MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Lactobacillus reuteri TD1

Total Repeats: 40052

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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32002	NC_021872	TCA	2	6	1708041	1708046	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	526231880
32003	NC_021872	ACC	2	6	1708084	1708089	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	526231880
32004	NC_021872	CCA	2	6	1708098	1708103	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	526231880
32005	NC_021872	CAT	2	6	1708104	1708109	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	526231880
32006	NC_021872	GAG	2	6	1708114	1708119	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	526231880
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32008	NC_021872	CTT	2	6	1708251	1708256	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	526231880
32009	NC_021872	ATT	2	6	1708309	1708314	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	526231881
32010	NC_021872	ATT	2	6	1708316	1708321	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	526231881
32011	NC_021872	AACA	2	8	1708438	1708445	75 %	0 %	0 %	25 %	526231881
32012	NC_021872	TGA	2	6	1708544	1708549	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	526231881
32013	NC_021872	AGGTCA	2	12	1708646	1708657	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	526231881
32014	NC_021872	GCT	2	6	1708730	1708735	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	526231881
32015	NC_021872	CCA	2	6	1708742	1708747	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	526231881
32016	NC_021872	ATA	2	6	1708760	1708765	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	526231881
32017	NC_021872	TTACT	2	10	1708767	1708776	20 %	60 %	0 %	20 %	526231881
32018	NC_021872	ATT	2	6	1708981	1708986	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	526231881
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32021	NC_021872	AGT	2	6	1709061	1709066	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	526231881
32022	NC_021872	TAT	2	6	1709115	1709120	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	526231881
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32024	NC_021872	ATT	2	6	1709233	1709238	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	526231881
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32033	NC_021872	T	6	6	1709796	1709801	0 %	100 %	0 %	0 %	526231882
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32043	NC_021872	CAA	2	6	1710372	1710377	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	526231882
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32105	NC_021872	A	6	6	1713150	1713155	100 %	0 %	0 %	0 %	526231885
32106	NC_021872	CAA	2	6	1713188	1713193	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	526231885
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32108	NC_021872	TCGT	2	8	1713382	1713389	0 %	50 %	25 %	25 %	526231885
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32115	NC_021872	T	7	7	1713719	1713725	0 %	100 %	0 %	0 %	526231885
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32235	NC_021872	ATT	2	6	1719188	1719193	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	526232569
32236	NC_021872	CTTC	2	8	1719199	1719206	0 %	50 %	0 %	50 %	526232570
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32250	NC_021872	TAC	2	6	1719600	1719605	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	526232570
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32254	NC_021872	CAT	2	6	1719963	1719968	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	526232570
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32263	NC_021872	ATA	2	6	1720419	1720424	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	526232571
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32265	NC_021872	ATT	2	6	1720456	1720461	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	526232571
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32323	NC_021872	TAAC	2	8	1723108	1723115	50 %	25 %	0 %	25 %	526231886
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32332	NC_021872	T	6	6	1723571	1723576	0 %	100 %	0 %	0 %	526231886
32333	NC_021872	TAA	2	6	1723627	1723632	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	526231886
32334	NC_021872	ACT	2	6	1723692	1723697	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	526231886
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32337	NC_021872	AATA	2	8	1723802	1723809	75 %	25 %	0 %	0 %	526231886
32338	NC_021872	CAA	2	6	1723882	1723887	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	526231886
32339	NC_021872	AGC	2	6	1723992	1723997	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	526231887
32340	NC_021872	ATG	2	6	1724143	1724148	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	526231887
32341	NC_021872	AAT	2	6	1724160	1724165	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	526231887
32342	NC_021872	ACC	2	6	1724235	1724240	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	526231887
32343	NC_021872	CTT	2	6	1724297	1724302	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	526231887
32344	NC_021872	TAG	2	6	1724321	1724326	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	526231887
32345	NC_021872	GTT	2	6	1724489	1724494	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	526231887
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32347	NC_021872	CAA	2	6	1724561	1724566	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	526231887
32348	NC_021872	TC	3	6	1724624	1724629	0 %	50 %	0 %	50 %	526231887
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32350	NC_021872	TAA	2	6	1724654	1724659	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	526231887
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32462	NC_021872	TC	3	6	1730539	1730544	0 %	50 %	0 %	50 %	526231891
32463	NC_021872	AGA	2	6	1730660	1730665	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	526231891
32464	NC_021872	TCCAT	2	10	1730671	1730680	20 %	40 %	0 %	40 %	526231891
32465	NC_021872	ATT	2	6	1730741	1730746	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	526231891
32466	NC_021872	A	6	6	1730786	1730791	100 %	0 %	0 %	0 %	526231891
32467	NC_021872	TAT	2	6	1730996	1731001	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	526231892
32468	NC_021872	TAA	2	6	1731030	1731035	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	526231892
32469	NC_021872	ACA	2	6	1731089	1731094	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	526231892
32470	NC_021872	ATA	2	6	1731105	1731110	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	526231892
32471	NC_021872	ACC	2	6	1731151	1731156	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	526231892
32472	NC_021872	TAA	2	6	1731167	1731172	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	526231892
32473	NC_021872	AAT	2	6	1731175	1731180	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	526231892
32474	NC_021872	ATCA	2	8	1731211	1731218	50 %	25 %	0 %	25 %	526231892
32475	NC_021872	TTC	2	6	1731319	1731324	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	526231892
32476	NC_021872	CCA	2	6	1731365	1731370	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	526231892
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32478	NC_021872	ATAA	2	8	1731590	1731597	75 %	25 %	0 %	0 %	526231892
32479	NC_021872	ATT	2	6	1731661	1731666	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	526231893
32480	NC_021872	GGAT	2	8	1731768	1731775	25 %	25 %	50 %	0 %	526231893
32481	NC_021872	TTC	2	6	1731803	1731808	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	526231893
32482	NC_021872	ACG	2	6	1731815	1731820	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	526231893
32483	NC_021872	TCT	2	6	1731847	1731852	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	526231893
32484	NC_021872	AACTA	2	10	1731932	1731941	60 %	20 %	0 %	20 %	526231893
32485	NC_021872	CAC	2	6	1732072	1732077	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	526231893
32486	NC_021872	CCA	2	6	1732167	1732172	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	526231893
32487	NC_021872	AAT	2	6	1732208	1732213	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	526231893
32488	NC_021872	ATA	2	6	1732222	1732227	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	526231893
32489	NC_021872	CAT	2	6	1732312	1732317	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	526231893
32490	NC_021872	TGACC	2	10	1732359	1732368	20 %	20 %	20 %	40 %	526231893
32491	NC_021872	CAA	2	6	1732471	1732476	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	526231893
32492	NC_021872	GTG	2	6	1732502	1732507	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	526231893
32493	NC_021872	GCG	2	6	1732774	1732779	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	526231894
32494	NC_021872	T	6	6	1732782	1732787	0 %	100 %	0 %	0 %	526231894
32495	NC_021872	ATC	2	6	1732849	1732854	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	526231894
32496	NC_021872	CTC	2	6	1732881	1732886	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	526231894
32497	NC_021872	ATC	2	6	1732891	1732896	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	526231894
32498	NC_021872	CCG	2	6	1732916	1732921	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	526231894
32499	NC_021872	AT	3	6	1733008	1733013	50 %	50 %	0 %	0 %	526231894
32500	NC_021872	TTGA	2	8	1733070	1733077	25 %	50 %	25 %	0 %	526231894

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