MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Listeria monocytogenes strain J1926

Total Repeats: 58897

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
13001	NC_021840	A	6	6	660545	660550	100 %	0 %	0 %	0 %	525934743
13002	NC_021840	TAA	2	6	660561	660566	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	525934743
13003	NC_021840	AAT	2	6	660589	660594	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	525934743
13004	NC_021840	TTA	2	6	660611	660616	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	525934743
13005	NC_021840	TA	3	6	660615	660620	50 %	50 %	0 %	0 %	525934743
13006	NC_021840	ATG	2	6	660638	660643	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525934743
13007	NC_021840	GAC	2	6	660650	660655	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525934743
13008	NC_021840	TA	4	8	660660	660667	50 %	50 %	0 %	0 %	525934743
13009	NC_021840	AGCAA	2	10	660682	660691	60 %	0 %	20 %	20 %	525934743
13010	NC_021840	ATT	2	6	660771	660776	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	525934743
13011	NC_021840	AGA	2	6	660844	660849	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	525934743
13012	NC_021840	T	6	6	661084	661089	0 %	100 %	0 %	0 %	525934744
13013	NC_021840	GTA	2	6	661098	661103	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525934744
13014	NC_021840	T	6	6	661117	661122	0 %	100 %	0 %	0 %	525934744
13015	NC_021840	GAA	2	6	661229	661234	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	525934744
13016	NC_021840	A	6	6	661246	661251	100 %	0 %	0 %	0 %	525934744
13017	NC_021840	AAG	2	6	661287	661292	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	525934744
13018	NC_021840	AC	3	6	661309	661314	50 %	0 %	0 %	50 %	525934744
13019	NC_021840	CAGAA	2	10	661328	661337	60 %	0 %	20 %	20 %	525934744
13020	NC_021840	CAA	2	6	661396	661401	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	525934744
13021	NC_021840	CAT	2	6	661480	661485	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525934744
13022	NC_021840	CAAA	2	8	661522	661529	75 %	0 %	0 %	25 %	525934744
13023	NC_021840	TAG	2	6	661537	661542	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525934744
13024	NC_021840	GTG	2	6	661745	661750	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	525934745
13025	NC_021840	TGG	2	6	661761	661766	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	525934745
13026	NC_021840	ACCAG	2	10	661779	661788	40 %	0 %	20 %	40 %	525934745
13027	NC_021840	CAA	2	6	661802	661807	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	525934745
13028	NC_021840	TCT	2	6	661844	661849	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	525934745
13029	NC_021840	AAG	2	6	661887	661892	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	525934745
13030	NC_021840	AGT	2	6	661926	661931	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525934745
13031	NC_021840	TCT	2	6	661957	661962	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	525934745
13032	NC_021840	CTA	2	6	661973	661978	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525934745
13033	NC_021840	TTA	2	6	662002	662007	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	525934745
13034	NC_021840	ACA	2	6	662089	662094	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	525934745
13035	NC_021840	GAA	2	6	662166	662171	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	525934745
13036	NC_021840	GAT	2	6	662184	662189	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525934745
13037	NC_021840	ATTG	2	8	662304	662311	25 %	50 %	25 %	0 %	525934745
13038	NC_021840	CGT	2	6	662315	662320	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525934745
13039	NC_021840	TTC	2	6	662346	662351	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	525934745
13040	NC_021840	GTT	2	6	662359	662364	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	525934745
13041	NC_021840	AT	3	6	662386	662391	50 %	50 %	0 %	0 %	525934745
13042	NC_021840	TTTTC	2	10	662582	662591	0 %	80 %	0 %	20 %	525934745
13043	NC_021840	GTC	2	6	662636	662641	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525934746
13044	NC_021840	GTC	3	9	662645	662653	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525934746
13045	NC_021840	ATC	3	9	662657	662665	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525934746
13046	NC_021840	CCG	3	9	662676	662684	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	525934746
13047	NC_021840	TTG	2	6	662696	662701	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	525934746
13048	NC_021840	CTT	2	6	662707	662712	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	525934746
13049	NC_021840	TGC	2	6	662750	662755	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525934746
13050	NC_021840	CTA	2	6	662779	662784	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525934746
13051	NC_021840	TGC	2	6	662801	662806	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525934746
13052	NC_021840	ACA	2	6	662808	662813	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	525934746
13053	NC_021840	AAG	3	9	662820	662828	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	525934746
13054	NC_021840	CAT	2	6	662852	662857	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525934746
13055	NC_021840	TAA	2	6	662860	662865	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	525934746
13056	NC_021840	CAA	3	9	662878	662886	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	525934746
13057	NC_021840	CCA	2	6	662895	662900	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	525934746
13058	NC_021840	AGT	3	9	663018	663026	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525934746
13059	NC_021840	CCTT	2	8	663063	663070	0 %	50 %	0 %	50 %	525934746
13060	NC_021840	AGC	2	6	663143	663148	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525934746
13061	NC_021840	TAA	2	6	663196	663201	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	525934746
13062	NC_021840	TAG	2	6	663208	663213	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525934746
13063	NC_021840	AAT	2	6	663215	663220	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	525934746
13064	NC_021840	GCA	2	6	663231	663236	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525934746
13065	NC_021840	CATC	2	8	663263	663270	25 %	25 %	0 %	50 %	525934746
