MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Lactobacillus reuteri TD1

Total Repeats: 40052

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
31501	NC_021872	TGC	2	6	1679673	1679678	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	526231854
31502	NC_021872	TA	3	6	1679688	1679693	50 %	50 %	0 %	0 %	526231854
31503	NC_021872	TCA	2	6	1679704	1679709	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	526231854
31504	NC_021872	GTA	2	6	1679713	1679718	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	526231854
31505	NC_021872	CCA	2	6	1679794	1679799	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	526231854
31506	NC_021872	TCA	2	6	1679821	1679826	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	526231854
31507	NC_021872	CGT	2	6	1679846	1679851	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	526231854
31508	NC_021872	TCA	2	6	1679860	1679865	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	526231854
31509	NC_021872	T	6	6	1679871	1679876	0 %	100 %	0 %	0 %	526231854
31510	NC_021872	CAT	2	6	1679937	1679942	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	526231854
31511	NC_021872	TTA	2	6	1679950	1679955	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	526231854
31512	NC_021872	ACG	2	6	1680063	1680068	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	526231854
31513	NC_021872	CGA	2	6	1680202	1680207	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	526231854
31514	NC_021872	GAT	2	6	1680208	1680213	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	526231854
31515	NC_021872	CCG	2	6	1680255	1680260	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	526231854
31516	NC_021872	AAC	2	6	1680288	1680293	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	526231854
31517	NC_021872	TAA	2	6	1680351	1680356	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	526231854
31518	NC_021872	TTG	2	6	1680387	1680392	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	526231854
31519	NC_021872	ATA	2	6	1680413	1680418	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	526231854
31520	NC_021872	TGCTT	2	10	1680421	1680430	0 %	60 %	20 %	20 %	526231854
31521	NC_021872	TTC	2	6	1680501	1680506	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	526231854
31522	NC_021872	ATC	2	6	1680513	1680518	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	526231854
31523	NC_021872	GCAA	2	8	1680580	1680587	50 %	0 %	25 %	25 %	526231854
31524	NC_021872	TCT	2	6	1680843	1680848	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	526231855
31525	NC_021872	TCA	2	6	1680936	1680941	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	526231855
31526	NC_021872	CTCG	2	8	1680952	1680959	0 %	25 %	25 %	50 %	526231855
31527	NC_021872	CCG	2	6	1680972	1680977	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	526231855
31528	NC_021872	TAA	2	6	1681030	1681035	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	526231855
31529	NC_021872	TAAT	2	8	1681038	1681045	50 %	50 %	0 %	0 %	526231855
31530	NC_021872	ACG	2	6	1681085	1681090	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	526231855
31531	NC_021872	CTGAG	2	10	1681100	1681109	20 %	20 %	40 %	20 %	526231855
31532	NC_021872	ATA	2	6	1681140	1681145	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	526231855
31533	NC_021872	ATCGTT	2	12	1681338	1681349	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	526231856
31534	NC_021872	CAA	2	6	1681361	1681366	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	526231856
31535	NC_021872	CAA	2	6	1681376	1681381	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	526231856
31536	NC_021872	ATCAT	2	10	1681405	1681414	40 %	40 %	0 %	20 %	526231856
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31538	NC_021872	GAT	2	6	1681524	1681529	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	526231856
31539	NC_021872	CAA	2	6	1681589	1681594	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	526231856
31540	NC_021872	ATGCAG	2	12	1681634	1681645	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	526231856
31541	NC_021872	TAC	2	6	1681656	1681661	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	526231856
31542	NC_021872	AGC	2	6	1681662	1681667	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	526231856
31543	NC_021872	TTAA	2	8	1681723	1681730	50 %	50 %	0 %	0 %	526231856
31544	NC_021872	TTC	2	6	1681744	1681749	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	526231856
31545	NC_021872	AGC	2	6	1681752	1681757	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	526231856
31546	NC_021872	ACC	2	6	1681842	1681847	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	526231856
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31548	NC_021872	GAA	2	6	1682100	1682105	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	526231856
