MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Lactobacillus reuteri TD1

Total Repeats: 40052

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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16502	NC_021872	GAT	2	6	870494	870499	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	526231327
16503	NC_021872	GAA	2	6	870539	870544	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	526231327
16504	NC_021872	AGA	3	9	870559	870567	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	526231327
16505	NC_021872	GAA	2	6	870623	870628	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	526231327
16506	NC_021872	AAG	2	6	870768	870773	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	526231327
16507	NC_021872	CAAG	2	8	870858	870865	50 %	0 %	25 %	25 %	526231327
16508	NC_021872	TGA	2	6	870973	870978	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	526231327
16509	NC_021872	GAA	2	6	871042	871047	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	526231327
16510	NC_021872	AGA	2	6	871048	871053	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	526231327
16511	NC_021872	AATGGC	2	12	871057	871068	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	526231327
16512	NC_021872	GATC	2	8	871075	871082	25 %	25 %	25 %	25 %	526231327
16513	NC_021872	TAG	2	6	871113	871118	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	526231327
16514	NC_021872	TTG	2	6	871215	871220	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	526231327
16515	NC_021872	GAA	2	6	871265	871270	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	526231327
16516	NC_021872	GAA	2	6	871310	871315	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	526231327
16517	NC_021872	A	7	7	871314	871320	100 %	0 %	0 %	0 %	526231327
16518	NC_021872	AAT	2	6	871323	871328	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	526231327
16519	NC_021872	ATT	2	6	871423	871428	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	526231328
16520	NC_021872	GTT	3	9	871502	871510	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	526231328
16521	NC_021872	TAA	2	6	871549	871554	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	526231328
16522	NC_021872	AGTT	2	8	871624	871631	25 %	50 %	25 %	0 %	526231328
16523	NC_021872	TGA	2	6	871660	871665	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	526231328
16524	NC_021872	ATT	2	6	871680	871685	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	526231328
16525	NC_021872	TCA	2	6	871692	871697	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	526231328
16526	NC_021872	TAA	2	6	871699	871704	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	526231328
16527	NC_021872	CAA	2	6	871730	871735	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	526231328
16528	NC_021872	GCTT	2	8	871736	871743	0 %	50 %	25 %	25 %	526231328
16529	NC_021872	TCAG	2	8	871897	871904	25 %	25 %	25 %	25 %	526231328
16530	NC_021872	GCAA	2	8	871909	871916	50 %	0 %	25 %	25 %	526231328
16531	NC_021872	GAA	2	6	871922	871927	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	526231328
16532	NC_021872	TGC	2	6	871963	871968	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	526231328
16533	NC_021872	GGC	2	6	871972	871977	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	526231328
16534	NC_021872	AGA	2	6	872007	872012	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	526231328
16535	NC_021872	GAT	2	6	872068	872073	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	526231328
16536	NC_021872	GTT	2	6	872132	872137	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	526231328
16537	NC_021872	ATT	2	6	872188	872193	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	526231328
16538	NC_021872	CTT	3	9	872217	872225	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	526231328
16539	NC_021872	TGA	2	6	872254	872259	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	526231328
16540	NC_021872	AAG	2	6	872319	872324	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	526231328
16541	NC_021872	ATG	2	6	872358	872363	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	526231328
16542	NC_021872	CTC	2	6	872400	872405	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	526231328
16543	NC_021872	GAT	2	6	872408	872413	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	526231328
16544	NC_021872	ACA	2	6	872438	872443	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	526231328
16545	NC_021872	GATG	2	8	872452	872459	25 %	25 %	50 %	0 %	526231328
16546	NC_021872	A	6	6	872574	872579	100 %	0 %	0 %	0 %	526231328
16547	NC_021872	ATGGA	2	10	872598	872607	40 %	20 %	40 %	0 %	526231328
16548	NC_021872	TGT	2	6	872614	872619	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	526231328
16549	NC_021872	TGA	2	6	872620	872625	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	526231328
16550	NC_021872	TA	3	6	872640	872645	50 %	50 %	0 %	0 %	526231328
16551	NC_021872	GAA	2	6	872657	872662	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	526231328
