MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Lactobacillus reuteri TD1

Total Repeats: 40052

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
31001	NC_021872	ACAA	2	8	1654597	1654604	75 %	0 %	0 %	25 %	526231825
31002	NC_021872	ACC	2	6	1654687	1654692	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	526231826
31003	NC_021872	GCAGAA	2	12	1654715	1654726	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	526231826
31004	NC_021872	TTA	2	6	1654730	1654735	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	526231826
31005	NC_021872	AAT	2	6	1654823	1654828	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	526231826
31006	NC_021872	CAT	2	6	1654848	1654853	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	526231826
31007	NC_021872	ATG	2	6	1654866	1654871	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	526231826
31008	NC_021872	TGA	2	6	1655029	1655034	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	526231826
31009	NC_021872	GCT	2	6	1655075	1655080	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	526231826
31010	NC_021872	TTAATT	2	12	1655125	1655136	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	526231827
31011	NC_021872	CTT	2	6	1655143	1655148	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	526231827
31012	NC_021872	ACG	2	6	1655255	1655260	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	526231827
31013	NC_021872	CCT	2	6	1655328	1655333	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	526231828
31014	NC_021872	CTT	2	6	1655377	1655382	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	526231828
31015	NC_021872	AAC	2	6	1655423	1655428	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	526231828
31016	NC_021872	GT	3	6	1655437	1655442	0 %	50 %	50 %	0 %	526231828
31017	NC_021872	CAC	2	6	1655506	1655511	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	526231828
31018	NC_021872	GCA	2	6	1655514	1655519	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	526231828
31019	NC_021872	TAG	2	6	1655593	1655598	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	526231828
31020	NC_021872	CAG	2	6	1655632	1655637	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	526231828
31021	NC_021872	CTT	2	6	1655668	1655673	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	526231828
31022	NC_021872	CAA	2	6	1655716	1655721	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	526231828
31023	NC_021872	AGC	2	6	1655729	1655734	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	526231828
31024	NC_021872	ACG	2	6	1655744	1655749	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	526231828
31025	NC_021872	TGA	2	6	1655831	1655836	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	526231828
31026	NC_021872	T	6	6	1655859	1655864	0 %	100 %	0 %	0 %	526231829
31027	NC_021872	AGC	2	6	1655887	1655892	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	526231829
31028	NC_021872	CCA	2	6	1655930	1655935	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	526231829
31029	NC_021872	AGTCTT	2	12	1656013	1656024	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	526231829
31030	NC_021872	ACTT	2	8	1656028	1656035	25 %	50 %	0 %	25 %	526231829
31031	NC_021872	TCA	2	6	1656080	1656085	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	526231829
31032	NC_021872	TTTG	2	8	1656106	1656113	0 %	75 %	25 %	0 %	526231829
31033	NC_021872	GAC	2	6	1656177	1656182	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	526231829
31034	NC_021872	TCTTGT	2	12	1656192	1656203	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	526231829
31035	NC_021872	TTAC	2	8	1656282	1656289	25 %	50 %	0 %	25 %	526231830
31036	NC_021872	CCTT	2	8	1656298	1656305	0 %	50 %	0 %	50 %	526231830
31037	NC_021872	CAG	2	6	1656380	1656385	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	526231830
31038	NC_021872	TAG	2	6	1656428	1656433	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	526231830
31039	NC_021872	TCT	2	6	1656460	1656465	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	526231830
31040	NC_021872	CAA	2	6	1656548	1656553	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	526231830
31041	NC_021872	CTT	2	6	1656564	1656569	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	526231830
31042	NC_021872	AAC	2	6	1656579	1656584	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	526231830
31043	NC_021872	TGT	2	6	1656596	1656601	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	526231830
31044	NC_021872	AGT	2	6	1656615	1656620	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	526231830
31045	NC_021872	TTA	2	6	1656640	1656645	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	526231830
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31047	NC_021872	CCA	2	6	1656873	1656878	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	526231831
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31050	NC_021872	GAT	2	6	1657067	1657072	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	526231831
31051	NC_021872	CTTG	2	8	1657075	1657082	0 %	50 %	25 %	25 %	526231831
31052	NC_021872	ATC	2	6	1657085	1657090	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	526231831
31053	NC_021872	T	6	6	1657122	1657127	0 %	100 %	0 %	0 %	526231831
31054	NC_021872	CTT	2	6	1657145	1657150	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	526231831
31055	NC_021872	CTT	2	6	1657291	1657296	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	526231832
31056	NC_021872	T	6	6	1657453	1657458	0 %	100 %	0 %	0 %	526231832
31057	NC_021872	TTC	2	6	1657525	1657530	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	526231833
31058	NC_021872	GTT	2	6	1657544	1657549	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	526231833
31059	NC_021872	AAC	2	6	1657555	1657560	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	526231833
31060	NC_021872	AATT	2	8	1657609	1657616	50 %	50 %	0 %	0 %	526231833
31061	NC_021872	TTAC	2	8	1657664	1657671	25 %	50 %	0 %	25 %	526231833
31062	NC_021872	CATA	2	8	1657728	1657735	50 %	25 %	0 %	25 %	526231833
31063	NC_021872	CAC	2	6	1657740	1657745	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	526231833
31064	NC_021872	TTC	2	6	1657852	1657857	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	526231833
31065	NC_021872	TCA	2	6	1657865	1657870	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	526231833
31066	NC_021872	TAG	2	6	1657884	1657889	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	526231833
31067	NC_021872	AGT	2	6	1657953	1657958	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	526231833
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31072	NC_021872	CCA	2	6	1658196	1658201	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	526231834
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31088	NC_021872	ACA	2	6	1659020	1659025	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	526231836
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31100	NC_021872	TAG	2	6	1659796	1659801	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	526231838
