MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Lactobacillus reuteri TD1

Total Repeats: 40052

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
26501	NC_021872	CTA	2	6	1411857	1411862	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	526231651
26502	NC_021872	GTT	2	6	1411900	1411905	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	526231652
26503	NC_021872	ATC	2	6	1411980	1411985	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	526231652
26504	NC_021872	ATA	2	6	1412056	1412061	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	526231652
26505	NC_021872	CTTTT	2	10	1412064	1412073	0 %	80 %	0 %	20 %	526231652
26506	NC_021872	T	6	6	1412070	1412075	0 %	100 %	0 %	0 %	526231652
26507	NC_021872	GTC	2	6	1412155	1412160	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	526231652
26508	NC_021872	ATA	2	6	1412169	1412174	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	526231652
26509	NC_021872	T	7	7	1412228	1412234	0 %	100 %	0 %	0 %	526231652
26510	NC_021872	TGA	2	6	1412290	1412295	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	526231652
26511	NC_021872	GCTG	2	8	1412326	1412333	0 %	25 %	50 %	25 %	526231652
26512	NC_021872	CATT	2	8	1412380	1412387	25 %	50 %	0 %	25 %	526231652
26513	NC_021872	T	6	6	1412386	1412391	0 %	100 %	0 %	0 %	526231652
26514	NC_021872	TTAAT	2	10	1412459	1412468	40 %	60 %	0 %	0 %	526231653
26515	NC_021872	CAC	2	6	1412535	1412540	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	526231653
26516	NC_021872	GTT	2	6	1412564	1412569	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	526231653
26517	NC_021872	AGA	2	6	1412576	1412581	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	526231653
26518	NC_021872	TCG	2	6	1412582	1412587	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	526231653
26519	NC_021872	ATTG	2	8	1412695	1412702	25 %	50 %	25 %	0 %	526231653
26520	NC_021872	ATC	2	6	1412710	1412715	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	526231653
26521	NC_021872	GAAC	2	8	1412774	1412781	50 %	0 %	25 %	25 %	526231653
26522	NC_021872	CTG	2	6	1412802	1412807	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	526231653
26523	NC_021872	ACT	3	9	1412819	1412827	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	526231653
26524	NC_021872	CTG	2	6	1412847	1412852	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	526231653
26525	NC_021872	CTG	2	6	1412925	1412930	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	526231653
26526	NC_021872	CAA	2	6	1412955	1412960	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	526231653
26527	NC_021872	GCG	2	6	1412976	1412981	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	526231653
26528	NC_021872	TTC	2	6	1413010	1413015	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	526231653
26529	NC_021872	GCCA	2	8	1413135	1413142	25 %	0 %	25 %	50 %	526231653
26530	NC_021872	CGT	2	6	1413167	1413172	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	526231653
26531	NC_021872	T	6	6	1413175	1413180	0 %	100 %	0 %	0 %	526231653
26532	NC_021872	CTT	2	6	1413190	1413195	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	526231653
26533	NC_021872	ATC	2	6	1413349	1413354	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	526231654
26534	NC_021872	CAA	2	6	1413414	1413419	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	526231654
26535	NC_021872	ATG	2	6	1413451	1413456	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	526231654
26536	NC_021872	ATC	2	6	1413561	1413566	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	526231654
26537	NC_021872	GAAG	2	8	1413567	1413574	50 %	0 %	50 %	0 %	526231654
26538	NC_021872	CAT	2	6	1413588	1413593	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	526231654
26539	NC_021872	AAACGA	2	12	1413716	1413727	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	526231655
26540	NC_021872	CTG	2	6	1413758	1413763	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	526231655
26541	NC_021872	CTT	2	6	1413764	1413769	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	526231655
26542	NC_021872	ACT	2	6	1413785	1413790	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	526231655
26543	NC_021872	GCA	2	6	1413841	1413846	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	526231655
26544	NC_021872	TAGC	2	8	1413861	1413868	25 %	25 %	25 %	25 %	526231655
26545	NC_021872	ATT	2	6	1413896	1413901	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	526231655
26546	NC_021872	A	6	6	1413956	1413961	100 %	0 %	0 %	0 %	526231655
26547	NC_021872	AGC	2	6	1414030	1414035	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	526231655
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26549	NC_021872	GGC	2	6	1414054	1414059	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	526231655