13066	NC_021840	AAT	3	9	663299	663307	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	525934746
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13069	NC_021840	ATT	2	6	663622	663627	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	525934747
13070	NC_021840	TGC	2	6	663722	663727	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525934747
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13072	NC_021840	AAT	2	6	663861	663866	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	525934747
13073	NC_021840	GTT	2	6	663896	663901	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	525934747
13074	NC_021840	ACG	2	6	663930	663935	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525934747
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13079	NC_021840	TCC	2	6	664118	664123	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	525934748
13080	NC_021840	CTG	2	6	664182	664187	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525934748
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13085	NC_021840	TAA	2	6	664404	664409	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	525934748
13086	NC_021840	TAA	2	6	664440	664445	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	525934748
13087	NC_021840	CAA	2	6	664489	664494	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	525934748
13088	NC_021840	TG	3	6	664514	664519	0 %	50 %	50 %	0 %	525934748
13089	NC_021840	CTT	2	6	664922	664927	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	525934749
13090	NC_021840	TTTG	2	8	664930	664937	0 %	75 %	25 %	0 %	525934749
13091	NC_021840	CAT	2	6	664997	665002	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525934749
13092	NC_021840	GATT	2	8	665045	665052	25 %	50 %	25 %	0 %	525934749
13093	NC_021840	TAT	2	6	665060	665065	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	525934749
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13096	NC_021840	TTC	2	6	665166	665171	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	525934749
13097	NC_021840	TGCGA	2	10	665184	665193	20 %	20 %	40 %	20 %	525934749
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13099	NC_021840	ATA	2	6	665215	665220	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	525934749
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13102	NC_021840	TCT	2	6	665344	665349	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	525934749
13103	NC_021840	ATG	2	6	665491	665496	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525934749
13104	NC_021840	TCA	2	6	665530	665535	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525934749
13105	NC_021840	CCA	2	6	665545	665550	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	525934749
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13107	NC_021840	TTTC	2	8	665756	665763	0 %	75 %	0 %	25 %	525934749
13108	NC_021840	GC	3	6	665764	665769	0 %	0 %	50 %	50 %	525934749
13109	NC_021840	TTCC	2	8	665822	665829	0 %	50 %	0 %	50 %	525934749
13110	NC_021840	AGT	2	6	665845	665850	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525934749
13111	NC_021840	T	6	6	665850	665855	0 %	100 %	0 %	0 %	525934749
13112	NC_021840	TAT	2	6	665882	665887	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	525934749
13113	NC_021840	CGA	2	6	665900	665905	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525934749
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13115	NC_021840	ATC	2	6	666012	666017	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525934749
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13117	NC_021840	GCAA	2	8	666142	666149	50 %	0 %	25 %	25 %	525934749
13118	NC_021840	ATC	3	9	666333	666341	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525934749
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13120	NC_021840	TCG	2	6	666455	666460	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525934749
13121	NC_021840	GAA	2	6	666519	666524	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	525934749
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13144	NC_021840	TTCA	2	8	667491	667498	25 %	50 %	0 %	25 %	525934749
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13230	NC_021840	A	6	6	672289	672294	100 %	0 %	0 %	0 %	525934752
13231	NC_021840	ATC	2	6	672402	672407	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525934752
13232	NC_021840	ATC	2	6	672411	672416	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525934752
13233	NC_021840	GTTT	2	8	672463	672470	0 %	75 %	25 %	0 %	525934752
13234	NC_021840	AC	3	6	672484	672489	50 %	0 %	0 %	50 %	525934752
13235	NC_021840	A	6	6	672514	672519	100 %	0 %	0 %	0 %	525934752
13236	NC_021840	TGT	2	6	672597	672602	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	525934752
13237	NC_021840	ACTT	2	8	672828	672835	25 %	50 %	0 %	25 %	525934752
13238	NC_021840	AAAAT	2	10	672845	672854	80 %	20 %	0 %	0 %	525934752
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13483	NC_021840	CAA	2	6	685441	685446	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	525934763
13484	NC_021840	TA	3	6	685544	685549	50 %	50 %	0 %	0 %	525934763
13485	NC_021840	CCA	2	6	685563	685568	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	525934763
13486	NC_021840	CTG	2	6	685573	685578	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525934763
13487	NC_021840	TCCCG	2	10	685610	685619	0 %	20 %	20 %	60 %	525934763
13488	NC_021840	ACC	2	6	685625	685630	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	525934763
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13491	NC_021840	CTT	2	6	686072	686077	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	525934764
13492	NC_021840	TGTA	2	8	686087	686094	25 %	50 %	25 %	0 %	525934764
13493	NC_021840	TTC	2	6	686112	686117	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	525934764
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13496	NC_021840	TCAC	2	8	686293	686300	25 %	25 %	0 %	50 %	525934764
13497	NC_021840	AC	3	6	686354	686359	50 %	0 %	0 %	50 %	525934764
13498	NC_021840	GTC	2	6	686449	686454	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525934764
13499	NC_021840	CAA	2	6	686471	686476	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	525934764
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