MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Lactobacillus reuteri TD1

Total Repeats: 40052

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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10002	NC_021872	AC	3	6	538901	538906	50 %	0 %	0 %	50 %	526232232
10003	NC_021872	ACT	2	6	538910	538915	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	526232232
10004	NC_021872	AAG	2	6	538922	538927	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	526232232
10005	NC_021872	CAT	2	6	538931	538936	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	526232232
10006	NC_021872	ACA	2	6	538975	538980	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	526232232
10007	NC_021872	AAG	2	6	538992	538997	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	526232232
10008	NC_021872	ATG	2	6	539022	539027	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	526232232
10009	NC_021872	AT	3	6	539080	539085	50 %	50 %	0 %	0 %	526232232
10010	NC_021872	CTG	2	6	539124	539129	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	526232232
10011	NC_021872	TGA	2	6	539137	539142	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	526232232
10012	NC_021872	CGAAA	2	10	539156	539165	60 %	0 %	20 %	20 %	526232232
10013	NC_021872	AGCT	2	8	539184	539191	25 %	25 %	25 %	25 %	526232232
10014	NC_021872	GAA	2	6	539264	539269	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	526232232
10015	NC_021872	TGA	2	6	539326	539331	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	526232232
10016	NC_021872	CTG	2	6	539343	539348	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	526232232
10017	NC_021872	ATC	2	6	539349	539354	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	526232232
10018	NC_021872	CAA	2	6	539439	539444	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	526232232
10019	NC_021872	GAT	3	9	539465	539473	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	526232232
10020	NC_021872	TGC	2	6	539500	539505	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	526232232
10021	NC_021872	TAAA	2	8	539521	539528	75 %	25 %	0 %	0 %	526232232
10022	NC_021872	ATTA	2	8	539605	539612	50 %	50 %	0 %	0 %	526231099
10023	NC_021872	TTCAT	2	10	539634	539643	20 %	60 %	0 %	20 %	526231099
10024	NC_021872	GATTT	2	10	539645	539654	20 %	60 %	20 %	0 %	526231099
10025	NC_021872	CGC	2	6	539704	539709	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	526231099
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10027	NC_021872	ATT	2	6	539750	539755	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	526231099
10028	NC_021872	TAA	2	6	539766	539771	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	526231099
10029	NC_021872	TTG	2	6	539783	539788	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	526231099
10030	NC_021872	TTG	2	6	539822	539827	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	526231099
10031	NC_021872	TGA	2	6	539837	539842	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	526231099
10032	NC_021872	AGT	3	9	539846	539854	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	526231099
10033	NC_021872	GCT	2	6	539864	539869	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	526231099
10034	NC_021872	TGA	2	6	539885	539890	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	526231099
10035	NC_021872	GTTA	2	8	539933	539940	25 %	50 %	25 %	0 %	526231099
10036	NC_021872	TTG	2	6	539962	539967	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	526231099
10037	NC_021872	TATT	2	8	539974	539981	25 %	75 %	0 %	0 %	526231099
10038	NC_021872	GAA	2	6	539982	539987	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	526231099
10039	NC_021872	TAG	2	6	540001	540006	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	526231099
10040	NC_021872	CTA	2	6	540036	540041	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	526231099
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10043	NC_021872	TTGT	2	8	540064	540071	0 %	75 %	25 %	0 %	526231099
10044	NC_021872	ACTT	2	8	540074	540081	25 %	50 %	0 %	25 %	526231099
10045	NC_021872	GCT	2	6	540111	540116	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	526231099
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10049	NC_021872	AATA	2	8	540393	540400	75 %	25 %	0 %	0 %	526231100
10050	NC_021872	AAG	2	6	540436	540441	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	526231100
10051	NC_021872	CTGAAA	2	12	540523	540534	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	526231100
10052	NC_021872	ATG	2	6	540556	540561	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	526231100
10053	NC_021872	GTT	2	6	540597	540602	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	526231100
10054	NC_021872	GAT	2	6	540636	540641	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	526231100
10055	NC_021872	A	6	6	540647	540652	100 %	0 %	0 %	0 %	526231100
10056	NC_021872	ATG	2	6	540670	540675	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	526231100
10057	NC_021872	TCT	2	6	540695	540700	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	526231100
10058	NC_021872	AAG	2	6	540765	540770	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	526231100
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10060	NC_021872	TCAAA	2	10	540812	540821	60 %	20 %	0 %	20 %	526231100
10061	NC_021872	GGAT	2	8	540849	540856	25 %	25 %	50 %	0 %	526231100
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10064	NC_021872	AAC	2	6	541004	541009	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	526231100
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10067	NC_021872	AAT	2	6	541139	541144	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	526231100
10068	NC_021872	GCTGG	2	10	541196	541205	0 %	20 %	60 %	20 %	526231100
