MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Lactobacillus reuteri TD1

Total Repeats: 40052

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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13002	NC_021872	GTTT	2	8	702425	702432	0 %	75 %	25 %	0 %	526231235
13003	NC_021872	ATT	2	6	702433	702438	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	526231235
13004	NC_021872	T	6	6	702437	702442	0 %	100 %	0 %	0 %	526231235
13005	NC_021872	TCG	2	6	702446	702451	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	526231235
13006	NC_021872	ATT	2	6	702511	702516	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	526231235
13007	NC_021872	TCAA	2	8	702554	702561	50 %	25 %	0 %	25 %	526231235
13008	NC_021872	TTC	2	6	702619	702624	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	526231235
13009	NC_021872	TTA	2	6	702709	702714	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	526231235
13010	NC_021872	CAT	2	6	702715	702720	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	526231235
13011	NC_021872	TTA	2	6	702730	702735	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	526231235
13012	NC_021872	TTC	2	6	702776	702781	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	526231235
13013	NC_021872	TTCA	2	8	702789	702796	25 %	50 %	0 %	25 %	526231235
13014	NC_021872	AAC	2	6	702798	702803	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	526231235
13015	NC_021872	CCA	2	6	702834	702839	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	526231235
13016	NC_021872	TGC	2	6	702906	702911	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	526231235
13017	NC_021872	ATT	2	6	702913	702918	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	526231235
13018	NC_021872	ACA	2	6	702925	702930	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	526231235
13019	NC_021872	TTA	2	6	702934	702939	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	526231235
13020	NC_021872	A	7	7	702964	702970	100 %	0 %	0 %	0 %	526231236
13021	NC_021872	TGA	2	6	702972	702977	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	526231236
13022	NC_021872	A	6	6	702988	702993	100 %	0 %	0 %	0 %	526231236
13023	NC_021872	AAT	2	6	703093	703098	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	526231236
13024	NC_021872	TTG	2	6	703103	703108	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	526231236
13025	NC_021872	TGT	2	6	703182	703187	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	526231236
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13027	NC_021872	TAT	2	6	703254	703259	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	526231236
13028	NC_021872	GAC	2	6	703444	703449	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	526231236
13029	NC_021872	ATT	2	6	703479	703484	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	526231236
13030	NC_021872	CAA	2	6	703493	703498	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	526231236
13031	NC_021872	ATT	2	6	703516	703521	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	526231236
13032	NC_021872	T	6	6	703529	703534	0 %	100 %	0 %	0 %	526231236
13033	NC_021872	AACCA	2	10	703600	703609	60 %	0 %	0 %	40 %	526231236
13034	NC_021872	GAT	2	6	703612	703617	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	526231236
13035	NC_021872	TTA	2	6	703625	703630	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	526231236
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13040	NC_021872	GCA	2	6	703819	703824	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	526231236
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13045	NC_021872	AAG	2	6	704071	704076	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	526231236
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13053	NC_021872	AAAAT	2	10	704460	704469	80 %	20 %	0 %	0 %	526231237
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13064	NC_021872	ATTGCA	2	12	704753	704764	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	526231237
13065	NC_021872	CTG	2	6	704790	704795	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	526231237
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13068	NC_021872	GAT	2	6	704885	704890	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	526231237
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13086	NC_021872	GATTAA	2	12	705613	705624	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	526231238
13087	NC_021872	GCGA	2	8	705642	705649	25 %	0 %	50 %	25 %	526231238
13088	NC_021872	TAT	2	6	705700	705705	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	526231238
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13090	NC_021872	TCA	2	6	705829	705834	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	526231238
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13092	NC_021872	TGA	2	6	705951	705956	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	526231238
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13099	NC_021872	TTA	2	6	706158	706163	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	526231238
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13102	NC_021872	GT	3	6	706502	706507	0 %	50 %	50 %	0 %	526231239
13103	NC_021872	TTGGTG	2	12	706536	706547	0 %	50 %	50 %	0 %	526231239
13104	NC_021872	GAG	2	6	706572	706577	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	526231239
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13106	NC_021872	TTAC	2	8	706687	706694	25 %	50 %	0 %	25 %	526231239
