MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Lactobacillus reuteri TD1

Total Repeats: 40052

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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22004	NC_021872	CTT	2	6	1172174	1172179	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	526232396
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22011	NC_021872	TTGCT	2	10	1172512	1172521	0 %	60 %	20 %	20 %	526232396
22012	NC_021872	TA	3	6	1172592	1172597	50 %	50 %	0 %	0 %	526232396
22013	NC_021872	TTG	2	6	1172610	1172615	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	526232396
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22118	NC_021872	A	6	6	1177381	1177386	100 %	0 %	0 %	0 %	526231534
22119	NC_021872	ATT	2	6	1177405	1177410	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	526231534
22120	NC_021872	TGA	2	6	1177433	1177438	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	526231534
22121	NC_021872	CAT	2	6	1177491	1177496	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	526231534
22122	NC_021872	TAAT	2	8	1177564	1177571	50 %	50 %	0 %	0 %	526231534
22123	NC_021872	GCT	2	6	1177590	1177595	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	526231534
22124	NC_021872	TAA	2	6	1177628	1177633	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	526231534
22125	NC_021872	TAAAG	2	10	1177685	1177694	60 %	20 %	20 %	0 %	526231534
22126	NC_021872	CTA	2	6	1177705	1177710	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	526231534
22127	NC_021872	CG	3	6	1177721	1177726	0 %	0 %	50 %	50 %	526231534
22128	NC_021872	CAAG	2	8	1177738	1177745	50 %	0 %	25 %	25 %	526231534
22129	NC_021872	GCAA	2	8	1177790	1177797	50 %	0 %	25 %	25 %	526231534
22130	NC_021872	ATC	2	6	1177803	1177808	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	526231534
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22138	NC_021872	GCT	2	6	1178176	1178181	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	526231535
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22218	NC_021872	CAG	2	6	1184556	1184561	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	526231537
22219	NC_021872	CCTT	2	8	1184582	1184589	0 %	50 %	0 %	50 %	526231537
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22221	NC_021872	CTT	3	9	1184680	1184688	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	526231537
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22223	NC_021872	T	6	6	1184704	1184709	0 %	100 %	0 %	0 %	526231537
22224	NC_021872	CTG	2	6	1184710	1184715	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	526231537
22225	NC_021872	GT	3	6	1184722	1184727	0 %	50 %	50 %	0 %	526231537
22226	NC_021872	AAT	2	6	1184771	1184776	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	526231537
22227	NC_021872	TCT	2	6	1184825	1184830	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	526231537
22228	NC_021872	TGC	2	6	1184831	1184836	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	526231537
22229	NC_021872	TGC	2	6	1184846	1184851	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	526231537
22230	NC_021872	TCTG	2	8	1184969	1184976	0 %	50 %	25 %	25 %	526231537
22231	NC_021872	TTG	2	6	1185007	1185012	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	526231537
22232	NC_021872	TC	3	6	1185027	1185032	0 %	50 %	0 %	50 %	526231537
22233	NC_021872	T	6	6	1185092	1185097	0 %	100 %	0 %	0 %	526231537
22234	NC_021872	CTTT	2	8	1185138	1185145	0 %	75 %	0 %	25 %	526231537
22235	NC_021872	TGC	2	6	1185152	1185157	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	526231537
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22240	NC_021872	CTT	2	6	1185307	1185312	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	526231537
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22242	NC_021872	GTTGC	2	10	1185336	1185345	0 %	40 %	40 %	20 %	526231537
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22262	NC_021872	TCAA	2	8	1186461	1186468	50 %	25 %	0 %	25 %	526231538
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22348	NC_021872	ATC	2	6	1190949	1190954	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	526231540
22349	NC_021872	TAAC	2	8	1191113	1191120	50 %	25 %	0 %	25 %	526231540
