MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Listeria monocytogenes J1816

Total Repeats: 55189

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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41502	NC_021829	AAT	2	6	2216064	2216069	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	525723038
41503	NC_021829	TTA	2	6	2216091	2216096	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	525723038
41504	NC_021829	AGA	2	6	2216108	2216113	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	525723038
41505	NC_021829	TAAT	2	8	2216128	2216135	50 %	50 %	0 %	0 %	525723038
41506	NC_021829	ATG	2	6	2216184	2216189	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525723038
41507	NC_021829	AAC	2	6	2216191	2216196	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	525723038
41508	NC_021829	TGT	2	6	2216225	2216230	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	525723038
41509	NC_021829	AAC	2	6	2216300	2216305	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	525723038
41510	NC_021829	ACA	2	6	2216364	2216369	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	525723038
41511	NC_021829	A	6	6	2216392	2216397	100 %	0 %	0 %	0 %	525723038
41512	NC_021829	AAG	2	6	2216401	2216406	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	525723038
41513	NC_021829	AAC	2	6	2216441	2216446	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	525723038
41514	NC_021829	AGCG	2	8	2216477	2216484	25 %	0 %	50 %	25 %	525723038
41515	NC_021829	ATC	2	6	2216680	2216685	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525723039
41516	NC_021829	CTTC	2	8	2216729	2216736	0 %	50 %	0 %	50 %	525723039
41517	NC_021829	AGA	2	6	2216739	2216744	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	525723039
41518	NC_021829	TGT	2	6	2216766	2216771	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	525723039
41519	NC_021829	ATT	2	6	2217134	2217139	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	525723040
41520	NC_021829	CA	3	6	2217152	2217157	50 %	0 %	0 %	50 %	525723040
41521	NC_021829	GAAC	2	8	2217170	2217177	50 %	0 %	25 %	25 %	525723040
41522	NC_021829	CCG	2	6	2217179	2217184	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	525723040
41523	NC_021829	GC	3	6	2217305	2217310	0 %	0 %	50 %	50 %	525723040
41524	NC_021829	TTGT	2	8	2217316	2217323	0 %	75 %	25 %	0 %	525723040
41525	NC_021829	CTT	2	6	2217328	2217333	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	525723040
41526	NC_021829	TACG	2	8	2217369	2217376	25 %	25 %	25 %	25 %	525723040
41527	NC_021829	GAA	2	6	2217390	2217395	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	525723040
41528	NC_021829	GAA	2	6	2217406	2217411	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	525723040
41529	NC_021829	GC	3	6	2217454	2217459	0 %	0 %	50 %	50 %	525723040
41530	NC_021829	TTTA	2	8	2217460	2217467	25 %	75 %	0 %	0 %	525723040
41531	NC_021829	A	7	7	2217707	2217713	100 %	0 %	0 %	0 %	525723040
41532	NC_021829	AC	3	6	2217756	2217761	50 %	0 %	0 %	50 %	525723040
41533	NC_021829	TTA	2	6	2217793	2217798	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	525723041
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41537	NC_021829	T	6	6	2218056	2218061	0 %	100 %	0 %	0 %	525723041
41538	NC_021829	TAAT	2	8	2218127	2218134	50 %	50 %	0 %	0 %	525723041
41539	NC_021829	ATTT	2	8	2218166	2218173	25 %	75 %	0 %	0 %	525723041
41540	NC_021829	AG	3	6	2218192	2218197	50 %	0 %	50 %	0 %	525723041
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41545	NC_021829	ATT	2	6	2218329	2218334	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	525723041
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41551	NC_021829	GAA	2	6	2218567	2218572	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	525723041
41552	NC_021829	GAA	2	6	2218582	2218587	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	525723041
41553	NC_021829	TGAA	2	8	2218616	2218623	50 %	25 %	25 %	0 %	525723041
41554	NC_021829	AAC	2	6	2218682	2218687	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	525723041
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41558	NC_021829	A	6	6	2218867	2218872	100 %	0 %	0 %	0 %	525723041
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41569	NC_021829	GAT	2	6	2219281	2219286	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525723041
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41587	NC_021829	TAC	2	6	2220107	2220112	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525723041
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41598	NC_021829	A	7	7	2220557	2220563	100 %	0 %	0 %	0 %	525723041
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41601	NC_021829	CTTA	2	8	2220632	2220639	25 %	50 %	0 %	25 %	525723041
41602	NC_021829	GAA	2	6	2220658	2220663	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	525723041
41603	NC_021829	A	6	6	2220662	2220667	100 %	0 %	0 %	0 %	525723041
41604	NC_021829	TTA	2	6	2220712	2220717	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	525723041
