MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Lactobacillus reuteri TD1

Total Repeats: 40052

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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35002	NC_021872	TCT	2	6	1871224	1871229	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	526231950
35003	NC_021872	GCT	2	6	1871239	1871244	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	526231950
35004	NC_021872	ATAC	2	8	1871341	1871348	50 %	25 %	0 %	25 %	526231950
35005	NC_021872	CAT	2	6	1871375	1871380	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	526231950
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35012	NC_021872	TAG	2	6	1871693	1871698	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	526231950
35013	NC_021872	GTT	2	6	1871933	1871938	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	526231950
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35033	NC_021872	GTA	2	6	1872896	1872901	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	526231951
35034	NC_021872	AT	3	6	1873001	1873006	50 %	50 %	0 %	0 %	526231951
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35038	NC_021872	CATC	2	8	1873233	1873240	25 %	25 %	0 %	50 %	526231951
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35099	NC_021872	ATT	2	6	1876663	1876668	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	526231953
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35102	NC_021872	A	7	7	1876915	1876921	100 %	0 %	0 %	0 %	526231953
35103	NC_021872	CAT	2	6	1876966	1876971	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	526231953
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35230	NC_021872	ATA	2	6	1882932	1882937	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	526231959
35231	NC_021872	ACTG	2	8	1882960	1882967	25 %	25 %	25 %	25 %	526231959
35232	NC_021872	GAG	2	6	1883255	1883260	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	526231959
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35235	NC_021872	TTG	2	6	1883447	1883452	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	526231959
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35266	NC_021872	TGA	2	6	1885115	1885120	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	526231961
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35300	NC_021872	CGT	2	6	1886964	1886969	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	526231962
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35327	NC_021872	CTG	3	9	1888401	1888409	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	526231963
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35329	NC_021872	CTG	2	6	1888458	1888463	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	526231963
35330	NC_021872	GTT	2	6	1888470	1888475	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	526231963
35331	NC_021872	AAATC	2	10	1888550	1888559	60 %	20 %	0 %	20 %	526231963
35332	NC_021872	TCT	2	6	1888566	1888571	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	526231963
35333	NC_021872	AGAT	2	8	1888595	1888602	50 %	25 %	25 %	0 %	526231963
35334	NC_021872	AAC	2	6	1888637	1888642	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	526231963
35335	NC_021872	TAAAT	2	10	1888685	1888694	60 %	40 %	0 %	0 %	526231963
35336	NC_021872	AAT	2	6	1888714	1888719	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	526231963
35337	NC_021872	GTT	2	6	1888832	1888837	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	526231964
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35339	NC_021872	ACC	2	6	1888849	1888854	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	526231964
35340	NC_021872	TAT	2	6	1888875	1888880	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	526231964
35341	NC_021872	GTT	2	6	1888886	1888891	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	526231964
35342	NC_021872	CTG	2	6	1888986	1888991	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	526231964
35343	NC_021872	ATC	2	6	1889020	1889025	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	526231964
35344	NC_021872	TTG	2	6	1889033	1889038	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	526231964
35345	NC_021872	TGA	2	6	1889059	1889064	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	526231964
35346	NC_021872	TCA	6	18	1889078	1889095	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	526231964
35347	NC_021872	TTGA	2	8	1889124	1889131	25 %	50 %	25 %	0 %	526231964
35348	NC_021872	TCA	2	6	1889141	1889146	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	526231964
35349	NC_021872	TTG	2	6	1889169	1889174	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	526231964
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35354	NC_021872	ATG	2	6	1889520	1889525	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	526231965
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35455	NC_021872	A	6	6	1894858	1894863	100 %	0 %	0 %	0 %	526232610
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35460	NC_021872	AAG	2	6	1895137	1895142	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	526232610
35461	NC_021872	CAAA	2	8	1895211	1895218	75 %	0 %	0 %	25 %	526232610
35462	NC_021872	GAT	2	6	1895240	1895245	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	526232610
35463	NC_021872	CAA	2	6	1895290	1895295	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	526232610
35464	NC_021872	TTC	2	6	1895319	1895324	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	526232610
35465	NC_021872	GTT	2	6	1895533	1895538	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	526231970
35466	NC_021872	AGG	2	6	1895541	1895546	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	526231970
35467	NC_021872	T	6	6	1895586	1895591	0 %	100 %	0 %	0 %	526231970
35468	NC_021872	TAA	2	6	1895666	1895671	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	526231970
35469	NC_021872	GCC	2	6	1895680	1895685	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	526231970
35470	NC_021872	TGC	2	6	1895697	1895702	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	526231970
35471	NC_021872	AT	3	6	1895729	1895734	50 %	50 %	0 %	0 %	526231970
35472	NC_021872	CTTC	2	8	1895737	1895744	0 %	50 %	0 %	50 %	526231970
35473	NC_021872	TCA	2	6	1895780	1895785	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	526231970
35474	NC_021872	CG	4	8	1895789	1895796	0 %	0 %	50 %	50 %	526231970
35475	NC_021872	GCT	2	6	1895821	1895826	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	526231970
35476	NC_021872	TCATC	2	10	1895849	1895858	20 %	40 %	0 %	40 %	526231970
35477	NC_021872	AAT	2	6	1895862	1895867	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	526231970
35478	NC_021872	TAGT	2	8	1895926	1895933	25 %	50 %	25 %	0 %	526231970
35479	NC_021872	ATG	2	6	1895946	1895951	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	526231970
35480	NC_021872	TAA	2	6	1895957	1895962	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	526231970
35481	NC_021872	ATCA	2	8	1895991	1895998	50 %	25 %	0 %	25 %	526231970
35482	NC_021872	ATT	2	6	1896006	1896011	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	526231970
35483	NC_021872	GTT	2	6	1896032	1896037	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	526231970
35484	NC_021872	ATA	2	6	1896082	1896087	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	526231970
35485	NC_021872	CAT	2	6	1896257	1896262	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	526231970
35486	NC_021872	GTTT	2	8	1896406	1896413	0 %	75 %	25 %	0 %	526231970
35487	NC_021872	CCA	3	9	1896415	1896423	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	526231970
35488	NC_021872	T	6	6	1896425	1896430	0 %	100 %	0 %	0 %	526231970
35489	NC_021872	TAA	2	6	1896568	1896573	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	526231971
35490	NC_021872	AG	3	6	1896620	1896625	50 %	0 %	50 %	0 %	526231971
35491	NC_021872	GATT	2	8	1896640	1896647	25 %	50 %	25 %	0 %	526231971
35492	NC_021872	AT	3	6	1896665	1896670	50 %	50 %	0 %	0 %	526231971
35493	NC_021872	AAG	2	6	1896708	1896713	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	526231971
35494	NC_021872	TCA	2	6	1896726	1896731	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	526231971
35495	NC_021872	TAC	2	6	1896791	1896796	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	526231971
35496	NC_021872	GCA	2	6	1896837	1896842	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	526231971
35497	NC_021872	CTA	2	6	1896844	1896849	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	526231971
35498	NC_021872	CATTT	2	10	1896860	1896869	20 %	60 %	0 %	20 %	526231971
35499	NC_021872	ACA	2	6	1896891	1896896	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	526231971
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