22350	NC_021872	T	6	6	1191224	1191229	0 %	100 %	0 %	0 %	526231540
22351	NC_021872	TCAGTT	2	12	1191241	1191252	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	526231540
22352	NC_021872	TCA	2	6	1191274	1191279	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	526231540
22353	NC_021872	TCA	2	6	1191499	1191504	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	526231540
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22355	NC_021872	ATC	3	9	1191579	1191587	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	526231540
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22462	NC_021872	ATAA	2	8	1196721	1196728	75 %	25 %	0 %	0 %	526231543
22463	NC_021872	ATT	2	6	1196768	1196773	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	526231543
22464	NC_021872	ATG	2	6	1196786	1196791	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	526231543
22465	NC_021872	CAA	2	6	1196834	1196839	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	526231543
22466	NC_021872	ACT	2	6	1196859	1196864	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	526231543
22467	NC_021872	ATAA	2	8	1196940	1196947	75 %	25 %	0 %	0 %	526231543
22468	NC_021872	CCA	3	9	1196954	1196962	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	526231543
22469	NC_021872	GGCC	2	8	1197074	1197081	0 %	0 %	50 %	50 %	526231543
22470	NC_021872	TGA	2	6	1197219	1197224	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	526231543
22471	NC_021872	CCA	2	6	1197267	1197272	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	526231543
22472	NC_021872	ATC	2	6	1197279	1197284	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	526231543
22473	NC_021872	ATG	2	6	1197333	1197338	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	526231543
22474	NC_021872	TCA	2	6	1198724	1198729	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	526232402
22475	NC_021872	ATC	2	6	1198786	1198791	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	526232402
22476	NC_021872	ATAGC	2	10	1198833	1198842	40 %	20 %	20 %	20 %	526232402
22477	NC_021872	AACA	2	8	1198858	1198865	75 %	0 %	0 %	25 %	526232402
22478	NC_021872	TCA	2	6	1198877	1198882	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	526232402
22479	NC_021872	TCT	2	6	1198889	1198894	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	526232402
22480	NC_021872	T	6	6	1198981	1198986	0 %	100 %	0 %	0 %	526232402
22481	NC_021872	TGT	2	6	1198990	1198995	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	526232402
22482	NC_021872	T	6	6	1199057	1199062	0 %	100 %	0 %	0 %	526232402
22483	NC_021872	AATTT	2	10	1199078	1199087	40 %	60 %	0 %	0 %	526232402
22484	NC_021872	CATTT	2	10	1199113	1199122	20 %	60 %	0 %	20 %	526232402
22485	NC_021872	TAAA	2	8	1199146	1199153	75 %	25 %	0 %	0 %	526232403
22486	NC_021872	TAT	2	6	1199186	1199191	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	526232403
22487	NC_021872	AGAT	2	8	1199193	1199200	50 %	25 %	25 %	0 %	526232403
22488	NC_021872	ATT	2	6	1199214	1199219	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	526232403
22489	NC_021872	CTTA	2	8	1199220	1199227	25 %	50 %	0 %	25 %	526232403
22490	NC_021872	TTA	2	6	1199257	1199262	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	526232403
22491	NC_021872	TATC	2	8	1199270	1199277	25 %	50 %	0 %	25 %	526232403
22492	NC_021872	T	6	6	1199280	1199285	0 %	100 %	0 %	0 %	526232403
22493	NC_021872	TAA	2	6	1199300	1199305	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	526232403
22494	NC_021872	A	7	7	1199343	1199349	100 %	0 %	0 %	0 %	526232403
22495	NC_021872	CAA	2	6	1199376	1199381	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	526232404
22496	NC_021872	TTA	2	6	1199456	1199461	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	526232404
22497	NC_021872	AGA	2	6	1199479	1199484	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	526232404
22498	NC_021872	TCT	2	6	1199511	1199516	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	526232404
22499	NC_021872	TCT	2	6	1199522	1199527	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	526232404
22500	NC_021872	ATA	2	6	1199539	1199544	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	526232404

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