	50 %	0 %	530313984
2048	NC_022045	TGG	2	6	98666	98671	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	530313984
2049	NC_022045	CTC	3	9	98686	98694	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	530313984
2050	NC_022045	TCA	2	6	98728	98733	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	530313984
2051	NC_022045	CTA	2	6	98745	98750	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	530313984
2052	NC_022045	GTT	2	6	98787	98792	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	530313984
2053	NC_022045	GTA	2	6	98895	98900	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	530313984
2054	NC_022045	TTTG	2	8	98910	98917	0 %	75 %	25 %	0 %	530313984
2055	NC_022045	TTA	2	6	98922	98927	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	530313984
2056	NC_022045	TCA	2	6	98952	98957	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	530313984
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2058	NC_022045	CTT	2	6	99145	99150	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	530313984
2059	NC_022045	ACC	2	6	99173	99178	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	530313984
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2061	NC_022045	TC	3	6	99196	99201	0 %	50 %	0 %	50 %	530313984
2062	NC_022045	CTTTT	2	10	99206	99215	0 %	80 %	0 %	20 %	530313984
2063	NC_022045	CAG	2	6	99217	99222	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	530313984
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2066	NC_022045	CTTT	2	8	99273	99280	0 %	75 %	0 %	25 %	530313984
2067	NC_022045	CCG	2	6	99340	99345	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	530313984
2068	NC_022045	CGA	2	6	99375	99380	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	530313984
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2070	NC_022045	CTG	2	6	99451	99456	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	530313984
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2094	NC_022045	TACA	2	8	100310	100317	50 %	25 %	0 %	25 %	530313984
2095	NC_022045	TAG	2	6	100331	100336	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	530313984
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2098	NC_022045	CAT	2	6	100487	100492	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	530313984
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2101	NC_022045	TGCT	2	8	100597	100604	0 %	50 %	25 %	25 %	530313985
2102	NC_022045	TTG	3	9	100661	100669	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	530313985
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2107	NC_022045	TGCGC	2	10	100783	100792	0 %	20 %	40 %	40 %	530313985
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2110	NC_022045	GATT	2	8	100815	100822	25 %	50 %	25 %	0 %	530313985
2111	NC_022045	GAT	2	6	100830	100835	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	530313985
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2113	NC_022045	GCAT	2	8	100869	100876	25 %	25 %	25 %	25 %	530313985
2114	NC_022045	CCT	2	6	100936	100941	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	530313985
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2117	NC_022045	ATTCAT	2	12	101215	101226	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	530313985
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2121	NC_022045	TTTG	2	8	101495	101502	0 %	75 %	25 %	0 %	530313985
2122	NC_022045	ATTTG	2	10	101558	101567	20 %	60 %	20 %	0 %	530313985
2123	NC_022045	T	6	6	101640	101645	0 %	100 %	0 %	0 %	530313985
2124	NC_022045	GGT	2	6	101696	101701	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	530313985
2125	NC_022045	GAT	2	6	101727	101732	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	530313985
2126	NC_022045	GAT	3	9	101767	101775	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	530313985
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2128	NC_022045	TG	3	6	101923	101928	0 %	50 %	50 %	0 %	530313985
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2360	NC_022045	AAAAG	2	10	113146	113155	80 %	0 %	20 %	0 %	530314001
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2482	NC_022045	TAAA	2	8	118052	118059	75 %	25 %	0 %	0 %	530314007
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2484	NC_022045	ATA	2	6	118109	118114	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	530314007
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2489	NC_022045	ATAAA	2	10	118837	118846	80 %	20 %	0 %	0 %	530314008
2490	NC_022045	CT	3	6	118876	118881	0 %	50 %	0 %	50 %	530314008
2491	NC_022045	TTTTC	2	10	119101	119110	0 %	80 %	0 %	20 %	530314008
2492	NC_022045	TTTG	2	8	119118	119125	0 %	75 %	25 %	0 %	530314008
2493	NC_022045	T	6	6	119141	119146	0 %	100 %	0 %	0 %	530314008
2494	NC_022045	TA	3	6	119154	119159	50 %	50 %	0 %	0 %	530314008
2495	NC_022045	AGTA	2	8	119185	119192	50 %	25 %	25 %	0 %	530314008
2496	NC_022045	AAT	2	6	119237	119242	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	530314008
2497	NC_022045	TTC	2	6	119275	119280	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	530314008
2498	NC_022045	ACTA	2	8	120211	120218	50 %	25 %	0 %	25 %	530314009
2499	NC_022045	TGT	2	6	120372	120377	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	530314009
2500	NC_022045	CTT	2	6	120415	120420	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	530314009

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