MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Listeria monocytogenes strain J1776

Total Repeats: 58948

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
501	NC_021839	T	6	6	28468	28473	0 %	100 %	0 %	0 %	525932162
502	NC_021839	ATG	2	6	28507	28512	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525932162
503	NC_021839	CGA	2	6	28520	28525	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525932162
504	NC_021839	TAT	2	6	28569	28574	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	525932162
505	NC_021839	TGGA	2	8	28609	28616	25 %	25 %	50 %	0 %	525932162
506	NC_021839	AAC	2	6	28698	28703	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	525932162
507	NC_021839	GGCT	2	8	28731	28738	0 %	25 %	50 %	25 %	525932162
508	NC_021839	ATTG	2	8	28743	28750	25 %	50 %	25 %	0 %	525932162
509	NC_021839	TTTA	2	8	28771	28778	25 %	75 %	0 %	0 %	525932162
510	NC_021839	GTG	2	6	28811	28816	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	525932162
511	NC_021839	TGG	2	6	28869	28874	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	525929699
512	NC_021839	GAT	2	6	29031	29036	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525929699
513	NC_021839	GGT	2	6	29037	29042	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	525929699
514	NC_021839	AATT	2	8	29104	29111	50 %	50 %	0 %	0 %	525929699
515	NC_021839	TGG	2	6	29152	29157	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	525929699
516	NC_021839	TGA	2	6	29171	29176	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525929699
517	NC_021839	ATT	2	6	29227	29232	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	525929699
518	NC_021839	TAA	2	6	29267	29272	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	525929699
519	NC_021839	A	6	6	29352	29357	100 %	0 %	0 %	0 %	525929699
520	NC_021839	AATG	2	8	29394	29401	50 %	25 %	25 %	0 %	525929699
521	NC_021839	TGG	2	6	29418	29423	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	525929699
522	NC_021839	GAA	2	6	29471	29476	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	525929699
523	NC_021839	A	6	6	29598	29603	100 %	0 %	0 %	0 %	525929699
524	NC_021839	GAA	2	6	29640	29645	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	525929699
525	NC_021839	AAT	2	6	29780	29785	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	525929699
526	NC_021839	G	6	6	29818	29823	0 %	0 %	100 %	0 %	525929699
527	NC_021839	ATAA	2	8	29859	29866	75 %	25 %	0 %	0 %	525929699
528	NC_021839	GAT	2	6	29889	29894	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525929699
529	NC_021839	A	7	7	29901	29907	100 %	0 %	0 %	0 %	525929699
530	NC_021839	TTAT	2	8	29919	29926	25 %	75 %	0 %	0 %	525929699
531	NC_021839	GAT	2	6	30000	30005	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525929699
532	NC_021839	TC	3	6	30047	30052	0 %	50 %	0 %	50 %	525929699
533	NC_021839	GAA	2	6	30066	30071	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	525929699
534	NC_021839	GTA	2	6	30094	30099	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525929699
535	NC_021839	AAT	2	6	30129	30134	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	525929699
536	NC_021839	GAT	2	6	30225	30230	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525929699
537	NC_021839	AAG	2	6	30269	30274	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	525929699
538	NC_021839	AAG	2	6	30292	30297	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	525929699
539	NC_021839	TGA	2	6	30335	30340	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525929699
540	NC_021839	ATC	2	6	30384	30389	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525929699
541	NC_021839	TTCTGA	2	12	30398	30409	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	525929699
542	NC_021839	TCT	2	6	30514	30519	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	525929699
543	NC_021839	GAA	2	6	30603	30608	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	525932163
544	NC_021839	TCCA	2	8	30674	30681	25 %	25 %	0 %	50 %	525932163
545	NC_021839	ACA	2	6	30714	30719	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	525932163
546	NC_021839	AAT	2	6	30746	30751	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	525932163
547	NC_021839	TAT	2	6	30771	30776	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	525932163
548	NC_021839	CTT	2	6	30821	30826	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	525932163
549	NC_021839	A	6	6	30837	30842	100 %	0 %	0 %	0 %	525932163
550	NC_021839	TTTC	2	8	30890	30897	0 %	75 %	0 %	25 %	525932163
551	NC_021839	ATTTA	2	10	30928	30937	40 %	60 %	0 %	0 %	525932163
552	NC_021839	AAG	2	6	30964	30969	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	525932163
553	NC_021839	GAA	2	6	31017	31022	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	525932163
554	NC_021839	A	6	6	31079	31084	100 %	0 %	0 %	0 %	525932163
555	NC_021839	GTT	2	6	31099	31104	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	525932163
556	NC_021839	A	6	6	31140	31145	100 %	0 %	0 %	0 %	525932163
557	NC_021839	T	7	7	31160	31166	0 %	100 %	0 %	0 %	525932163
558	NC_021839	ATATG	2	10	31220	31229	40 %	40 %	20 %	0 %	525932163
559	NC_021839	ATT	2	6	31232	31237	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	525932163
560	NC_021839	ATT	2	6	31255	31260	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	525932163
561	NC_021839	ATT	2	6	31288	31293	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	525932163
562	NC_021839	TA	3	6	31336	31341	50 %	50 %	0 %	0 %	525932163
563	NC_021839	TAC	2	6	31397	31402	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525932163
564	NC_021839	ATG	2	6	31414	31419	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525932163