16552	NC_021872	TCA	2	6	872668	872673	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	526231328
16553	NC_021872	AATTG	2	10	872731	872740	40 %	40 %	20 %	0 %	526231328
16554	NC_021872	TGA	2	6	872782	872787	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	526231328
16555	NC_021872	AACA	2	8	872817	872824	75 %	0 %	0 %	25 %	526231328
16556	NC_021872	CAC	2	6	872842	872847	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	526231328
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16558	NC_021872	ATT	2	6	872918	872923	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	526231328
16559	NC_021872	TCA	2	6	872977	872982	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	526231328
16560	NC_021872	CAC	2	6	873104	873109	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	526231328
16561	NC_021872	ATG	2	6	873180	873185	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	526231328
16562	NC_021872	GAT	2	6	873197	873202	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	526231328
16563	NC_021872	GAA	2	6	873218	873223	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	526231328
16564	NC_021872	AAT	2	6	873224	873229	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	526231328
16565	NC_021872	ATG	2	6	873431	873436	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	526231328
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16567	NC_021872	CAAAC	2	10	873499	873508	60 %	0 %	0 %	40 %	526231328
16568	NC_021872	AAC	2	6	873525	873530	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	526231328
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16574	NC_021872	TGA	2	6	873829	873834	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	526231328
16575	NC_021872	ATGGT	2	10	873928	873937	20 %	40 %	40 %	0 %	526231328
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16579	NC_021872	A	6	6	874223	874228	100 %	0 %	0 %	0 %	526231328
16580	NC_021872	ATTCC	2	10	874271	874280	20 %	40 %	0 %	40 %	526231328
16581	NC_021872	CCTT	2	8	874284	874291	0 %	50 %	0 %	50 %	526231328
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16583	NC_021872	A	7	7	874386	874392	100 %	0 %	0 %	0 %	526231328
16584	NC_021872	ACGA	2	8	874458	874465	50 %	0 %	25 %	25 %	526231328
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16588	NC_021872	TGA	2	6	874573	874578	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	526231328
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16590	NC_021872	AAC	2	6	874642	874647	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	526231328
16591	NC_021872	ATA	2	6	874674	874679	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	526231328
16592	NC_021872	ATG	2	6	874704	874709	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	526231328
16593	NC_021872	GAT	2	6	874717	874722	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	526231328
16594	NC_021872	GAT	2	6	874772	874777	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	526231328
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16598	NC_021872	TAC	2	6	874932	874937	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	526231328
16599	NC_021872	GT	3	6	874965	874970	0 %	50 %	50 %	0 %	526231328
16600	NC_021872	ATGGA	2	10	875067	875076	40 %	20 %	40 %	0 %	526231328
16601	NC_021872	TTTC	2	8	875085	875092	0 %	75 %	0 %	25 %	526231328
16602	NC_021872	GCT	2	6	875228	875233	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	526231328
16603	NC_021872	TAT	2	6	875288	875293	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	526231328
16604	NC_021872	TTC	2	6	875300	875305	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	526231328
16605	NC_021872	GC	3	6	875311	875316	0 %	0 %	50 %	50 %	526231328
16606	NC_021872	GTA	2	6	875330	875335	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	526231328
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16608	NC_021872	ATG	2	6	875397	875402	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	526231328
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16610	NC_021872	TTGA	2	8	875516	875523	25 %	50 %	25 %	0 %	526231328
16611	NC_021872	CAAA	2	8	875581	875588	75 %	0 %	0 %	25 %	526231328
16612	NC_021872	TTG	2	6	875589	875594	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	526231328
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16618	NC_021872	TGA	2	6	876035	876040	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	526231329
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16980	NC_021872	ATA	2	6	898317	898322	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	526231348
16981	NC_021872	AGC	2	6	898353	898358	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	526231348
16982	NC_021872	AGA	2	6	898438	898443	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	526231348
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16984	NC_021872	TAT	2	6	898475	898480	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	526231348
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