MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Lactobacillus reuteri TD1

Total Repeats: 40052

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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25502	NC_021872	ATC	2	6	1359597	1359602	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	526231597
25503	NC_021872	TAA	2	6	1359622	1359627	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	526231597
25504	NC_021872	AAT	2	6	1359707	1359712	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	526231597
25505	NC_021872	CCAT	2	8	1359852	1359859	25 %	25 %	0 %	50 %	526231597
25506	NC_021872	ATC	2	6	1359960	1359965	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	526231597
25507	NC_021872	CAAT	2	8	1360004	1360011	50 %	25 %	0 %	25 %	526231597
25508	NC_021872	ATC	2	6	1360029	1360034	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	526231598
25509	NC_021872	CTTC	2	8	1360070	1360077	0 %	50 %	0 %	50 %	526231598
25510	NC_021872	CTG	2	6	1360127	1360132	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	526231598
25511	NC_021872	ACG	2	6	1360196	1360201	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	526231598
25512	NC_021872	CAT	2	6	1360368	1360373	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	526231598
25513	NC_021872	TTC	2	6	1360395	1360400	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	526231598
25514	NC_021872	GTT	2	6	1360493	1360498	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	526231598
25515	NC_021872	TTC	2	6	1360503	1360508	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	526231598
25516	NC_021872	AGTC	2	8	1360520	1360527	25 %	25 %	25 %	25 %	526231598
25517	NC_021872	AAAT	2	8	1360534	1360541	75 %	25 %	0 %	0 %	526231598
25518	NC_021872	AATT	2	8	1360572	1360579	50 %	50 %	0 %	0 %	526231598
25519	NC_021872	TAA	2	6	1360695	1360700	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	526231598
25520	NC_021872	AT	3	6	1360797	1360802	50 %	50 %	0 %	0 %	526231598
25521	NC_021872	CAT	2	6	1360820	1360825	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	526231598
25522	NC_021872	TTG	2	6	1360842	1360847	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	526231598
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25524	NC_021872	TTG	2	6	1360892	1360897	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	526231599
25525	NC_021872	TCGT	2	8	1360907	1360914	0 %	50 %	25 %	25 %	526231599
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25527	NC_021872	TTG	2	6	1360976	1360981	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	526231599
25528	NC_021872	AT	3	6	1361041	1361046	50 %	50 %	0 %	0 %	526231599
25529	NC_021872	CCA	2	6	1361071	1361076	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	526231599
25530	NC_021872	GAATG	2	10	1361085	1361094	40 %	20 %	40 %	0 %	526231599
25531	NC_021872	TCG	2	6	1361108	1361113	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	526231599
25532	NC_021872	TTTG	2	8	1361116	1361123	0 %	75 %	25 %	0 %	526231599
25533	NC_021872	ATT	2	6	1361218	1361223	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	526231599
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25535	NC_021872	ATT	2	6	1361256	1361261	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	526231599
25536	NC_021872	AAT	2	6	1361349	1361354	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	526231599
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25539	NC_021872	TTTG	2	8	1361396	1361403	0 %	75 %	25 %	0 %	526231599
25540	NC_021872	ATC	2	6	1361424	1361429	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	526231599
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25542	NC_021872	CGA	2	6	1361467	1361472	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	526231599
25543	NC_021872	GAA	2	6	1361488	1361493	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	526231599
25544	NC_021872	GAT	2	6	1361721	1361726	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	526231599
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25546	NC_021872	T	6	6	1361805	1361810	0 %	100 %	0 %	0 %	526231599
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25549	NC_021872	ATC	2	6	1361874	1361879	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	526231599
25550	NC_021872	ATC	2	6	1361922	1361927	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	526231599
25551	NC_021872	TTG	2	6	1361928	1361933	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	526231599
25552	NC_021872	GCC	2	6	1361989	1361994	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	526231599
25553	NC_021872	TGTTC	2	10	1362080	1362089	0 %	60 %	20 %	20 %	526231599
25554	NC_021872	TTC	2	6	1362105	1362110	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	526231599
25555	NC_021872	AATA	2	8	1362200	1362207	75 %	25 %	0 %	0 %	526231599
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25558	NC_021872	ATA	2	6	1362439	1362444	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	526231599
25559	NC_021872	TA	3	6	1362483	1362488	50 %	50 %	0 %	0 %	526231599
25560	NC_021872	CAT	2	6	1362554	1362559	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	526231599
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25564	NC_021872	TCGA	2	8	1362678	1362685	25 %	25 %	25 %	25 %	526231599
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25567	NC_021872	CAT	2	6	1362845	1362850	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	526231600
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25570	NC_021872	AATG	2	8	1363111	1363118	50 %	25 %	25 %	0 %	526231600
