MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Lactobacillus reuteri TD1

Total Repeats: 40052

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
11001	NC_021872	AGA	2	6	588620	588625	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	526232236
11002	NC_021872	GAT	2	6	588683	588688	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	526232236
11003	NC_021872	T	7	7	588747	588753	0 %	100 %	0 %	0 %	526232236
11004	NC_021872	ATGT	2	8	588792	588799	25 %	50 %	25 %	0 %	526232236
11005	NC_021872	TCA	2	6	588837	588842	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	526232236
11006	NC_021872	T	6	6	588978	588983	0 %	100 %	0 %	0 %	526232236
11007	NC_021872	TTG	2	6	590812	590817	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	526231144
11008	NC_021872	TCA	2	6	590839	590844	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	526231144
11009	NC_021872	ACA	2	6	590935	590940	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	526231144
11010	NC_021872	TGA	2	6	590957	590962	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	526231144
11011	NC_021872	GAT	2	6	590994	590999	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	526231144
11012	NC_021872	ATG	2	6	591020	591025	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	526231144
11013	NC_021872	GAC	2	6	591086	591091	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	526231144
11014	NC_021872	AGT	2	6	591093	591098	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	526231144
11015	NC_021872	GAC	2	6	591131	591136	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	526231144
11016	NC_021872	CCTT	2	8	591172	591179	0 %	50 %	0 %	50 %	526231144
11017	NC_021872	ACGA	2	8	591192	591199	50 %	0 %	25 %	25 %	526231144
11018	NC_021872	GCTTTT	2	12	591245	591256	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	526231144
11019	NC_021872	CGA	2	6	591292	591297	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	526231144
11020	NC_021872	GAC	2	6	591371	591376	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	526231144
11021	NC_021872	ATAA	2	8	591412	591419	75 %	25 %	0 %	0 %	526231144
11022	NC_021872	ATTG	2	8	591819	591826	25 %	50 %	25 %	0 %	526231145
11023	NC_021872	ATT	2	6	591835	591840	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	526231145
11024	NC_021872	ACG	2	6	591876	591881	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	526231145
11025	NC_021872	CAG	2	6	591946	591951	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	526231145
11026	NC_021872	GAA	2	6	591964	591969	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	526231145
11027	NC_021872	TAA	2	6	592056	592061	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	526231145
11028	NC_021872	AAC	3	9	592155	592163	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	526231145
11029	NC_021872	ACA	2	6	592188	592193	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	526231145
11030	NC_021872	CAA	3	9	592201	592209	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	526231145
11031	NC_021872	AAGC	2	8	592219	592226	50 %	0 %	25 %	25 %	526231145
11032	NC_021872	AAAT	2	8	592242	592249	75 %	25 %	0 %	0 %	526231145
11033	NC_021872	GGA	2	6	592335	592340	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	526231145
11034	NC_021872	TAA	2	6	592368	592373	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	526231145
11035	NC_021872	AAG	2	6	592447	592452	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	526231145
11036	NC_021872	TCCAA	2	10	592586	592595	40 %	20 %	0 %	40 %	526231145
11037	NC_021872	TGT	2	6	592638	592643	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	526231145
11038	NC_021872	TAA	2	6	592653	592658	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	526231145
11039	NC_021872	GATT	2	8	592674	592681	25 %	50 %	25 %	0 %	526231145
11040	NC_021872	AGAA	2	8	592700	592707	75 %	0 %	25 %	0 %	526231145
11041	NC_021872	TGA	2	6	592745	592750	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	526231145
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11043	NC_021872	ATT	2	6	592882	592887	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	526231145
11044	NC_021872	A	6	6	592991	592996	100 %	0 %	0 %	0 %	526231145
11045	NC_021872	TGA	2	6	593037	593042	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	526231145
11046	NC_021872	CTT	2	6	593151	593156	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	526231145
11047	NC_021872	TGA	2	6	593187	593192	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	526231145
11048	NC_021872	AAC	2	6	593231	593236	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	526231145
11049	NC_021872	TTC	2	6	593285	593290	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	526231145
11050	NC_021872	CAA	2	6	593320	593325	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	526231145
11051	NC_021872	GCA	3	9	593359	593367	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	526231145
11052	NC_021872	A	6	6	593371	593376	100 %	0 %	0 %	0 %	526231145
11053	NC_021872	TAT	2	6	593482	593487	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	526231145
11054	NC_021872	ATA	2	6	593750	593755	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	526231146
