MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Listeria monocytogenes strain J1776

Total Repeats: 58948

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
42501	NC_021839	TCA	2	6	2116910	2116915	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525931484
42502	NC_021839	T	6	6	2116998	2117003	0 %	100 %	0 %	0 %	525931484
42503	NC_021839	ATA	2	6	2117056	2117061	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	525931484
42504	NC_021839	TCT	2	6	2117126	2117131	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	525931484
42505	NC_021839	AAG	2	6	2117170	2117175	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	525931484
42506	NC_021839	ACT	2	6	2117263	2117268	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525931484
42507	NC_021839	AT	3	6	2117330	2117335	50 %	50 %	0 %	0 %	525931484
42508	NC_021839	AGT	2	6	2117354	2117359	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525931484
42509	NC_021839	ATT	2	6	2117449	2117454	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	525931484
42510	NC_021839	CTG	2	6	2117466	2117471	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525931484
42511	NC_021839	TCCAT	2	10	2117475	2117484	20 %	40 %	0 %	40 %	525931484
42512	NC_021839	TTC	2	6	2117539	2117544	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	525931484
42513	NC_021839	T	6	6	2117649	2117654	0 %	100 %	0 %	0 %	525931484
42514	NC_021839	GTTTT	2	10	2117664	2117673	0 %	80 %	20 %	0 %	525931484
42515	NC_021839	TAT	2	6	2117742	2117747	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	525931484
42516	NC_021839	CCA	2	6	2117755	2117760	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	525931484
42517	NC_021839	CAA	2	6	2117809	2117814	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	525931484
42518	NC_021839	TTGC	2	8	2117823	2117830	0 %	50 %	25 %	25 %	525931484
42519	NC_021839	ACT	2	6	2117845	2117850	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525931484
42520	NC_021839	TAA	2	6	2117866	2117871	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	525931484
42521	NC_021839	TAAA	2	8	2117884	2117891	75 %	25 %	0 %	0 %	525931484
42522	NC_021839	T	6	6	2117905	2117910	0 %	100 %	0 %	0 %	525931484
42523	NC_021839	AAT	2	6	2117934	2117939	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	525931484
42524	NC_021839	CTT	2	6	2117961	2117966	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	525931484
42525	NC_021839	GCA	2	6	2117972	2117977	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525931484
42526	NC_021839	TTA	2	6	2118012	2118017	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	525931484
42527	NC_021839	TCT	3	9	2118035	2118043	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	525931484
42528	NC_021839	ATT	2	6	2118049	2118054	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	525931484
42529	NC_021839	ACT	2	6	2118221	2118226	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525931484
42530	NC_021839	AAGG	2	8	2118233	2118240	50 %	0 %	50 %	0 %	525931484
42531	NC_021839	AAT	2	6	2118280	2118285	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	525931484
42532	NC_021839	TTC	2	6	2118313	2118318	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	525931484
42533	NC_021839	TGCT	2	8	2118367	2118374	0 %	50 %	25 %	25 %	525931484
42534	NC_021839	CTC	2	6	2118406	2118411	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	525931484
42535	NC_021839	A	6	6	2118461	2118466	100 %	0 %	0 %	0 %	525931484
42536	NC_021839	CTTT	2	8	2118504	2118511	0 %	75 %	0 %	25 %	525931484
42537	NC_021839	TAA	2	6	2118564	2118569	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	525931484
42538	NC_021839	TTC	2	6	2118586	2118591	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	525931484
42539	NC_021839	CTT	2	6	2118651	2118656	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	525931484
42540	NC_021839	ATTT	2	8	2118669	2118676	25 %	75 %	0 %	0 %	525931484
42541	NC_021839	T	7	7	2118867	2118873	0 %	100 %	0 %	0 %	525931484
42542	NC_021839	TGT	2	6	2119032	2119037	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	525931484
42543	NC_021839	TGA	2	6	2119043	2119048	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525931484
42544	NC_021839	TTC	2	6	2119066	2119071	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	525931484