31101	NC_021872	CAC	2	6	1659811	1659816	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	526231838
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31109	NC_021872	CAC	2	6	1660642	1660647	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	526231839
31110	NC_021872	CTTA	2	8	1660800	1660807	25 %	50 %	0 %	25 %	526231840
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31114	NC_021872	TCT	2	6	1660886	1660891	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	526231840
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31116	NC_021872	ACG	2	6	1660969	1660974	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	526231840
31117	NC_021872	TGA	2	6	1660986	1660991	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	526231840
31118	NC_021872	TCT	2	6	1660995	1661000	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	526231840
31119	NC_021872	CTT	2	6	1661010	1661015	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	526231840
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31123	NC_021872	TCT	2	6	1661191	1661196	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	526231841
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31218	NC_021872	ATC	2	6	1665891	1665896	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	526231846
31219	NC_021872	GTG	2	6	1666022	1666027	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	526231846
31220	NC_021872	ATG	2	6	1666261	1666266	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	526231846
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31222	NC_021872	TAG	2	6	1666295	1666300	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	526231846
31223	NC_021872	CTG	2	6	1666301	1666306	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	526231846
31224	NC_021872	CATC	2	8	1666337	1666344	25 %	25 %	0 %	50 %	526231846
31225	NC_021872	CAT	2	6	1666364	1666369	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	526231846
31226	NC_021872	GTC	2	6	1666426	1666431	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	526231846
31227	NC_021872	TTA	2	6	1666495	1666500	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	526231846
31228	NC_021872	ATT	2	6	1666641	1666646	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	526231847
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31230	NC_021872	TAT	2	6	1666725	1666730	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	526231847
31231	NC_021872	CGA	2	6	1666829	1666834	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	526231847
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31445	NC_021872	T	6	6	1677309	1677314	0 %	100 %	0 %	0 %	526231853
31446	NC_021872	TAA	2	6	1677337	1677342	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	526231853
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31457	NC_021872	T	7	7	1677620	1677626	0 %	100 %	0 %	0 %	526231853
31458	NC_021872	TTA	2	6	1677687	1677692	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	526231853
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31460	NC_021872	GTG	2	6	1677761	1677766	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	526231853
31461	NC_021872	AAT	2	6	1677843	1677848	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	526231853
31462	NC_021872	CTTGT	2	10	1677871	1677880	0 %	60 %	20 %	20 %	526231853
31463	NC_021872	CGCT	2	8	1677896	1677903	0 %	25 %	25 %	50 %	526231853
31464	NC_021872	TATT	2	8	1678195	1678202	25 %	75 %	0 %	0 %	526231854
31465	NC_021872	CTT	2	6	1678236	1678241	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	526231854
31466	NC_021872	CAC	2	6	1678304	1678309	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	526231854
31467	NC_021872	ATC	2	6	1678329	1678334	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	526231854
31468	NC_021872	ACG	2	6	1678356	1678361	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	526231854
31469	NC_021872	GCA	2	6	1678417	1678422	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	526231854
31470	NC_021872	TGA	2	6	1678495	1678500	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	526231854
31471	NC_021872	TTCT	2	8	1678503	1678510	0 %	75 %	0 %	25 %	526231854
31472	NC_021872	AATG	2	8	1678516	1678523	50 %	25 %	25 %	0 %	526231854
31473	NC_021872	TCA	2	6	1678537	1678542	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	526231854
31474	NC_021872	TTG	2	6	1678581	1678586	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	526231854
31475	NC_021872	CGC	3	9	1678593	1678601	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	526231854
31476	NC_021872	AACC	2	8	1678640	1678647	50 %	0 %	0 %	50 %	526231854
31477	NC_021872	ATA	3	9	1678690	1678698	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	526231854
31478	NC_021872	CAT	2	6	1678748	1678753	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	526231854
31479	NC_021872	TAA	2	6	1678767	1678772	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	526231854
31480	NC_021872	TAA	2	6	1678809	1678814	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	526231854
31481	NC_021872	AAC	2	6	1678815	1678820	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	526231854
31482	NC_021872	TGT	2	6	1678831	1678836	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	526231854
31483	NC_021872	AT	3	6	1678924	1678929	50 %	50 %	0 %	0 %	526231854
31484	NC_021872	TCACTC	2	12	1679167	1679178	16.67 %	33.33 %	0 %	50 %	526231854
31485	NC_021872	TTC	2	6	1679179	1679184	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	526231854
31486	NC_021872	CAA	2	6	1679216	1679221	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	526231854
31487	NC_021872	TTG	2	6	1679274	1679279	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	526231854
31488	NC_021872	ATCTT	2	10	1679302	1679311	20 %	60 %	0 %	20 %	526231854
31489	NC_021872	TTG	2	6	1679325	1679330	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	526231854
31490	NC_021872	CTT	3	9	1679372	1679380	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	526231854
31491	NC_021872	TCT	2	6	1679395	1679400	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	526231854
31492	NC_021872	TGA	2	6	1679422	1679427	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	526231854
31493	NC_021872	TCA	2	6	1679470	1679475	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	526231854
31494	NC_021872	CTT	2	6	1679540	1679545	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	526231854
31495	NC_021872	TCA	2	6	1679554	1679559	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	526231854
31496	NC_021872	ATG	2	6	1679571	1679576	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	526231854
31497	NC_021872	CTC	2	6	1679580	1679585	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	526231854
31498	NC_021872	AGT	2	6	1679628	1679633	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	526231854
31499	NC_021872	TCA	2	6	1679638	1679643	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	526231854
31500	NC_021872	CGT	2	6	1679662	1679667	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	526231854

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