11055	NC_021872	CGA	2	6	593759	593764	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	526231146
11056	NC_021872	TAC	2	6	593771	593776	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	526231146
11057	NC_021872	AGC	2	6	593830	593835	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	526231146
11058	NC_021872	CAG	2	6	593884	593889	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	526231146
11059	NC_021872	ATT	2	6	593923	593928	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	526231146
11060	NC_021872	GTG	2	6	593936	593941	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	526231146
11061	NC_021872	ATT	2	6	594007	594012	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	526231146
11062	NC_021872	A	6	6	594039	594044	100 %	0 %	0 %	0 %	526231146
11063	NC_021872	TACC	2	8	594081	594088	25 %	25 %	0 %	50 %	526231146
11064	NC_021872	AAG	2	6	594101	594106	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	526231146
11065	NC_021872	TAA	2	6	594177	594182	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	526231146
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11067	NC_021872	TGG	2	6	594254	594259	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	526231146
11068	NC_021872	TGG	2	6	594411	594416	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	526231146
11069	NC_021872	ATATCT	2	12	594683	594694	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	526231146
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11071	NC_021872	TGCT	2	8	594705	594712	0 %	50 %	25 %	25 %	526231146
11072	NC_021872	GAA	2	6	594817	594822	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	526231146
11073	NC_021872	TAA	2	6	594834	594839	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	526231146
11074	NC_021872	TGA	2	6	594846	594851	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	526231146
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11077	NC_021872	TGCA	2	8	595034	595041	25 %	25 %	25 %	25 %	526231147
11078	NC_021872	TGA	2	6	595091	595096	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	526231147
11079	NC_021872	GCA	2	6	595177	595182	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	526231147
11080	NC_021872	TCG	2	6	595236	595241	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	526231147
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11083	NC_021872	CTG	2	6	595436	595441	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	526231147
11084	NC_021872	ATG	4	12	595450	595461	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	526231147
11085	NC_021872	TGG	2	6	595464	595469	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	526231147
11086	NC_021872	GCT	2	6	595486	595491	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	526231147
11087	NC_021872	CTT	2	6	595533	595538	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	526231147
11088	NC_021872	AACT	2	8	595583	595590	50 %	25 %	0 %	25 %	526231147
11089	NC_021872	CGG	2	6	595702	595707	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	526231147
11090	NC_021872	ATG	2	6	595708	595713	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	526231147
11091	NC_021872	ATG	2	6	595823	595828	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	526231147
11092	NC_021872	CTT	2	6	595832	595837	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	526231147
11093	NC_021872	ATT	2	6	595879	595884	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	526231147
11094	NC_021872	TTC	2	6	595922	595927	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	526231147
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11099	NC_021872	GCG	2	6	596489	596494	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	526231148
11100	NC_021872	GAA	2	6	596498	596503	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	526231148
11101	NC_021872	TGG	2	6	596516	596521	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	526231148
11102	NC_021872	GTG	2	6	596547	596552	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	526231148
11103	NC_021872	A	6	6	596555	596560	100 %	0 %	0 %	0 %	526231148
11104	NC_021872	CCA	2	6	596585	596590	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	526231148
11105	NC_021872	ATG	2	6	596679	596684	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	526231148
11106	NC_021872	TAT	2	6	596685	596690	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	526231148
11107	NC_021872	CAA	2	6	596798	596803	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	526231148
11108	NC_021872	ATT	2	6	596834	596839	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	526231148
11109	NC_021872	TGA	2	6	596899	596904	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	526231148
11110	NC_021872	TTG	2	6	596934	596939	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	526231148
11111	NC_021872	CAT	2	6	596977	596982	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	526231148
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11113	NC_021872	GAT	2	6	597038	597043	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	526231148
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11117	NC_021872	ATT	2	6	597242	597247	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	526231148
