MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Lactobacillus reuteri TD1

Total Repeats: 40052

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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38502	NC_021872	TCA	2	6	2058663	2058668	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	526232107
38503	NC_021872	GAC	2	6	2059313	2059318	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	526232108
38504	NC_021872	GGA	2	6	2059375	2059380	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	526232108
38505	NC_021872	ATT	2	6	2059429	2059434	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	526232108
38506	NC_021872	ACT	2	6	2059538	2059543	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	526232108
38507	NC_021872	GGC	2	6	2059585	2059590	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	526232108
38508	NC_021872	TAT	2	6	2059660	2059665	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	526232108
38509	NC_021872	GCT	2	6	2059724	2059729	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	526232108
38510	NC_021872	TATT	2	8	2059773	2059780	25 %	75 %	0 %	0 %	526232108
38511	NC_021872	TAT	2	6	2059806	2059811	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	526232108
38512	NC_021872	TTG	2	6	2059845	2059850	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	526232108
38513	NC_021872	GGT	2	6	2059976	2059981	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	526232108
38514	NC_021872	TAT	2	6	2060008	2060013	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	526232108
38515	NC_021872	TAC	2	6	2060119	2060124	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	526232108
38516	NC_021872	CTT	2	6	2060171	2060176	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	526232108
38517	NC_021872	TTCT	2	8	2060224	2060231	0 %	75 %	0 %	25 %	526232108
38518	NC_021872	ATG	2	6	2060241	2060246	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	526232108
38519	NC_021872	ATA	2	6	2060253	2060258	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	526232108
38520	NC_021872	TAT	2	6	2060307	2060312	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	526232108
38521	NC_021872	CAA	2	6	2060355	2060360	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	526232108
38522	NC_021872	TTA	2	6	2060385	2060390	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	526232108
38523	NC_021872	TCAT	2	8	2060400	2060407	25 %	50 %	0 %	25 %	526232108
38524	NC_021872	ACG	2	6	2060428	2060433	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	526232108
38525	NC_021872	ATT	2	6	2060447	2060452	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	526232108
38526	NC_021872	CAA	2	6	2060507	2060512	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	526232108
38527	NC_021872	ATT	2	6	2060587	2060592	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	526232108
38528	NC_021872	ATG	2	6	2060594	2060599	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	526232108
38529	NC_021872	CTT	2	6	2060683	2060688	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	526232108
38530	NC_021872	CTT	2	6	2060789	2060794	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	526232108
38531	NC_021872	TGC	2	6	2060836	2060841	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	526232108
38532	NC_021872	AGA	2	6	2060893	2060898	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	526232108
38533	NC_021872	AAT	2	6	2061171	2061176	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	526232109
38534	NC_021872	ATA	2	6	2061181	2061186	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	526232109
38535	NC_021872	GCG	2	6	2061203	2061208	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	526232109
38536	NC_021872	GAA	2	6	2061249	2061254	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	526232109
38537	NC_021872	A	6	6	2061258	2061263	100 %	0 %	0 %	0 %	526232109
38538	NC_021872	CATAAA	2	12	2061306	2061317	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	526232109
38539	NC_021872	ACA	2	6	2061434	2061439	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	526232109
38540	NC_021872	TAC	2	6	2061467	2061472	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	526232109
38541	NC_021872	CCA	2	6	2061478	2061483	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	526232109
38542	NC_021872	TCA	2	6	2061489	2061494	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	526232109
38543	NC_021872	CAG	2	6	2061515	2061520	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	526232109
38544	NC_021872	TGA	2	6	2061557	2061562	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	526232109
38545	NC_021872	ATC	2	6	2061628	2061633	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	526232109
38546	NC_021872	CAA	2	6	2061642	2061647	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	526232109
38547	NC_021872	ACT	2	6	2061651	2061656	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	526232109
38548	NC_021872	CAA	2	6	2061675	2061680	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	526232109
38549	NC_021872	AACC	2	8	2061681	2061688	50 %	0 %	0 %	50 %	526232109
38550	NC_021872	GAA	2	6	2061696	2061701	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	526232109
38551	NC_021872	CAC	2	6	2061702	2061707	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	526232109
38552	NC_021872	CAA	3	9	2061723	2061731	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	526232109
