MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Lactobacillus reuteri TD1

Total Repeats: 40052

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
11501	NC_021872	ATTCC	2	10	616422	616431	20 %	40 %	0 %	40 %	526231163
11502	NC_021872	TGA	2	6	616496	616501	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	526231163
11503	NC_021872	TGTTT	2	10	616550	616559	0 %	80 %	20 %	0 %	526231163
11504	NC_021872	ACA	2	6	616591	616596	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	526231163
11505	NC_021872	GCG	2	6	616743	616748	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	526231163
11506	NC_021872	TTA	2	6	616800	616805	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	526231163
11507	NC_021872	GATG	2	8	616865	616872	25 %	25 %	50 %	0 %	526231163
11508	NC_021872	TGA	2	6	616901	616906	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	526231163
11509	NC_021872	TTA	2	6	616930	616935	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	526231163
11510	NC_021872	GTT	2	6	616962	616967	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	526231163
11511	NC_021872	TAAAC	2	10	616980	616989	60 %	20 %	0 %	20 %	526231163
11512	NC_021872	AAT	2	6	617077	617082	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	526231164
11513	NC_021872	GAGAAC	2	12	617087	617098	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	526231164
11514	NC_021872	GAA	2	6	617144	617149	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	526231164
11515	NC_021872	TGA	2	6	617164	617169	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	526231164
11516	NC_021872	CAA	2	6	617174	617179	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	526231164
11517	NC_021872	TGA	2	6	617230	617235	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	526231164
11518	NC_021872	ATT	2	6	617308	617313	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	526231164
11519	NC_021872	GAT	2	6	617324	617329	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	526231164
11520	NC_021872	ATT	3	9	617453	617461	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	526231164
11521	NC_021872	TG	3	6	617465	617470	0 %	50 %	50 %	0 %	526231164
11522	NC_021872	ATA	2	6	617544	617549	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	526231164
11523	NC_021872	GA	3	6	617568	617573	50 %	0 %	50 %	0 %	526231164
11524	NC_021872	CAAAG	3	15	617613	617627	60 %	0 %	20 %	20 %	526231164
11525	NC_021872	AAG	2	6	617646	617651	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	526231164
11526	NC_021872	TTAC	2	8	617676	617683	25 %	50 %	0 %	25 %	526231164
11527	NC_021872	ATA	2	6	617760	617765	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	526231164
11528	NC_021872	TTA	2	6	617771	617776	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	526231164
11529	NC_021872	A	6	6	617799	617804	100 %	0 %	0 %	0 %	526231164
11530	NC_021872	CAA	2	6	617865	617870	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	526231164
11531	NC_021872	TAA	2	6	617905	617910	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	526231164
11532	NC_021872	AGC	2	6	617966	617971	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	526231164
11533	NC_021872	CAAGC	2	10	618000	618009	40 %	0 %	20 %	40 %	526231164
11534	NC_021872	TAA	2	6	618031	618036	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	526231164
11535	NC_021872	CTG	2	6	618051	618056	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	526231164
11536	NC_021872	TAA	3	9	618058	618066	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	526231164
11537	NC_021872	GTC	2	6	618069	618074	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	526231164
11538	NC_021872	CAAC	2	8	618104	618111	50 %	0 %	0 %	50 %	526231164
11539	NC_021872	AACT	2	8	618162	618169	50 %	25 %	0 %	25 %	526231165
11540	NC_021872	ATT	3	9	618182	618190	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	526231165
11541	NC_021872	TTA	3	9	618200	618208	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	526231165
11542	NC_021872	TGC	2	6	618280	618285	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	526231165
11543	NC_021872	TATTT	2	10	618286	618295	20 %	80 %	0 %	0 %	526231165
11544	NC_021872	GCA	2	6	618299	618304	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	526231165
11545	NC_021872	GTT	2	6	618437	618442	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	526231165
11546	NC_021872	CAT	2	6	618444	618449	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	526231165
11547	NC_021872	ATT	2	6	618464	618469	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	526231165
11548	NC_021872	GTA	2	6	618524	618529	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	526231165
11549	NC_021872	ACT	2	6	618563	618568	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	526231165
11550	NC_021872	TCT	2	6	618585	618590	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	526231165
11551	NC_021872	AAT	2	6	618599	618604	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	526231165
11552	NC_021872	TA	3	6	618648	618653	50 %	50 %	0 %	0 %	526231165