31549	NC_021872	ATA	2	6	1682191	1682196	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	526231856
31550	NC_021872	CTT	2	6	1682205	1682210	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	526231856
31551	NC_021872	CAG	2	6	1682222	1682227	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	526231856
31552	NC_021872	TAA	2	6	1682345	1682350	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	526231856
31553	NC_021872	CAG	2	6	1682351	1682356	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	526231856
31554	NC_021872	AT	3	6	1682666	1682671	50 %	50 %	0 %	0 %	526232564
31555	NC_021872	AAT	2	6	1682715	1682720	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	526232564
31556	NC_021872	TGC	2	6	1682738	1682743	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	526232564
31557	NC_021872	AGA	3	9	1682768	1682776	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	526232564
31558	NC_021872	GCA	3	9	1682832	1682840	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	526232564
31559	NC_021872	AAAGC	2	10	1682991	1683000	60 %	0 %	20 %	20 %	526232564
31560	NC_021872	TGT	2	6	1683092	1683097	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	526232564
31561	NC_021872	TATGA	2	10	1683111	1683120	40 %	40 %	20 %	0 %	526232564
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31563	NC_021872	CTTC	2	8	1683232	1683239	0 %	50 %	0 %	50 %	526232564
31564	NC_021872	AGA	2	6	1683242	1683247	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	526232564
31565	NC_021872	ATG	2	6	1683280	1683285	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	526232564
31566	NC_021872	CAA	2	6	1683355	1683360	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	526232564
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31568	NC_021872	TATT	2	8	1683433	1683440	25 %	75 %	0 %	0 %	526232564
31569	NC_021872	GA	3	6	1683474	1683479	50 %	0 %	50 %	0 %	526232564
31570	NC_021872	TTA	2	6	1683482	1683487	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	526232564
31571	NC_021872	AACC	2	8	1683495	1683502	50 %	0 %	0 %	50 %	526232564
31572	NC_021872	ATA	2	6	1683550	1683555	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	526232564
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31574	NC_021872	AATT	2	8	1684359	1684366	50 %	50 %	0 %	0 %	526231857
31575	NC_021872	TCA	2	6	1684369	1684374	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	526231857
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31583	NC_021872	GAA	2	6	1684669	1684674	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	526231857
31584	NC_021872	GTTT	2	8	1684805	1684812	0 %	75 %	25 %	0 %	526231857
31585	NC_021872	TAA	2	6	1684827	1684832	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	526231857
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31587	NC_021872	A	6	6	1684859	1684864	100 %	0 %	0 %	0 %	526231857
31588	NC_021872	TAT	2	6	1684877	1684882	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	526231857
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31592	NC_021872	GTA	2	6	1685174	1685179	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	526231858
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31596	NC_021872	ATA	2	6	1685280	1685285	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	526231858
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31598	NC_021872	AGT	2	6	1685449	1685454	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	526231858
31599	NC_021872	GCT	2	6	1685490	1685495	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	526231858
31600	NC_021872	AGC	2	6	1685630	1685635	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	526231858
31601	NC_021872	CCCG	2	8	1685691	1685698	0 %	0 %	25 %	75 %	526231858
31602	NC_021872	A	6	6	1685809	1685814	100 %	0 %	0 %	0 %	526231858
31603	NC_021872	CAG	2	6	1685881	1685886	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	526231858
31604	NC_021872	TAA	2	6	1685941	1685946	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	526231858
31605	NC_021872	CAA	2	6	1685962	1685967	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	526231858
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31610	NC_021872	GATA	2	8	1686120	1686127	50 %	25 %	25 %	0 %	526231858
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31613	NC_021872	CAA	2	6	1686292	1686297	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	526231858
31614	NC_021872	TCG	2	6	1686301	1686306	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	526231858
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31616	NC_021872	CCA	2	6	1686477	1686482	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	526231858
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