MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Lactobacillus reuteri TD1

Total Repeats: 40052

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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30002	NC_021872	AAT	2	6	1600190	1600195	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	526231780
30003	NC_021872	GGCT	2	8	1600231	1600238	0 %	25 %	50 %	25 %	526231780
30004	NC_021872	AAT	2	6	1600246	1600251	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	526231780
30005	NC_021872	TTG	2	6	1600282	1600287	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	526231780
30006	NC_021872	CAG	2	6	1600428	1600433	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	526231780
30007	NC_021872	TAA	2	6	1600482	1600487	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	526231780
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30009	NC_021872	GAA	2	6	1600756	1600761	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	526231781
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30012	NC_021872	CAA	2	6	1600904	1600909	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	526231781
30013	NC_021872	AGTT	2	8	1600923	1600930	25 %	50 %	25 %	0 %	526231781
30014	NC_021872	AAC	2	6	1600974	1600979	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	526231781
30015	NC_021872	TGA	2	6	1601005	1601010	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	526231781
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30017	NC_021872	TCT	2	6	1601344	1601349	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	526231782
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30019	NC_021872	TGT	2	6	1601448	1601453	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	526231782
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30023	NC_021872	TCA	2	6	1601528	1601533	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	526231782
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30025	NC_021872	AGT	2	6	1601616	1601621	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	526231782
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30033	NC_021872	TTG	2	6	1601865	1601870	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	526231783
30034	NC_021872	TCT	3	9	1601888	1601896	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	526231783
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30043	NC_021872	TTA	2	6	1602434	1602439	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	526231783
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30051	NC_021872	TCA	2	6	1602662	1602667	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	526231783
30052	NC_021872	CATT	2	8	1602675	1602682	25 %	50 %	0 %	25 %	526231783
30053	NC_021872	TTGG	2	8	1602688	1602695	0 %	50 %	50 %	0 %	526231783
30054	NC_021872	AAT	2	6	1602724	1602729	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	526231783
30055	NC_021872	GCT	2	6	1602925	1602930	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	526231784
30056	NC_021872	TGA	2	6	1602949	1602954	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	526231784
30057	NC_021872	TAC	2	6	1602969	1602974	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	526231784
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30059	NC_021872	TTG	2	6	1603029	1603034	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	526231784
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30062	NC_021872	T	6	6	1603090	1603095	0 %	100 %	0 %	0 %	526231784
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30235	NC_021872	AAG	2	6	1612054	1612059	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	526232551
30236	NC_021872	A	6	6	1612074	1612079	100 %	0 %	0 %	0 %	526232551
30237	NC_021872	GAC	2	6	1612288	1612293	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	526232552
30238	NC_021872	CAA	2	6	1612348	1612353	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	526232552
30239	NC_021872	GAA	2	6	1612390	1612395	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	526232552
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30242	NC_021872	GCC	2	6	1612624	1612629	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	526232552
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30245	NC_021872	CAA	2	6	1612822	1612827	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	526232552
30246	NC_021872	TTTTC	2	10	1612840	1612849	0 %	80 %	0 %	20 %	526232552
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30330	NC_021872	A	6	6	1618346	1618351	100 %	0 %	0 %	0 %	526232555
30331	NC_021872	TCCT	2	8	1618390	1618397	0 %	50 %	0 %	50 %	526232555
30332	NC_021872	GAT	2	6	1618452	1618457	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	526232555
30333	NC_021872	CAA	2	6	1618527	1618532	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	526232555
30334	NC_021872	TGG	2	6	1618556	1618561	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	526232555
