MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Lactobacillus reuteri TD1

Total Repeats: 40052

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
3001	NC_021872	AAG	2	6	161393	161398	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	526230818
3002	NC_021872	TAA	2	6	161491	161496	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	526230818
3003	NC_021872	ATG	2	6	161682	161687	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	526230818
3004	NC_021872	TAAT	2	8	161720	161727	50 %	50 %	0 %	0 %	526230818
3005	NC_021872	GTA	2	6	162668	162673	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	526230819
3006	NC_021872	ATT	2	6	162716	162721	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	526230819
3007	NC_021872	ATT	2	6	162848	162853	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	526230819
3008	NC_021872	TG	3	6	162856	162861	0 %	50 %	50 %	0 %	526230819
3009	NC_021872	GGT	2	6	162862	162867	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	526230819
3010	NC_021872	TGG	2	6	162869	162874	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	526230819
3011	NC_021872	ATC	2	6	162891	162896	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	526230819
3012	NC_021872	ATC	2	6	162954	162959	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	526230819
3013	NC_021872	TTA	2	6	162996	163001	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	526230819
3014	NC_021872	GCGGT	2	10	163028	163037	0 %	20 %	60 %	20 %	526230819
3015	NC_021872	GATG	2	8	163039	163046	25 %	25 %	50 %	0 %	526230819
3016	NC_021872	TAT	2	6	163123	163128	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	526230819
3017	NC_021872	GAA	2	6	163222	163227	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	526230819
3018	NC_021872	TTTG	2	8	163240	163247	0 %	75 %	25 %	0 %	526230819
3019	NC_021872	CAT	2	6	163285	163290	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	526230819
3020	NC_021872	TAA	2	6	163435	163440	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	526230819
3021	NC_021872	TGG	2	6	163515	163520	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	526230819
3022	NC_021872	ACC	2	6	163569	163574	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	526230819
3023	NC_021872	CG	3	6	163592	163597	0 %	0 %	50 %	50 %	526230819
3024	NC_021872	GGA	2	6	163622	163627	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	526230819
3025	NC_021872	TTG	2	6	163659	163664	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	526230819
3026	NC_021872	TCA	2	6	163669	163674	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	526230819
3027	NC_021872	AAAT	2	8	163917	163924	75 %	25 %	0 %	0 %	526230820
3028	NC_021872	GATTG	2	10	163990	163999	20 %	40 %	40 %	0 %	526230820
3029	NC_021872	TAC	2	6	164013	164018	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	526230820
3030	NC_021872	GCA	2	6	164021	164026	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	526230820
3031	NC_021872	TGG	2	6	164074	164079	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	526230820
3032	NC_021872	TTA	2	6	164102	164107	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	526230820
3033	NC_021872	TCT	2	6	164148	164153	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	526230820
3034	NC_021872	AT	3	6	164194	164199	50 %	50 %	0 %	0 %	526230820
3035	NC_021872	TCATCT	2	12	164220	164231	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	526230820
3036	NC_021872	GTT	2	6	164314	164319	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	526230820
3037	NC_021872	TAT	2	6	164327	164332	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	526230820
3038	NC_021872	GCA	2	6	164339	164344	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	526230820
3039	NC_021872	TGGT	2	8	164361	164368	0 %	50 %	50 %	0 %	526230820
3040	NC_021872	TGG	2	6	164377	164382	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	526230820
3041	NC_021872	TA	3	6	164436	164441	50 %	50 %	0 %	0 %	526230820
3042	NC_021872	GT	3	6	164505	164510	0 %	50 %	50 %	0 %	526230820
3043	NC_021872	ATT	3	9	164543	164551	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	526230820
3044	NC_021872	TTG	2	6	164571	164576	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	526230820
3045	NC_021872	TTGA	2	8	164582	164589	25 %	50 %	25 %	0 %	526230820
3046	NC_021872	CAA	2	6	164693	164698	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	526230820
3047	NC_021872	TGT	2	6	164743	164748	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	526230820
3048	NC_021872	ATG	2	6	164757	164762	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	526230820
3049	NC_021872	A	6	6	164777	164782	100 %	0 %	0 %	0 %	526230820
3050	NC_021872	ATG	2	6	164784	164789	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	526230820
3051	NC_021872	TGA	2	6	164800	164805	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	526230820
3052	NC_021872	AAC	2	6	164819	164824	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	526230821
3053	NC_021872	TAA	2	6	164832	164837	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	526230821
3054	NC_021872	AATG	2	8	164944	164951	50 %	25 %	25 %	0 %	526230821
3055	NC_021872	AGTT	2	8	164967	164974	25 %	50 %	25 %	0 %	526230821
