MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Lactobacillus reuteri TD1

Total Repeats: 40052

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
24501	NC_021872	CGA	2	6	1311465	1311470	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	526232468
24502	NC_021872	TAC	2	6	1311541	1311546	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	526232468
24503	NC_021872	GCTT	2	8	1311571	1311578	0 %	50 %	25 %	25 %	526232468
24504	NC_021872	TTA	2	6	1311738	1311743	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	526232468
24505	NC_021872	TTAG	2	8	1311804	1311811	25 %	50 %	25 %	0 %	526232468
24506	NC_021872	CAG	3	9	1311817	1311825	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	526232468
24507	NC_021872	ATC	2	6	1311851	1311856	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	526232468
24508	NC_021872	GCC	2	6	1311870	1311875	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	526232468
24509	NC_021872	TTA	2	6	1311903	1311908	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	526232468
24510	NC_021872	CCA	2	6	1311942	1311947	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	526232468
24511	NC_021872	GATT	2	8	1311969	1311976	25 %	50 %	25 %	0 %	526232468
24512	NC_021872	CT	3	6	1312000	1312005	0 %	50 %	0 %	50 %	526232468
24513	NC_021872	CTC	2	6	1312076	1312081	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	526232469
24514	NC_021872	CT	3	6	1312142	1312147	0 %	50 %	0 %	50 %	526232469
24515	NC_021872	TTC	2	6	1312152	1312157	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	526232469
24516	NC_021872	TGA	2	6	1312217	1312222	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	526232469
24517	NC_021872	CCA	2	6	1312253	1312258	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	526232469
24518	NC_021872	AAT	2	6	1312280	1312285	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	526232470
24519	NC_021872	ATCA	2	8	1312303	1312310	50 %	25 %	0 %	25 %	526232470
24520	NC_021872	TCA	2	6	1312313	1312318	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	526232470
24521	NC_021872	TTG	2	6	1312401	1312406	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	526232470
24522	NC_021872	CTT	2	6	1312429	1312434	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	526232470
24523	NC_021872	GTT	2	6	1312540	1312545	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	526232470
24524	NC_021872	ATA	2	6	1312571	1312576	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	526232470
24525	NC_021872	TGAT	2	8	1312788	1312795	25 %	50 %	25 %	0 %	526232471
24526	NC_021872	TTA	2	6	1312808	1312813	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	526232471
24527	NC_021872	AGTTA	2	10	1312858	1312867	40 %	40 %	20 %	0 %	526232471
24528	NC_021872	TTG	2	6	1312889	1312894	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	526232471
24529	NC_021872	TCT	2	6	1312946	1312951	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	526232471
24530	NC_021872	GTCC	2	8	1312997	1313004	0 %	25 %	25 %	50 %	526232471
24531	NC_021872	CAT	2	6	1313031	1313036	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	526232471
24532	NC_021872	ATT	2	6	1313054	1313059	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	526232471
24533	NC_021872	AGA	2	6	1313171	1313176	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	526232472
24534	NC_021872	GTT	2	6	1313246	1313251	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	526232472
24535	NC_021872	CAT	3	9	1313305	1313313	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	526232472
24536	NC_021872	TTG	2	6	1313342	1313347	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	526232472
24537	NC_021872	CAA	2	6	1313398	1313403	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	526232472
24538	NC_021872	GTAA	2	8	1313459	1313466	50 %	25 %	25 %	0 %	526232472
24539	NC_021872	CCA	2	6	1313526	1313531	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	526232472
24540	NC_021872	CAA	2	6	1313584	1313589	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	526232472
24541	NC_021872	CAC	2	6	1313626	1313631	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	526232472
24542	NC_021872	GTG	2	6	1313650	1313655	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	526232472
24543	NC_021872	CTT	3	9	1313666	1313674	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	526232472
24544	NC_021872	CAG	2	6	1313680	1313685	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	526232472
24545	NC_021872	CAA	2	6	1313719	1313724	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	526232472
24546	NC_021872	TCCTT	2	10	1313820	1313829	0 %	60 %	0 %	40 %	526232472