42545	NC_021839	TCT	3	9	2119163	2119171	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	525931484
42546	NC_021839	TAA	2	6	2119201	2119206	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	525931484
42547	NC_021839	TTG	2	6	2119342	2119347	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	525931484
42548	NC_021839	AAG	2	6	2119353	2119358	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	525931484
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42550	NC_021839	T	6	6	2119410	2119415	0 %	100 %	0 %	0 %	525931484
42551	NC_021839	AAT	2	6	2119463	2119468	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	525931484
42552	NC_021839	ATT	2	6	2119487	2119492	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	525931484
42553	NC_021839	AT	3	6	2119494	2119499	50 %	50 %	0 %	0 %	525931484
42554	NC_021839	TAG	2	6	2119533	2119538	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525931484
42555	NC_021839	TCT	2	6	2119553	2119558	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	525931484
42556	NC_021839	CTT	3	9	2119566	2119574	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	525931484
42557	NC_021839	TAAA	2	8	2119587	2119594	75 %	25 %	0 %	0 %	525931484
42558	NC_021839	TAA	2	6	2119680	2119685	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	525931484
42559	NC_021839	ACCC	2	8	2119725	2119732	25 %	0 %	0 %	75 %	525931484
42560	NC_021839	ACTAAA	2	12	2119762	2119773	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	525931484
42561	NC_021839	ATGT	2	8	2119862	2119869	25 %	50 %	25 %	0 %	525931484
42562	NC_021839	GTT	2	6	2119916	2119921	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	525931484
42563	NC_021839	ATT	2	6	2119946	2119951	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	525931484
42564	NC_021839	CAC	2	6	2119968	2119973	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	525931484
42565	NC_021839	T	6	6	2120150	2120155	0 %	100 %	0 %	0 %	525932404
42566	NC_021839	TAT	2	6	2120186	2120191	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	525932404
42567	NC_021839	GTT	2	6	2120219	2120224	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	525932404
42568	NC_021839	TC	3	6	2120232	2120237	0 %	50 %	0 %	50 %	525932404
42569	NC_021839	TCA	2	6	2120315	2120320	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525932404
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42571	NC_021839	CA	3	6	2120644	2120649	50 %	0 %	0 %	50 %	525932405
42572	NC_021839	ATT	2	6	2120653	2120658	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	525932405
42573	NC_021839	A	7	7	2120664	2120670	100 %	0 %	0 %	0 %	525932405
42574	NC_021839	GAA	2	6	2120792	2120797	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	525932405
42575	NC_021839	A	7	7	2120807	2120813	100 %	0 %	0 %	0 %	525932405
42576	NC_021839	TA	3	6	2120848	2120853	50 %	50 %	0 %	0 %	525932405
42577	NC_021839	GAA	2	6	2120854	2120859	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	525932405
42578	NC_021839	ATT	2	6	2120878	2120883	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	525932406
42579	NC_021839	TGT	2	6	2120897	2120902	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	525932406
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42581	NC_021839	T	6	6	2120942	2120947	0 %	100 %	0 %	0 %	525932406
42582	NC_021839	TC	3	6	2121017	2121022	0 %	50 %	0 %	50 %	525932406
42583	NC_021839	TAA	2	6	2121089	2121094	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	525932407
42584	NC_021839	ATT	2	6	2121115	2121120	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	525932407
42585	NC_021839	T	6	6	2121153	2121158	0 %	100 %	0 %	0 %	525932407
42586	NC_021839	TGA	2	6	2121199	2121204	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525932407
42587	NC_021839	ATC	2	6	2121282	2121287	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525932407
42588	NC_021839	GGT	2	6	2121543	2121548	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	525932408
42589	NC_021839	ATT	2	6	2121554	2121559	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	525932408
42590	NC_021839	TCT	2	6	2121625	2121630	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	525932408
42591	NC_021839	ATT	2	6	2121656	2121661	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	525932408
42592	NC_021839	CAA	2	6	2121694	2121699	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	525932408
