MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Listeria monocytogenes strain J1776

Total Repeats: 58948

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
45001	NC_021839	CAG	2	6	2242188	2242193	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525931569
45002	NC_021839	CAT	2	6	2242242	2242247	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525931569
45003	NC_021839	TCA	2	6	2242248	2242253	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525931569
45004	NC_021839	ACG	2	6	2242297	2242302	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525931569
45005	NC_021839	GC	3	6	2242357	2242362	0 %	0 %	50 %	50 %	525931569
45006	NC_021839	CTT	2	6	2242380	2242385	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	525931569
45007	NC_021839	TAT	2	6	2242455	2242460	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	525931569
45008	NC_021839	CAGT	2	8	2242602	2242609	25 %	25 %	25 %	25 %	525931569
45009	NC_021839	TTCA	2	8	2242615	2242622	25 %	50 %	0 %	25 %	525931569
45010	NC_021839	TTC	2	6	2242649	2242654	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	525931569
45011	NC_021839	ATA	2	6	2242685	2242690	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	525931569
45012	NC_021839	TTG	2	6	2242723	2242728	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	525931569
45013	NC_021839	CTT	2	6	2242776	2242781	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	525931569
45014	NC_021839	TAT	2	6	2242782	2242787	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	525931569
45015	NC_021839	CTT	2	6	2242839	2242844	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	525931569
45016	NC_021839	ATC	2	6	2243005	2243010	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525931569
45017	NC_021839	TTG	2	6	2243056	2243061	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	525931570
45018	NC_021839	CTT	3	9	2243070	2243078	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	525931570
45019	NC_021839	CTT	2	6	2243157	2243162	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	525931570
45020	NC_021839	TAC	2	6	2243164	2243169	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525931570
45021	NC_021839	CAT	2	6	2243179	2243184	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525931570
45022	NC_021839	CGC	2	6	2243259	2243264	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	525931570
45023	NC_021839	CATTT	2	10	2243266	2243275	20 %	60 %	0 %	20 %	525931570
45024	NC_021839	TAA	2	6	2243359	2243364	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	525931570
45025	NC_021839	T	6	6	2243383	2243388	0 %	100 %	0 %	0 %	525931570
45026	NC_021839	TTC	2	6	2243431	2243436	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	525931570
45027	NC_021839	TCG	2	6	2243498	2243503	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525931570
45028	NC_021839	CTT	2	6	2243505	2243510	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	525931570
45029	NC_021839	CGG	2	6	2243513	2243518	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	525931570
45030	NC_021839	ATTG	2	8	2243521	2243528	25 %	50 %	25 %	0 %	525931570
45031	NC_021839	GAAT	2	8	2243535	2243542	50 %	25 %	25 %	0 %	525931570
45032	NC_021839	ATA	2	6	2243690	2243695	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	525931570
45033	NC_021839	GAA	2	6	2244180	2244185	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	525931571
45034	NC_021839	AAT	2	6	2244189	2244194	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	525931571
45035	NC_021839	GCC	2	6	2244265	2244270	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	525931571
45036	NC_021839	A	6	6	2244275	2244280	100 %	0 %	0 %	0 %	525931571
45037	NC_021839	ACA	2	6	2244301	2244306	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	525931571
45038	NC_021839	A	7	7	2244348	2244354	100 %	0 %	0 %	0 %	525931571
45039	NC_021839	A	6	6	2244385	2244390	100 %	0 %	0 %	0 %	525931571
45040	NC_021839	TCT	2	6	2244448	2244453	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	525931571
45041	NC_021839	GGAAA	2	10	2244461	2244470	60 %	0 %	40 %	0 %	525931571
45042	NC_021839	A	7	7	2244468	2244474	100 %	0 %	0 %	0 %	525931571
45043	NC_021839	ACG	2	6	2244548	2244553	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525931571
45044	NC_021839	TTA	2	6	2244574	2244579	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	525931571
45045	NC_021839	CAG	2	6	2244587	2244592	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525931571
45046	NC_021839	A	7	7	2244727	2244733	100 %	0 %	0 %	0 %	525931571
45047	NC_021839	GAA	2	6	2244736	2244741	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	525931571
45048	NC_021839	ACTTC	2	10	2244791	2244800	20 %	40 %	0 %	40 %	525931571
45049	NC_021839	TGA	2	6	2244879	2244884	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525931571
45050	NC_021839	AGC	2	6	2244936	2244941	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525931571
45051	NC_021839	A	6	6	2244946	2244951	100 %	0 %	0 %	0 %	525931571
45052	NC_021839	A	6	6	2244965	2244970	100 %	0 %	0 %	0 %	525931571
45053	NC_021839	ATC	2	6	2244978	2244983	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525931571
45054	NC_021839	ATTAAC	2	12	2245029	2245040	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	525931571
45055	NC_021839	A	6	6	2245051	2245056	100 %	0 %	0 %	0 %	525931571
45056	NC_021839	ACT	2	6	2245078	2245083	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525931571
45057	NC_021839	CAAAA	2	10	2245098	2245107	80 %	0 %	0 %	20 %	525931571
45058	NC_021839	CAA	2	6	2245124	2245129	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	525931571
45059	NC_021839	TCC	2	6	2245158	2245163	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	525931571