24547	NC_021872	AGC	2	6	1313918	1313923	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	526232472
24548	NC_021872	CAA	2	6	1313947	1313952	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	526232472
24549	NC_021872	TTG	2	6	1313958	1313963	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	526232472
24550	NC_021872	ATC	2	6	1313969	1313974	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	526232472
24551	NC_021872	TCC	2	6	1314179	1314184	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	526232473
24552	NC_021872	TGCCTT	2	12	1314207	1314218	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	526232473
24553	NC_021872	ATT	2	6	1314277	1314282	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	526232473
24554	NC_021872	TTC	2	6	1314286	1314291	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	526232473
24555	NC_021872	ACA	2	6	1314443	1314448	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	526232473
24556	NC_021872	GTC	2	6	1314463	1314468	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	526232473
24557	NC_021872	AAT	2	6	1314474	1314479	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	526232473
24558	NC_021872	TAA	2	6	1314582	1314587	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	526232473
24559	NC_021872	TA	3	6	1314603	1314608	50 %	50 %	0 %	0 %	526232473
24560	NC_021872	AAT	2	6	1314615	1314620	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	526232473
24561	NC_021872	TTG	2	6	1314627	1314632	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	526232473
24562	NC_021872	CTC	2	6	1314644	1314649	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	526232474
24563	NC_021872	AAT	2	6	1314679	1314684	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	526232474
24564	NC_021872	CAA	2	6	1314733	1314738	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	526232474
24565	NC_021872	ATA	2	6	1314866	1314871	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	526232474
24566	NC_021872	AGT	2	6	1314872	1314877	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	526232474
24567	NC_021872	CTT	2	6	1314892	1314897	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	526232474
24568	NC_021872	CAAT	2	8	1315013	1315020	50 %	25 %	0 %	25 %	526232475
24569	NC_021872	AATT	2	8	1315045	1315052	50 %	50 %	0 %	0 %	526232475
24570	NC_021872	TGC	2	6	1315084	1315089	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	526232475
24571	NC_021872	ACC	2	6	1315102	1315107	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	526232475
24572	NC_021872	ACC	2	6	1315177	1315182	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	526232475
24573	NC_021872	TCT	2	6	1315311	1315316	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	526232475
24574	NC_021872	TCCA	2	8	1315354	1315361	25 %	25 %	0 %	50 %	526232475
24575	NC_021872	ATC	2	6	1315379	1315384	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	526232475
24576	NC_021872	T	6	6	1315477	1315482	0 %	100 %	0 %	0 %	526232476
24577	NC_021872	ATC	2	6	1315506	1315511	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	526232476
24578	NC_021872	ACC	2	6	1315515	1315520	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	526232476
24579	NC_021872	AGC	2	6	1315605	1315610	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	526232476
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24582	NC_021872	TAAT	2	8	1315682	1315689	50 %	50 %	0 %	0 %	526232476
24583	NC_021872	TCA	2	6	1315690	1315695	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	526232476
24584	NC_021872	ATA	2	6	1315696	1315701	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	526232476
24585	NC_021872	CTG	2	6	1315773	1315778	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	526232476
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24587	NC_021872	CCA	2	6	1315811	1315816	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	526232477
24588	NC_021872	TTTG	2	8	1315841	1315848	0 %	75 %	25 %	0 %	526232477
24589	NC_021872	TCCC	2	8	1315882	1315889	0 %	25 %	0 %	75 %	526232477
24590	NC_021872	TCA	2	6	1315913	1315918	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	526232477
24591	NC_021872	TAA	2	6	1315950	1315955	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	526232477
24592	NC_021872	ACC	2	6	1315989	1315994	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	526231571
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24594	NC_021872	CTT	2	6	1316031	1316036	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	526231571
24595	NC_021872	ATC	2	6	1316061	1316066	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	526231571
