MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Lactobacillus reuteri TD1

Total Repeats: 40052

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
6001	NC_021872	GATT	2	8	324412	324419	25 %	50 %	25 %	0 %	526230928
6002	NC_021872	TGC	2	6	324560	324565	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	526230928
6003	NC_021872	ATC	2	6	324616	324621	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	526230928
6004	NC_021872	GATT	2	8	324671	324678	25 %	50 %	25 %	0 %	526230928
6005	NC_021872	AAGC	2	8	324720	324727	50 %	0 %	25 %	25 %	526230928
6006	NC_021872	GCT	2	6	324734	324739	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	526230928
6007	NC_021872	TGAATT	2	12	324749	324760	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	526230928
6008	NC_021872	CTG	2	6	324787	324792	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	526230928
6009	NC_021872	TGA	2	6	324800	324805	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	526230928
6010	NC_021872	CAG	2	6	324819	324824	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	526230928
6011	NC_021872	TTG	2	6	324844	324849	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	526230928
6012	NC_021872	TGA	2	6	324857	324862	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	526230928
6013	NC_021872	TCA	2	6	325026	325031	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	526230928
6014	NC_021872	TA	3	6	325086	325091	50 %	50 %	0 %	0 %	526230928
6015	NC_021872	GTAT	2	8	325209	325216	25 %	50 %	25 %	0 %	526230928
6016	NC_021872	ATG	2	6	325224	325229	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	526230928
6017	NC_021872	AGT	2	6	325265	325270	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	526230928
6018	NC_021872	CTAA	2	8	325350	325357	50 %	25 %	0 %	25 %	526230928
6019	NC_021872	AAT	2	6	325396	325401	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	526230928
6020	NC_021872	TGC	2	6	325559	325564	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	526230929
6021	NC_021872	A	7	7	325582	325588	100 %	0 %	0 %	0 %	526230929
6022	NC_021872	TTG	2	6	325653	325658	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	526230929
6023	NC_021872	TACG	2	8	325666	325673	25 %	25 %	25 %	25 %	526230929
6024	NC_021872	TGC	2	6	325769	325774	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	526230929
6025	NC_021872	ATG	2	6	325777	325782	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	526230929
6026	NC_021872	AAAT	2	8	325784	325791	75 %	25 %	0 %	0 %	526230929
6027	NC_021872	ACA	2	6	326002	326007	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	526230930
6028	NC_021872	GAA	2	6	326025	326030	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	526230930
6029	NC_021872	TAA	2	6	326082	326087	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	526230930
6030	NC_021872	CGG	2	6	326103	326108	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	526230930
6031	NC_021872	CGC	2	6	326115	326120	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	526230930
6032	NC_021872	CGA	2	6	326222	326227	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	526230930
6033	NC_021872	CAT	2	6	326273	326278	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	526230930
6034	NC_021872	TTGG	2	8	326300	326307	0 %	50 %	50 %	0 %	526230930
6035	NC_021872	TG	3	6	326376	326381	0 %	50 %	50 %	0 %	526230930
6036	NC_021872	GGC	2	6	326392	326397	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	526230930
6037	NC_021872	TAG	2	6	326408	326413	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	526230930
6038	NC_021872	ATT	2	6	326419	326424	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	526230930
6039	NC_021872	AAT	2	6	326496	326501	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	526230930
6040	NC_021872	TCTTGT	2	12	326502	326513	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	526230930
6041	NC_021872	CGGCG	2	10	326607	326616	0 %	0 %	60 %	40 %	526230930
6042	NC_021872	AGC	2	6	326628	326633	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	526230930
6043	NC_021872	T	6	6	326713	326718	0 %	100 %	0 %	0 %	526230930
6044	NC_021872	CAA	2	6	326765	326770	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	526230930
6045	NC_021872	TA	3	6	326795	326800	50 %	50 %	0 %	0 %	526230930
6046	NC_021872	TTA	2	6	326867	326872	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	526230930
6047	NC_021872	TTA	2	6	326905	326910	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	526230930
6048	NC_021872	GTA	2	6	326974	326979	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	526230930
6049	NC_021872	TTGC	2	8	326980	326987	0 %	50 %	25 %	25 %	526230930
6050	NC_021872	CGA	2	6	327077	327082	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	526230930
6051	NC_021872	ATT	2	6	327088	327093	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	526230930
6052	NC_021872	ATG	2	6	327128	327133	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	526230930
6053	NC_021872	TGA	2	6	327135	327140	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	526230930
6054	NC_021872	TGG	2	6	327153	327158	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	526230930
6055	NC_021872	ATT	2	6	327196	327201	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	526230930
6056	NC_021872	CTT	3	9	327222	327230	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	526230930
6057	NC_021872	TCA	2	6	327237	327242	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	526230930
6058	NC_021872	TAT	2	6	327307	327312	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	526230930
6059	NC_021872	A	6	6	327359	327364	100 %	0 %	0 %	0 %	526230930
6060	NC_021872	GAA	2	6	327384	327389	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	526230931
6061	NC_021872	GAA	2	6	327459	327464	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	526230931
6062	NC_021872	ACC	2	6	327494	327499	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	526230931
6063	NC_021872	TTG	2	6	327502	327507	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	526230931
6064	NC_021872	CTG	2	6	327538	327543	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	526230931
6065	NC_021872	GAATG	2	10	327552	327561	40 %	20 %	40 %	0 %	526230931
6066	NC_021872	GAAG	2	8	327620	327627	50 %	0 %	50 %	0 %	526230931
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6068	NC_021872	TGC	2	6	327725	327730	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	526230931
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6072	NC_021872	AAG	2	6	327799	327804	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	526230931
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6085	NC_021872	TGA	3	9	329078	329086	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	526230932
6086	NC_021872	GTA	2	6	329112	329117	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	526230932
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6091	NC_021872	TAATG	2	10	329426	329435	40 %	40 %	20 %	0 %	526230932
