MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Listeria monocytogenes strain J1776

Total Repeats: 58948

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
31501	NC_021839	TAA	2	6	1560426	1560431	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	525932364
31502	NC_021839	TTA	2	6	1560704	1560709	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	525930997
31503	NC_021839	TCA	2	6	1560744	1560749	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525930997
31504	NC_021839	TCC	2	6	1560792	1560797	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	525930997
31505	NC_021839	GCA	2	6	1560816	1560821	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525930997
31506	NC_021839	CTT	2	6	1560838	1560843	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	525930997
31507	NC_021839	A	6	6	1560886	1560891	100 %	0 %	0 %	0 %	525930997
31508	NC_021839	CAT	2	6	1560893	1560898	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525930997
31509	NC_021839	T	6	6	1560905	1560910	0 %	100 %	0 %	0 %	525930997
31510	NC_021839	T	7	7	1560919	1560925	0 %	100 %	0 %	0 %	525930997
31511	NC_021839	CAC	2	6	1560949	1560954	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	525930997
31512	NC_021839	ATTA	2	8	1560998	1561005	50 %	50 %	0 %	0 %	525930997
31513	NC_021839	AC	3	6	1561024	1561029	50 %	0 %	0 %	50 %	525930997
31514	NC_021839	ACA	2	6	1561095	1561100	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	525930997
31515	NC_021839	TAA	2	6	1561106	1561111	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	525930997
31516	NC_021839	AAC	2	6	1561132	1561137	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	525930997
31517	NC_021839	A	6	6	1561141	1561146	100 %	0 %	0 %	0 %	525930997
31518	NC_021839	ATT	2	6	1561215	1561220	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	525930997
31519	NC_021839	AAC	2	6	1561454	1561459	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	525930998
31520	NC_021839	CCG	2	6	1561580	1561585	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	525930998
31521	NC_021839	CAA	2	6	1561615	1561620	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	525930998
31522	NC_021839	A	6	6	1561682	1561687	100 %	0 %	0 %	0 %	525930998
31523	NC_021839	TTAT	2	8	1561699	1561706	25 %	75 %	0 %	0 %	525930998
31524	NC_021839	ACA	2	6	1561769	1561774	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	525930998
31525	NC_021839	A	6	6	1561774	1561779	100 %	0 %	0 %	0 %	525930998
31526	NC_021839	GAA	2	6	1561785	1561790	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	525930998
31527	NC_021839	AAG	3	9	1561870	1561878	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	525930998
31528	NC_021839	A	7	7	1561912	1561918	100 %	0 %	0 %	0 %	525930998
31529	NC_021839	T	7	7	1561939	1561945	0 %	100 %	0 %	0 %	525930999
31530	NC_021839	CAC	2	6	1561963	1561968	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	525930999
31531	NC_021839	TAA	2	6	1562007	1562012	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	525930999
31532	NC_021839	TGATTT	2	12	1562129	1562140	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	525930999
31533	NC_021839	GCT	2	6	1562149	1562154	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525930999
31534	NC_021839	ACGT	2	8	1562178	1562185	25 %	25 %	25 %	25 %	525930999
31535	NC_021839	GTT	2	6	1562207	1562212	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	525930999
31536	NC_021839	T	6	6	1562256	1562261	0 %	100 %	0 %	0 %	525930999
31537	NC_021839	CAT	2	6	1562271	1562276	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525930999
31538	NC_021839	TTC	2	6	1562331	1562336	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	525930999
31539	NC_021839	TGT	2	6	1562442	1562447	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	525930999
31540	NC_021839	TGT	2	6	1562869	1562874	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	525931000
31541	NC_021839	T	6	6	1562902	1562907	0 %	100 %	0 %	0 %	525931000
31542	NC_021839	GCC	2	6	1562917	1562922	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	525931000
31543	NC_021839	TAC	2	6	1562977	1562982	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525931000
31544	NC_021839	T	7	7	1562983	1562989	0 %	100 %	0 %	0 %	525931000
31545	NC_021839	GTG	2	6	1563039	1563044	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	525931000
31546	NC_021839	AGT	2	6	1563124	1563129	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525931000
31547	NC_021839	T	6	6	1563214	1563219	0 %	100 %	0 %	0 %	525931000
31548	NC_021839	TCT	2	6	1563272	1563277	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	525931000
31549	NC_021839	TTG	2	6	1563304	1563309	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	525931000
31550	NC_021839	AGTT	2	8	1563478	1563485	25 %	50 %	25 %	0 %	525931000
31551	NC_021839	GTT	2	6	1563489	1563494	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	525931000
31552	NC_021839	TCT	2	6	1563515	1563520	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	525931000
31553	NC_021839	TGT	2	6	1563541	1563546	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	525931000
31554	NC_021839	ATA	2	6	1563593	1563598	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	525931000
31555	NC_021839	TGTT	2	8	1563619	1563626	0 %	75 %	25 %	0 %	525931000
31556	NC_021839	CAT	2	6	1563627	1563632	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525931000
31557	NC_021839	T	6	6	1563669	1563674	0 %	100 %	0 %	0 %	525931000
31558	NC_021839	ATGGC	2	10	1563728	1563737	20 %	20 %	40 %	20 %	525931000