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10071	NC_021872	ATTT	2	8	541377	541384	25 %	75 %	0 %	0 %	526231100
10072	NC_021872	AAAAGA	2	12	541385	541396	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	526231100
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10091	NC_021872	GTG	2	6	542793	542798	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	526231101
10092	NC_021872	CATGT	2	10	542809	542818	20 %	40 %	20 %	20 %	526231101
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10103	NC_021872	ATG	3	9	543368	543376	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	526231102
10104	NC_021872	AAAG	2	8	543452	543459	75 %	0 %	25 %	0 %	526231103
10105	NC_021872	GCA	3	9	543543	543551	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	526231103
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10109	NC_021872	ATTT	2	8	543701	543708	25 %	75 %	0 %	0 %	526231103
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10117	NC_021872	GTT	2	6	543957	543962	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	526231103
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10239	NC_021872	CTA	2	6	549871	549876	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	526231109
10240	NC_021872	ATG	2	6	549893	549898	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	526231109
10241	NC_021872	AAGC	2	8	549944	549951	50 %	0 %	25 %	25 %	526231109
10242	NC_021872	TGC	2	6	549957	549962	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	526231109
10243	NC_021872	TA	3	6	549968	549973	50 %	50 %	0 %	0 %	526231109
10244	NC_021872	GGT	2	6	550045	550050	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	526231109
10245	NC_021872	CTG	2	6	550151	550156	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	526231109
10246	NC_021872	GGT	2	6	550270	550275	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	526231109
10247	NC_021872	TCA	2	6	550294	550299	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	526231109
10248	NC_021872	TTG	3	9	550331	550339	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	526231109
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10250	NC_021872	CAA	3	9	550420	550428	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	526231109
10251	NC_021872	ATT	2	6	550591	550596	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	526231109
10252	NC_021872	ATTG	2	8	550602	550609	25 %	50 %	25 %	0 %	526231109
10253	NC_021872	AGT	2	6	550649	550654	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	526231109
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10255	NC_021872	ACTT	2	8	550776	550783	25 %	50 %	0 %	25 %	526231110
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10258	NC_021872	AT	3	6	550870	550875	50 %	50 %	0 %	0 %	526231110
10259	NC_021872	CAG	2	6	550947	550952	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	526231110
10260	NC_021872	CTG	2	6	551091	551096	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	526231110
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10262	NC_021872	ATC	2	6	551310	551315	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	526231110
10263	NC_021872	CAAG	2	8	551323	551330	50 %	0 %	25 %	25 %	526231110
10264	NC_021872	AAG	2	6	551385	551390	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	526231110
10265	NC_021872	TAC	2	6	551406	551411	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	526231110
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10271	NC_021872	GGC	2	6	551672	551677	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	526231111
10272	NC_021872	ATTG	2	8	551691	551698	25 %	50 %	25 %	0 %	526231111
10273	NC_021872	TGC	2	6	551733	551738	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	526231111
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10278	NC_021872	GAA	2	6	551902	551907	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	526231111
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10304	NC_021872	TATGGC	2	12	553071	553082	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	526231112
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10309	NC_021872	TAG	2	6	553267	553272	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	526231112
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10313	NC_021872	AATT	2	8	553394	553401	50 %	50 %	0 %	0 %	526231112
10314	NC_021872	AT	3	6	553499	553504	50 %	50 %	0 %	0 %	526231112
10315	NC_021872	CAA	2	6	553506	553511	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	526231112
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10339	NC_021872	AAG	2	6	554930	554935	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	526231114
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10344	NC_021872	GATG	2	8	555268	555275	25 %	25 %	50 %	0 %	526231114
10345	NC_021872	ATT	2	6	555293	555298	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	526231114
10346	NC_021872	TGGG	2	8	555306	555313	0 %	25 %	75 %	0 %	526231114
10347	NC_021872	TTG	2	6	555363	555368	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	526231114
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10349	NC_021872	TTG	2	6	555441	555446	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	526231114
10350	NC_021872	CAA	2	6	555453	555458	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	526231114
10351	NC_021872	ATG	2	6	555459	555464	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	526231114
10352	NC_021872	A	6	6	555477	555482	100 %	0 %	0 %	0 %	526231114
10353	NC_021872	A	7	7	555518	555524	100 %	0 %	0 %	0 %	526231114
10354	NC_021872	CCG	2	6	555546	555551	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	526231114
10355	NC_021872	TTC	2	6	555586	555591	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	526231114
