MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Listeria monocytogenes strain J1776

Total Repeats: 58948

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
43001	NC_021839	ATT	2	6	2139917	2139922	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	525932430
43002	NC_021839	TCA	2	6	2139932	2139937	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525932430
43003	NC_021839	ATT	2	6	2139941	2139946	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	525932430
43004	NC_021839	TAA	2	6	2139976	2139981	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	525932430
43005	NC_021839	ATAG	2	8	2139984	2139991	50 %	25 %	25 %	0 %	525932430
43006	NC_021839	T	6	6	2140030	2140035	0 %	100 %	0 %	0 %	525932430
43007	NC_021839	ACT	2	6	2140180	2140185	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525932430
43008	NC_021839	TGAAT	2	10	2140206	2140215	40 %	40 %	20 %	0 %	525932430
43009	NC_021839	AGT	2	6	2140266	2140271	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525932430
43010	NC_021839	TTC	2	6	2140294	2140299	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	525932430
43011	NC_021839	TTA	2	6	2140313	2140318	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	525932430
43012	NC_021839	T	6	6	2140321	2140326	0 %	100 %	0 %	0 %	525932430
43013	NC_021839	TTCG	2	8	2140335	2140342	0 %	50 %	25 %	25 %	525932430
43014	NC_021839	TTTTTG	2	12	2140353	2140364	0 %	83.33 %	16.67 %	0 %	525932430
43015	NC_021839	TC	3	6	2140368	2140373	0 %	50 %	0 %	50 %	525932430
43016	NC_021839	AAAT	2	8	2140411	2140418	75 %	25 %	0 %	0 %	525932430
43017	NC_021839	TAT	2	6	2140485	2140490	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	525932430
43018	NC_021839	TTA	2	6	2140491	2140496	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	525932430
43019	NC_021839	TG	3	6	2140555	2140560	0 %	50 %	50 %	0 %	525932430
43020	NC_021839	TC	3	6	2140588	2140593	0 %	50 %	0 %	50 %	525932430
43021	NC_021839	AGT	2	6	2140606	2140611	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525932430
43022	NC_021839	TAA	2	6	2140629	2140634	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	525932430
43023	NC_021839	T	6	6	2140663	2140668	0 %	100 %	0 %	0 %	525932430
43024	NC_021839	CCTT	2	8	2140670	2140677	0 %	50 %	0 %	50 %	525932430
43025	NC_021839	ATA	2	6	2140711	2140716	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	525932430
43026	NC_021839	TTA	2	6	2140727	2140732	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	525932430
43027	NC_021839	CTCC	2	8	2140868	2140875	0 %	25 %	0 %	75 %	525932430
43028	NC_021839	CAA	2	6	2140884	2140889	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	525932430
43029	NC_021839	CTT	2	6	2140929	2140934	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	525932430
43030	NC_021839	AT	3	6	2141007	2141012	50 %	50 %	0 %	0 %	525932430
43031	NC_021839	CAA	3	9	2141022	2141030	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	525932430
43032	NC_021839	TAA	2	6	2141214	2141219	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	525932430
43033	NC_021839	TA	3	6	2141263	2141268	50 %	50 %	0 %	0 %	525931487
43034	NC_021839	AGT	2	6	2141288	2141293	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525931487
43035	NC_021839	ATT	2	6	2141325	2141330	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	525931487
43036	NC_021839	TCG	2	6	2141356	2141361	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525931487
43037	NC_021839	TACA	2	8	2141364	2141371	50 %	25 %	0 %	25 %	525931487
43038	NC_021839	GTT	2	6	2141417	2141422	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	525931487
43039	NC_021839	CAA	2	6	2141423	2141428	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	525931487
43040	NC_021839	CAT	2	6	2141504	2141509	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525931487
43041	NC_021839	TTG	2	6	2141515	2141520	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	525931487
43042	NC_021839	TTC	2	6	2141556	2141561	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	525931487
43043	NC_021839	CAGG	2	8	2141575	2141582	25 %	0 %	50 %	25 %	525931487
43044	NC_021839	TGAA	2	8	2141635	2141642	50 %	25 %	25 %	0 %	525931487
43045	NC_021839	ATA	2	6	2141706	2141711	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	525931487
43046	NC_021839	TTG	2	6	2141796	2141801	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	525931487
43047	NC_021839	TCC	2	6	2141802	2141807	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	525931487
43048	NC_021839	A	6	6	2141814	2141819	100 %	0 %	0 %	0 %	525931487
43049	NC_021839	ATA	2	6	2141887	2141892	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	525931487
43050	NC_021839	TACCA	2	10	2141912	2141921	40 %	20 %	0 %	40 %	525931487
43051	NC_021839	TA	3	6	2141960	2141965	50 %	50 %	0 %	0 %	525931487
43052	NC_021839	TTC	2	6	2141979	2141984	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	525931487
43053	NC_021839	GCC	2	6	2142017	2142022	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	525931487
43054	NC_021839	GAT	2	6	2142071	2142076	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525931487
43055	NC_021839	ATTCA	2	10	2142090	2142099	40 %	40 %	0 %	20 %	525931487
43056	NC_021839	TTC	2	6	2142144	2142149	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	525931487
43057	NC_021839	TCG	2	6	2142304	2142309	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525931487
43058	NC_021839	AATCCA	2	12	2142346	2142357	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	525931487
43059	NC_021839	CCAT	2	8	2142361	2142368	25 %	25 %	0 %	50 %	525931487
43060	NC_021839	GCA	2	6	2142400	2142405	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525931487
