MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Listeria monocytogenes strain J1776

Total Repeats: 58948

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
24501	NC_021839	T	6	6	1217391	1217396	0 %	100 %	0 %	0 %	525930706
24502	NC_021839	T	6	6	1217398	1217403	0 %	100 %	0 %	0 %	525930706
24503	NC_021839	ATT	3	9	1217546	1217554	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	525930707
24504	NC_021839	TAA	2	6	1217591	1217596	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	525930707
24505	NC_021839	AT	3	6	1217614	1217619	50 %	50 %	0 %	0 %	525930707
24506	NC_021839	GAC	2	6	1217624	1217629	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525930707
24507	NC_021839	GTA	2	6	1217646	1217651	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525930707
24508	NC_021839	CAT	2	6	1217744	1217749	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525930707
24509	NC_021839	ACT	2	6	1217752	1217757	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525930707
24510	NC_021839	CCAG	2	8	1217766	1217773	25 %	0 %	25 %	50 %	525930707
24511	NC_021839	TGC	2	6	1217784	1217789	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525930707
24512	NC_021839	AGC	2	6	1217790	1217795	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525930707
24513	NC_021839	TGC	2	6	1217847	1217852	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525930707
24514	NC_021839	GCC	2	6	1217874	1217879	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	525930707
24515	NC_021839	AAT	2	6	1217905	1217910	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	525930707
24516	NC_021839	CTA	2	6	1217984	1217989	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525930707
24517	NC_021839	TTC	2	6	1217991	1217996	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	525930707
24518	NC_021839	TTGC	2	8	1218004	1218011	0 %	50 %	25 %	25 %	525930707
24519	NC_021839	CAT	2	6	1218119	1218124	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525930707
24520	NC_021839	GAAT	2	8	1218458	1218465	50 %	25 %	25 %	0 %	525930708
24521	NC_021839	ATT	2	6	1218553	1218558	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	525930708
24522	NC_021839	TTCC	2	8	1218577	1218584	0 %	50 %	0 %	50 %	525930708
24523	NC_021839	ACA	2	6	1218607	1218612	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	525930708
24524	NC_021839	A	6	6	1218612	1218617	100 %	0 %	0 %	0 %	525930708
24525	NC_021839	GAA	2	6	1218634	1218639	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	525930708
24526	NC_021839	ATTT	2	8	1218748	1218755	25 %	75 %	0 %	0 %	525930708
24527	NC_021839	GAT	2	6	1218781	1218786	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525930708
24528	NC_021839	CTT	2	6	1218803	1218808	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	525930708
24529	NC_021839	TTTC	2	8	1218826	1218833	0 %	75 %	0 %	25 %	525930708
24530	NC_021839	GTTA	2	8	1218874	1218881	25 %	50 %	25 %	0 %	525930708
24531	NC_021839	CAG	2	6	1218887	1218892	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525930708
24532	NC_021839	TA	3	6	1218923	1218928	50 %	50 %	0 %	0 %	525930708
24533	NC_021839	TCT	2	6	1219004	1219009	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	525930708
24534	NC_021839	GAT	2	6	1219089	1219094	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525930708
24535	NC_021839	CTT	2	6	1219097	1219102	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	525930708
24536	NC_021839	GCA	2	6	1219117	1219122	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525930708
24537	NC_021839	ATT	2	6	1219153	1219158	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	525930708
24538	NC_021839	TGGAA	2	10	1219167	1219176	40 %	20 %	40 %	0 %	525930708
24539	NC_021839	TCC	2	6	1219227	1219232	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	525930708
24540	NC_021839	AAAT	2	8	1219255	1219262	75 %	25 %	0 %	0 %	525930708
24541	NC_021839	TGAA	2	8	1219373	1219380	50 %	25 %	25 %	0 %	525932347
24542	NC_021839	A	6	6	1219394	1219399	100 %	0 %	0 %	0 %	525932347
24543	NC_021839	TGG	2	6	1219431	1219436	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	525932347
24544	NC_021839	ACT	2	6	1219465	1219470	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525932347
24545	NC_021839	ATG	2	6	1219481	1219486	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525932347
24546	NC_021839	AGA	2	6	1219518	1219523	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	525932347
24547	NC_021839	TGA	2	6	1219557	1219562	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525932347
24548	NC_021839	TGC	2	6	1219734	1219739	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525932347
24549	NC_021839	A	6	6	1219746	1219751	100 %	0 %	0 %	0 %	525932347
24550	NC_021839	AGAAA	2	10	1219788	1219797	80 %	0 %	20 %	0 %	525932347
24551	NC_021839	ATT	2	6	1219798	1219803	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	525932347
24552	NC_021839	CTG	2	6	1219823	1219828	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525932347
24553	NC_021839	AGATTT	2	12	1219872	1219883	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	525932347
24554	NC_021839	GGA	2	6	1220011	1220016	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	525932347
24555	NC_021839	TGC	2	6	1220025	1220030	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525932347
24556	NC_021839	GCC	2	6	1220155	1220160	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	525932347
24557	NC_021839	GATT	2	8	1220196	1220203	25 %	50 %	25 %	0 %	525932347
24558	NC_021839	CTT	2	6	1220347	1220352	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	525932347
24559	NC_021839	ATC	2	6	1220368	1220373	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525932347
24560	NC_021839	AGA	2	6	1220400	1220405	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	525932347
24561	NC_021839	AAGA	2	8	1220410	1220417	75 %	0 %	25 %	0 %	525932347
24562	NC_021839	AGA	2	6	1220433	1220438	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	525932347
24563	NC_021839	GAAAA	2	10	1220446	1220455	80 %	0 %	20 %	0 %	525932347
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24565	NC_021839	ATG	2	6	1220542	1220547	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525932348
24566	NC_021839	GCCT	2	8	1220556	1220563	0 %	25 %	25 %	50 %	525932348