45060	NC_021839	A	6	6	2245192	2245197	100 %	0 %	0 %	0 %	525931571
45061	NC_021839	A	7	7	2245253	2245259	100 %	0 %	0 %	0 %	525931571
45062	NC_021839	TATTT	2	10	2245292	2245301	20 %	80 %	0 %	0 %	525931572
45063	NC_021839	AAC	2	6	2245311	2245316	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	525931572
45064	NC_021839	GTAAT	2	10	2245336	2245345	40 %	40 %	20 %	0 %	525931572
45065	NC_021839	TGAA	2	8	2245359	2245366	50 %	25 %	25 %	0 %	525931572
45066	NC_021839	ATC	2	6	2245395	2245400	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525931572
45067	NC_021839	T	6	6	2245401	2245406	0 %	100 %	0 %	0 %	525931572
45068	NC_021839	TGT	2	6	2245413	2245418	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	525931572
45069	NC_021839	ACA	2	6	2245495	2245500	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	525931572
45070	NC_021839	CTT	2	6	2245529	2245534	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	525931572
45071	NC_021839	TCA	2	6	2245550	2245555	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525931572
45072	NC_021839	ATC	2	6	2245611	2245616	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525931572
45073	NC_021839	GC	3	6	2245727	2245732	0 %	0 %	50 %	50 %	525931572
45074	NC_021839	T	6	6	2245761	2245766	0 %	100 %	0 %	0 %	525931572
45075	NC_021839	CTTTTT	2	12	2245823	2245834	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	525931572
45076	NC_021839	AGT	2	6	2245865	2245870	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525931572
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45078	NC_021839	TTA	2	6	2245900	2245905	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	525931572
45079	NC_021839	GAG	2	6	2246056	2246061	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	525931572
45080	NC_021839	ACTAAA	2	12	2246080	2246091	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	525931572
45081	NC_021839	AAG	2	6	2246216	2246221	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	525931573
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45083	NC_021839	AAT	2	6	2246404	2246409	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	525931573
45084	NC_021839	AAT	2	6	2246443	2246448	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	525931573
45085	NC_021839	GCT	2	6	2246477	2246482	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525931573
45086	NC_021839	AGC	2	6	2246542	2246547	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525931573
45087	NC_021839	GTAATA	2	12	2246616	2246627	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	525931573
45088	NC_021839	ATA	2	6	2246636	2246641	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	525931573
45089	NC_021839	GC	3	6	2246695	2246700	0 %	0 %	50 %	50 %	525931573
45090	NC_021839	T	6	6	2246710	2246715	0 %	100 %	0 %	0 %	525931573
45091	NC_021839	GTTA	2	8	2246719	2246726	25 %	50 %	25 %	0 %	525931573
45092	NC_021839	TAA	2	6	2246734	2246739	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	525931573
45093	NC_021839	A	7	7	2246759	2246765	100 %	0 %	0 %	0 %	525931573
45094	NC_021839	AAT	2	6	2246771	2246776	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	525931573
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45097	NC_021839	TCT	2	6	2246929	2246934	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	525931574
45098	NC_021839	TGCGTT	2	12	2246977	2246988	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	525931574
45099	NC_021839	CAT	2	6	2247017	2247022	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525931574
45100	NC_021839	TTC	2	6	2247129	2247134	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	525931574
45101	NC_021839	CAA	2	6	2247224	2247229	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	525931574
45102	NC_021839	GAT	2	6	2247300	2247305	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525931574
45103	NC_021839	AGG	2	6	2247334	2247339	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	525931574
45104	NC_021839	TCA	2	6	2247388	2247393	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525931574
45105	NC_021839	GTT	2	6	2247411	2247416	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	525931574
45106	NC_021839	GCT	2	6	2247443	2247448	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525931574
45107	NC_021839	CCG	2	6	2247454	2247459	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	525931574
45108	NC_021839	TTTTC	2	10	2247481	2247490	0 %	80 %	0 %	20 %	525931574
45109	NC_021839	CAA	2	6	2247500	2247505	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	525931574
45110	NC_021839	T	6	6	2247536	2247541	0 %	100 %	0 %	0 %	525931574
45111	NC_021839	ATA	2	6	2247602	2247607	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	525931574
45112	NC_021839	ACT	2	6	2247775	2247780	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525931574
45113	NC_021839	ATC	2	6	2247880	2247885	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525931574
45114	NC_021839	ATTT	2	8	2248199	2248206	25 %	75 %	0 %	0 %	525931575
45115	NC_021839	TAA	2	6	2248221	2248226	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	525931575
45116	NC_021839	TAT	2	6	2248230	2248235	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	525931575
45117	NC_021839	CTGT	2	8	2248236	2248243	0 %	50 %	25 %	25 %	525931575
45118	NC_021839	TAT	2	6	2248308	2248313	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	525931575
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45232	NC_021839	TTTC	2	8	2253996	2254003	0 %	75 %	0 %	25 %	525931583
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45465	NC_021839	TCTT	2	8	2265542	2265549	0 %	75 %	0 %	25 %	525931597
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