MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Lactobacillus reuteri TD1

Total Repeats: 40052

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
2501	NC_021872	AAC	2	6	131712	131717	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	526232177
2502	NC_021872	CAA	2	6	131721	131726	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	526232177
2503	NC_021872	ATT	2	6	131727	131732	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	526232177
2504	NC_021872	TAC	2	6	131744	131749	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	526232177
2505	NC_021872	GCT	2	6	131805	131810	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	526232177
2506	NC_021872	TGA	3	9	131876	131884	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	526232177
2507	NC_021872	CAA	2	6	131928	131933	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	526232177
2508	NC_021872	GATCCA	2	12	131985	131996	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	526232177
2509	NC_021872	AAC	2	6	132100	132105	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	526232177
2510	NC_021872	TTCAC	2	10	132109	132118	20 %	40 %	0 %	40 %	526232177
2511	NC_021872	ATG	2	6	132259	132264	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	526232177
2512	NC_021872	ATT	2	6	132336	132341	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	526232177
2513	NC_021872	GTT	2	6	132510	132515	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	526232177
2514	NC_021872	TGA	2	6	132551	132556	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	526232177
2515	NC_021872	CAA	2	6	132605	132610	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	526232177
2516	NC_021872	ATT	2	6	132616	132621	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	526232177
2517	NC_021872	ATC	2	6	132766	132771	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	526232177
2518	NC_021872	GAA	2	6	132800	132805	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	526232177
2519	NC_021872	TGT	2	6	132848	132853	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	526232177
2520	NC_021872	AAGT	2	8	132862	132869	50 %	25 %	25 %	0 %	526232177
2521	NC_021872	TCAC	2	8	132910	132917	25 %	25 %	0 %	50 %	526232177
2522	NC_021872	AGTT	2	8	132919	132926	25 %	50 %	25 %	0 %	526232177
2523	NC_021872	ATC	2	6	132945	132950	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	526232177
2524	NC_021872	GCT	2	6	132975	132980	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	526232177
2525	NC_021872	TGT	2	6	132998	133003	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	526232177
2526	NC_021872	AAC	2	6	133089	133094	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	526232177
2527	NC_021872	ATT	2	6	133107	133112	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	526232177
2528	NC_021872	TAC	2	6	133122	133127	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	526232177
2529	NC_021872	TGA	2	6	133193	133198	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	526232177
2530	NC_021872	CTA	2	6	133303	133308	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	526232177
2531	NC_021872	GGT	2	6	133374	133379	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	526232177
2532	NC_021872	AAG	2	6	133428	133433	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	526232177
2533	NC_021872	ATT	2	6	133443	133448	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	526232177
2534	NC_021872	ACT	2	6	133602	133607	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	526232177
2535	NC_021872	TGA	2	6	133658	133663	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	526232177
2536	NC_021872	ACT	2	6	133723	133728	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	526232177
2537	NC_021872	CTA	2	6	133813	133818	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	526232177
2538	NC_021872	AAG	2	6	133915	133920	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	526232177
2539	NC_021872	ACG	2	6	134212	134217	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	526232177
2540	NC_021872	TTG	2	6	134293	134298	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	526232177
2541	NC_021872	TGT	2	6	134516	134521	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	526232177
2542	NC_021872	AAG	2	6	134538	134543	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	526232177
2543	NC_021872	CAA	2	6	134659	134664	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	526232177
2544	NC_021872	GTT	2	6	134727	134732	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	526232177
2545	NC_021872	ACC	2	6	134734	134739	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	526232177
2546	NC_021872	TAAC	2	8	134782	134789	50 %	25 %	0 %	25 %	526232177
2547	NC_021872	GAA	2	6	134793	134798	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	526232177
2548	NC_021872	GCT	2	6	134922	134927	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	526232177
2549	NC_021872	TGATAA	2	12	134930	134941	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	526232177
2550	NC_021872	TGT	2	6	135236	135241	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	526232177
2551	NC_021872	GTA	2	6	135276	135281	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	526232177
2552	NC_021872	ATGGCA	2	12	135295	135306	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	526232177