13107	NC_021872	CAA	2	6	706728	706733	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	526231239
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13110	NC_021872	AAT	2	6	706819	706824	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	526231239
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13115	NC_021872	CAGG	2	8	706970	706977	25 %	0 %	50 %	25 %	526231239
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13224	NC_021872	TGT	3	9	711388	711396	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	526231243
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13229	NC_021872	GACT	2	8	712122	712129	25 %	25 %	25 %	25 %	526231244
13230	NC_021872	GTG	2	6	712148	712153	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	526231244
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13232	NC_021872	GCT	2	6	712195	712200	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	526231244
13233	NC_021872	TAT	2	6	712238	712243	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	526231244
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13235	NC_021872	ATG	2	6	712316	712321	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	526231244
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13237	NC_021872	CTT	2	6	712338	712343	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	526231244
13238	NC_021872	GAC	2	6	712404	712409	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	526231244
13239	NC_021872	TGT	2	6	712470	712475	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	526231244
13240	NC_021872	ATG	2	6	712487	712492	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	526231244
13241	NC_021872	TGT	2	6	712503	712508	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	526231244
13242	NC_021872	TTGG	2	8	712544	712551	0 %	50 %	50 %	0 %	526231244
13243	NC_021872	GTT	2	6	712564	712569	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	526231244
13244	NC_021872	ACT	2	6	712603	712608	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	526231244
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13354	NC_021872	A	7	7	717604	717610	100 %	0 %	0 %	0 %	526231250
13355	NC_021872	TGCTT	2	10	717613	717622	0 %	60 %	20 %	20 %	526231250
13356	NC_021872	TTAA	2	8	717719	717726	50 %	50 %	0 %	0 %	526231250
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13358	NC_021872	TAAA	2	8	717871	717878	75 %	25 %	0 %	0 %	526231250
13359	NC_021872	TAAT	2	8	717979	717986	50 %	50 %	0 %	0 %	526231251
13360	NC_021872	ATA	2	6	717992	717997	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	526231251
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13362	NC_021872	GGA	2	6	718027	718032	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	526231251
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13364	NC_021872	TGT	2	6	718080	718085	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	526231251
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13464	NC_021872	A	6	6	722830	722835	100 %	0 %	0 %	0 %	526231254
13465	NC_021872	CTT	2	6	722856	722861	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	526231254
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13469	NC_021872	AT	3	6	723010	723015	50 %	50 %	0 %	0 %	526231254
13470	NC_021872	ATA	2	6	723103	723108	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	526231254
13471	NC_021872	A	6	6	723187	723192	100 %	0 %	0 %	0 %	526231255
13472	NC_021872	AAATTA	2	12	723309	723320	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	526231255
13473	NC_021872	CAGT	2	8	723362	723369	25 %	25 %	25 %	25 %	526231255
13474	NC_021872	ATTA	2	8	723403	723410	50 %	50 %	0 %	0 %	526231255
13475	NC_021872	CGG	2	6	723425	723430	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	526231255
13476	NC_021872	GTA	2	6	723452	723457	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	526231255
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13478	NC_021872	CTC	2	6	723585	723590	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	526231255
13479	NC_021872	ATC	2	6	723621	723626	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	526231255
13480	NC_021872	AT	3	6	723652	723657	50 %	50 %	0 %	0 %	526231255
13481	NC_021872	GAA	2	6	723659	723664	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	526231255
13482	NC_021872	TGA	2	6	723676	723681	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	526231255
13483	NC_021872	GTA	2	6	723686	723691	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	526231255
13484	NC_021872	CGAA	2	8	723736	723743	50 %	0 %	25 %	25 %	526231255
13485	NC_021872	ATT	2	6	723761	723766	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	526231255
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13487	NC_021872	ATT	2	6	723851	723856	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	526231255
13488	NC_021872	TGA	2	6	723859	723864	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	526231255
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13491	NC_021872	AGAA	2	8	724041	724048	75 %	0 %	25 %	0 %	526231255
13492	NC_021872	TTA	2	6	724082	724087	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	526231255
13493	NC_021872	AAG	2	6	724089	724094	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	526231255
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13496	NC_021872	GTAA	2	8	724260	724267	50 %	25 %	25 %	0 %	526232242
13497	NC_021872	AATTT	2	10	724352	724361	40 %	60 %	0 %	0 %	526232242
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