43061	NC_021839	ATAGA	2	10	2142430	2142439	60 %	20 %	20 %	0 %	525931487
43062	NC_021839	AGT	2	6	2142465	2142470	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525931487
43063	NC_021839	TGT	2	6	2142541	2142546	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	525931487
43064	NC_021839	TCA	2	6	2142565	2142570	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525931487
43065	NC_021839	TCC	2	6	2142592	2142597	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	525931488
43066	NC_021839	TTA	2	6	2142617	2142622	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	525931488
43067	NC_021839	GTA	2	6	2142629	2142634	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525931488
43068	NC_021839	TAA	2	6	2142651	2142656	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	525931488
43069	NC_021839	TAT	2	6	2142675	2142680	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	525931488
43070	NC_021839	AAT	2	6	2142691	2142696	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	525931488
43071	NC_021839	TCA	2	6	2142728	2142733	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525931488
43072	NC_021839	A	6	6	2142797	2142802	100 %	0 %	0 %	0 %	525931488
43073	NC_021839	CCAC	2	8	2142903	2142910	25 %	0 %	0 %	75 %	525931488
43074	NC_021839	AAT	2	6	2142928	2142933	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	525931488
43075	NC_021839	GCG	2	6	2142935	2142940	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	525931488
43076	NC_021839	TTGTAT	2	12	2142943	2142954	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	525931488
43077	NC_021839	TTG	2	6	2142982	2142987	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	525931488
43078	NC_021839	TCA	2	6	2142990	2142995	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525931488
43079	NC_021839	TAA	2	6	2142999	2143004	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	525931488
43080	NC_021839	TATC	2	8	2143005	2143012	25 %	50 %	0 %	25 %	525931488
43081	NC_021839	ATC	2	6	2143015	2143020	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525931488
43082	NC_021839	AGC	2	6	2143075	2143080	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525931488
43083	NC_021839	TCT	2	6	2143178	2143183	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	525931488
43084	NC_021839	ATTTCC	2	12	2143185	2143196	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	525931488
43085	NC_021839	CACT	2	8	2143312	2143319	25 %	25 %	0 %	50 %	525931488
43086	NC_021839	ATTA	2	8	2143353	2143360	50 %	50 %	0 %	0 %	525932431
43087	NC_021839	ATG	2	6	2143382	2143387	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525932431
43088	NC_021839	AAT	2	6	2143401	2143406	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	525932431
43089	NC_021839	TTGTTC	2	12	2143492	2143503	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	525932431
43090	NC_021839	CTT	2	6	2143533	2143538	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	525932431
43091	NC_021839	TC	3	6	2143574	2143579	0 %	50 %	0 %	50 %	525932431
43092	NC_021839	TGT	3	9	2143886	2143894	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	525932432
43093	NC_021839	T	6	6	2143896	2143901	0 %	100 %	0 %	0 %	525932432
43094	NC_021839	TCG	2	6	2143952	2143957	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525932432
43095	NC_021839	GATAAA	2	12	2143967	2143978	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	525932432
43096	NC_021839	T	7	7	2143979	2143985	0 %	100 %	0 %	0 %	525932432
43097	NC_021839	TAA	2	6	2143993	2143998	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	525932432
43098	NC_021839	T	6	6	2144005	2144010	0 %	100 %	0 %	0 %	525932432
43099	NC_021839	T	6	6	2144133	2144138	0 %	100 %	0 %	0 %	525932432
43100	NC_021839	TC	3	6	2144157	2144162	0 %	50 %	0 %	50 %	525932432
43101	NC_021839	GTG	2	6	2144196	2144201	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	525932432
43102	NC_021839	TCCA	2	8	2144219	2144226	25 %	25 %	0 %	50 %	525932432
43103	NC_021839	ATA	2	6	2144252	2144257	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	525932432
43104	NC_021839	T	6	6	2144280	2144285	0 %	100 %	0 %	0 %	525932432
43105	NC_021839	T	6	6	2144352	2144357	0 %	100 %	0 %	0 %	525932432
43106	NC_021839	CTC	2	6	2144394	2144399	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	525932432
43107	NC_021839	ATTA	2	8	2144407	2144414	50 %	50 %	0 %	0 %	525932432
43108	NC_021839	TATT	2	8	2144513	2144520	25 %	75 %	0 %	0 %	525932433
43109	NC_021839	TTGT	2	8	2144529	2144536	0 %	75 %	25 %	0 %	525932433
43110	NC_021839	GGT	2	6	2144603	2144608	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	525932433
43111	NC_021839	TTA	2	6	2144613	2144618	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	525932433
43112	NC_021839	TCT	2	6	2144624	2144629	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	525932433
43113	NC_021839	AC	3	6	2144646	2144651	50 %	0 %	0 %	50 %	525932433
43114	NC_021839	TCT	2	6	2144654	2144659	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	525932433
43115	NC_021839	T	6	6	2144659	2144664	0 %	100 %	0 %	0 %	525932433
43116	NC_021839	AAT	2	6	2144863	2144868	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	525932434
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43118	NC_021839	TCT	2	6	2144939	2144944	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	525932434
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43233	NC_021839	ATTA	2	8	2149874	2149881	50 %	50 %	0 %	0 %	525931491
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43349	NC_021839	GCC	2	6	2156126	2156131	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	525932458
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