MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Lactobacillus reuteri TD1

Total Repeats: 40052

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
24001	NC_021872	T	6	6	1279819	1279824	0 %	100 %	0 %	0 %	526231564
24002	NC_021872	GTT	2	6	1279927	1279932	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	526231564
24003	NC_021872	CTG	2	6	1279972	1279977	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	526231564
24004	NC_021872	CAT	2	6	1280038	1280043	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	526231564
24005	NC_021872	AAT	2	6	1280045	1280050	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	526231564
24006	NC_021872	GTC	2	6	1280241	1280246	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	526231564
24007	NC_021872	AGGA	2	8	1280270	1280277	50 %	0 %	50 %	0 %	526231564
24008	NC_021872	CT	3	6	1280286	1280291	0 %	50 %	0 %	50 %	526231564
24009	NC_021872	GATA	2	8	1280341	1280348	50 %	25 %	25 %	0 %	526231564
24010	NC_021872	TAA	2	6	1280386	1280391	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	526231564
24011	NC_021872	ACC	2	6	1280396	1280401	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	526231564
24012	NC_021872	TCT	2	6	1280422	1280427	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	526231564
24013	NC_021872	A	6	6	1280452	1280457	100 %	0 %	0 %	0 %	526231564
24014	NC_021872	ATC	2	6	1280489	1280494	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	526231564
24015	NC_021872	TAA	2	6	1280544	1280549	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	526231564
24016	NC_021872	AAT	2	6	1280555	1280560	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	526231564
24017	NC_021872	TAA	2	6	1280665	1280670	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	526231564
24018	NC_021872	GCC	2	6	1280850	1280855	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	526231564
24019	NC_021872	GCTG	2	8	1280970	1280977	0 %	25 %	50 %	25 %	526231564
24020	NC_021872	CAT	2	6	1280989	1280994	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	526231564
24021	NC_021872	ATATG	2	10	1281011	1281020	40 %	40 %	20 %	0 %	526231564
24022	NC_021872	CTG	2	6	1281041	1281046	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	526231564
24023	NC_021872	AATC	2	8	1281049	1281056	50 %	25 %	0 %	25 %	526231564
24024	NC_021872	TAG	2	6	1281082	1281087	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	526231564
24025	NC_021872	TAAA	2	8	1281136	1281143	75 %	25 %	0 %	0 %	526231564
24026	NC_021872	AAT	2	6	1281172	1281177	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	526231564
24027	NC_021872	CAA	2	6	1281247	1281252	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	526231564
24028	NC_021872	CA	3	6	1281282	1281287	50 %	0 %	0 %	50 %	526231564
24029	NC_021872	CATG	2	8	1281297	1281304	25 %	25 %	25 %	25 %	526231564
24030	NC_021872	GC	3	6	1281329	1281334	0 %	0 %	50 %	50 %	526231564
24031	NC_021872	TTC	2	6	1281365	1281370	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	526231564
24032	NC_021872	CCA	2	6	1281384	1281389	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	526231564
24033	NC_021872	TTG	2	6	1281396	1281401	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	526231564
24034	NC_021872	CAA	2	6	1281412	1281417	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	526231564
24035	NC_021872	CAA	2	6	1281454	1281459	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	526231564
24036	NC_021872	TAC	2	6	1281487	1281492	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	526231564
24037	NC_021872	GGC	2	6	1281526	1281531	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	526231564
24038	NC_021872	CGG	2	6	1281592	1281597	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	526231564
24039	NC_021872	CAG	2	6	1281625	1281630	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	526231564
24040	NC_021872	TCCT	2	8	1281677	1281684	0 %	50 %	0 %	50 %	526231564
24041	NC_021872	A	6	6	1281706	1281711	100 %	0 %	0 %	0 %	526231564
24042	NC_021872	CTGC	2	8	1281736	1281743	0 %	25 %	25 %	50 %	526231564
24043	NC_021872	TCT	2	6	1281774	1281779	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	526231564
24044	NC_021872	TC	3	6	1281828	1281833	0 %	50 %	0 %	50 %	526231564
24045	NC_021872	TCA	2	6	1281835	1281840	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	526231564
24046	NC_021872	TAC	2	6	1281869	1281874	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	526231565
24047	NC_021872	AAAG	2	8	1281944	1281951	75 %	0 %	25 %	0 %	526231565
24048	NC_021872	ATCAAA	2	12	1281995	1282006	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	526231565