10356	NC_021872	ACC	2	6	555672	555677	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	526231114
10357	NC_021872	GAA	2	6	555686	555691	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	526231114
10358	NC_021872	GAA	2	6	555947	555952	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	526231114
10359	NC_021872	AGC	2	6	555958	555963	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	526231114
10360	NC_021872	TAT	2	6	555974	555979	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	526231114
10361	NC_021872	AGC	2	6	555984	555989	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	526231114
10362	NC_021872	ATC	2	6	556005	556010	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	526231114
10363	NC_021872	T	6	6	556198	556203	0 %	100 %	0 %	0 %	526231114
10364	NC_021872	ATTA	2	8	556207	556214	50 %	50 %	0 %	0 %	526231114
10365	NC_021872	TG	3	6	556260	556265	0 %	50 %	50 %	0 %	526231114
10366	NC_021872	GA	3	6	556266	556271	50 %	0 %	50 %	0 %	526231114
10367	NC_021872	GGGAT	2	10	556307	556316	20 %	20 %	60 %	0 %	526231114
10368	NC_021872	ATG	2	6	556364	556369	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	526231114
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10370	NC_021872	AGTT	2	8	556449	556456	25 %	50 %	25 %	0 %	526231114
10371	NC_021872	TTGG	2	8	556462	556469	0 %	50 %	50 %	0 %	526231114
10372	NC_021872	CAAAG	2	10	556601	556610	60 %	0 %	20 %	20 %	526231115
10373	NC_021872	GTT	2	6	556617	556622	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	526231115
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10375	NC_021872	GTT	2	6	556636	556641	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	526231115
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10379	NC_021872	ACC	2	6	556763	556768	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	526231115
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10381	NC_021872	AATG	2	8	556797	556804	50 %	25 %	25 %	0 %	526231115
10382	NC_021872	GCC	2	6	556930	556935	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	526231115
10383	NC_021872	TTG	2	6	556985	556990	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	526231115
10384	NC_021872	TGC	2	6	556997	557002	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	526231115
10385	NC_021872	GTA	2	6	557044	557049	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	526231115
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10389	NC_021872	AGTA	2	8	557238	557245	50 %	25 %	25 %	0 %	526231115
10390	NC_021872	TTG	2	6	557341	557346	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	526231115
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10392	NC_021872	TAA	2	6	557486	557491	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	526231115
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10400	NC_021872	GCTT	2	8	557779	557786	0 %	50 %	25 %	25 %	526231116
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10422	NC_021872	TACT	2	8	558804	558811	25 %	50 %	0 %	25 %	526231117
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10448	NC_021872	AATGGT	2	12	560582	560593	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	526231118
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10465	NC_021872	CTG	2	6	561460	561465	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	526231120
10466	NC_021872	GTAA	2	8	561471	561478	50 %	25 %	25 %	0 %	526231120
10467	NC_021872	TTG	2	6	561514	561519	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	526231120
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10469	NC_021872	AGCA	2	8	561574	561581	50 %	0 %	25 %	25 %	526231120
10470	NC_021872	AAG	2	6	561733	561738	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	526231121
10471	NC_021872	ATTG	2	8	561816	561823	25 %	50 %	25 %	0 %	526231121
10472	NC_021872	CGC	2	6	561861	561866	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	526231121
10473	NC_021872	TGA	2	6	561891	561896	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	526231121
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10475	NC_021872	CGG	2	6	562018	562023	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	526231121
10476	NC_021872	ATGC	2	8	562045	562052	25 %	25 %	25 %	25 %	526231121
10477	NC_021872	ACA	2	6	562083	562088	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	526231121
10478	NC_021872	ATA	2	6	562196	562201	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	526231121
10479	NC_021872	TCG	2	6	562242	562247	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	526231121
10480	NC_021872	TCA	2	6	562326	562331	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	526231122
10481	NC_021872	A	6	6	562331	562336	100 %	0 %	0 %	0 %	526231122
10482	NC_021872	GAA	2	6	562370	562375	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	526231122
10483	NC_021872	ATG	2	6	562500	562505	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	526231122
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10485	NC_021872	GTT	2	6	562613	562618	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	526231122
10486	NC_021872	GTC	2	6	562629	562634	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	526231122
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10490	NC_021872	ATG	2	6	563073	563078	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	526231122
10491	NC_021872	TTC	2	6	563121	563126	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	526231122
10492	NC_021872	GTC	2	6	563127	563132	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	526231122
10493	NC_021872	ACTC	2	8	563171	563178	25 %	25 %	0 %	50 %	526231122
10494	NC_021872	TGC	2	6	563194	563199	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	526231122
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