3056	NC_021872	TCT	2	6	165002	165007	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	526230821
3057	NC_021872	GCA	2	6	165058	165063	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	526230821
3058	NC_021872	GTGATT	2	12	165070	165081	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	526230821
3059	NC_021872	GTCAAT	2	12	165096	165107	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	526230821
3060	NC_021872	GCA	2	6	165315	165320	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	526230822
3061	NC_021872	A	7	7	165320	165326	100 %	0 %	0 %	0 %	526230822
3062	NC_021872	TGA	2	6	165341	165346	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	526230822
3063	NC_021872	GAA	2	6	165372	165377	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	526230822
3064	NC_021872	TTA	2	6	165394	165399	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	526230822
3065	NC_021872	GGC	2	6	165408	165413	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	526230822
3066	NC_021872	ATT	2	6	165485	165490	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	526230822
3067	NC_021872	A	7	7	165512	165518	100 %	0 %	0 %	0 %	526230822
3068	NC_021872	GAA	2	6	165525	165530	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	526230822
3069	NC_021872	AGC	2	6	165572	165577	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	526230822
3070	NC_021872	TTG	2	6	165619	165624	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	526230822
3071	NC_021872	ACA	2	6	165650	165655	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	526230822
3072	NC_021872	TTA	2	6	165676	165681	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	526230822
3073	NC_021872	CAG	2	6	165689	165694	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	526230822
3074	NC_021872	GAT	2	6	165702	165707	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	526230822
3075	NC_021872	TGA	2	6	165731	165736	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	526230822
3076	NC_021872	TAG	2	6	165739	165744	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	526230822
3077	NC_021872	TTG	2	6	165960	165965	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	526230822
3078	NC_021872	AGT	2	6	166001	166006	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	526230822
3079	NC_021872	TCG	2	6	166052	166057	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	526230822
3080	NC_021872	TGA	2	6	166470	166475	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	526230823
3081	NC_021872	AGAA	2	8	166483	166490	75 %	0 %	25 %	0 %	526230823
3082	NC_021872	GCA	2	6	166526	166531	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	526230823
3083	NC_021872	AAGC	2	8	166577	166584	50 %	0 %	25 %	25 %	526230823
3084	NC_021872	CTT	2	6	166618	166623	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	526230823
3085	NC_021872	A	6	6	166718	166723	100 %	0 %	0 %	0 %	526230823
3086	NC_021872	AATC	2	8	166758	166765	50 %	25 %	0 %	25 %	526230823
3087	NC_021872	TGG	2	6	166855	166860	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	526230823
3088	NC_021872	ATG	2	6	166901	166906	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	526230823
3089	NC_021872	GAA	2	6	166916	166921	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	526230823
3090	NC_021872	ATT	2	6	166952	166957	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	526230823
3091	NC_021872	ATG	2	6	166997	167002	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	526230823
3092	NC_021872	TAC	2	6	167127	167132	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	526230823
3093	NC_021872	CTG	2	6	167157	167162	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	526230823
3094	NC_021872	TTG	2	6	167298	167303	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	526230823
3095	NC_021872	CAA	2	6	167327	167332	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	526230823
3096	NC_021872	TA	3	6	167346	167351	50 %	50 %	0 %	0 %	526230823
3097	NC_021872	TTC	2	6	167376	167381	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	526230823
3098	NC_021872	ATG	2	6	167458	167463	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	526230824
3099	NC_021872	TGG	2	6	167666	167671	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	526230824
3100	NC_021872	TCC	2	6	167776	167781	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	526230824
3101	NC_021872	GAT	2	6	167868	167873	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	526230824
3102	NC_021872	CAA	2	6	167916	167921	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	526230824
3103	NC_021872	A	6	6	168012	168017	100 %	0 %	0 %	0 %	526230824
3104	NC_021872	AAAG	2	8	168126	168133	75 %	0 %	25 %	0 %	526230824
3105	NC_021872	ACA	2	6	168158	168163	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	526230824
3106	NC_021872	CTC	2	6	168190	168195	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	526230824
3107	NC_021872	CTGATA	2	12	168211	168222	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	526230824
3108	NC_021872	GAT	2	6	168231	168236	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	526230824
3109	NC_021872	CGT	2	6	168270	168275	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	526230824
3110	NC_021872	GATT	2	8	168314	168321	25 %	50 %	25 %	0 %	526230824