38553	NC_021872	AAT	2	6	2061837	2061842	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	526232109
38554	NC_021872	TTAA	2	8	2062105	2062112	50 %	50 %	0 %	0 %	526232110
38555	NC_021872	TTTA	2	8	2062153	2062160	25 %	75 %	0 %	0 %	526232110
38556	NC_021872	GA	3	6	2062169	2062174	50 %	0 %	50 %	0 %	526232110
38557	NC_021872	AAG	2	6	2062219	2062224	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	526232110
38558	NC_021872	ATCG	2	8	2062225	2062232	25 %	25 %	25 %	25 %	526232110
38559	NC_021872	AAG	2	6	2062241	2062246	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	526232110
38560	NC_021872	CAA	2	6	2062378	2062383	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	526232110
38561	NC_021872	CGA	2	6	2062392	2062397	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	526232110
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38565	NC_021872	GTT	2	6	2062615	2062620	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	526232110
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38590	NC_021872	ATGA	2	8	2063938	2063945	50 %	25 %	25 %	0 %	526232110
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38597	NC_021872	TTTA	2	8	2064544	2064551	25 %	75 %	0 %	0 %	526232630
38598	NC_021872	TAAC	2	8	2064580	2064587	50 %	25 %	0 %	25 %	526232630
38599	NC_021872	ACCG	2	8	2064620	2064627	25 %	0 %	25 %	50 %	526232630
38600	NC_021872	A	6	6	2064713	2064718	100 %	0 %	0 %	0 %	526232630
38601	NC_021872	ACT	2	6	2064722	2064727	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	526232630
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38604	NC_021872	A	7	7	2064860	2064866	100 %	0 %	0 %	0 %	526232630
38605	NC_021872	ATA	2	6	2064885	2064890	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	526232630
38606	NC_021872	TTA	2	6	2064909	2064914	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	526232630
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38614	NC_021872	T	6	6	2065188	2065193	0 %	100 %	0 %	0 %	526232630
38615	NC_021872	CCA	2	6	2065217	2065222	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	526232630
38616	NC_021872	GAT	2	6	2065310	2065315	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	526232630
38617	NC_021872	CTC	2	6	2065327	2065332	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	526232630
38618	NC_021872	CGA	2	6	2065358	2065363	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	526232630
38619	NC_021872	TTA	2	6	2065380	2065385	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	526232630
38620	NC_021872	ATAAA	2	10	2065412	2065421	80 %	20 %	0 %	0 %	526232630
38621	NC_021872	TCC	2	6	2065424	2065429	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	526232630
38622	NC_021872	TTGG	2	8	2065482	2065489	0 %	50 %	50 %	0 %	526232630
38623	NC_021872	CCAA	2	8	2065522	2065529	50 %	0 %	0 %	50 %	526232630
38624	NC_021872	T	7	7	2065550	2065556	0 %	100 %	0 %	0 %	526232630
38625	NC_021872	ATA	2	6	2065605	2065610	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	526232630
38626	NC_021872	TGC	2	6	2065655	2065660	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	526232630
38627	NC_021872	A	6	6	2065753	2065758	100 %	0 %	0 %	0 %	526232630
38628	NC_021872	CCATTG	2	12	2065760	2065771	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	526232630
38629	NC_021872	TAA	2	6	2065859	2065864	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	526232631
38630	NC_021872	CAC	2	6	2065915	2065920	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	526232631
38631	NC_021872	CGA	2	6	2066092	2066097	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	526232631
38632	NC_021872	CAC	2	6	2066209	2066214	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	526232631
38633	NC_021872	TTTC	2	8	2066282	2066289	0 %	75 %	0 %	25 %	526232631
38634	NC_021872	GAA	2	6	2066299	2066304	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	526232631
38635	NC_021872	TGC	2	6	2066310	2066315	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	526232631
38636	NC_021872	ACA	2	6	2066320	2066325	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	526232631
38637	NC_021872	ATC	2	6	2066337	2066342	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	526232631
38638	NC_021872	TCG	2	6	2066413	2066418	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	526232631
38639	NC_021872	CTT	2	6	2066461	2066466	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	526232631
38640	NC_021872	TTTTTA	2	12	2066544	2066555	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	526232631
38641	NC_021872	TTCAT	2	10	2066637	2066646	20 %	60 %	0 %	20 %	526232631
38642	NC_021872	ACT	2	6	2066660	2066665	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	526232631
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38644	NC_021872	CAG	2	6	2066746	2066751	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	526232631
38645	NC_021872	GCA	2	6	2066769	2066774	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	526232631
38646	NC_021872	GTT	2	6	2066775	2066780	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	526232631
38647	NC_021872	CTTTT	2	10	2066786	2066795	0 %	80 %	0 %	20 %	526232631
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38650	NC_021872	TAA	2	6	2066917	2066922	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	526232631
38651	NC_021872	ATGGG	2	10	2066930	2066939	20 %	20 %	60 %	0 %	526232631
38652	NC_021872	CTTT	2	8	2066968	2066975	0 %	75 %	0 %	25 %	526232631
38653	NC_021872	TCA	2	6	2067088	2067093	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	526232631
