MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Lactobacillus reuteri TD1

Total Repeats: 40052

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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33003	NC_021872	AT	3	6	1758019	1758024	50 %	50 %	0 %	0 %	526231907
33004	NC_021872	CTT	2	6	1758053	1758058	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	526231907
33005	NC_021872	ACC	2	6	1758076	1758081	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	526231907
33006	NC_021872	ACA	2	6	1758091	1758096	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	526231907
33007	NC_021872	CATG	2	8	1758106	1758113	25 %	25 %	25 %	25 %	526231907
33008	NC_021872	CCT	2	6	1758172	1758177	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	526231907
33009	NC_021872	TAT	2	6	1758459	1758464	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	526232577
33010	NC_021872	TGC	2	6	1758486	1758491	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	526232577
33011	NC_021872	TAT	2	6	1758578	1758583	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	526232577
33012	NC_021872	GGC	2	6	1758634	1758639	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	526232577
33013	NC_021872	ATTT	2	8	1758645	1758652	25 %	75 %	0 %	0 %	526232577
33014	NC_021872	TAT	2	6	1758675	1758680	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	526232577
33015	NC_021872	TCT	2	6	1758681	1758686	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	526232577
33016	NC_021872	CTTA	2	8	1758775	1758782	25 %	50 %	0 %	25 %	526232577
33017	NC_021872	AGA	2	6	1758807	1758812	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	526232577
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33019	NC_021872	GAG	2	6	1758901	1758906	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	526232577
33020	NC_021872	GCTGTT	2	12	1758931	1758942	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	526232577
33021	NC_021872	CTTTA	2	10	1758963	1758972	20 %	60 %	0 %	20 %	526232577
33022	NC_021872	CTC	2	6	1758994	1758999	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	526232577
33023	NC_021872	TTG	2	6	1759025	1759030	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	526232577
33024	NC_021872	GGT	2	6	1759033	1759038	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	526232577
33025	NC_021872	GGA	2	6	1759072	1759077	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	526232577
33026	NC_021872	TTA	2	6	1759109	1759114	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	526232577
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33029	NC_021872	GAA	2	6	1759201	1759206	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	526232577
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33031	NC_021872	GT	3	6	1759268	1759273	0 %	50 %	50 %	0 %	526232577
33032	NC_021872	TTC	2	6	1759283	1759288	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	526232577
33033	NC_021872	AGC	2	6	1759323	1759328	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	526232577
33034	NC_021872	TA	3	6	1759330	1759335	50 %	50 %	0 %	0 %	526232577
33035	NC_021872	AATGGC	2	12	1759344	1759355	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	526232577
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33039	NC_021872	CGCT	2	8	1759943	1759950	0 %	25 %	25 %	50 %	526231908
33040	NC_021872	ATA	2	6	1760080	1760085	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	526231908
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33050	NC_021872	TGC	2	6	1760584	1760589	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	526231908
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33054	NC_021872	ACT	2	6	1761148	1761153	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	526231909
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33089	NC_021872	CTGG	2	8	1763050	1763057	0 %	25 %	50 %	25 %	526231910
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33100	NC_021872	CGT	2	6	1764032	1764037	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	526231911
33101	NC_021872	TATC	2	8	1764064	1764071	25 %	50 %	0 %	25 %	526231911
33102	NC_021872	TAG	2	6	1764168	1764173	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	526231911
33103	NC_021872	TCA	2	6	1764208	1764213	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	526231911
33104	NC_021872	AAAC	2	8	1764216	1764223	75 %	0 %	0 %	25 %	526231911
33105	NC_021872	TGGA	2	8	1764316	1764323	25 %	25 %	50 %	0 %	526231911
33106	NC_021872	GA	4	8	1764322	1764329	50 %	0 %	50 %	0 %	526231911
33107	NC_021872	ATA	2	6	1764402	1764407	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	526231911
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33113	NC_021872	TCG	2	6	1764724	1764729	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	526231912
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33464	NC_021872	ATC	2	6	1783081	1783086	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	526232582
33465	NC_021872	AGT	2	6	1783141	1783146	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	526232582
33466	NC_021872	TAT	2	6	1783161	1783166	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	526232582
33467	NC_021872	TGA	2	6	1783184	1783189	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	526232582
33468	NC_021872	TGT	2	6	1783219	1783224	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	526232582
33469	NC_021872	CAT	2	6	1783353	1783358	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	526232582
33470	NC_021872	TCTT	2	8	1783398	1783405	0 %	75 %	0 %	25 %	526232583
33471	NC_021872	CAA	2	6	1783414	1783419	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	526232583
33472	NC_021872	CTT	2	6	1783439	1783444	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	526232583
33473	NC_021872	CAT	2	6	1783468	1783473	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	526232583
33474	NC_021872	TCTT	2	8	1783491	1783498	0 %	75 %	0 %	25 %	526232583
33475	NC_021872	GTCT	2	8	1783535	1783542	0 %	50 %	25 %	25 %	526232583
33476	NC_021872	TAA	2	6	1783546	1783551	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	526232583
33477	NC_021872	AAT	2	6	1783619	1783624	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	526232583
33478	NC_021872	CCA	2	6	1783677	1783682	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	526232583
33479	NC_021872	ATCAA	2	10	1783695	1783704	60 %	20 %	0 %	20 %	526232583
33480	NC_021872	GTT	2	6	1783720	1783725	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	526232583
33481	NC_021872	TCA	2	6	1783731	1783736	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	526232583
33482	NC_021872	CAG	2	6	1783738	1783743	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	526232583
33483	NC_021872	TCA	2	6	1783818	1783823	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	526232583
33484	NC_021872	AT	3	6	1783842	1783847	50 %	50 %	0 %	0 %	526232583
33485	NC_021872	ACC	2	6	1783958	1783963	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	526232583
33486	NC_021872	AAT	2	6	1784012	1784017	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	526232584
33487	NC_021872	TA	3	6	1784124	1784129	50 %	50 %	0 %	0 %	526232584
33488	NC_021872	TAA	2	6	1784137	1784142	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	526232584
33489	NC_021872	CATC	2	8	1784253	1784260	25 %	25 %	0 %	50 %	526232584
33490	NC_021872	AAT	2	6	1784392	1784397	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	526232584
33491	NC_021872	TCA	2	6	1784465	1784470	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	526232584
33492	NC_021872	TAG	2	6	1784561	1784566	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	526232584
33493	NC_021872	T	6	6	1784596	1784601	0 %	100 %	0 %	0 %	526232584
33494	NC_021872	AAT	2	6	1784619	1784624	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	526232584
33495	NC_021872	TACT	2	8	1784738	1784745	25 %	50 %	0 %	25 %	526232585
33496	NC_021872	TGGT	2	8	1784768	1784775	0 %	50 %	50 %	0 %	526232585
33497	NC_021872	CTT	2	6	1784786	1784791	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	526232585
33498	NC_021872	TAA	2	6	1784827	1784832	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	526232585
33499	NC_021872	CAA	2	6	1784908	1784913	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	526232585
33500	NC_021872	TCA	2	6	1784922	1784927	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	526232585

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