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25572	NC_021872	AT	3	6	1363156	1363161	50 %	50 %	0 %	0 %	526231600
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25577	NC_021872	T	7	7	1363343	1363349	0 %	100 %	0 %	0 %	526231600
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25588	NC_021872	TTGC	2	8	1363804	1363811	0 %	50 %	25 %	25 %	526231601
25589	NC_021872	TCA	3	9	1363907	1363915	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	526231601
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25591	NC_021872	TCAA	2	8	1363994	1364001	50 %	25 %	0 %	25 %	526231601
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25598	NC_021872	T	6	6	1364367	1364372	0 %	100 %	0 %	0 %	526231601
25599	NC_021872	TCT	2	6	1364378	1364383	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	526231601
25600	NC_021872	CAGGT	2	10	1364473	1364482	20 %	20 %	40 %	20 %	526231601
25601	NC_021872	AAT	2	6	1364604	1364609	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	526231601
25602	NC_021872	TGC	2	6	1364708	1364713	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	526231601
25603	NC_021872	T	6	6	1364771	1364776	0 %	100 %	0 %	0 %	526231601
25604	NC_021872	CCTC	2	8	1364895	1364902	0 %	25 %	0 %	75 %	526231602
25605	NC_021872	CTG	2	6	1364956	1364961	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	526231602
25606	NC_021872	TTA	2	6	1364970	1364975	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	526231602
25607	NC_021872	CAG	2	6	1364998	1365003	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	526231602
25608	NC_021872	ACT	2	6	1365033	1365038	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	526231602
25609	NC_021872	T	6	6	1365058	1365063	0 %	100 %	0 %	0 %	526231602
25610	NC_021872	GCCG	2	8	1365129	1365136	0 %	0 %	50 %	50 %	526231602
25611	NC_021872	AATC	2	8	1365181	1365188	50 %	25 %	0 %	25 %	526231602
25612	NC_021872	ACT	2	6	1365222	1365227	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	526231602
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25615	NC_021872	TAA	2	6	1365442	1365447	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	526231602
25616	NC_021872	CTC	2	6	1365466	1365471	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	526231602
25617	NC_021872	ATTG	2	8	1365503	1365510	25 %	50 %	25 %	0 %	526231602
25618	NC_021872	AGC	2	6	1365521	1365526	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	526231602
25619	NC_021872	GGAA	2	8	1365543	1365550	50 %	0 %	50 %	0 %	526231602
25620	NC_021872	AGC	2	6	1365560	1365565	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	526231602
25621	NC_021872	TAA	2	6	1365592	1365597	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	526231602
25622	NC_021872	TGA	2	6	1365684	1365689	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	526231602
25623	NC_021872	TGG	2	6	1365711	1365716	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	526231602
25624	NC_021872	CTGG	2	8	1365718	1365725	0 %	25 %	50 %	25 %	526231602
25625	NC_021872	CTTT	2	8	1365837	1365844	0 %	75 %	0 %	25 %	526231603
25626	NC_021872	TGGATC	2	12	1365859	1365870	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	526231603
25627	NC_021872	TACT	2	8	1365873	1365880	25 %	50 %	0 %	25 %	526231603
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25630	NC_021872	TGA	2	6	1365963	1365968	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	526231603
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25633	NC_021872	GCT	2	6	1366088	1366093	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	526231603
25634	NC_021872	CTT	2	6	1366098	1366103	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	526231603
25635	NC_021872	AACG	2	8	1366122	1366129	50 %	0 %	25 %	25 %	526231603
25636	NC_021872	GCA	2	6	1366164	1366169	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	526231603
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25646	NC_021872	TAA	2	6	1366531	1366536	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	526231603
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25648	NC_021872	TGA	2	6	1366589	1366594	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	526231603
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25653	NC_021872	TGTT	2	8	1366895	1366902	0 %	75 %	25 %	0 %	526231603
25654	NC_021872	CAA	2	6	1366921	1366926	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	526231603
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25717	NC_021872	AATC	2	8	1370018	1370025	50 %	25 %	0 %	25 %	526231606
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25720	NC_021872	CCA	2	6	1370217	1370222	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	526231606
25721	NC_021872	CTT	2	6	1370245	1370250	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	526231606
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25723	NC_021872	ATCATT	2	12	1370330	1370341	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	526231606
25724	NC_021872	TTCCC	2	10	1370368	1370377	0 %	40 %	0 %	60 %	526231606
25725	NC_021872	ATT	2	6	1370626	1370631	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	526231607
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25728	NC_021872	AGCA	2	8	1370678	1370685	50 %	0 %	25 %	25 %	526231607
25729	NC_021872	AAC	2	6	1370711	1370716	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	526231607
25730	NC_021872	CAA	2	6	1370781	1370786	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	526231607
25731	NC_021872	TTA	2	6	1370849	1370854	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	526231607
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