38654	NC_021872	AATCAT	2	12	2067329	2067340	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	526232112
38655	NC_021872	TTCTA	2	10	2067398	2067407	20 %	60 %	0 %	20 %	526232112
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38657	NC_021872	CGC	2	6	2067458	2067463	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	526232112
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38659	NC_021872	TAC	2	6	2067582	2067587	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	526232112
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38662	NC_021872	TGG	2	6	2067758	2067763	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	526232112
38663	NC_021872	CTG	2	6	2067778	2067783	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	526232112
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38668	NC_021872	TAT	2	6	2067875	2067880	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	526232112
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38670	NC_021872	CTG	2	6	2067976	2067981	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	526232112
38671	NC_021872	TCT	3	9	2067982	2067990	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	526232112
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38673	NC_021872	CTG	2	6	2068021	2068026	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	526232112
38674	NC_021872	AAT	2	6	2068064	2068069	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	526232112
38675	NC_021872	TAGT	2	8	2068105	2068112	25 %	50 %	25 %	0 %	526232112
38676	NC_021872	GTC	2	6	2068245	2068250	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	526232112
38677	NC_021872	TTC	2	6	2068306	2068311	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	526232112
38678	NC_021872	CTT	2	6	2068377	2068382	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	526232112
38679	NC_021872	ATT	2	6	2068479	2068484	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	526232112
38680	NC_021872	TTA	2	6	2068575	2068580	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	526232112
38681	NC_021872	TAG	2	6	2068624	2068629	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	526232112
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38699	NC_021872	ATC	2	6	2069479	2069484	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	526232113
38700	NC_021872	TTC	2	6	2069539	2069544	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	526232113
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38702	NC_021872	CAA	2	6	2069649	2069654	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	526232113
38703	NC_021872	CTT	2	6	2069673	2069678	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	526232113
38704	NC_021872	TGCACC	2	12	2069707	2069718	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	526232113
38705	NC_021872	ACT	2	6	2069720	2069725	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	526232113
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38707	NC_021872	TCA	2	6	2069920	2069925	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	526232632
38708	NC_021872	CT	3	6	2069982	2069987	0 %	50 %	0 %	50 %	526232632
38709	NC_021872	TAC	2	6	2070517	2070522	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	526232633
38710	NC_021872	CTTC	2	8	2070553	2070560	0 %	50 %	0 %	50 %	526232633
38711	NC_021872	AAG	2	6	2070576	2070581	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	526232633
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38713	NC_021872	AAG	3	9	2070666	2070674	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	526232633
38714	NC_021872	CTG	2	6	2070675	2070680	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	526232633
38715	NC_021872	TCT	2	6	2070735	2070740	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	526232633
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38718	NC_021872	AAAC	2	8	2070911	2070918	75 %	0 %	0 %	25 %	526232633
38719	NC_021872	AGA	2	6	2070943	2070948	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	526232633
38720	NC_021872	TTC	2	6	2070951	2070956	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	526232633
38721	NC_021872	AAG	2	6	2070999	2071004	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	526232633
38722	NC_021872	GCT	2	6	2071025	2071030	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	526232633
38723	NC_021872	ATC	2	6	2071032	2071037	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	526232633
38724	NC_021872	TGC	2	6	2071057	2071062	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	526232633
38725	NC_021872	A	6	6	2071133	2071138	100 %	0 %	0 %	0 %	526232633
38726	NC_021872	CCG	2	6	2071221	2071226	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	526232633
38727	NC_021872	GCT	2	6	2071277	2071282	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	526232633
38728	NC_021872	GGT	2	6	2071286	2071291	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	526232633
38729	NC_021872	AC	3	6	2071308	2071313	50 %	0 %	0 %	50 %	526232633
38730	NC_021872	TGA	2	6	2071399	2071404	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	526232633
38731	NC_021872	TGT	2	6	2071411	2071416	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	526232633
38732	NC_021872	GCA	2	6	2071460	2071465	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	526232633
38733	NC_021872	TCCA	2	8	2071497	2071504	25 %	25 %	0 %	50 %	526232633
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