MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Lactobacillus reuteri TD1

Total Repeats: 40052

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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19502	NC_021872	GAT	2	6	1037895	1037900	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	526231452
19503	NC_021872	CAA	2	6	1038096	1038101	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	526231452
19504	NC_021872	AAAG	2	8	1038107	1038114	75 %	0 %	25 %	0 %	526231452
19505	NC_021872	TTA	2	6	1038123	1038128	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	526231452
19506	NC_021872	GAA	2	6	1038168	1038173	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	526231452
19507	NC_021872	TAC	2	6	1038204	1038209	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	526231452
19508	NC_021872	AACT	2	8	1038220	1038227	50 %	25 %	0 %	25 %	526231452
19509	NC_021872	GAA	2	6	1038293	1038298	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	526231452
19510	NC_021872	TAAC	2	8	1038313	1038320	50 %	25 %	0 %	25 %	526231452
19511	NC_021872	CTAA	2	8	1038420	1038427	50 %	25 %	0 %	25 %	526231452
19512	NC_021872	AAC	2	6	1038439	1038444	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	526231452
19513	NC_021872	TCAAT	2	10	1038477	1038486	40 %	40 %	0 %	20 %	526231452
19514	NC_021872	GAA	2	6	1038697	1038702	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	526232349
19515	NC_021872	AGA	2	6	1038703	1038708	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	526232349
19516	NC_021872	AGA	2	6	1038711	1038716	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	526232349
19517	NC_021872	TGC	2	6	1038751	1038756	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	526232349
19518	NC_021872	GTT	2	6	1038806	1038811	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	526232349
19519	NC_021872	TAT	2	6	1038837	1038842	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	526232349
19520	NC_021872	AT	3	6	1038841	1038846	50 %	50 %	0 %	0 %	526232349
19521	NC_021872	TTA	2	6	1038848	1038853	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	526232349
19522	NC_021872	A	6	6	1038971	1038976	100 %	0 %	0 %	0 %	526232349
19523	NC_021872	TTA	3	9	1038999	1039007	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	526232349
19524	NC_021872	ATT	2	6	1039016	1039021	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	526232349
19525	NC_021872	TTA	2	6	1039022	1039027	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	526232349
19526	NC_021872	CAT	2	6	1039067	1039072	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	526232349
19527	NC_021872	ATT	2	6	1039075	1039080	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	526232349
19528	NC_021872	TATT	2	8	1039117	1039124	25 %	75 %	0 %	0 %	526232350
19529	NC_021872	TTCAT	2	10	1039155	1039164	20 %	60 %	0 %	20 %	526232350
19530	NC_021872	CTT	2	6	1039211	1039216	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	526232350
19531	NC_021872	TAG	2	6	1039234	1039239	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	526232350
19532	NC_021872	ACT	2	6	1039293	1039298	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	526232350
19533	NC_021872	A	6	6	1039311	1039316	100 %	0 %	0 %	0 %	526232350
19534	NC_021872	CCAG	2	8	1039322	1039329	25 %	0 %	25 %	50 %	526232350
19535	NC_021872	AATTT	2	10	1039335	1039344	40 %	60 %	0 %	0 %	526232350
19536	NC_021872	CAA	2	6	1039363	1039368	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	526232350
19537	NC_021872	ATG	2	6	1039399	1039404	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	526232350
19538	NC_021872	ATT	2	6	1039439	1039444	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	526232350
19539	NC_021872	TTCAT	2	10	1039455	1039464	20 %	60 %	0 %	20 %	526232350
19540	NC_021872	ATT	2	6	1039490	1039495	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	526232350
19541	NC_021872	CCG	2	6	1039516	1039521	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	526232350
19542	NC_021872	AGC	2	6	1039535	1039540	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	526232350
19543	NC_021872	TAC	2	6	1039541	1039546	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	526232350
19544	NC_021872	GGT	2	6	1039578	1039583	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	526232350
19545	NC_021872	TTA	2	6	1039624	1039629	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	526232350
19546	NC_021872	TGGTCT	2	12	1039694	1039705	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	526232350
19547	NC_021872	GTT	2	6	1039785	1039790	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	526232350
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19549	NC_021872	GTT	2	6	1039899	1039904	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	526231453
19550	NC_021872	TTA	2	6	1039978	1039983	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	526231453
19551	NC_021872	ATT	2	6	1040100	1040105	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	526231453
19552	NC_021872	AAG	2	6	1040194	1040199	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	526231453
