MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Listeria monocytogenes strain J1776

Total Repeats: 58948

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
11501	NC_021839	TAA	2	6	581866	581871	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	525930141
11502	NC_021839	A	6	6	581889	581894	100 %	0 %	0 %	0 %	525930141
11503	NC_021839	A	6	6	581919	581924	100 %	0 %	0 %	0 %	525930141
11504	NC_021839	GAA	2	6	581973	581978	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	525930141
11505	NC_021839	ATT	2	6	581991	581996	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	525930141
11506	NC_021839	AAC	2	6	582010	582015	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	525930141
11507	NC_021839	ATTA	2	8	582047	582054	50 %	50 %	0 %	0 %	525930141
11508	NC_021839	A	6	6	582129	582134	100 %	0 %	0 %	0 %	525930141
11509	NC_021839	ATT	2	6	582174	582179	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	525930141
11510	NC_021839	GA	3	6	582209	582214	50 %	0 %	50 %	0 %	525930141
11511	NC_021839	ATG	2	6	582265	582270	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525930141
11512	NC_021839	T	6	6	582272	582277	0 %	100 %	0 %	0 %	525930141
11513	NC_021839	T	8	8	582338	582345	0 %	100 %	0 %	0 %	525932269
11514	NC_021839	TTCT	2	8	582382	582389	0 %	75 %	0 %	25 %	525932269
11515	NC_021839	ATTG	2	8	582462	582469	25 %	50 %	25 %	0 %	525932269
11516	NC_021839	GAA	2	6	582479	582484	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	525932269
11517	NC_021839	AAG	2	6	582485	582490	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	525932269
11518	NC_021839	AT	3	6	582526	582531	50 %	50 %	0 %	0 %	525932269
11519	NC_021839	T	6	6	582564	582569	0 %	100 %	0 %	0 %	525932269
11520	NC_021839	AGT	2	6	582615	582620	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525932269
11521	NC_021839	A	6	6	582645	582650	100 %	0 %	0 %	0 %	525932269
11522	NC_021839	TA	4	8	582653	582660	50 %	50 %	0 %	0 %	525932269
11523	NC_021839	A	6	6	582663	582668	100 %	0 %	0 %	0 %	525932269
11524	NC_021839	TAA	2	6	582695	582700	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	525932269
11525	NC_021839	A	7	7	582699	582705	100 %	0 %	0 %	0 %	525932269
11526	NC_021839	ACAA	2	8	582732	582739	75 %	0 %	0 %	25 %	525932269
11527	NC_021839	A	6	6	582747	582752	100 %	0 %	0 %	0 %	525932269
11528	NC_021839	ATATT	2	10	582766	582775	40 %	60 %	0 %	0 %	525932269
11529	NC_021839	AAAG	2	8	582777	582784	75 %	0 %	25 %	0 %	525932269
11530	NC_021839	ATTG	2	8	582836	582843	25 %	50 %	25 %	0 %	525932270
11531	NC_021839	TTC	2	6	582858	582863	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	525932270
11532	NC_021839	TTTA	2	8	582948	582955	25 %	75 %	0 %	0 %	525932270
11533	NC_021839	AATT	2	8	583005	583012	50 %	50 %	0 %	0 %	525932270
11534	NC_021839	CTT	2	6	583073	583078	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	525932270
11535	NC_021839	ATT	2	6	583189	583194	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	525932270
11536	NC_021839	TAA	2	6	583202	583207	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	525932270
11537	NC_021839	AAG	2	6	583230	583235	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	525932270
11538	NC_021839	TATTGA	2	12	583247	583258	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	525932270
11539	NC_021839	T	6	6	583275	583280	0 %	100 %	0 %	0 %	525932270
11540	NC_021839	A	6	6	583513	583518	100 %	0 %	0 %	0 %	525930142
11541	NC_021839	AAG	2	6	583545	583550	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	525930142
11542	NC_021839	CGAA	2	8	583558	583565	50 %	0 %	25 %	25 %	525930142
11543	NC_021839	AT	3	6	583582	583587	50 %	50 %	0 %	0 %	525930142
11544	NC_021839	TGA	2	6	583678	583683	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525930142
11545	NC_021839	AGA	2	6	583684	583689	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	525930142
11546	NC_021839	CTTT	2	8	583728	583735	0 %	75 %	0 %	25 %	525930142
11547	NC_021839	GAA	2	6	583742	583747	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	525930142
11548	NC_021839	TGC	2	6	583899	583904	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525930142
11549	NC_021839	A	6	6	583928	583933	100 %	0 %	0 %	0 %	525930142
11550	NC_021839	ATTT	2	8	583943	583950	25 %	75 %	0 %	0 %	525930142
11551	NC_021839	CGC	2	6	583954	583959	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	525930142
11552	NC_021839	TAAT	2	8	583974	583981	50 %	50 %	0 %	0 %	525930142
11553	NC_021839	TAG	2	6	584010	584015	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525930142
11554	NC_021839	ATT	2	6	584063	584068	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	525930143
11555	NC_021839	AACAA	2	10	584083	584092	80 %	0 %	0 %	20 %	525930143
11556	NC_021839	CCA	2	6	584105	584110	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	525930143
11557	NC_021839	TACTT	2	10	584155	584164	20 %	60 %	0 %	20 %	525930143
11558	NC_021839	A	7	7	584374	584380	100 %	0 %	0 %	0 %	525930143
11559	NC_021839	AAG	2	6	584403	584408	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	525930143
11560	NC_021839	A	6	6	584439	584444	100 %	0 %	0 %	0 %	525930143
11561	NC_021839	TGG	2	6	584464	584469	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	525930143
11562	NC_021839	TGA	2	6	584530	584535	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525930143
11563	NC_021839	TACG	2	8	584562	584569	25 %	25 %	25 %	25 %	525930143
11564	NC_021839	AAG	3	9	584640	584648	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	525930143
11565	NC_021839	TGA	2	6	584662	584667	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525930143