24049	NC_021872	CAC	2	6	1282063	1282068	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	526231565
24050	NC_021872	CTT	2	6	1282255	1282260	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	526231565
24051	NC_021872	TCT	2	6	1282302	1282307	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	526231565
24052	NC_021872	GAT	2	6	1282320	1282325	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	526231565
24053	NC_021872	TTC	2	6	1282373	1282378	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	526231565
24054	NC_021872	ACT	2	6	1282380	1282385	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	526231565
24055	NC_021872	CTT	2	6	1282396	1282401	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	526231565
24056	NC_021872	TGTCA	2	10	1282502	1282511	20 %	40 %	20 %	20 %	526231565
24057	NC_021872	GCA	2	6	1282512	1282517	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	526231565
24058	NC_021872	ATCA	2	8	1282592	1282599	50 %	25 %	0 %	25 %	526231565
24059	NC_021872	CAT	2	6	1282733	1282738	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	526231565
24060	NC_021872	CCA	2	6	1282797	1282802	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	526231565
24061	NC_021872	CAA	2	6	1282888	1282893	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	526231565
24062	NC_021872	A	6	6	1282936	1282941	100 %	0 %	0 %	0 %	526231565
24063	NC_021872	ACA	2	6	1282956	1282961	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	526231565
24064	NC_021872	A	6	6	1283029	1283034	100 %	0 %	0 %	0 %	526231565
24065	NC_021872	TTTC	2	8	1283086	1283093	0 %	75 %	0 %	25 %	526231565
24066	NC_021872	ACAA	2	8	1283102	1283109	75 %	0 %	0 %	25 %	526231565
24067	NC_021872	ATG	2	6	1283139	1283144	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	526231565
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24069	NC_021872	ACCA	2	8	1283158	1283165	50 %	0 %	0 %	50 %	526231565
24070	NC_021872	GAT	2	6	1283179	1283184	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	526231565
24071	NC_021872	TTC	2	6	1283294	1283299	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	526231565
24072	NC_021872	TAT	2	6	1283521	1283526	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	526231565
24073	NC_021872	CAA	2	6	1283527	1283532	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	526231565
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24075	NC_021872	TTA	2	6	1283610	1283615	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	526231565
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24077	NC_021872	AAGT	2	8	1283667	1283674	50 %	25 %	25 %	0 %	526231565
24078	NC_021872	GCT	2	6	1283740	1283745	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	526231565
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24089	NC_021872	CAA	2	6	1284519	1284524	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	526231566
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24100	NC_021872	GTG	2	6	1285360	1285365	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	526231567
24101	NC_021872	CAATCA	2	12	1285398	1285409	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	526231567
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24104	NC_021872	CGT	2	6	1285794	1285799	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	526231567
24105	NC_021872	CTA	2	6	1285830	1285835	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	526231567
24106	NC_021872	CTA	2	6	1285896	1285901	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	526231567
24107	NC_021872	TGG	2	6	1285935	1285940	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	526231567
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24110	NC_021872	CTTT	2	8	1286042	1286049	0 %	75 %	0 %	25 %	526231567
24111	NC_021872	AGA	2	6	1286081	1286086	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	526231567
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24115	NC_021872	TAA	2	6	1286924	1286929	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	526232447
24116	NC_021872	TCAAT	2	10	1286941	1286950	40 %	40 %	0 %	20 %	526232447
24117	NC_021872	GTT	2	6	1286956	1286961	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	526232447
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24225	NC_021872	TTA	2	6	1296536	1296541	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	526231569
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24227	NC_021872	T	6	6	1296639	1296644	0 %	100 %	0 %	0 %	526231569
24228	NC_021872	TCA	2	6	1296663	1296668	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	526231569
24229	NC_021872	GAAA	2	8	1296809	1296816	75 %	0 %	25 %	0 %	526231570
