MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Listeria monocytogenes strain J1776

Total Repeats: 58948

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
31001	NC_021839	TTGA	2	8	1537916	1537923	25 %	50 %	25 %	0 %	525930979
31002	NC_021839	GAA	2	6	1538382	1538387	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	525930980
31003	NC_021839	TTAGT	2	10	1538423	1538432	20 %	60 %	20 %	0 %	525930980
31004	NC_021839	GTG	2	6	1538444	1538449	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	525930980
31005	NC_021839	GAT	2	6	1538458	1538463	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525930980
31006	NC_021839	TGA	2	6	1538508	1538513	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525930980
31007	NC_021839	TTAC	2	8	1538611	1538618	25 %	50 %	0 %	25 %	525930980
31008	NC_021839	ACT	2	6	1538662	1538667	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525930980
31009	NC_021839	ACT	2	6	1538697	1538702	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525930980
31010	NC_021839	A	6	6	1538723	1538728	100 %	0 %	0 %	0 %	525930980
31011	NC_021839	ACT	2	6	1538773	1538778	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525930980
31012	NC_021839	TAT	2	6	1538828	1538833	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	525930980
31013	NC_021839	TACCG	2	10	1538836	1538845	20 %	20 %	20 %	40 %	525930980
31014	NC_021839	A	6	6	1538854	1538859	100 %	0 %	0 %	0 %	525930980
31015	NC_021839	A	6	6	1539043	1539048	100 %	0 %	0 %	0 %	525930980
31016	NC_021839	GTTA	2	8	1539064	1539071	25 %	50 %	25 %	0 %	525930980
31017	NC_021839	CGG	2	6	1539141	1539146	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	525930980
31018	NC_021839	A	6	6	1539250	1539255	100 %	0 %	0 %	0 %	525930980
31019	NC_021839	TGG	2	6	1539276	1539281	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	525930980
31020	NC_021839	AAGA	2	8	1539313	1539320	75 %	0 %	25 %	0 %	525930980
31021	NC_021839	GAT	2	6	1539421	1539426	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525930980
31022	NC_021839	TAC	2	6	1539445	1539450	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525930980
31023	NC_021839	GTG	3	9	1539554	1539562	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	525930980
31024	NC_021839	CTT	2	6	1539610	1539615	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	525930980
31025	NC_021839	A	6	6	1539616	1539621	100 %	0 %	0 %	0 %	525930980
31026	NC_021839	TAAA	2	8	1539698	1539705	75 %	25 %	0 %	0 %	525930981
31027	NC_021839	CTT	2	6	1539745	1539750	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	525930981
31028	NC_021839	TGCT	2	8	1539773	1539780	0 %	50 %	25 %	25 %	525930981
31029	NC_021839	TTG	2	6	1539842	1539847	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	525930981
31030	NC_021839	ATT	2	6	1539922	1539927	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	525930981
31031	NC_021839	TGA	2	6	1539968	1539973	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525930981
31032	NC_021839	TCT	2	6	1540016	1540021	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	525930981
31033	NC_021839	GTT	2	6	1540042	1540047	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	525930981
31034	NC_021839	TA	3	6	1540073	1540078	50 %	50 %	0 %	0 %	525930981
31035	NC_021839	CTA	2	6	1540151	1540156	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525930981
31036	NC_021839	ATT	2	6	1540213	1540218	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	525930981
31037	NC_021839	AGC	2	6	1540260	1540265	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525930981
31038	NC_021839	GCC	2	6	1540286	1540291	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	525930981
31039	NC_021839	ATT	2	6	1540296	1540301	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	525930981
31040	NC_021839	GAT	2	6	1540356	1540361	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525930981
31041	NC_021839	TGGT	2	8	1540362	1540369	0 %	50 %	50 %	0 %	525930981
31042	NC_021839	TTC	2	6	1540375	1540380	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	525930981
31043	NC_021839	GAG	2	6	1540381	1540386	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	525930981
31044	NC_021839	CGTT	2	8	1540388	1540395	0 %	50 %	25 %	25 %	525930981
31045	NC_021839	TATC	2	8	1540443	1540450	25 %	50 %	0 %	25 %	525930981
31046	NC_021839	GCT	2	6	1540486	1540491	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525930981
31047	NC_021839	ATT	3	9	1540516	1540524	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	525930981
31048	NC_021839	ATT	2	6	1540531	1540536	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	525930981
31049	NC_021839	ATG	2	6	1540562	1540567	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525930981
31050	NC_021839	AG	3	6	1540578	1540583	50 %	0 %	50 %	0 %	525930981
31051	NC_021839	CG	3	6	1540618	1540623	0 %	0 %	50 %	50 %	525930982
31052	NC_021839	TC	3	6	1540697	1540702	0 %	50 %	0 %	50 %	525930982
31053	NC_021839	CTA	2	6	1540741	1540746	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525930982
31054	NC_021839	A	6	6	1540817	1540822	100 %	0 %	0 %	0 %	525930982
31055	NC_021839	TTC	2	6	1540839	1540844	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	525930982
31056	NC_021839	TAAATT	2	12	1540892	1540903	50 %	50 %	0 %	0 %	525930982
31057	NC_021839	ATG	2	6	1540944	1540949	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525930982
31058	NC_021839	TGC	2	6	1540984	1540989	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525930982
31059	NC_021839	TTG	2	6	1541041	1541046	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	525930982
