MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Lactobacillus reuteri TD1

Total Repeats: 40052

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
3501	NC_021872	GTA	2	6	191343	191348	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	526230839
3502	NC_021872	AGA	2	6	191434	191439	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	526230840
3503	NC_021872	AAAGA	2	10	191444	191453	80 %	0 %	20 %	0 %	526230840
3504	NC_021872	TAA	2	6	191614	191619	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	526230840
3505	NC_021872	GTT	2	6	191660	191665	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	526230840
3506	NC_021872	TGA	2	6	191671	191676	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	526230840
3507	NC_021872	ATC	2	6	191712	191717	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	526230840
3508	NC_021872	ACA	2	6	191930	191935	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	526230840
3509	NC_021872	CAG	2	6	192008	192013	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	526230840
3510	NC_021872	ATGT	2	8	192044	192051	25 %	50 %	25 %	0 %	526230840
3511	NC_021872	ATG	2	6	192111	192116	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	526230840
3512	NC_021872	CGG	2	6	192135	192140	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	526230840
3513	NC_021872	TTA	2	6	192173	192178	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	526230840
3514	NC_021872	TTA	2	6	192195	192200	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	526230840
3515	NC_021872	ATC	2	6	192204	192209	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	526230840
3516	NC_021872	TAG	2	6	192219	192224	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	526230840
3517	NC_021872	TTC	2	6	192256	192261	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	526230840
3518	NC_021872	CTT	2	6	192383	192388	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	526230840
3519	NC_021872	A	7	7	192394	192400	100 %	0 %	0 %	0 %	526230840
3520	NC_021872	GAA	2	6	192407	192412	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	526230840
3521	NC_021872	ATG	2	6	192498	192503	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	526230840
3522	NC_021872	GAA	2	6	192506	192511	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	526230840
3523	NC_021872	AGA	3	9	192553	192561	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	526230840
3524	NC_021872	A	7	7	192570	192576	100 %	0 %	0 %	0 %	526230840
3525	NC_021872	GAATT	2	10	192585	192594	40 %	40 %	20 %	0 %	526230840
3526	NC_021872	CAAC	2	8	192605	192612	50 %	0 %	0 %	50 %	526230840
3527	NC_021872	CTTG	2	8	192655	192662	0 %	50 %	25 %	25 %	526230840
3528	NC_021872	AGT	2	6	192686	192691	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	526230840
3529	NC_021872	CGGT	2	8	192811	192818	0 %	25 %	50 %	25 %	526230840
3530	NC_021872	TGG	2	6	192841	192846	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	526230840
3531	NC_021872	ACTG	2	8	192911	192918	25 %	25 %	25 %	25 %	526230840
3532	NC_021872	TCA	2	6	192964	192969	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	526230840
3533	NC_021872	TA	3	6	193038	193043	50 %	50 %	0 %	0 %	526230840
3534	NC_021872	GCAA	2	8	193057	193064	50 %	0 %	25 %	25 %	526230840
3535	NC_021872	TGGT	2	8	193089	193096	0 %	50 %	50 %	0 %	526230840
3536	NC_021872	TGA	2	6	193177	193182	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	526230840
3537	NC_021872	A	6	6	193203	193208	100 %	0 %	0 %	0 %	526230840
3538	NC_021872	TGA	2	6	193209	193214	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	526230840
3539	NC_021872	TCA	2	6	193261	193266	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	526230840
3540	NC_021872	AT	3	6	193267	193272	50 %	50 %	0 %	0 %	526230840
3541	NC_021872	GAC	2	6	193285	193290	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	526230840
3542	NC_021872	CAGC	2	8	193406	193413	25 %	0 %	25 %	50 %	526230840
3543	NC_021872	A	6	6	193593	193598	100 %	0 %	0 %	0 %	526230840
3544	NC_021872	GAG	2	6	193604	193609	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	526230840
3545	NC_021872	GAA	2	6	193645	193650	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	526230841
3546	NC_021872	AAG	2	6	193733	193738	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	526230841
3547	NC_021872	TTG	2	6	193795	193800	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	526230841
3548	NC_021872	CCTT	2	8	193910	193917	0 %	50 %	0 %	50 %	526230841
3549	NC_021872	ATG	2	6	193928	193933	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	526230841
3550	NC_021872	TCG	2	6	193983	193988	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	526230841
3551	NC_021872	AT	3	6	194061	194066	50 %	50 %	0 %	0 %	526230841