31559	NC_021839	T	6	6	1563741	1563746	0 %	100 %	0 %	0 %	525931000
31560	NC_021839	CTG	2	6	1563756	1563761	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525931000
31561	NC_021839	TTC	2	6	1563880	1563885	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	525931000
31562	NC_021839	TAT	2	6	1564045	1564050	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	525931000
31563	NC_021839	T	6	6	1564172	1564177	0 %	100 %	0 %	0 %	525931000
31564	NC_021839	TAA	2	6	1564223	1564228	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	525931001
31565	NC_021839	CTT	3	9	1564262	1564270	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	525931001
31566	NC_021839	ATAA	2	8	1564314	1564321	75 %	25 %	0 %	0 %	525931001
31567	NC_021839	GATA	2	8	1564331	1564338	50 %	25 %	25 %	0 %	525931001
31568	NC_021839	TCT	2	6	1564390	1564395	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	525931001
31569	NC_021839	CAT	2	6	1564433	1564438	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525931001
31570	NC_021839	ATT	2	6	1564473	1564478	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	525931001
31571	NC_021839	TGT	2	6	1564482	1564487	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	525931001
31572	NC_021839	TCT	2	6	1564489	1564494	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	525931001
31573	NC_021839	T	6	6	1564508	1564513	0 %	100 %	0 %	0 %	525931001
31574	NC_021839	CAC	2	6	1564532	1564537	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	525931001
31575	NC_021839	T	6	6	1564560	1564565	0 %	100 %	0 %	0 %	525931001
31576	NC_021839	GTT	3	9	1564573	1564581	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	525931001
31577	NC_021839	TTC	2	6	1564621	1564626	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	525931001
31578	NC_021839	GAA	2	6	1564675	1564680	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	525931001
31579	NC_021839	TTC	2	6	1564698	1564703	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	525931001
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31582	NC_021839	TGC	2	6	1564758	1564763	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525931001
31583	NC_021839	GATA	2	8	1564767	1564774	50 %	25 %	25 %	0 %	525931001
31584	NC_021839	ATA	2	6	1564777	1564782	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	525931001
31585	NC_021839	GTT	2	6	1564809	1564814	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	525931001
31586	NC_021839	TTA	2	6	1564825	1564830	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	525931001
31587	NC_021839	TACT	2	8	1564850	1564857	25 %	50 %	0 %	25 %	525931001
31588	NC_021839	TTC	2	6	1564869	1564874	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	525931001
31589	NC_021839	A	7	7	1564894	1564900	100 %	0 %	0 %	0 %	525931001
31590	NC_021839	ATT	2	6	1564930	1564935	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	525931001
31591	NC_021839	ATC	2	6	1564936	1564941	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525931001
31592	NC_021839	TGT	2	6	1565188	1565193	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	525931002
31593	NC_021839	CCA	2	6	1565224	1565229	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	525931002
31594	NC_021839	TTAA	2	8	1565245	1565252	50 %	50 %	0 %	0 %	525931002
31595	NC_021839	ATCTT	2	10	1565254	1565263	20 %	60 %	0 %	20 %	525931002
31596	NC_021839	ATAA	2	8	1565295	1565302	75 %	25 %	0 %	0 %	525931002
31597	NC_021839	T	6	6	1565373	1565378	0 %	100 %	0 %	0 %	525931002
31598	NC_021839	ATA	2	6	1565383	1565388	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	525931002
31599	NC_021839	CGT	2	6	1565402	1565407	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525931002
31600	NC_021839	T	6	6	1565429	1565434	0 %	100 %	0 %	0 %	525931002
31601	NC_021839	CCA	2	6	1565440	1565445	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	525931002
31602	NC_021839	TACTTT	2	12	1565511	1565522	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	525931002
31603	NC_021839	ATA	2	6	1565562	1565567	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	525931002
31604	NC_021839	TAA	2	6	1565648	1565653	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	525931002
31605	NC_021839	GCT	2	6	1565701	1565706	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525931002
31606	NC_021839	TAA	2	6	1565825	1565830	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	525931002
31607	NC_021839	GCT	2	6	1565857	1565862	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525931002
31608	NC_021839	ATCGA	2	10	1565871	1565880	40 %	20 %	20 %	20 %	525931002
31609	NC_021839	CTT	2	6	1565891	1565896	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	525931002
31610	NC_021839	GCA	2	6	1565899	1565904	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525931002
31611	NC_021839	CAT	2	6	1565912	1565917	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525931002
31612	NC_021839	GTT	2	6	1565929	1565934	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	525931002
31613	NC_021839	TGCT	2	8	1565958	1565965	0 %	50 %	25 %	25 %	525931002
31614	NC_021839	TGA	2	6	1565999	1566004	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525931002
31615	NC_021839	TCT	2	6	1566215	1566220	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	525931003
31616	NC_021839	TAA	2	6	1566223	1566228	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	525931003
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31618	NC_021839	TGG	2	6	1566241	1566246	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	525931003
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