11566	NC_021839	TAAA	2	8	584679	584686	75 %	25 %	0 %	0 %	525930143
11567	NC_021839	CAA	2	6	584696	584701	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	525930143
11568	NC_021839	ACG	2	6	584724	584729	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525930143
11569	NC_021839	TAA	2	6	584737	584742	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	525930143
11570	NC_021839	AGT	2	6	584872	584877	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525930143
11571	NC_021839	TCCG	2	8	584880	584887	0 %	25 %	25 %	50 %	525930143
11572	NC_021839	GTG	2	6	584955	584960	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	525930143
11573	NC_021839	AATG	2	8	584996	585003	50 %	25 %	25 %	0 %	525930143
11574	NC_021839	CA	3	6	585011	585016	50 %	0 %	0 %	50 %	525930143
11575	NC_021839	GGA	2	6	585097	585102	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	525930143
11576	NC_021839	TGA	2	6	585143	585148	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525930143
11577	NC_021839	TTA	2	6	585220	585225	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	525930144
11578	NC_021839	TAT	2	6	585232	585237	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	525930144
11579	NC_021839	T	7	7	585240	585246	0 %	100 %	0 %	0 %	525930144
11580	NC_021839	T	6	6	585286	585291	0 %	100 %	0 %	0 %	525930144
11581	NC_021839	GTTC	2	8	585320	585327	0 %	50 %	25 %	25 %	525930144
11582	NC_021839	GTT	2	6	585357	585362	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	525930144
11583	NC_021839	CTTA	2	8	585380	585387	25 %	50 %	0 %	25 %	525930144
11584	NC_021839	TTA	2	6	585425	585430	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	525930144
11585	NC_021839	TGC	2	6	585452	585457	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525930144
11586	NC_021839	GCG	2	6	585499	585504	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	525930144
11587	NC_021839	AATTGG	2	12	585522	585533	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525930144
11588	NC_021839	TTTA	2	8	585546	585553	25 %	75 %	0 %	0 %	525930144
11589	NC_021839	CG	3	6	585659	585664	0 %	0 %	50 %	50 %	525930144
11590	NC_021839	ACA	2	6	585685	585690	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	525930144
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11593	NC_021839	GAT	2	6	585897	585902	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525930144
11594	NC_021839	AAAAG	2	10	585929	585938	80 %	0 %	20 %	0 %	525930144
11595	NC_021839	GAA	2	6	585953	585958	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	525930144
11596	NC_021839	ATTT	2	8	585975	585982	25 %	75 %	0 %	0 %	525930145
11597	NC_021839	T	6	6	586027	586032	0 %	100 %	0 %	0 %	525930145
11598	NC_021839	TAA	2	6	586040	586045	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	525930145
11599	NC_021839	GGC	2	6	586047	586052	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	525930145
11600	NC_021839	TAT	2	6	586086	586091	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	525930145
11601	NC_021839	AAG	2	6	586093	586098	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	525930145
11602	NC_021839	CTA	2	6	586116	586121	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525930145
11603	NC_021839	ATT	2	6	586122	586127	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	525930145
11604	NC_021839	GCT	2	6	586151	586156	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525930145
11605	NC_021839	TTC	2	6	586157	586162	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	525930145
11606	NC_021839	TAT	2	6	586175	586180	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	525930145
11607	NC_021839	AAT	2	6	586251	586256	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	525930145
11608	NC_021839	TTA	2	6	586279	586284	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	525930145
11609	NC_021839	TTC	2	6	586305	586310	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	525930145
11610	NC_021839	TGA	2	6	586387	586392	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525930145
11611	NC_021839	GCG	2	6	586434	586439	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	525930145
11612	NC_021839	CG	3	6	586438	586443	0 %	0 %	50 %	50 %	525930145
11613	NC_021839	TTCT	2	8	586468	586475	0 %	75 %	0 %	25 %	525930145
11614	NC_021839	TAT	2	6	586493	586498	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	525930145
11615	NC_021839	GAT	2	6	586545	586550	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525930145
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11617	NC_021839	TTA	2	6	586694	586699	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	525930145
11618	NC_021839	CAAC	2	8	586706	586713	50 %	0 %	0 %	50 %	525930145
11619	NC_021839	CGA	2	6	586744	586749	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525930145
11620	NC_021839	CTG	2	6	586763	586768	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525930146
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11989	NC_021839	AG	3	6	604965	604970	50 %	0 %	50 %	0 %	525930158
11990	NC_021839	AAC	2	6	604984	604989	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	525930158
11991	NC_021839	TGA	2	6	605038	605043	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525930158
11992	NC_021839	GC	3	6	605125	605130	0 %	0 %	50 %	50 %	525930158
11993	NC_021839	TA	3	6	605142	605147	50 %	50 %	0 %	0 %	525930158
11994	NC_021839	ACA	2	6	605301	605306	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	525930158
11995	NC_021839	GTA	2	6	605309	605314	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525930158
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