565	NC_021839	TTA	2	6	31446	31451	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	525932163
566	NC_021839	CAG	2	6	31477	31482	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525932163
567	NC_021839	AT	3	6	31515	31520	50 %	50 %	0 %	0 %	525932163
568	NC_021839	ATA	2	6	31534	31539	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	525932163
569	NC_021839	TAT	2	6	31569	31574	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	525932163
570	NC_021839	TTG	2	6	31605	31610	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	525932163
571	NC_021839	TAT	2	6	31653	31658	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	525932163
572	NC_021839	AGA	2	6	31697	31702	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	525932163
573	NC_021839	AAG	2	6	31708	31713	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	525932163
574	NC_021839	TAC	2	6	31734	31739	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525932163
575	NC_021839	GTT	2	6	31776	31781	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	525932163
576	NC_021839	ATTTG	2	10	31826	31835	20 %	60 %	20 %	0 %	525932163
577	NC_021839	GAAG	2	8	31836	31843	50 %	0 %	50 %	0 %	525932163
578	NC_021839	TTA	2	6	31879	31884	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	525932163
579	NC_021839	ACAAA	2	10	31894	31903	80 %	0 %	0 %	20 %	525932163
580	NC_021839	TTTAA	2	10	31976	31985	40 %	60 %	0 %	0 %	525932163
581	NC_021839	TAT	3	9	32061	32069	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	525932164
582	NC_021839	T	7	7	32094	32100	0 %	100 %	0 %	0 %	525932164
583	NC_021839	TAT	2	6	32106	32111	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	525932164
584	NC_021839	AGA	2	6	32164	32169	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	525932164
585	NC_021839	ATT	2	6	32241	32246	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	525932164
586	NC_021839	CTTT	2	8	32277	32284	0 %	75 %	0 %	25 %	525932164
587	NC_021839	ATG	2	6	32561	32566	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525929700
588	NC_021839	CTT	2	6	32654	32659	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	525929700
589	NC_021839	AGA	2	6	32784	32789	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	525929700
590	NC_021839	CAA	2	6	32847	32852	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	525929700
591	NC_021839	AAG	2	6	32876	32881	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	525929700
592	NC_021839	ATT	2	6	32926	32931	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	525929700
593	NC_021839	GTTC	2	8	32965	32972	0 %	50 %	25 %	25 %	525929700
594	NC_021839	A	6	6	33013	33018	100 %	0 %	0 %	0 %	525929700
595	NC_021839	GCTTG	2	10	33052	33061	0 %	40 %	40 %	20 %	525929700
596	NC_021839	ATT	2	6	33169	33174	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	525929700
597	NC_021839	ACT	2	6	33194	33199	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525929700
598	NC_021839	AC	3	6	33206	33211	50 %	0 %	0 %	50 %	525929700
599	NC_021839	ACA	2	6	33221	33226	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	525929700
600	NC_021839	CAA	2	6	33375	33380	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	525929700
601	NC_021839	A	6	6	33379	33384	100 %	0 %	0 %	0 %	525929700
602	NC_021839	A	6	6	33393	33398	100 %	0 %	0 %	0 %	525929700
603	NC_021839	TCG	2	6	33483	33488	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525929700
604	NC_021839	ATT	2	6	33502	33507	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	525929700
605	NC_021839	ATG	2	6	33608	33613	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525929700
606	NC_021839	CAT	2	6	33630	33635	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525929700
607	NC_021839	GAA	2	6	33652	33657	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	525929700
608	NC_021839	ATT	2	6	33685	33690	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	525929700
609	NC_021839	CTT	2	6	33705	33710	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	525929700
610	NC_021839	TCG	2	6	33762	33767	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525929700
611	NC_021839	CAA	2	6	33880	33885	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	525929700
612	NC_021839	AGT	2	6	33903	33908	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525929700
613	NC_021839	CAAA	2	8	33961	33968	75 %	0 %	0 %	25 %	525929700
614	NC_021839	CGT	2	6	33994	33999	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525929700
615	NC_021839	TGG	2	6	34017	34022	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	525929700
616	NC_021839	ACGTG	2	10	34053	34062	20 %	20 %	40 %	20 %	525929700
617	NC_021839	TTC	2	6	34137	34142	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	525929700
618	NC_021839	TAAA	2	8	34154	34161	75 %	25 %	0 %	0 %	525929700
619	NC_021839	CCG	2	6	34185	34190	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	525929700
620	NC_021839	AAAC	2	8	34202	34209	75 %	0 %	0 %	25 %	525929700
621	NC_021839	GATT	2	8	34224	34231	25 %	50 %	25 %	0 %	525929700
622	NC_021839	GTA	2	6	34261	34266	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525929700
623	NC_021839	AGA	3	9	34308	34316	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	525929700
624	NC_021839	GAT	2	6	34438	34443	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525929700
625	NC_021839	TTG	2	6	34514	34519	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	525929700
626	NC_021839	TGC	2	6	34557	34562	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525929700
627	NC_021839	TCG	2	6	34620	34625	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525929700
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629	NC_021839	GTTC	2	8	34690	34697	0 %	50 %	25 %	25 %	525929700
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