42593	NC_021839	T	6	6	2121787	2121792	0 %	100 %	0 %	0 %	525932408
42594	NC_021839	CATA	2	8	2121829	2121836	50 %	25 %	0 %	25 %	525932408
42595	NC_021839	T	6	6	2121848	2121853	0 %	100 %	0 %	0 %	525932408
42596	NC_021839	TGATT	2	10	2121886	2121895	20 %	60 %	20 %	0 %	525932408
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42598	NC_021839	AGA	2	6	2121947	2121952	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	525932408
42599	NC_021839	TTCT	2	8	2121955	2121962	0 %	75 %	0 %	25 %	525932408
42600	NC_021839	TG	3	6	2122034	2122039	0 %	50 %	50 %	0 %	525932408
42601	NC_021839	GGAA	2	8	2122053	2122060	50 %	0 %	50 %	0 %	525932408
42602	NC_021839	TCTAT	2	10	2122113	2122122	20 %	60 %	0 %	20 %	525932408
42603	NC_021839	CAT	2	6	2122184	2122189	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525932408
42604	NC_021839	AT	3	6	2122194	2122199	50 %	50 %	0 %	0 %	525932408
42605	NC_021839	TCA	3	9	2122212	2122220	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525932408
42606	NC_021839	ACT	2	6	2122290	2122295	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525932408
42607	NC_021839	CT	3	6	2122310	2122315	0 %	50 %	0 %	50 %	525932408
42608	NC_021839	GAA	2	6	2122339	2122344	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	525932408
42609	NC_021839	TAATT	2	10	2122350	2122359	40 %	60 %	0 %	0 %	525932408
42610	NC_021839	ATAA	2	8	2122391	2122398	75 %	25 %	0 %	0 %	525932409
42611	NC_021839	TAA	2	6	2122451	2122456	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	525932409
42612	NC_021839	T	7	7	2122458	2122464	0 %	100 %	0 %	0 %	525932409
42613	NC_021839	TCA	2	6	2122483	2122488	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525932409
42614	NC_021839	TTATT	2	10	2122559	2122568	20 %	80 %	0 %	0 %	525932409
42615	NC_021839	A	7	7	2122599	2122605	100 %	0 %	0 %	0 %	525932409
42616	NC_021839	TTC	2	6	2122612	2122617	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	525932409
42617	NC_021839	CTA	2	6	2122619	2122624	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525932409
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42619	NC_021839	TTA	2	6	2122652	2122657	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	525932409
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42716	NC_021839	AT	3	6	2126311	2126316	50 %	50 %	0 %	0 %	525932414
42717	NC_021839	TTTCAG	2	12	2126337	2126348	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	525932414
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42719	NC_021839	TG	3	6	2126470	2126475	0 %	50 %	50 %	0 %	525932415
42720	NC_021839	GCGAA	2	10	2126528	2126537	40 %	0 %	40 %	20 %	525932415
42721	NC_021839	AAC	2	6	2126540	2126545	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	525932415
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42724	NC_021839	TTTG	2	8	2126692	2126699	0 %	75 %	25 %	0 %	525932415
42725	NC_021839	AATATA	2	12	2126712	2126723	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	525932415
42726	NC_021839	AGT	2	6	2126763	2126768	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525932415
42727	NC_021839	AGA	2	6	2126802	2126807	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	525932415
42728	NC_021839	AT	3	6	2126812	2126817	50 %	50 %	0 %	0 %	525932415
42729	NC_021839	TCA	2	6	2126854	2126859	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525932415
42730	NC_021839	T	7	7	2126953	2126959	0 %	100 %	0 %	0 %	525932415
42731	NC_021839	ATC	2	6	2126976	2126981	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525932415
42732	NC_021839	AT	3	6	2127046	2127051	50 %	50 %	0 %	0 %	525932415
42733	NC_021839	TCA	2	6	2127092	2127097	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525932415
42734	NC_021839	ATCTA	2	10	2127135	2127144	40 %	40 %	0 %	20 %	525932415
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42854	NC_021839	ATC	2	6	2132679	2132684	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525932418
42855	NC_021839	TGC	2	6	2132699	2132704	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525932418
42856	NC_021839	TGT	3	9	2132733	2132741	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	525932418
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42882	NC_021839	TCT	2	6	2134485	2134490	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	525932420
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