31060	NC_021839	CCA	2	6	1541083	1541088	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	525930982
31061	NC_021839	GAT	2	6	1541094	1541099	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525930982
31062	NC_021839	AGC	2	6	1541108	1541113	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525930982
31063	NC_021839	ACG	2	6	1541251	1541256	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525930982
31064	NC_021839	ATT	2	6	1541288	1541293	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	525930982
31065	NC_021839	GCA	2	6	1541308	1541313	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525930982
31066	NC_021839	AAT	2	6	1541422	1541427	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	525930982
31067	NC_021839	GCT	2	6	1541517	1541522	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525930983
31068	NC_021839	AGC	2	6	1541621	1541626	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525930983
31069	NC_021839	GTT	2	6	1541682	1541687	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	525930983
31070	NC_021839	TTTC	2	8	1541760	1541767	0 %	75 %	0 %	25 %	525930983
31071	NC_021839	TCT	2	6	1541778	1541783	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	525930983
31072	NC_021839	AAG	2	6	1541833	1541838	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	525930983
31073	NC_021839	TAA	2	6	1541845	1541850	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	525930983
31074	NC_021839	CTT	2	6	1541887	1541892	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	525930983
31075	NC_021839	CA	3	6	1542023	1542028	50 %	0 %	0 %	50 %	525930983
31076	NC_021839	CCA	2	6	1542045	1542050	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	525930983
31077	NC_021839	CAC	2	6	1542059	1542064	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	525930983
31078	NC_021839	CCG	2	6	1542096	1542101	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	525930983
31079	NC_021839	CG	3	6	1542187	1542192	0 %	0 %	50 %	50 %	525930983
31080	NC_021839	CTG	2	6	1542265	1542270	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525930983
31081	NC_021839	CTT	2	6	1542295	1542300	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	525930983
31082	NC_021839	TTCT	2	8	1542332	1542339	0 %	75 %	0 %	25 %	525930983
31083	NC_021839	TAA	2	6	1542368	1542373	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	525930983
31084	NC_021839	CCA	2	6	1542375	1542380	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	525930983
31085	NC_021839	T	6	6	1542391	1542396	0 %	100 %	0 %	0 %	525930983
31086	NC_021839	TTTA	2	8	1542422	1542429	25 %	75 %	0 %	0 %	525930983
31087	NC_021839	T	6	6	1542494	1542499	0 %	100 %	0 %	0 %	525930983
31088	NC_021839	AGG	2	6	1542500	1542505	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	525930983
31089	NC_021839	CTT	2	6	1542523	1542528	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	525930983
31090	NC_021839	AAT	2	6	1542542	1542547	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	525930983
31091	NC_021839	CAG	2	6	1542574	1542579	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525930983
31092	NC_021839	ATT	2	6	1542650	1542655	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	525930983
31093	NC_021839	AGT	2	6	1542666	1542671	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525930983
31094	NC_021839	AATTA	2	10	1542722	1542731	60 %	40 %	0 %	0 %	525930983
31095	NC_021839	CTACA	2	10	1542772	1542781	40 %	20 %	0 %	40 %	525930983
31096	NC_021839	TCA	2	6	1543019	1543024	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525930984
31097	NC_021839	CGT	2	6	1543048	1543053	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525930984
31098	NC_021839	CAT	2	6	1543066	1543071	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525930984
31099	NC_021839	AAAAT	2	10	1543094	1543103	80 %	20 %	0 %	0 %	525930984
31100	NC_021839	GTT	2	6	1543170	1543175	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	525930984
31101	NC_021839	TGAT	2	8	1543241	1543248	25 %	50 %	25 %	0 %	525930984
31102	NC_021839	GTC	2	6	1543256	1543261	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525930984
31103	NC_021839	TTGT	2	8	1543271	1543278	0 %	75 %	25 %	0 %	525930984
31104	NC_021839	CCA	2	6	1543295	1543300	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	525930984
31105	NC_021839	AAC	2	6	1543339	1543344	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	525930984
31106	NC_021839	AT	3	6	1543361	1543366	50 %	50 %	0 %	0 %	525930984
31107	NC_021839	CAC	2	6	1543407	1543412	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	525930984
31108	NC_021839	ACC	2	6	1543462	1543467	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	525930984
31109	NC_021839	CAAT	2	8	1543545	1543552	50 %	25 %	0 %	25 %	525930984
31110	NC_021839	CCA	2	6	1543556	1543561	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	525930984
31111	NC_021839	CAA	2	6	1543656	1543661	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	525930984
31112	NC_021839	T	6	6	1543705	1543710	0 %	100 %	0 %	0 %	525930984
31113	NC_021839	TAA	2	6	1543713	1543718	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	525930984
31114	NC_021839	CG	3	6	1543741	1543746	0 %	0 %	50 %	50 %	525930984
31115	NC_021839	TTG	2	6	1543858	1543863	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	525930984
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31473	NC_021839	ATA	2	6	1559376	1559381	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	525930996
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