MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Lactobacillus reuteri TD1

Total Repeats: 40052

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
12501	NC_021872	TTC	2	6	671676	671681	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	526231209
12502	NC_021872	ATA	2	6	671924	671929	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	526231210
12503	NC_021872	CCG	2	6	671975	671980	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	526231210
12504	NC_021872	ATT	2	6	671998	672003	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	526231210
12505	NC_021872	TTCA	2	8	672194	672201	25 %	50 %	0 %	25 %	526232238
12506	NC_021872	TAA	2	6	672277	672282	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	526232238
12507	NC_021872	ATAA	2	8	672300	672307	75 %	25 %	0 %	0 %	526232238
12508	NC_021872	CTC	2	6	672403	672408	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	526231211
12509	NC_021872	TCA	2	6	672438	672443	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	526231211
12510	NC_021872	CGC	2	6	672509	672514	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	526231211
12511	NC_021872	TTA	2	6	672536	672541	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	526231211
12512	NC_021872	ACA	2	6	672661	672666	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	526231211
12513	NC_021872	TTC	2	6	672734	672739	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	526231211
12514	NC_021872	ATTT	2	8	672779	672786	25 %	75 %	0 %	0 %	526231211
12515	NC_021872	TTCAG	2	10	672798	672807	20 %	40 %	20 %	20 %	526231211
12516	NC_021872	TGA	2	6	672876	672881	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	526231211
12517	NC_021872	CTT	2	6	672958	672963	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	526231211
12518	NC_021872	TCG	2	6	672969	672974	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	526231211
12519	NC_021872	TTTA	2	8	672984	672991	25 %	75 %	0 %	0 %	526231211
12520	NC_021872	GCT	2	6	673057	673062	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	526231211
12521	NC_021872	ATC	2	6	673102	673107	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	526231211
12522	NC_021872	GGC	2	6	673235	673240	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	526231211
12523	NC_021872	TTC	2	6	673244	673249	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	526231211
12524	NC_021872	TTA	2	6	673278	673283	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	526231211
12525	NC_021872	GTT	2	6	673306	673311	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	526231211
12526	NC_021872	TTC	2	6	673423	673428	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	526231211
12527	NC_021872	TAA	2	6	673560	673565	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	526231211
12528	NC_021872	ATTT	2	8	673630	673637	25 %	75 %	0 %	0 %	526231211
12529	NC_021872	ATT	2	6	673639	673644	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	526231211
12530	NC_021872	CCA	2	6	673647	673652	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	526231211
12531	NC_021872	CTAA	2	8	673661	673668	50 %	25 %	0 %	25 %	526231211
12532	NC_021872	TTA	2	6	673868	673873	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	526231212
12533	NC_021872	A	6	6	673873	673878	100 %	0 %	0 %	0 %	526231212
12534	NC_021872	TCA	2	6	673893	673898	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	526231212
12535	NC_021872	T	6	6	673932	673937	0 %	100 %	0 %	0 %	526231212
12536	NC_021872	TTCC	2	8	673958	673965	0 %	50 %	0 %	50 %	526231212
12537	NC_021872	CAGT	2	8	673996	674003	25 %	25 %	25 %	25 %	526231212
12538	NC_021872	AGT	2	6	674012	674017	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	526231212
12539	NC_021872	TAT	2	6	674029	674034	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	526231212
12540	NC_021872	ACC	2	6	674051	674056	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	526231212
12541	NC_021872	TAT	2	6	674095	674100	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	526231212
12542	NC_021872	GTA	2	6	674141	674146	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	526231212
12543	NC_021872	GTT	2	6	674187	674192	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	526231212
12544	NC_021872	AAT	2	6	674238	674243	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	526231212
12545	NC_021872	AGT	2	6	674261	674266	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	526231212
12546	NC_021872	TGAT	2	8	674308	674315	25 %	50 %	25 %	0 %	526231212
12547	NC_021872	TA	3	6	674620	674625	50 %	50 %	0 %	0 %	526231213
12548	NC_021872	T	6	6	674704	674709	0 %	100 %	0 %	0 %	526231213
12549	NC_021872	ATT	2	6	674775	674780	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	526231213
12550	NC_021872	ACG	2	6	674879	674884	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	526231213
12551	NC_021872	ATT	3	9	674889	674897	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	526231213
12552	NC_021872	GAT	2	6	674898	674903	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	526231213
12553	NC_021872	CTT	2	6	674945	674950	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	526231213
12554	NC_021872	TGAACT	2	12	674966	674977	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	526231213
12555	NC_021872	ATG	2	6	675186	675191	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	526231214
12556	NC_021872	ACTT	2	8	675222	675229	25 %	50 %	0 %	25 %	526231214
12557	NC_021872	ATC	2	6	675234	675239	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	526231214
12558	NC_021872	AAG	2	6	675273	675278	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	526231214
12559	NC_021872	AAC	2	6	675302	675307	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	526231214
