MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Listeria monocytogenes J1-220

Total Repeats: 60479

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
32501	NC_021830	CAT	2	6	1611199	1611204	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525734139
32502	NC_021830	TCA	2	6	1611294	1611299	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525734139
32503	NC_021830	ATAA	2	8	1611300	1611307	75 %	25 %	0 %	0 %	525734139
32504	NC_021830	CTA	2	6	1611310	1611315	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525734139
32505	NC_021830	TCG	2	6	1611342	1611347	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525734139
32506	NC_021830	CTT	2	6	1611352	1611357	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	525734139
32507	NC_021830	CTT	2	6	1611388	1611393	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	525734139
32508	NC_021830	ACG	2	6	1611398	1611403	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525734139
32509	NC_021830	TTC	2	6	1611455	1611460	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	525734139
32510	NC_021830	TACG	2	8	1611475	1611482	25 %	25 %	25 %	25 %	525734139
32511	NC_021830	TTG	2	6	1611483	1611488	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	525734139
32512	NC_021830	TTC	2	6	1611527	1611532	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	525734139
32513	NC_021830	CTT	2	6	1611580	1611585	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	525734139
32514	NC_021830	CTT	2	6	1611652	1611657	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	525734139
32515	NC_021830	GTG	2	6	1611697	1611702	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	525734139
32516	NC_021830	TCT	3	9	1611765	1611773	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	525734139
32517	NC_021830	T	7	7	1611796	1611802	0 %	100 %	0 %	0 %	525734139
32518	NC_021830	TTTA	2	8	1611983	1611990	25 %	75 %	0 %	0 %	525734139
32519	NC_021830	TTGTAT	2	12	1612030	1612041	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	525734139
32520	NC_021830	AGA	2	6	1612070	1612075	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	525734139
32521	NC_021830	CCT	2	6	1612149	1612154	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	525734140
32522	NC_021830	TGT	2	6	1612180	1612185	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	525734140
32523	NC_021830	TTC	2	6	1612225	1612230	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	525734140
32524	NC_021830	AGT	2	6	1612233	1612238	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525734140
32525	NC_021830	TGT	2	6	1612390	1612395	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	525734140
32526	NC_021830	ATA	2	6	1612412	1612417	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	525734140
32527	NC_021830	CAT	2	6	1612419	1612424	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525734140
32528	NC_021830	TTAA	2	8	1612454	1612461	50 %	50 %	0 %	0 %	525734140
32529	NC_021830	TTG	2	6	1612471	1612476	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	525734140
32530	NC_021830	T	6	6	1612480	1612485	0 %	100 %	0 %	0 %	525734140
32531	NC_021830	GTA	2	6	1612486	1612491	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525734140
32532	NC_021830	TAA	2	6	1612499	1612504	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	525734140
32533	NC_021830	ATA	2	6	1612532	1612537	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	525734140
32534	NC_021830	TTC	2	6	1612588	1612593	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	525734140
32535	NC_021830	AGT	2	6	1612597	1612602	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525734140
32536	NC_021830	AACG	2	8	1612626	1612633	50 %	0 %	25 %	25 %	525734140
32537	NC_021830	AGA	2	6	1612654	1612659	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	525734140
32538	NC_021830	TAA	2	6	1612682	1612687	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	525734140
32539	NC_021830	TGGT	2	8	1612879	1612886	0 %	50 %	50 %	0 %	525734140
32540	NC_021830	TAA	2	6	1612930	1612935	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	525734140
32541	NC_021830	TCT	2	6	1612946	1612951	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	525734140
32542	NC_021830	T	6	6	1612955	1612960	0 %	100 %	0 %	0 %	525734140
32543	NC_021830	AGA	2	6	1612984	1612989	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	525734140
32544	NC_021830	GCT	2	6	1613060	1613065	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525734140
32545	NC_021830	CCA	2	6	1613081	1613086	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	525734140
32546	NC_021830	CTG	2	6	1613118	1613123	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525734140
32547	NC_021830	ACC	2	6	1613140	1613145	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	525734140
32548	NC_021830	GAA	2	6	1613147	1613152	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	525734140
32549	NC_021830	CCA	2	6	1613153	1613158	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	525734140
32550	NC_021830	T	6	6	1613273	1613278	0 %	100 %	0 %	0 %	525734140
32551	NC_021830	ACG	2	6	1613288	1613293	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525734140
32552	NC_021830	CAT	2	6	1613298	1613303	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525734140
32553	NC_021830	TGC	2	6	1613335	1613340	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525734140
32554	NC_021830	TGT	2	6	1613341	1613346	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	525734140
32555	NC_021830	T	6	6	1613354	1613359	0 %	100 %	0 %	0 %	525734140
32556	NC_021830	TGT	2	6	1613403	1613408	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	525734140
32557	NC_021830	TTC	2	6	1613434	1613439	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	525734140
32558	NC_021830	TGC	2	6	1613452	1613457	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525734140
32559	NC_021830	TTTA	2	8	1613461	1613468	25 %	75 %	0 %	0 %	525734140
32560	NC_021830	TAA	2	6	1613472	1613477	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	525734140