24567	NC_021839	AGT	2	6	1220606	1220611	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525932348
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24569	NC_021839	TAT	2	6	1220687	1220692	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	525932348
24570	NC_021839	TTA	2	6	1220703	1220708	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	525932348
24571	NC_021839	TAC	2	6	1220738	1220743	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525932348
24572	NC_021839	T	6	6	1220744	1220749	0 %	100 %	0 %	0 %	525932348
24573	NC_021839	AATT	2	8	1220750	1220757	50 %	50 %	0 %	0 %	525932348
24574	NC_021839	T	6	6	1220765	1220770	0 %	100 %	0 %	0 %	525932348
24575	NC_021839	CTC	2	6	1220788	1220793	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	525932348
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24580	NC_021839	AGT	2	6	1221056	1221061	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525932348
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24582	NC_021839	TGA	2	6	1221142	1221147	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525932348
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24586	NC_021839	GTTC	2	8	1221370	1221377	0 %	50 %	25 %	25 %	525930709
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24588	NC_021839	ATT	2	6	1221494	1221499	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	525930709
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24595	NC_021839	AT	3	6	1221771	1221776	50 %	50 %	0 %	0 %	525930710
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24597	NC_021839	GTAG	2	8	1221854	1221861	25 %	25 %	50 %	0 %	525930710
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24600	NC_021839	CCA	2	6	1221960	1221965	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	525930710
24601	NC_021839	T	6	6	1222026	1222031	0 %	100 %	0 %	0 %	525930710
24602	NC_021839	TTTC	2	8	1222045	1222052	0 %	75 %	0 %	25 %	525930710
24603	NC_021839	CTA	2	6	1222069	1222074	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525930710
24604	NC_021839	GTA	2	6	1222112	1222117	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525930710
24605	NC_021839	GCTT	2	8	1222126	1222133	0 %	50 %	25 %	25 %	525930710
24606	NC_021839	AAG	2	6	1222201	1222206	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	525930710
24607	NC_021839	ATT	2	6	1222217	1222222	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	525930710
24608	NC_021839	TTC	2	6	1222259	1222264	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	525930710
24609	NC_021839	CTT	2	6	1222288	1222293	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	525930710
24610	NC_021839	TCT	2	6	1222314	1222319	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	525930710
24611	NC_021839	T	7	7	1222324	1222330	0 %	100 %	0 %	0 %	525930710
24612	NC_021839	GTT	2	6	1222339	1222344	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	525930710
24613	NC_021839	TG	3	6	1222395	1222400	0 %	50 %	50 %	0 %	525930710
24614	NC_021839	AAC	2	6	1222421	1222426	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	525930710
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24617	NC_021839	ATC	2	6	1222479	1222484	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525930710
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24968	NC_021839	AAT	2	6	1238568	1238573	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	525930724
24969	NC_021839	TTGT	2	8	1238592	1238599	0 %	75 %	25 %	0 %	525930724
24970	NC_021839	ATC	2	6	1238892	1238897	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525930725
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24972	NC_021839	GTA	2	6	1238982	1238987	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525930725
24973	NC_021839	TCTA	2	8	1239048	1239055	25 %	50 %	0 %	25 %	525930725
24974	NC_021839	GCA	2	6	1239077	1239082	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525930725
24975	NC_021839	TAC	2	6	1239155	1239160	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525930725
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24977	NC_021839	TGT	2	6	1239183	1239188	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	525930725
24978	NC_021839	CAC	2	6	1239191	1239196	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	525930725
24979	NC_021839	TTG	2	6	1239215	1239220	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	525930725
24980	NC_021839	TTTCA	2	10	1239246	1239255	20 %	60 %	0 %	20 %	525930725
24981	NC_021839	TGAG	2	8	1239262	1239269	25 %	25 %	50 %	0 %	525930725
24982	NC_021839	TTC	2	6	1239348	1239353	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	525930725
24983	NC_021839	AGA	2	6	1239420	1239425	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	525930725
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24986	NC_021839	T	8	8	1239536	1239543	0 %	100 %	0 %	0 %	525930725
24987	NC_021839	CCA	2	6	1239554	1239559	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	525930725
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24989	NC_021839	TTAT	2	8	1239823	1239830	25 %	75 %	0 %	0 %	525930726
24990	NC_021839	GTT	2	6	1239847	1239852	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	525930726
24991	NC_021839	ATT	2	6	1239859	1239864	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	525930726
24992	NC_021839	GGGC	2	8	1239890	1239897	0 %	0 %	75 %	25 %	525930726
24993	NC_021839	ATT	2	6	1239898	1239903	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	525930726
24994	NC_021839	AGC	2	6	1239942	1239947	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525930726
24995	NC_021839	AAC	2	6	1239960	1239965	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	525930726
24996	NC_021839	ATT	2	6	1239972	1239977	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	525930726
24997	NC_021839	AGA	2	6	1240050	1240055	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	525930726
24998	NC_021839	ATG	2	6	1240058	1240063	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525930726
24999	NC_021839	GAC	2	6	1240075	1240080	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525930726
25000	NC_021839	GAAG	2	8	1240164	1240171	50 %	0 %	50 %	0 %	525930726

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