24596	NC_021872	CAG	2	6	1316078	1316083	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	526231571
24597	NC_021872	GCT	2	6	1316161	1316166	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	526231571
24598	NC_021872	TTAAC	2	10	1316246	1316255	40 %	40 %	0 %	20 %	526231571
24599	NC_021872	TCT	2	6	1316269	1316274	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	526231571
24600	NC_021872	AAT	2	6	1316325	1316330	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	526231571
24601	NC_021872	CTG	2	6	1316432	1316437	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	526231571
24602	NC_021872	GTT	2	6	1316461	1316466	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	526231571
24603	NC_021872	CAT	2	6	1316468	1316473	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	526231571
24604	NC_021872	TAT	2	6	1316480	1316485	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	526231571
24605	NC_021872	ACC	2	6	1316667	1316672	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	526231571
24606	NC_021872	TGC	2	6	1316694	1316699	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	526231571
24607	NC_021872	TCT	2	6	1316752	1316757	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	526231571
24608	NC_021872	CAG	2	6	1316855	1316860	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	526231571
24609	NC_021872	ATTT	2	8	1316935	1316942	25 %	75 %	0 %	0 %	526231571
24610	NC_021872	TCC	2	6	1316944	1316949	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	526232478
24611	NC_021872	TGTTTT	2	12	1316989	1317000	0 %	83.33 %	16.67 %	0 %	526232478
24612	NC_021872	TTA	2	6	1317028	1317033	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	526232478
24613	NC_021872	TC	3	6	1317056	1317061	0 %	50 %	0 %	50 %	526232478
24614	NC_021872	CGG	2	6	1317103	1317108	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	526232478
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24616	NC_021872	GTT	2	6	1317163	1317168	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	526232478
24617	NC_021872	CAT	2	6	1317173	1317178	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	526232478
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24733	NC_021872	ACAA	2	8	1322494	1322501	75 %	0 %	0 %	25 %	526231573
24734	NC_021872	TCA	2	6	1322526	1322531	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	526231573
24735	NC_021872	TG	3	6	1322582	1322587	0 %	50 %	50 %	0 %	526231573
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24738	NC_021872	ACCA	2	8	1322641	1322648	50 %	0 %	0 %	50 %	526231573
24739	NC_021872	CAT	2	6	1322686	1322691	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	526231573
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24745	NC_021872	CT	3	6	1322968	1322973	0 %	50 %	0 %	50 %	526232482
24746	NC_021872	CTATC	2	10	1323032	1323041	20 %	40 %	0 %	40 %	526232482
24747	NC_021872	TG	3	6	1323044	1323049	0 %	50 %	50 %	0 %	526232482
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24756	NC_021872	TAA	3	9	1324200	1324208	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	526232484
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24831	NC_021872	CAA	2	6	1328174	1328179	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	526232494
24832	NC_021872	TAAA	2	8	1328277	1328284	75 %	25 %	0 %	0 %	526232494
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24835	NC_021872	AT	3	6	1328491	1328496	50 %	50 %	0 %	0 %	526232495
24836	NC_021872	CAA	3	9	1328520	1328528	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	526232495
24837	NC_021872	CAA	2	6	1328592	1328597	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	526232495
24838	NC_021872	ATTT	2	8	1328788	1328795	25 %	75 %	0 %	0 %	526232495
24839	NC_021872	TCA	2	6	1328796	1328801	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	526232495
24840	NC_021872	ATC	2	6	1328835	1328840	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	526232496
24841	NC_021872	ATC	2	6	1328856	1328861	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	526232496
24842	NC_021872	TAA	2	6	1328884	1328889	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	526232496
24843	NC_021872	ATT	2	6	1329078	1329083	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	526232496
24844	NC_021872	TC	4	8	1329093	1329100	0 %	50 %	0 %	50 %	526232496
24845	NC_021872	TAACTT	2	12	1329246	1329257	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	526232496
24846	NC_021872	TCC	2	6	1329267	1329272	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	526232497
24847	NC_021872	TTA	2	6	1329327	1329332	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	526232497
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