3111	NC_021872	CAA	2	6	168363	168368	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	526230824
3112	NC_021872	TTG	2	6	168394	168399	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	526230824
3113	NC_021872	AC	3	6	168429	168434	50 %	0 %	0 %	50 %	526230824
3114	NC_021872	ATTG	2	8	168467	168474	25 %	50 %	25 %	0 %	526230824
3115	NC_021872	ATT	2	6	168524	168529	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	526230824
3116	NC_021872	CAG	2	6	168544	168549	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	526230824
3117	NC_021872	ATC	2	6	168571	168576	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	526230824
3118	NC_021872	TTG	2	6	168628	168633	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	526230824
3119	NC_021872	GGAG	2	8	168692	168699	25 %	0 %	75 %	0 %	526230824
3120	NC_021872	A	6	6	168754	168759	100 %	0 %	0 %	0 %	526230825
3121	NC_021872	ATT	2	6	168764	168769	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	526230825
3122	NC_021872	GCA	2	6	168770	168775	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	526230825
3123	NC_021872	AAG	2	6	168798	168803	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	526230825
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3125	NC_021872	GCA	2	6	168953	168958	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	526230825
3126	NC_021872	A	6	6	168966	168971	100 %	0 %	0 %	0 %	526230825
3127	NC_021872	A	6	6	168985	168990	100 %	0 %	0 %	0 %	526230825
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3133	NC_021872	AGC	2	6	169258	169263	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	526230825
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3153	NC_021872	GAT	2	6	170209	170214	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	526230826
3154	NC_021872	AGT	2	6	170223	170228	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	526230826
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3223	NC_021872	GATT	2	8	174994	175001	25 %	50 %	25 %	0 %	526230829
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3226	NC_021872	A	7	7	175064	175070	100 %	0 %	0 %	0 %	526230829
3227	NC_021872	AAGT	2	8	175072	175079	50 %	25 %	25 %	0 %	526230829
3228	NC_021872	A	6	6	175080	175085	100 %	0 %	0 %	0 %	526230829
3229	NC_021872	GACA	2	8	175260	175267	50 %	0 %	25 %	25 %	526230830
3230	NC_021872	AGA	2	6	175332	175337	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	526230830
3231	NC_021872	A	6	6	175402	175407	100 %	0 %	0 %	0 %	526230830
3232	NC_021872	CTG	2	6	175445	175450	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	526230830
3233	NC_021872	GGT	2	6	175564	175569	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	526230830
3234	NC_021872	GGT	2	6	175576	175581	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	526230830
3235	NC_021872	GTT	2	6	175594	175599	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	526230830
3236	NC_021872	TAA	2	6	175656	175661	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	526230830
3237	NC_021872	TAT	2	6	175689	175694	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	526230830
3238	NC_021872	AGA	2	6	175746	175751	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	526230830
3239	NC_021872	TGG	2	6	175791	175796	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	526230830
3240	NC_021872	GTA	2	6	175915	175920	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	526230830
3241	NC_021872	ATAC	2	8	175925	175932	50 %	25 %	0 %	25 %	526230830
3242	NC_021872	CAATTA	2	12	175976	175987	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	526230830
3243	NC_021872	CAA	2	6	176039	176044	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	526230830
3244	NC_021872	TGG	2	6	176163	176168	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	526230830
3245	NC_021872	GAA	2	6	176287	176292	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	526230830
3246	NC_021872	A	6	6	176308	176313	100 %	0 %	0 %	0 %	526230830
3247	NC_021872	CAAT	2	8	176378	176385	50 %	25 %	0 %	25 %	526230830
3248	NC_021872	GAT	2	6	176428	176433	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	526230830
3249	NC_021872	TAA	2	6	176508	176513	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	526230830
3250	NC_021872	AGT	2	6	176514	176519	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	526230830
3251	NC_021872	TGA	2	6	176571	176576	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	526230830
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3254	NC_021872	ATGG	2	8	176678	176685	25 %	25 %	50 %	0 %	526230830
3255	NC_021872	GTAT	2	8	176698	176705	25 %	50 %	25 %	0 %	526230830
3256	NC_021872	AAC	2	6	176741	176746	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	526230830
3257	NC_021872	ACTTT	2	10	176762	176771	20 %	60 %	0 %	20 %	526230830
3258	NC_021872	ATG	2	6	176833	176838	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	526230830
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3262	NC_021872	AATT	2	8	177256	177263	50 %	50 %	0 %	0 %	526230831
3263	NC_021872	GCG	2	6	177285	177290	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	526230831
3264	NC_021872	GGA	2	6	177423	177428	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	526230831
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3270	NC_021872	A	6	6	177769	177774	100 %	0 %	0 %	0 %	526230831