11553	NC_021872	TTCA	2	8	618692	618699	25 %	50 %	0 %	25 %	526231165
11554	NC_021872	GGAT	2	8	618718	618725	25 %	25 %	50 %	0 %	526231165
11555	NC_021872	TAAT	2	8	618907	618914	50 %	50 %	0 %	0 %	526231166
11556	NC_021872	AAC	2	6	618974	618979	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	526231166
11557	NC_021872	ATCA	2	8	618988	618995	50 %	25 %	0 %	25 %	526231166
11558	NC_021872	TTA	2	6	619012	619017	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	526231166
11559	NC_021872	TTTG	2	8	619047	619054	0 %	75 %	25 %	0 %	526231166
11560	NC_021872	GAT	2	6	619077	619082	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	526231166
11561	NC_021872	A	6	6	619104	619109	100 %	0 %	0 %	0 %	526231166
11562	NC_021872	GAA	2	6	619134	619139	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	526231166
11563	NC_021872	A	6	6	619156	619161	100 %	0 %	0 %	0 %	526231166
11564	NC_021872	AAC	2	6	619168	619173	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	526231166
11565	NC_021872	GAG	2	6	619225	619230	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	526231166
11566	NC_021872	ACC	2	6	619310	619315	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	526231166
11567	NC_021872	GGC	2	6	619417	619422	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	526231166
11568	NC_021872	CTA	2	6	619456	619461	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	526231166
11569	NC_021872	CTT	2	6	619486	619491	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	526231166
11570	NC_021872	CAAC	2	8	619497	619504	50 %	0 %	0 %	50 %	526231166
11571	NC_021872	CGTG	2	8	619526	619533	0 %	25 %	50 %	25 %	526231166
11572	NC_021872	GAA	2	6	619554	619559	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	526231166
11573	NC_021872	A	6	6	619558	619563	100 %	0 %	0 %	0 %	526231166
11574	NC_021872	GAA	2	6	619596	619601	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	526231166
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11577	NC_021872	CAG	3	9	619684	619692	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	526231166
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11579	NC_021872	TGG	2	6	619760	619765	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	526231166
11580	NC_021872	TGC	2	6	619778	619783	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	526231166
11581	NC_021872	TTA	2	6	619800	619805	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	526231166
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11585	NC_021872	CGA	2	6	619881	619886	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	526231166
11586	NC_021872	GGCC	2	8	619925	619932	0 %	0 %	50 %	50 %	526231166
11587	NC_021872	A	7	7	620096	620102	100 %	0 %	0 %	0 %	526231166
11588	NC_021872	ATTTG	2	10	620188	620197	20 %	60 %	20 %	0 %	526231167
11589	NC_021872	AGC	2	6	620212	620217	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	526231167
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11591	NC_021872	TGG	2	6	620350	620355	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	526231167
11592	NC_021872	ACT	2	6	620408	620413	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	526231167
11593	NC_021872	TGA	2	6	620524	620529	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	526231167
11594	NC_021872	GTG	2	6	620553	620558	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	526231167
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11601	NC_021872	TGG	2	6	620821	620826	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	526231167
11602	NC_021872	TCG	2	6	620866	620871	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	526231167
11603	NC_021872	TAAAG	2	10	620917	620926	60 %	20 %	20 %	0 %	526231167
11604	NC_021872	TATG	2	8	620977	620984	25 %	50 %	25 %	0 %	526231167
11605	NC_021872	TTG	2	6	621039	621044	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	526231167
11606	NC_021872	ATGA	2	8	621137	621144	50 %	25 %	25 %	0 %	526231167
11607	NC_021872	GAAA	2	8	621202	621209	75 %	0 %	25 %	0 %	526231167
11608	NC_021872	CTG	2	6	621210	621215	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	526231167
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11610	NC_021872	AATA	2	8	621279	621286	75 %	25 %	0 %	0 %	526231167
11611	NC_021872	CGC	2	6	621524	621529	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	526231168
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11616	NC_021872	A	6	6	621660	621665	100 %	0 %	0 %	0 %	526231168
11617	NC_021872	AGA	2	6	621686	621691	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	526231168
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11620	NC_021872	GCG	2	6	621734	621739	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	526231168
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11623	NC_021872	GA	3	6	621820	621825	50 %	0 %	50 %	0 %	526231168
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11979	NC_021872	ATT	2	6	638348	638353	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	526231181
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