30335	NC_021872	ATT	2	6	1618582	1618587	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	526232555
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30337	NC_021872	TTTG	2	8	1618811	1618818	0 %	75 %	25 %	0 %	526232556
30338	NC_021872	A	6	6	1618839	1618844	100 %	0 %	0 %	0 %	526232556
30339	NC_021872	ATG	2	6	1618859	1618864	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	526232556
30340	NC_021872	ACT	2	6	1618887	1618892	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	526232556
30341	NC_021872	T	6	6	1618892	1618897	0 %	100 %	0 %	0 %	526232556
30342	NC_021872	CTG	2	6	1619100	1619105	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	526232556
30343	NC_021872	TGA	2	6	1619143	1619148	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	526232556
30344	NC_021872	CTT	2	6	1619188	1619193	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	526232556
30345	NC_021872	TTAA	2	8	1619526	1619533	50 %	50 %	0 %	0 %	526232557
30346	NC_021872	ATC	2	6	1619627	1619632	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	526232557
30347	NC_021872	ATA	2	6	1619633	1619638	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	526232557
30348	NC_021872	ACC	2	6	1619648	1619653	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	526232557
30349	NC_021872	ACC	2	6	1619657	1619662	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	526232557
30350	NC_021872	AAT	2	6	1619672	1619677	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	526232557
30351	NC_021872	CTC	2	6	1619711	1619716	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	526232557
30352	NC_021872	T	6	6	1619734	1619739	0 %	100 %	0 %	0 %	526232557
30353	NC_021872	TAA	2	6	1619807	1619812	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	526232557
30354	NC_021872	CTGA	2	8	1619869	1619876	25 %	25 %	25 %	25 %	526232557
30355	NC_021872	CAT	2	6	1619908	1619913	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	526232557
30356	NC_021872	TAC	3	9	1619974	1619982	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	526232557
30357	NC_021872	CTG	2	6	1620137	1620142	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	526232557
30358	NC_021872	TCT	2	6	1620165	1620170	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	526232557
30359	NC_021872	ATA	2	6	1620198	1620203	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	526232557
30360	NC_021872	AGC	2	6	1620239	1620244	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	526232557
30361	NC_021872	TG	3	6	1620263	1620268	0 %	50 %	50 %	0 %	526232557
30362	NC_021872	AGAA	2	8	1620302	1620309	75 %	0 %	25 %	0 %	526232557
30363	NC_021872	TCA	2	6	1620315	1620320	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	526232557
30364	NC_021872	GGTT	2	8	1620364	1620371	0 %	50 %	50 %	0 %	526232557
30365	NC_021872	ATTTT	2	10	1620384	1620393	20 %	80 %	0 %	0 %	526232557
30366	NC_021872	T	6	6	1620390	1620395	0 %	100 %	0 %	0 %	526232557
30367	NC_021872	ACG	2	6	1620428	1620433	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	526232557
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30369	NC_021872	GTT	2	6	1620500	1620505	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	526232557
30370	NC_021872	CTG	2	6	1620538	1620543	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	526232557
30371	NC_021872	TTC	2	6	1620647	1620652	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	526232557
30372	NC_021872	TAA	2	6	1620707	1620712	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	526232557
30373	NC_021872	TGA	2	6	1620743	1620748	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	526232557
30374	NC_021872	ATC	2	6	1620752	1620757	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	526232557
30375	NC_021872	TGG	2	6	1620789	1620794	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	526232557
30376	NC_021872	AAT	2	6	1620811	1620816	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	526232557
30377	NC_021872	CAG	2	6	1620835	1620840	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	526232557
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30381	NC_021872	CGT	2	6	1621055	1621060	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	526232558
30382	NC_021872	T	6	6	1621333	1621338	0 %	100 %	0 %	0 %	526232559
30383	NC_021872	GGC	2	6	1621351	1621356	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	526232559
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30393	NC_021872	CTGT	2	8	1622342	1622349	0 %	50 %	25 %	25 %	526232560
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30404	NC_021872	TTC	2	6	1622797	1622802	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	526231793
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30417	NC_021872	TTAG	2	8	1623384	1623391	25 %	50 %	25 %	0 %	526231794