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11119	NC_021872	CTGAA	2	10	597348	597357	40 %	20 %	20 %	20 %	526231148
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11122	NC_021872	TGA	2	6	597604	597609	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	526231148
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11222	NC_021872	TTCAT	2	10	602961	602970	20 %	60 %	0 %	20 %	526231151
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11227	NC_021872	A	6	6	603235	603240	100 %	0 %	0 %	0 %	526231151
11228	NC_021872	A	6	6	603321	603326	100 %	0 %	0 %	0 %	526231151
11229	NC_021872	ATAAA	2	10	603362	603371	80 %	20 %	0 %	0 %	526231151
11230	NC_021872	TGT	2	6	603384	603389	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	526231151
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11234	NC_021872	ACCG	2	8	603540	603547	25 %	0 %	25 %	50 %	526231151
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11237	NC_021872	GAA	2	6	603675	603680	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	526231151
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11240	NC_021872	GGTG	2	8	603819	603826	0 %	25 %	75 %	0 %	526231152
11241	NC_021872	ATT	2	6	604026	604031	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	526231152
11242	NC_021872	AGTA	2	8	604130	604137	50 %	25 %	25 %	0 %	526231152
11243	NC_021872	AGA	2	6	604168	604173	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	526231152
11244	NC_021872	CATTAT	2	12	604243	604254	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	526231152
11245	NC_021872	AAT	2	6	604264	604269	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	526231152
11246	NC_021872	ATC	2	6	604313	604318	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	526231152
11247	NC_021872	TG	3	6	604330	604335	0 %	50 %	50 %	0 %	526231152
11248	NC_021872	GC	3	6	604355	604360	0 %	0 %	50 %	50 %	526231152
11249	NC_021872	ATA	2	6	604410	604415	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	526231152
11250	NC_021872	TTC	2	6	604545	604550	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	526231152
11251	NC_021872	TTA	2	6	604581	604586	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	526231152
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11254	NC_021872	TGA	2	6	604669	604674	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	526231152
11255	NC_021872	CAG	2	6	604692	604697	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	526231152
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11257	NC_021872	TGAA	2	8	604740	604747	50 %	25 %	25 %	0 %	526231152
11258	NC_021872	ACC	2	6	604756	604761	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	526231152
11259	NC_021872	ATC	2	6	604800	604805	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	526231152
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11262	NC_021872	TAA	2	6	604987	604992	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	526231152
11263	NC_021872	TGA	2	6	605014	605019	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	526231152
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11269	NC_021872	AGC	2	6	605349	605354	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	526231152
11270	NC_021872	ATG	2	6	605405	605410	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	526231152
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11272	NC_021872	A	6	6	605472	605477	100 %	0 %	0 %	0 %	526231152
11273	NC_021872	GTT	2	6	605588	605593	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	526231153
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11277	NC_021872	GCT	2	6	605720	605725	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	526231153
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11283	NC_021872	GAA	2	6	605933	605938	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	526231153
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11352	NC_021872	GTATT	2	10	609119	609128	20 %	60 %	20 %	0 %	526231156
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11361	NC_021872	GTA	2	6	609488	609493	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	526231156
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11481	NC_021872	TTA	2	6	615582	615587	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	526231162
11482	NC_021872	A	7	7	615595	615601	100 %	0 %	0 %	0 %	526231162
11483	NC_021872	TTTA	2	8	615654	615661	25 %	75 %	0 %	0 %	526231162
11484	NC_021872	GTG	2	6	615666	615671	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	526231162
11485	NC_021872	AAT	2	6	615675	615680	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	526231162
11486	NC_021872	CAG	2	6	615802	615807	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	526231163
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11489	NC_021872	ATG	2	6	615919	615924	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	526231163
11490	NC_021872	T	6	6	615994	615999	0 %	100 %	0 %	0 %	526231163
11491	NC_021872	CGA	2	6	616000	616005	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	526231163
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11499	NC_021872	AGA	2	6	616313	616318	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	526231163
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