26550	NC_021872	CAA	2	6	1414067	1414072	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	526231655
26551	NC_021872	ATG	2	6	1414073	1414078	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	526231655
26552	NC_021872	AAC	2	6	1414094	1414099	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	526231655
26553	NC_021872	GCC	2	6	1414157	1414162	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	526231655
26554	NC_021872	TGC	2	6	1414168	1414173	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	526231655
26555	NC_021872	CTTT	2	8	1414206	1414213	0 %	75 %	0 %	25 %	526231655
26556	NC_021872	TAT	2	6	1414237	1414242	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	526231655
26557	NC_021872	TGC	2	6	1414270	1414275	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	526231655
26558	NC_021872	AGA	2	6	1414314	1414319	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	526231655
26559	NC_021872	GCT	2	6	1414331	1414336	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	526231655
26560	NC_021872	CTT	2	6	1414360	1414365	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	526231655
26561	NC_021872	CTT	2	6	1414377	1414382	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	526231655
26562	NC_021872	CTT	2	6	1414402	1414407	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	526231655
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26565	NC_021872	TCG	2	6	1414468	1414473	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	526231655
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26590	NC_021872	ATG	2	6	1415634	1415639	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	526231657
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26592	NC_021872	AAT	2	6	1415671	1415676	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	526231657
26593	NC_021872	CT	3	6	1415691	1415696	0 %	50 %	0 %	50 %	526231657
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26597	NC_021872	GCCG	2	8	1415906	1415913	0 %	0 %	50 %	50 %	526231657
26598	NC_021872	TAA	2	6	1416052	1416057	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	526231657
26599	NC_021872	A	6	6	1416199	1416204	100 %	0 %	0 %	0 %	526231657
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26601	NC_021872	CAA	2	6	1416231	1416236	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	526231657
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26605	NC_021872	TTTAC	2	10	1416339	1416348	20 %	60 %	0 %	20 %	526231657
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26614	NC_021872	CAA	2	6	1416724	1416729	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	526231658
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26616	NC_021872	GAT	2	6	1416809	1416814	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	526231658
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26724	NC_021872	T	6	6	1422905	1422910	0 %	100 %	0 %	0 %	526231664
26725	NC_021872	TTA	2	6	1422938	1422943	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	526231664
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26728	NC_021872	CTTC	2	8	1423107	1423114	0 %	50 %	0 %	50 %	526231664
26729	NC_021872	TAA	2	6	1423192	1423197	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	526231664
26730	NC_021872	AT	3	6	1423242	1423247	50 %	50 %	0 %	0 %	526231664
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26732	NC_021872	GCA	2	6	1423377	1423382	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	526231664
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26734	NC_021872	TTG	2	6	1423480	1423485	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	526231664
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26966	NC_021872	GAA	2	6	1435975	1435980	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	526231680
26967	NC_021872	TCAA	2	8	1436022	1436029	50 %	25 %	0 %	25 %	526231680
26968	NC_021872	ATC	2	6	1436057	1436062	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	526231680
26969	NC_021872	GAA	2	6	1436157	1436162	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	526231680
26970	NC_021872	ATT	2	6	1436187	1436192	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	526231680
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26972	NC_021872	CAT	2	6	1436347	1436352	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	526231680
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26977	NC_021872	A	6	6	1436672	1436677	100 %	0 %	0 %	0 %	526231680
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26992	NC_021872	TCA	2	6	1437337	1437342	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	526232517
26993	NC_021872	TCGC	2	8	1437346	1437353	0 %	25 %	25 %	50 %	526232517
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