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32562	NC_021830	TATT	2	8	1613625	1613632	25 %	75 %	0 %	0 %	525734141
32563	NC_021830	TCA	2	6	1613671	1613676	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525734141
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32565	NC_021830	CTT	2	6	1613693	1613698	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	525734141
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32569	NC_021830	AT	3	6	1613909	1613914	50 %	50 %	0 %	0 %	525734141
32570	NC_021830	TGC	2	6	1614067	1614072	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525734142
32571	NC_021830	TGT	2	6	1614158	1614163	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	525734142
32572	NC_021830	ATA	2	6	1614301	1614306	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	525734142
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32574	NC_021830	T	7	7	1614392	1614398	0 %	100 %	0 %	0 %	525734142
32575	NC_021830	TTGT	2	8	1614487	1614494	0 %	75 %	25 %	0 %	525734142
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32583	NC_021830	AAT	2	6	1614717	1614722	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	525734142
32584	NC_021830	TAGA	2	8	1614742	1614749	50 %	25 %	25 %	0 %	525734142
32585	NC_021830	CTGG	2	8	1614779	1614786	0 %	25 %	50 %	25 %	525734142
32586	NC_021830	TCTA	2	8	1614817	1614824	25 %	50 %	0 %	25 %	525734142
32587	NC_021830	CTT	2	6	1614861	1614866	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	525734142
32588	NC_021830	TATT	2	8	1614890	1614897	25 %	75 %	0 %	0 %	525734142
32589	NC_021830	ATATC	2	10	1614935	1614944	40 %	40 %	0 %	20 %	525734142
32590	NC_021830	AATA	2	8	1614948	1614955	75 %	25 %	0 %	0 %	525734142
32591	NC_021830	TGCT	2	8	1614981	1614988	0 %	50 %	25 %	25 %	525734142
32592	NC_021830	GTA	2	6	1614996	1615001	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525734142
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32594	NC_021830	GATTT	2	10	1615024	1615033	20 %	60 %	20 %	0 %	525734142
32595	NC_021830	T	6	6	1615031	1615036	0 %	100 %	0 %	0 %	525734142
32596	NC_021830	ATG	2	6	1615040	1615045	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525734142
32597	NC_021830	ATC	2	6	1615063	1615068	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525734142
32598	NC_021830	AG	3	6	1615114	1615119	50 %	0 %	50 %	0 %	525734142
32599	NC_021830	GCT	2	6	1615139	1615144	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525734142
32600	NC_021830	T	7	7	1615152	1615158	0 %	100 %	0 %	0 %	525734142
32601	NC_021830	TCT	3	9	1615201	1615209	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	525734143
32602	NC_021830	TTC	2	6	1615230	1615235	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	525734143
32603	NC_021830	ACA	3	9	1615273	1615281	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	525734143
32604	NC_021830	TCC	2	6	1615314	1615319	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	525734143
32605	NC_021830	CAT	2	6	1615343	1615348	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525734143
32606	NC_021830	TTC	2	6	1615407	1615412	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	525734143
32607	NC_021830	TCT	2	6	1615423	1615428	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	525734143
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32609	NC_021830	TAA	2	6	1615479	1615484	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	525734143
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32611	NC_021830	T	6	6	1615532	1615537	0 %	100 %	0 %	0 %	525734143
32612	NC_021830	AATG	2	8	1615604	1615611	50 %	25 %	25 %	0 %	525734143
32613	NC_021830	GGC	2	6	1615623	1615628	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	525734143
32614	NC_021830	CTTG	2	8	1615690	1615697	0 %	50 %	25 %	25 %	525734143
32615	NC_021830	GATG	2	8	1615698	1615705	25 %	25 %	50 %	0 %	525734143
32616	NC_021830	TTCT	2	8	1615736	1615743	0 %	75 %	0 %	25 %	525734143
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32853	NC_021830	TGA	2	6	1627385	1627390	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525734153
32854	NC_021830	TCC	2	6	1627417	1627422	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	525734153
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32970	NC_021830	TTC	2	6	1633984	1633989	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	525734159
32971	NC_021830	ATT	2	6	1634047	1634052	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	525734159
32972	NC_021830	CAA	2	6	1634173	1634178	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	525734159
32973	NC_021830	GCT	2	6	1634183	1634188	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525734159
32974	NC_021830	CAT	2	6	1634205	1634210	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525734159
32975	NC_021830	CGT	2	6	1634232	1634237	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525734159
32976	NC_021830	CAG	2	6	1634262	1634267	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525734159
32977	NC_021830	ATCCT	2	10	1634372	1634381	20 %	40 %	0 %	40 %	525734159
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32980	NC_021830	AAT	2	6	1634533	1634538	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	525734159
32981	NC_021830	TCA	2	6	1634543	1634548	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525734159
32982	NC_021830	AGC	2	6	1634557	1634562	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525734159
32983	NC_021830	AAT	2	6	1634590	1634595	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	525734159
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32991	NC_021830	T	6	6	1634743	1634748	0 %	100 %	0 %	0 %	525734160
32992	NC_021830	CAC	2	6	1634818	1634823	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	525734160
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32998	NC_021830	T	6	6	1635119	1635124	0 %	100 %	0 %	0 %	525734160
32999	NC_021830	CAG	2	6	1635169	1635174	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525734160
33000	NC_021830	ACC	2	6	1635411	1635416	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	525734161

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