MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Lactobacillus reuteri TD1

Total Repeats: 40052

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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34502	NC_021872	TAAC	2	8	1843016	1843023	50 %	25 %	0 %	25 %	526231939
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34504	NC_021872	GAA	2	6	1843090	1843095	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	526231939
34505	NC_021872	AC	4	8	1843188	1843195	50 %	0 %	0 %	50 %	526231939
34506	NC_021872	TCA	2	6	1843276	1843281	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	526231939
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34514	NC_021872	AC	3	6	1844063	1844068	50 %	0 %	0 %	50 %	526231940
34515	NC_021872	TCA	2	6	1844109	1844114	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	526231940
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34604	NC_021872	AT	3	6	1850016	1850021	50 %	50 %	0 %	0 %	526232601
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34733	NC_021872	T	7	7	1856766	1856772	0 %	100 %	0 %	0 %	526232604
34734	NC_021872	AAT	2	6	1856832	1856837	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	526232604
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34846	NC_021872	AAC	2	6	1861922	1861927	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	526232607
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34848	NC_021872	AAT	2	6	1862071	1862076	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	526232607
34849	NC_021872	CAT	2	6	1862128	1862133	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	526232607
34850	NC_021872	CTA	2	6	1862145	1862150	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	526232607
34851	NC_021872	TTG	2	6	1862159	1862164	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	526232607
34852	NC_021872	ATTA	2	8	1862185	1862192	50 %	50 %	0 %	0 %	526232607
34853	NC_021872	AGGG	2	8	1862200	1862207	25 %	0 %	75 %	0 %	526232607
34854	NC_021872	ATC	2	6	1862302	1862307	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	526232607
34855	NC_021872	GT	3	6	1862310	1862315	0 %	50 %	50 %	0 %	526232607
34856	NC_021872	CTT	2	6	1862319	1862324	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	526232607
34857	NC_021872	ATC	2	6	1862399	1862404	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	526232607
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34859	NC_021872	CAT	2	6	1863508	1863513	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	526231945
34860	NC_021872	TCA	2	6	1863723	1863728	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	526231945
34861	NC_021872	T	6	6	1863737	1863742	0 %	100 %	0 %	0 %	526231945
34862	NC_021872	TTC	2	6	1863746	1863751	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	526231945
34863	NC_021872	GACCTG	2	12	1863826	1863837	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	526231945
34864	NC_021872	CTT	2	6	1863947	1863952	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	526231945
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34867	NC_021872	CTT	2	6	1864072	1864077	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	526231945
34868	NC_021872	AAG	2	6	1864155	1864160	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	526231945
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34870	NC_021872	ATG	2	6	1864182	1864187	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	526231945
34871	NC_021872	CATC	2	8	1864213	1864220	25 %	25 %	0 %	50 %	526231945
34872	NC_021872	TTC	2	6	1864236	1864241	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	526231945
34873	NC_021872	CAA	2	6	1864258	1864263	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	526231945
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34878	NC_021872	CTT	2	6	1864366	1864371	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	526231945
34879	NC_021872	TCA	2	6	1864380	1864385	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	526231945
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34882	NC_021872	TAG	2	6	1864561	1864566	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	526231945
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34885	NC_021872	AAT	2	6	1864650	1864655	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	526231945
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34928	NC_021872	AATT	2	8	1867479	1867486	50 %	50 %	0 %	0 %	526231947
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34930	NC_021872	GCCAT	2	10	1867599	1867608	20 %	20 %	20 %	40 %	526231947
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34947	NC_021872	TGA	2	6	1868836	1868841	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	526231948
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34952	NC_021872	TGA	2	6	1869060	1869065	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	526231948
34953	NC_021872	GTC	2	6	1869096	1869101	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	526231948
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34957	NC_021872	TCT	2	6	1869270	1869275	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	526231948
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34959	NC_021872	TTC	2	6	1869327	1869332	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	526231948
34960	NC_021872	GCA	2	6	1869366	1869371	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	526231948
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34962	NC_021872	TTA	2	6	1869441	1869446	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	526231948
34963	NC_021872	GTC	2	6	1869447	1869452	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	526231948
34964	NC_021872	CAT	2	6	1869460	1869465	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	526231948
34965	NC_021872	GTT	2	6	1869506	1869511	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	526231948
34966	NC_021872	GTAA	2	8	1869525	1869532	50 %	25 %	25 %	0 %	526231948
34967	NC_021872	ACA	2	6	1869675	1869680	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	526231948
34968	NC_021872	ATT	2	6	1869737	1869742	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	526231948
34969	NC_021872	TTA	2	6	1869763	1869768	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	526231948
34970	NC_021872	ATTA	2	8	1869842	1869849	50 %	50 %	0 %	0 %	526231948
34971	NC_021872	CAT	2	6	1869854	1869859	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	526231948
34972	NC_021872	TTG	2	6	1869944	1869949	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	526231948
34973	NC_021872	TAAAT	2	10	1869968	1869977	60 %	40 %	0 %	0 %	526231948
34974	NC_021872	ACA	2	6	1870020	1870025	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	526231948
34975	NC_021872	A	7	7	1870031	1870037	100 %	0 %	0 %	0 %	526231948
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34977	NC_021872	TCC	2	6	1870094	1870099	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	526231948
34978	NC_021872	A	7	7	1870102	1870108	100 %	0 %	0 %	0 %	526231948
34979	NC_021872	ATT	2	6	1870113	1870118	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	526231948
34980	NC_021872	AGC	2	6	1870328	1870333	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	526231949
34981	NC_021872	TCA	2	6	1870380	1870385	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	526231949
34982	NC_021872	TG	3	6	1870404	1870409	0 %	50 %	50 %	0 %	526231949
34983	NC_021872	TAT	2	6	1870423	1870428	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	526231949
34984	NC_021872	AATT	2	8	1870492	1870499	50 %	50 %	0 %	0 %	526231949
34985	NC_021872	T	6	6	1870510	1870515	0 %	100 %	0 %	0 %	526231949
34986	NC_021872	TAC	2	6	1870537	1870542	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	526231949
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34988	NC_021872	TGT	2	6	1870729	1870734	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	526231949
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34990	NC_021872	TCT	2	6	1870764	1870769	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	526231949
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34992	NC_021872	ATT	2	6	1870861	1870866	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	526231949
34993	NC_021872	TCG	2	6	1870932	1870937	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	526231949
34994	NC_021872	CTT	2	6	1870942	1870947	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	526231949
34995	NC_021872	CAA	2	6	1870973	1870978	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	526231949
34996	NC_021872	CTG	2	6	1870995	1871000	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	526231949
34997	NC_021872	ATT	3	9	1871002	1871010	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	526231949
34998	NC_021872	T	6	6	1871024	1871029	0 %	100 %	0 %	0 %	526231949
34999	NC_021872	GGT	2	6	1871087	1871092	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	526231949
35000	NC_021872	T	6	6	1871201	1871206	0 %	100 %	0 %	0 %	526231950

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