3271	NC_021872	ATT	2	6	177794	177799	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	526230831
3272	NC_021872	ATT	2	6	177805	177810	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	526230831
3273	NC_021872	TGT	2	6	177818	177823	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	526230831
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3279	NC_021872	TGA	2	6	178265	178270	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	526230831
3280	NC_021872	GCT	2	6	178327	178332	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	526230831
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3282	NC_021872	TGT	2	6	178508	178513	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	526230831
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3332	NC_021872	TGA	2	6	182520	182525	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	526232181
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3341	NC_021872	TGA	2	6	182699	182704	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	526232181
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3345	NC_021872	AG	3	6	182922	182927	50 %	0 %	50 %	0 %	526232181
3346	NC_021872	CCAA	2	8	182932	182939	50 %	0 %	0 %	50 %	526232181
3347	NC_021872	TGACG	2	10	182940	182949	20 %	20 %	40 %	20 %	526232181
3348	NC_021872	GAT	2	6	182970	182975	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	526232181
3349	NC_021872	CAA	2	6	183064	183069	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	526232181
3350	NC_021872	AATTA	2	10	183090	183099	60 %	40 %	0 %	0 %	526232181
3351	NC_021872	TAA	2	6	183120	183125	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	526232181
3352	NC_021872	ATC	2	6	183167	183172	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	526232181
3353	NC_021872	CAA	2	6	183179	183184	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	526232181
3354	NC_021872	AAT	2	6	183187	183192	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	526232181
3355	NC_021872	CGGT	2	8	183224	183231	0 %	25 %	50 %	25 %	526232181
3356	NC_021872	GT	3	6	183281	183286	0 %	50 %	50 %	0 %	526232181
3357	NC_021872	TAA	2	6	183345	183350	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	526232181
3358	NC_021872	CAA	2	6	183355	183360	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	526232181
3359	NC_021872	ATT	2	6	183401	183406	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	526232181
3360	NC_021872	GAT	2	6	183456	183461	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	526232181
3361	NC_021872	CAAA	2	8	183496	183503	75 %	0 %	0 %	25 %	526232181
3362	NC_021872	ACTA	2	8	183570	183577	50 %	25 %	0 %	25 %	526232181
3363	NC_021872	CGG	2	6	183608	183613	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	526232181
3364	NC_021872	AGG	2	6	183632	183637	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	526232181
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3368	NC_021872	TGC	2	6	183841	183846	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	526232182
3369	NC_021872	AGT	2	6	183897	183902	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	526232182
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3384	NC_021872	AGT	2	6	184460	184465	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	526232182
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3469	NC_021872	CA	3	6	189406	189411	50 %	0 %	0 %	50 %	526230836
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3480	NC_021872	CTTC	2	8	190091	190098	0 %	50 %	0 %	50 %	526230837
3481	NC_021872	ACTT	2	8	190233	190240	25 %	50 %	0 %	25 %	526230837
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3484	NC_021872	ATT	2	6	190316	190321	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	526230837
3485	NC_021872	ATG	2	6	190431	190436	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	526230837
3486	NC_021872	AGG	2	6	190467	190472	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	526230837
3487	NC_021872	ATG	2	6	190572	190577	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	526230838
3488	NC_021872	ATGAGG	2	12	190629	190640	33.33 %	16.67 %	50 %	0 %	526230838
3489	NC_021872	GGA	2	6	190717	190722	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	526230838
3490	NC_021872	GGT	2	6	190741	190746	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	526230839
3491	NC_021872	TC	3	6	190824	190829	0 %	50 %	0 %	50 %	526230839
3492	NC_021872	A	6	6	190836	190841	100 %	0 %	0 %	0 %	526230839
3493	NC_021872	AGG	2	6	190873	190878	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	526230839
3494	NC_021872	AAT	2	6	190942	190947	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	526230839
3495	NC_021872	TTTG	2	8	191057	191064	0 %	75 %	25 %	0 %	526230839
3496	NC_021872	AGT	2	6	191083	191088	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	526230839
3497	NC_021872	A	6	6	191181	191186	100 %	0 %	0 %	0 %	526230839
3498	NC_021872	AAT	2	6	191207	191212	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	526230839
3499	NC_021872	TAA	2	6	191278	191283	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	526230839
3500	NC_021872	ATG	2	6	191303	191308	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	526230839

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