24230	NC_021872	ATCGA	2	10	1296832	1296841	40 %	20 %	20 %	20 %	526231570
24231	NC_021872	GAA	2	6	1296927	1296932	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	526231570
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24349	NC_021872	TTAGTT	2	12	1303505	1303516	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	526232462
24350	NC_021872	AGT	2	6	1303543	1303548	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	526232462
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24352	NC_021872	ACC	2	6	1303675	1303680	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	526232462
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24462	NC_021872	CTA	2	6	1309866	1309871	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	526232468
24463	NC_021872	AACT	2	8	1309882	1309889	50 %	25 %	0 %	25 %	526232468
24464	NC_021872	CCA	3	9	1309890	1309898	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	526232468
24465	NC_021872	CCA	2	6	1309902	1309907	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	526232468
24466	NC_021872	ATTC	2	8	1309922	1309929	25 %	50 %	0 %	25 %	526232468
24467	NC_021872	AGC	2	6	1309934	1309939	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	526232468
24468	NC_021872	CAT	2	6	1309943	1309948	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	526232468
24469	NC_021872	CAG	2	6	1309975	1309980	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	526232468
24470	NC_021872	TCA	2	6	1309998	1310003	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	526232468
24471	NC_021872	ACT	2	6	1310055	1310060	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	526232468
24472	NC_021872	ACTTA	2	10	1310240	1310249	40 %	40 %	0 %	20 %	526232468
24473	NC_021872	CTTGA	2	10	1310303	1310312	20 %	40 %	20 %	20 %	526232468
24474	NC_021872	CTT	2	6	1310366	1310371	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	526232468
24475	NC_021872	CAG	2	6	1310407	1310412	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	526232468
24476	NC_021872	TTA	2	6	1310442	1310447	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	526232468
24477	NC_021872	ATT	2	6	1310471	1310476	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	526232468
24478	NC_021872	CCA	2	6	1310514	1310519	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	526232468
24479	NC_021872	TTA	2	6	1310526	1310531	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	526232468
24480	NC_021872	CTG	2	6	1310560	1310565	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	526232468
24481	NC_021872	CAT	2	6	1310660	1310665	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	526232468
24482	NC_021872	TCA	2	6	1310757	1310762	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	526232468
24483	NC_021872	TCA	2	6	1310862	1310867	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	526232468
24484	NC_021872	ACC	2	6	1310873	1310878	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	526232468
24485	NC_021872	TCT	2	6	1310923	1310928	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	526232468
24486	NC_021872	CGG	2	6	1310935	1310940	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	526232468
24487	NC_021872	TGC	2	6	1310975	1310980	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	526232468
24488	NC_021872	AAG	2	6	1311089	1311094	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	526232468
24489	NC_021872	CTG	2	6	1311196	1311201	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	526232468
24490	NC_021872	AGC	2	6	1311215	1311220	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	526232468
24491	NC_021872	CAA	2	6	1311244	1311249	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	526232468
24492	NC_021872	CTC	2	6	1311262	1311267	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	526232468
24493	NC_021872	CCTT	2	8	1311276	1311283	0 %	50 %	0 %	50 %	526232468
24494	NC_021872	GAA	2	6	1311294	1311299	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	526232468
24495	NC_021872	TGC	2	6	1311308	1311313	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	526232468
24496	NC_021872	TTG	2	6	1311359	1311364	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	526232468
24497	NC_021872	CTC	2	6	1311376	1311381	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	526232468
24498	NC_021872	TGCACT	2	12	1311389	1311400	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	526232468
24499	NC_021872	TGT	2	6	1311402	1311407	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	526232468
24500	NC_021872	CAG	2	6	1311451	1311456	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	526232468

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