6092	NC_021872	TGG	2	6	329450	329455	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	526230932
6093	NC_021872	TTG	2	6	329458	329463	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	526230932
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6102	NC_021872	TTAAT	2	10	330025	330034	40 %	60 %	0 %	0 %	526230933
6103	NC_021872	T	6	6	330075	330080	0 %	100 %	0 %	0 %	526230933
6104	NC_021872	TCTTT	2	10	330107	330116	0 %	80 %	0 %	20 %	526230933
6105	NC_021872	CAG	2	6	330125	330130	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	526230933
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6107	NC_021872	CAG	2	6	330296	330301	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	526230933
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6109	NC_021872	AT	3	6	330370	330375	50 %	50 %	0 %	0 %	526230933
6110	NC_021872	AGA	2	6	330395	330400	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	526230933
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6112	NC_021872	GCG	2	6	330412	330417	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	526230933
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6116	NC_021872	T	7	7	330846	330852	0 %	100 %	0 %	0 %	526230934
6117	NC_021872	TTG	2	6	330884	330889	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	526230934
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6119	NC_021872	ATA	2	6	330929	330934	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	526230934
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6121	NC_021872	CACC	2	8	330987	330994	25 %	0 %	0 %	75 %	526230934
6122	NC_021872	AGCAGT	2	12	331005	331016	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	526230934
6123	NC_021872	TAAT	2	8	331025	331032	50 %	50 %	0 %	0 %	526230934
6124	NC_021872	CGA	2	6	331058	331063	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	526230934
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6126	NC_021872	TAG	2	6	331100	331105	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	526230934
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6229	NC_021872	CTC	2	6	336136	336141	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	526230938
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6234	NC_021872	AAT	3	9	336213	336221	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	526230938
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6236	NC_021872	GGC	2	6	336375	336380	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	526230938
6237	NC_021872	GTG	2	6	336382	336387	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	526230938
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6239	NC_021872	T	6	6	336451	336456	0 %	100 %	0 %	0 %	526230939
6240	NC_021872	GTA	2	6	336472	336477	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	526230939
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6242	NC_021872	GCA	2	6	336525	336530	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	526230939
6243	NC_021872	ATT	2	6	336556	336561	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	526230939
6244	NC_021872	GAA	2	6	336604	336609	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	526230939
6245	NC_021872	GCT	2	6	336703	336708	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	526230939
6246	NC_021872	T	7	7	336726	336732	0 %	100 %	0 %	0 %	526230939
6247	NC_021872	TGA	2	6	336740	336745	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	526230939
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6249	NC_021872	TGA	2	6	336809	336814	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	526230939
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6270	NC_021872	TGG	2	6	337999	338004	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	526230940
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6272	NC_021872	ATT	2	6	338167	338172	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	526230940
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6282	NC_021872	TA	3	6	338786	338791	50 %	50 %	0 %	0 %	526230941
6283	NC_021872	CAA	2	6	338841	338846	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	526230941
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6351	NC_021872	TAA	2	6	342170	342175	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	526230943
6352	NC_021872	AAG	2	6	342213	342218	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	526230943
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6360	NC_021872	CGGG	2	8	342485	342492	0 %	0 %	75 %	25 %	526230943
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6363	NC_021872	TGA	2	6	342734	342739	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	526230943
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6468	NC_021872	TGA	2	6	354610	354615	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	526232205
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6471	NC_021872	TAG	2	6	354725	354730	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	526232205
6472	NC_021872	AT	3	6	354874	354879	50 %	50 %	0 %	0 %	526232205
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6478	NC_021872	GAG	2	6	355553	355558	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	526230947
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6483	NC_021872	AAC	2	6	355854	355859	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	526230947
6484	NC_021872	ATC	2	6	355906	355911	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	526230947
6485	NC_021872	GCA	2	6	355925	355930	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	526230947
6486	NC_021872	A	6	6	355934	355939	100 %	0 %	0 %	0 %	526230947
6487	NC_021872	ACC	2	6	355950	355955	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	526230947
6488	NC_021872	TGA	2	6	356032	356037	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	526230947
6489	NC_021872	TAAT	2	8	356113	356120	50 %	50 %	0 %	0 %	526230947
6490	NC_021872	CCT	2	6	356357	356362	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	526230948
6491	NC_021872	TTC	2	6	356395	356400	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	526230948
6492	NC_021872	TAC	2	6	356425	356430	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	526230948
6493	NC_021872	TTCTA	2	10	356447	356456	20 %	60 %	0 %	20 %	526230948
6494	NC_021872	TAC	2	6	356461	356466	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	526230948
6495	NC_021872	GGT	2	6	356479	356484	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	526230948
6496	NC_021872	GCA	2	6	356506	356511	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	526230948
6497	NC_021872	GGT	2	6	356611	356616	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	526230948
6498	NC_021872	TTA	2	6	356621	356626	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	526230948
6499	NC_021872	GT	3	6	356660	356665	0 %	50 %	50 %	0 %	526230948
6500	NC_021872	TCG	3	9	356763	356771	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	526230948

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