3552	NC_021872	GAA	2	6	194091	194096	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	526230841
3553	NC_021872	TGG	2	6	194115	194120	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	526230841
3554	NC_021872	CTAT	2	8	194127	194134	25 %	50 %	0 %	25 %	526230841
3555	NC_021872	TGT	2	6	194220	194225	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	526230841
3556	NC_021872	ATT	2	6	194251	194256	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	526230841
3557	NC_021872	TAA	2	6	194294	194299	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	526230841
3558	NC_021872	TAT	2	6	194397	194402	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	526230841
3559	NC_021872	CTG	2	6	194510	194515	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	526230841
3560	NC_021872	GAA	2	6	194530	194535	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	526230841
3561	NC_021872	TAA	2	6	194561	194566	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	526230841
3562	NC_021872	CAAC	2	8	194596	194603	50 %	0 %	0 %	50 %	526230841
3563	NC_021872	GTA	2	6	194677	194682	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	526230841
3564	NC_021872	CGA	2	6	194685	194690	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	526230841
3565	NC_021872	AAC	2	6	194706	194711	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	526230841
3566	NC_021872	AAG	2	6	194753	194758	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	526230841
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3568	NC_021872	GCT	2	6	194839	194844	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	526230841
3569	NC_021872	GAA	2	6	194857	194862	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	526230841
3570	NC_021872	T	6	6	194895	194900	0 %	100 %	0 %	0 %	526230841
3571	NC_021872	TGG	2	6	194958	194963	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	526230841
3572	NC_021872	CGC	2	6	194999	195004	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	526230841
3573	NC_021872	GAA	2	6	195016	195021	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	526230841
3574	NC_021872	G	6	6	195197	195202	0 %	0 %	100 %	0 %	526230842
3575	NC_021872	CAA	2	6	195287	195292	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	526230842
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3578	NC_021872	ATG	2	6	195342	195347	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	526230842
3579	NC_021872	TGG	2	6	195478	195483	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	526230842
3580	NC_021872	CAG	2	6	195489	195494	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	526230842
3581	NC_021872	AGA	2	6	195562	195567	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	526230842
3582	NC_021872	CTT	2	6	195569	195574	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	526230842
3583	NC_021872	GCT	2	6	195578	195583	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	526230842
3584	NC_021872	CTA	2	6	195747	195752	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	526230842
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3586	NC_021872	GATT	2	8	195828	195835	25 %	50 %	25 %	0 %	526230842
3587	NC_021872	TGAT	2	8	195876	195883	25 %	50 %	25 %	0 %	526230842
3588	NC_021872	AGG	2	6	195931	195936	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	526230842
3589	NC_021872	AGG	2	6	195945	195950	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	526230842
3590	NC_021872	A	6	6	196093	196098	100 %	0 %	0 %	0 %	526230842
3591	NC_021872	AGCAC	2	10	196174	196183	40 %	0 %	20 %	40 %	526230843
3592	NC_021872	AAT	2	6	196190	196195	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	526230843
3593	NC_021872	ATT	3	9	196216	196224	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	526230843
3594	NC_021872	ATC	2	6	196230	196235	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	526230843
3595	NC_021872	ATT	2	6	196333	196338	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	526230843
3596	NC_021872	ATT	2	6	196433	196438	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	526230843
3597	NC_021872	AGCA	2	8	196506	196513	50 %	0 %	25 %	25 %	526230843
3598	NC_021872	TGG	2	6	196792	196797	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	526230844
3599	NC_021872	TGG	2	6	197071	197076	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	526230844
3600	NC_021872	GCT	2	6	197096	197101	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	526230844
3601	NC_021872	ATG	2	6	197112	197117	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	526230844
3602	NC_021872	TGG	2	6	197127	197132	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	526230844
3603	NC_021872	AGA	2	6	197170	197175	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	526230844
3604	NC_021872	CAT	2	6	197184	197189	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	526230844