2553	NC_021872	ATT	2	6	135384	135389	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	526232177
2554	NC_021872	TGT	2	6	135593	135598	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	526232177
2555	NC_021872	AAC	3	9	135618	135626	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	526232177
2556	NC_021872	AGC	2	6	135703	135708	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	526232177
2557	NC_021872	ATG	2	6	135769	135774	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	526232177
2558	NC_021872	CAA	2	6	135816	135821	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	526232177
2559	NC_021872	TAA	2	6	135959	135964	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	526232177
2560	NC_021872	TGGTAA	2	12	136058	136069	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	526232177
2561	NC_021872	TGT	2	6	136109	136114	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	526232177
2562	NC_021872	ATT	2	6	136221	136226	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	526232177
2563	NC_021872	TGT	2	6	136430	136435	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	526232177
2564	NC_021872	AAC	2	6	136455	136460	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	526232177
2565	NC_021872	AGC	2	6	136540	136545	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	526232177
2566	NC_021872	GAC	2	6	136608	136613	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	526232177
2567	NC_021872	TAC	2	6	136616	136621	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	526232177
2568	NC_021872	ACG	2	6	136656	136661	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	526232177
2569	NC_021872	CAA	2	6	136895	136900	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	526232177
2570	NC_021872	ATG	2	6	136909	136914	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	526232177
2571	NC_021872	GTT	2	6	136929	136934	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	526232177
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2574	NC_021872	AAC	3	9	137280	137288	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	526232177
2575	NC_021872	TGACT	2	10	137309	137318	20 %	40 %	20 %	20 %	526232177
2576	NC_021872	ATCAA	2	10	137356	137365	60 %	20 %	0 %	20 %	526232177
2577	NC_021872	CAG	2	6	137410	137415	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	526232177
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2579	NC_021872	TGT	2	6	137459	137464	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	526232177
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2582	NC_021872	TAA	2	6	137618	137623	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	526232177
2583	NC_021872	TGA	2	6	137630	137635	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	526232177
2584	NC_021872	ATC	2	6	137670	137675	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	526232177
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2586	NC_021872	CTG	2	6	137719	137724	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	526232177
2587	NC_021872	CAA	2	6	137811	137816	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	526232177
2588	NC_021872	TTAC	2	8	137833	137840	25 %	50 %	0 %	25 %	526232177
2589	NC_021872	CCAA	2	8	137931	137938	50 %	0 %	0 %	50 %	526232177
2590	NC_021872	GTT	2	6	138030	138035	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	526232177
2591	NC_021872	ACG	2	6	138039	138044	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	526232177
2592	NC_021872	AAG	2	6	138183	138188	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	526232177
2593	NC_021872	AAT	2	6	138210	138215	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	526232177
2594	NC_021872	GCT	2	6	138219	138224	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	526232177
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2597	NC_021872	CATTT	2	10	138537	138546	20 %	60 %	0 %	20 %	526232178
2598	NC_021872	A	6	6	138559	138564	100 %	0 %	0 %	0 %	526232178
2599	NC_021872	TAT	2	6	138578	138583	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	526232178
2600	NC_021872	ATA	2	6	138601	138606	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	526232178
2601	NC_021872	TTA	2	6	138624	138629	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	526232178
2602	NC_021872	GTG	2	6	140010	140015	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	526230799
2603	NC_021872	AGA	2	6	140023	140028	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	526230799
2604	NC_021872	TGA	2	6	140032	140037	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	526230799
2605	NC_021872	CAA	2	6	140075	140080	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	526230799
2606	NC_021872	AGA	2	6	140118	140123	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	526230799
2607	NC_021872	CCG	2	6	140151	140156	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	526230799
2608	NC_021872	TGC	2	6	140158	140163	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	526230799
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2611	NC_021872	TGA	2	6	140494	140499	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	526230799
2612	NC_021872	GAAG	2	8	140506	140513	50 %	0 %	50 %	0 %	526230799
2613	NC_021872	ACC	2	6	140530	140535	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	526230799