19553	NC_021872	TCT	2	6	1040224	1040229	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	526231453
19554	NC_021872	TGC	2	6	1040234	1040239	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	526231453
19555	NC_021872	A	6	6	1040272	1040277	100 %	0 %	0 %	0 %	526231453
19556	NC_021872	ATCGG	2	10	1040304	1040313	20 %	20 %	40 %	20 %	526231453
19557	NC_021872	GC	3	6	1040331	1040336	0 %	0 %	50 %	50 %	526231453
19558	NC_021872	TGC	2	6	1040423	1040428	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	526231453
19559	NC_021872	AGA	3	9	1040513	1040521	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	526231453
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19561	NC_021872	ATT	2	6	1040544	1040549	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	526231453
19562	NC_021872	AGT	2	6	1040726	1040731	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	526231453
19563	NC_021872	TAAT	2	8	1040767	1040774	50 %	50 %	0 %	0 %	526231453
19564	NC_021872	ACA	2	6	1040796	1040801	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	526231453
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19566	NC_021872	TTAT	2	8	1040925	1040932	25 %	75 %	0 %	0 %	526232351
19567	NC_021872	AT	3	6	1041010	1041015	50 %	50 %	0 %	0 %	526232351
19568	NC_021872	T	6	6	1041119	1041124	0 %	100 %	0 %	0 %	526232351
19569	NC_021872	CCG	2	6	1041152	1041157	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	526232351
19570	NC_021872	CGC	2	6	1041215	1041220	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	526232351
19571	NC_021872	GTG	2	6	1041276	1041281	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	526232351
19572	NC_021872	CCA	2	6	1041361	1041366	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	526232351
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19578	NC_021872	ATT	2	6	1041994	1041999	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	526231454
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19581	NC_021872	GGC	2	6	1042207	1042212	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	526231454
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19583	NC_021872	ATT	3	9	1042366	1042374	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	526231454
19584	NC_021872	TTA	2	6	1042409	1042414	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	526231454
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19588	NC_021872	CGA	2	6	1042575	1042580	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	526231454
19589	NC_021872	CAT	2	6	1042587	1042592	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	526231454
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19591	NC_021872	CAT	2	6	1042686	1042691	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	526231454
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19593	NC_021872	TGC	2	6	1042816	1042821	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	526231454
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19596	NC_021872	A	6	6	1042859	1042864	100 %	0 %	0 %	0 %	526231454
19597	NC_021872	TGA	2	6	1043119	1043124	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	526231455
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19599	NC_021872	A	6	6	1043146	1043151	100 %	0 %	0 %	0 %	526231455
19600	NC_021872	TATT	2	8	1043165	1043172	25 %	75 %	0 %	0 %	526231455
19601	NC_021872	AGA	2	6	1043179	1043184	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	526231455
19602	NC_021872	GAT	2	6	1043315	1043320	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	526231455
19603	NC_021872	TTG	2	6	1043321	1043326	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	526231455
19604	NC_021872	ATT	2	6	1043372	1043377	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	526231455
19605	NC_021872	GACT	2	8	1043400	1043407	25 %	25 %	25 %	25 %	526231455
19606	NC_021872	AAG	2	6	1043490	1043495	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	526231455
19607	NC_021872	TGA	2	6	1043521	1043526	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	526231455
19608	NC_021872	CTAT	2	8	1043559	1043566	25 %	50 %	0 %	25 %	526231455
19609	NC_021872	AACG	2	8	1043567	1043574	50 %	0 %	25 %	25 %	526231455
19610	NC_021872	TTA	2	6	1043580	1043585	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	526231455
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19612	NC_021872	AGATC	2	10	1043896	1043905	40 %	20 %	20 %	20 %	526231455
19613	NC_021872	TAA	2	6	1043919	1043924	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	526231455
19614	NC_021872	GACC	2	8	1044089	1044096	25 %	0 %	25 %	50 %	526231455
19615	NC_021872	TTA	2	6	1044102	1044107	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	526231455
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19617	NC_021872	TGA	2	6	1044136	1044141	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	526231455
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19624	NC_021872	GAACC	2	10	1044407	1044416	40 %	0 %	20 %	40 %	526231455
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