3605	NC_021872	AGC	2	6	197209	197214	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	526230844
3606	NC_021872	TC	3	6	197253	197258	0 %	50 %	0 %	50 %	526230844
3607	NC_021872	ACAG	2	8	197272	197279	50 %	0 %	25 %	25 %	526230844
3608	NC_021872	AAG	2	6	197426	197431	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	526230844
3609	NC_021872	AAT	2	6	197441	197446	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	526230844
3610	NC_021872	TGA	2	6	197458	197463	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	526230844
3611	NC_021872	TGA	2	6	197488	197493	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	526230844
3612	NC_021872	CCG	2	6	197643	197648	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	526230844
3613	NC_021872	GAT	2	6	197699	197704	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	526230844
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3617	NC_021872	AAG	2	6	197762	197767	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	526230844
3618	NC_021872	GTT	2	6	197789	197794	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	526230844
3619	NC_021872	TGT	2	6	197811	197816	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	526230844
3620	NC_021872	CAAC	2	8	197876	197883	50 %	0 %	0 %	50 %	526230844
3621	NC_021872	AAC	2	6	197889	197894	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	526230844
3622	NC_021872	CAAAT	2	10	197935	197944	60 %	20 %	0 %	20 %	526230844
3623	NC_021872	ATG	2	6	197961	197966	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	526230844
3624	NC_021872	GGCGA	2	10	198038	198047	20 %	0 %	60 %	20 %	526230844
3625	NC_021872	TGA	2	6	198049	198054	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	526230844
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3639	NC_021872	G	6	6	198929	198934	0 %	0 %	100 %	0 %	526230845
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3871	NC_021872	GAT	2	6	215814	215819	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	526232187
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3969	NC_021872	ATC	4	12	220764	220775	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	526232190
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3973	NC_021872	T	6	6	220982	220987	0 %	100 %	0 %	0 %	526232190
3974	NC_021872	GTT	2	6	220992	220997	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	526232190
3975	NC_021872	TTC	2	6	221001	221006	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	526232190
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3978	NC_021872	TAC	2	6	221202	221207	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	526232191
3979	NC_021872	CAT	2	6	221232	221237	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	526232191
3980	NC_021872	GTTT	2	8	221524	221531	0 %	75 %	25 %	0 %	526230852
3981	NC_021872	ACC	2	6	221585	221590	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	526230852
3982	NC_021872	TTA	2	6	221622	221627	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	526230852
3983	NC_021872	ATG	3	9	221813	221821	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	526230852
3984	NC_021872	TTG	2	6	221924	221929	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	526230852
3985	NC_021872	ATT	2	6	221970	221975	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	526230852
3986	NC_021872	CTT	3	9	221983	221991	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	526230852
3987	NC_021872	GTC	2	6	222008	222013	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	526230852
3988	NC_021872	TTC	2	6	222048	222053	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	526230852
3989	NC_021872	ATT	2	6	222054	222059	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	526230852
3990	NC_021872	GAT	2	6	222100	222105	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	526232192
3991	NC_021872	GGC	2	6	222157	222162	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	526232192
3992	NC_021872	ATG	2	6	222226	222231	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	526232192
3993	NC_021872	GAAAA	3	15	222263	222277	80 %	0 %	20 %	0 %	526232192
3994	NC_021872	A	6	6	222274	222279	100 %	0 %	0 %	0 %	526232192
3995	NC_021872	ATA	2	6	222371	222376	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	526232192
3996	NC_021872	TAA	2	6	222379	222384	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	526232192
3997	NC_021872	GCT	2	6	222443	222448	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	526232192
3998	NC_021872	TA	3	6	222453	222458	50 %	50 %	0 %	0 %	526232192
3999	NC_021872	T	7	7	222459	222465	0 %	100 %	0 %	0 %	526232192
4000	NC_021872	TGC	2	6	222617	222622	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	526230853

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