12560	NC_021872	TAA	2	6	675337	675342	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	526231214
12561	NC_021872	ATT	2	6	675352	675357	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	526231214
12562	NC_021872	AT	3	6	675427	675432	50 %	50 %	0 %	0 %	526231214
12563	NC_021872	A	7	7	675450	675456	100 %	0 %	0 %	0 %	526231214
12564	NC_021872	GATCAA	2	12	675464	675475	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	526231214
12565	NC_021872	TGAT	2	8	675561	675568	25 %	50 %	25 %	0 %	526231214
12566	NC_021872	TGA	2	6	675589	675594	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	526231214
12567	NC_021872	TCA	2	6	675599	675604	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	526231214
12568	NC_021872	TA	3	6	675609	675614	50 %	50 %	0 %	0 %	526231214
12569	NC_021872	TAT	2	6	675629	675634	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	526231214
12570	NC_021872	ATG	2	6	675672	675677	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	526231214
12571	NC_021872	CTTGCT	2	12	675689	675700	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	526231214
12572	NC_021872	CAA	2	6	675723	675728	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	526231214
12573	NC_021872	T	6	6	675736	675741	0 %	100 %	0 %	0 %	526231214
12574	NC_021872	GAAA	2	8	675753	675760	75 %	0 %	25 %	0 %	526231214
12575	NC_021872	TAT	2	6	675955	675960	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	526231215
12576	NC_021872	CGA	2	6	675991	675996	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	526231215
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12579	NC_021872	CAT	2	6	676114	676119	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	526231215
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12585	NC_021872	TAGAGA	2	12	676661	676672	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	526231215
12586	NC_021872	TTATT	2	10	676681	676690	20 %	80 %	0 %	0 %	526231215
12587	NC_021872	G	6	6	676694	676699	0 %	0 %	100 %	0 %	526231215
12588	NC_021872	TTA	2	6	676717	676722	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	526231215
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12590	NC_021872	ATT	2	6	676786	676791	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	526231215
12591	NC_021872	AATT	2	8	676811	676818	50 %	50 %	0 %	0 %	526231215
12592	NC_021872	ATC	2	6	676847	676852	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	526231215
12593	NC_021872	ATG	2	6	676883	676888	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	526231215
12594	NC_021872	ATA	2	6	676923	676928	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	526231215
12595	NC_021872	ACAT	2	8	676933	676940	50 %	25 %	0 %	25 %	526231216
12596	NC_021872	AAC	2	6	677083	677088	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	526231216
12597	NC_021872	CTGACG	2	12	677139	677150	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	526231216
12598	NC_021872	TAC	2	6	677221	677226	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	526231216
12599	NC_021872	GAA	2	6	677279	677284	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	526231216
12600	NC_021872	AAG	2	6	677336	677341	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	526231216
12601	NC_021872	TTA	2	6	677351	677356	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	526231216
12602	NC_021872	ATA	2	6	677400	677405	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	526231216
12603	NC_021872	TCA	2	6	677437	677442	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	526231216
12604	NC_021872	ATTTTG	2	12	677508	677519	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	526231216
12605	NC_021872	AAC	2	6	677648	677653	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	526231216
12606	NC_021872	CAG	2	6	677672	677677	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	526231216
12607	NC_021872	TAA	2	6	677710	677715	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	526231216
12608	NC_021872	AAAAG	2	10	677737	677746	80 %	0 %	20 %	0 %	526231216
12609	NC_021872	AAG	2	6	677765	677770	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	526231216
12610	NC_021872	TAA	2	6	677890	677895	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	526231216
12611	NC_021872	TTGG	2	8	677923	677930	0 %	50 %	50 %	0 %	526231216
12612	NC_021872	GAT	2	6	678029	678034	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	526231216
12613	NC_021872	CTCA	2	8	678044	678051	25 %	25 %	0 %	50 %	526231216
12614	NC_021872	TGC	2	6	678058	678063	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	526231216
12615	NC_021872	AGCA	2	8	678084	678091	50 %	0 %	25 %	25 %	526231216
12616	NC_021872	GAA	2	6	678101	678106	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	526231216
12617	NC_021872	AATG	2	8	678136	678143	50 %	25 %	25 %	0 %	526231216
12618	NC_021872	ATA	2	6	678150	678155	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	526231216
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12620	NC_021872	A	6	6	678245	678250	100 %	0 %	0 %	0 %	526231216
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12982	NC_021872	CAA	2	6	701818	701823	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	526231234
12983	NC_021872	TAAAAG	2	12	701843	701854	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	526231234
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12986	NC_021872	TTAA	2	8	702046	702053	50 %	50 %	0 %	0 %	526231235
12987	NC_021872	AAAG	2	8	702066	702073	75 %	0 %	25 %	0 %	526231235
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12990	NC_021872	CAA	2	6	702131	702136	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	526231235
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