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30435	NC_021872	GTA	2	6	1624724	1624729	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	526232561
30436	NC_021872	GTA	2	6	1624745	1624750	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	526232561
30437	NC_021872	TCACCG	2	12	1624752	1624763	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	526232561
30438	NC_021872	TAAC	2	8	1624815	1624822	50 %	25 %	0 %	25 %	526232561
30439	NC_021872	TTAA	2	8	1624907	1624914	50 %	50 %	0 %	0 %	526232561
30440	NC_021872	TCA	2	6	1624949	1624954	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	526232561
30441	NC_021872	TCA	2	6	1624970	1624975	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	526232561
30442	NC_021872	CAC	2	6	1624978	1624983	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	526232561
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30444	NC_021872	GCT	2	6	1625010	1625015	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	526232561
30445	NC_021872	ACCA	2	8	1625062	1625069	50 %	0 %	0 %	50 %	526232561
30446	NC_021872	CGC	2	6	1625089	1625094	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	526232561
30447	NC_021872	ATG	2	6	1625175	1625180	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	526232561
30448	NC_021872	TAA	2	6	1625290	1625295	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	526232561
30449	NC_021872	TCAG	2	8	1625330	1625337	25 %	25 %	25 %	25 %	526232561
30450	NC_021872	ATC	3	9	1625561	1625569	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	526231795
30451	NC_021872	GAT	2	6	1625587	1625592	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	526231795
30452	NC_021872	ATA	2	6	1625616	1625621	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	526231795
30453	NC_021872	A	6	6	1625642	1625647	100 %	0 %	0 %	0 %	526231795
30454	NC_021872	AG	3	6	1625653	1625658	50 %	0 %	50 %	0 %	526231795
30455	NC_021872	TAA	2	6	1625734	1625739	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	526231795
30456	NC_021872	ATA	2	6	1625773	1625778	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	526231795
30457	NC_021872	ATC	2	6	1625801	1625806	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	526231795
30458	NC_021872	T	6	6	1625854	1625859	0 %	100 %	0 %	0 %	526231795
30459	NC_021872	TCT	2	6	1625880	1625885	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	526231795
30460	NC_021872	GAA	2	6	1626080	1626085	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	526231796
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30462	NC_021872	TAA	2	6	1626155	1626160	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	526231796
30463	NC_021872	A	6	6	1626179	1626184	100 %	0 %	0 %	0 %	526231796
30464	NC_021872	TCT	2	6	1626201	1626206	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	526231796
30465	NC_021872	TCA	2	6	1626243	1626248	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	526231796
30466	NC_021872	CAA	2	6	1626298	1626303	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	526231796
30467	NC_021872	ATTT	2	8	1626320	1626327	25 %	75 %	0 %	0 %	526231796
30468	NC_021872	GACT	2	8	1626447	1626454	25 %	25 %	25 %	25 %	526231796
30469	NC_021872	GAA	2	6	1626457	1626462	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	526231796
30470	NC_021872	ATG	2	6	1626494	1626499	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	526231796
30471	NC_021872	CAA	2	6	1626541	1626546	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	526231796
30472	NC_021872	AGA	2	6	1626627	1626632	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	526231796
30473	NC_021872	TTA	2	6	1626673	1626678	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	526231796
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30482	NC_021872	GAA	2	6	1627098	1627103	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	526231797
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30486	NC_021872	TGG	2	6	1627470	1627475	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	526231797
30487	NC_021872	AACA	2	8	1627500	1627507	75 %	0 %	0 %	25 %	526231797
30488	NC_021872	AAC	2	6	1627537	1627542	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	526231797
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30491	NC_021872	TTAA	2	8	1627739	1627746	50 %	50 %	0 %	0 %	526231798
30492	NC_021872	ATTG	2	8	1627771	1627778	25 %	50 %	25 %	0 %	526231798
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30496	NC_021872	AGTT	2	8	1628171	1628178	25 %	50 %	25 %	0 %	526231799
30497	NC_021872	AGTT	3	12	1628261	1628272	25 %	50 %	25 %	0 %	526231799
30498	NC_021872	AGT	2	6	1628282	1628287	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	526231799
30499	NC_021872	CCAC	2	8	1628295	1628302	25 %	0 %	0 %	75 %	526231799
30500	NC_021872	TTC	2	6	1628319	1628324	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	526231799

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