2614	NC_021872	AT	3	6	140536	140541	50 %	50 %	0 %	0 %	526230799
2615	NC_021872	AAG	2	6	140589	140594	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	526230799
2616	NC_021872	CTG	2	6	140637	140642	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	526230799
2617	NC_021872	TAC	2	6	140660	140665	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	526230799
2618	NC_021872	GAA	2	6	140687	140692	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	526230799
2619	NC_021872	CAT	2	6	140721	140726	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	526230799
2620	NC_021872	AGC	2	6	140743	140748	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	526230799
2621	NC_021872	GAA	2	6	140875	140880	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	526230799
2622	NC_021872	TTA	2	6	140901	140906	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	526230799
2623	NC_021872	ACT	2	6	140912	140917	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	526230799
2624	NC_021872	GTT	2	6	141000	141005	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	526230799
2625	NC_021872	CGG	2	6	141029	141034	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	526230799
2626	NC_021872	CA	3	6	141080	141085	50 %	0 %	0 %	50 %	526230799
2627	NC_021872	CATG	2	8	141190	141197	25 %	25 %	25 %	25 %	526230799
2628	NC_021872	TAA	2	6	141238	141243	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	526230799
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2630	NC_021872	AGC	2	6	141529	141534	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	526230800
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2632	NC_021872	ATC	2	6	141550	141555	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	526230800
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2634	NC_021872	CAG	2	6	141607	141612	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	526230800
2635	NC_021872	CTG	2	6	141617	141622	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	526230800
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2640	NC_021872	TACTA	2	10	141889	141898	40 %	40 %	0 %	20 %	526230800
2641	NC_021872	GTT	2	6	141904	141909	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	526230800
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2659	NC_021872	TAT	2	6	142797	142802	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	526230800
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2669	NC_021872	CT	3	6	143411	143416	0 %	50 %	0 %	50 %	526230801
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2700	NC_021872	GTA	2	6	146448	146453	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	526230803
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2730	NC_021872	GCA	2	6	147815	147820	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	526230804
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2732	NC_021872	CTG	2	6	147933	147938	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	526230804
2733	NC_021872	ACT	2	6	148015	148020	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	526230804
2734	NC_021872	GTTC	2	8	148077	148084	0 %	50 %	25 %	25 %	526230804
2735	NC_021872	GGT	2	6	148088	148093	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	526230804
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2737	NC_021872	TTGGA	2	10	148182	148191	20 %	40 %	40 %	0 %	526230804
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2739	NC_021872	TGC	2	6	148263	148268	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	526230804
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2742	NC_021872	CTT	2	6	148343	148348	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	526230804
2743	NC_021872	TAC	2	6	148363	148368	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	526230804
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2863	NC_021872	AGTG	2	8	154491	154498	25 %	25 %	50 %	0 %	526230812
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2982	NC_021872	GTT	2	6	160796	160801	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	526230818
2983	NC_021872	CCAAGC	2	12	160819	160830	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	526230818
2984	NC_021872	GCT	2	6	160883	160888	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	526230818
2985	NC_021872	TGA	2	6	160891	160896	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	526230818
2986	NC_021872	TAA	2	6	160897	160902	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	526230818
2987	NC_021872	ATT	2	6	160906	160911	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	526230818
2988	NC_021872	TGC	2	6	160915	160920	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	526230818
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2990	NC_021872	CAG	2	6	161016	161021	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	526230818
2991	NC_021872	TTC	2	6	161025	161030	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	526230818
2992	NC_021872	TTTG	2	8	161113	161120	0 %	75 %	25 %	0 %	526230818
2993	NC_021872	CGT	2	6	161134	161139	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	526230818
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2999	NC_021872	TGG	2	6	161314	161319	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	526230818
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