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41614	NC_021829	A	6	6	2221030	2221035	100 %	0 %	0 %	0 %	525723041
41615	NC_021829	ATT	3	9	2221089	2221097	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	525723041
41616	NC_021829	GGC	2	6	2221149	2221154	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	525723041
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41618	NC_021829	CA	3	6	2221230	2221235	50 %	0 %	0 %	50 %	525723041
41619	NC_021829	GAA	2	6	2221252	2221257	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	525723041
41620	NC_021829	TAT	2	6	2221265	2221270	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	525723041
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41626	NC_021829	TACGC	2	10	2221585	2221594	20 %	20 %	20 %	40 %	525723042
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41734	NC_021829	TAC	2	6	2226344	2226349	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525724007
41735	NC_021829	GATGCG	3	18	2226462	2226479	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	525724007
41736	NC_021829	GCTGAT	2	12	2226489	2226500	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	525724007
41737	NC_021829	GATGCG	3	18	2226510	2226527	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	525724007
41738	NC_021829	GCCGAC	2	12	2226531	2226542	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	525724007
41739	NC_021829	GCTGAC	2	12	2226579	2226590	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	525724007
41740	NC_021829	GACGCC	2	12	2226618	2226629	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	525724007
41741	NC_021829	GCTGAT	3	18	2226645	2226662	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	525724007
41742	NC_021829	GCTGAC	2	12	2226663	2226674	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	525724007
41743	NC_021829	GATGCT	2	12	2226678	2226689	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	525724007
41744	NC_021829	GCTGAT	4	24	2226711	2226734	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	525724007
41745	NC_021829	GCTGAT	3	18	2226759	2226776	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	525724007
41746	NC_021829	GATGCT	3	18	2226900	2226917	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	525724007
41747	NC_021829	GCTGAT	3	18	2226993	2227010	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	525724007
41748	NC_021829	GCTGAT	3	18	2227023	2227040	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	525724007
41749	NC_021829	GATGCG	2	12	2227080	2227091	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	525724007
41750	NC_021829	GCTGAT	5	30	2227131	2227160	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	525724007
41751	NC_021829	GCTGAT	3	18	2227275	2227292	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	525724007
41752	NC_021829	GCGGAT	2	12	2227293	2227304	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	525724007
41753	NC_021829	GCCGAT	2	12	2227311	2227322	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	525724007
41754	NC_021829	GCCGAT	2	12	2227383	2227394	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	525724007
41755	NC_021829	GCGGAT	2	12	2227395	2227406	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	525724007
41756	NC_021829	GATGCG	2	12	2227416	2227427	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	525724007
41757	NC_021829	GATGCC	2	12	2227428	2227439	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	525724007
41758	NC_021829	GA	3	6	2227457	2227462	50 %	0 %	50 %	0 %	525724007
41759	NC_021829	AAC	2	6	2227592	2227597	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	525724007
41760	NC_021829	GATGCG	2	12	2227830	2227841	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	525724007
41761	NC_021829	TGG	2	6	2227856	2227861	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	525724007
41762	NC_021829	GGA	2	6	2227881	2227886	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	525724007
41763	NC_021829	ACT	2	6	2227887	2227892	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525724007
41764	NC_021829	GGA	2	6	2227905	2227910	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	525724007
41765	NC_021829	AAC	2	6	2227985	2227990	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	525724007
41766	NC_021829	CTTC	2	8	2228010	2228017	0 %	50 %	0 %	50 %	525724007
41767	NC_021829	AGT	2	6	2228034	2228039	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525724007
41768	NC_021829	TCT	2	6	2228062	2228067	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	525724007
41769	NC_021829	TAC	2	6	2228086	2228091	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525724007
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41772	NC_021829	GAA	2	6	2228245	2228250	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	525723046
41773	NC_021829	ATGGC	2	10	2228271	2228280	20 %	20 %	40 %	20 %	525723046
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41775	NC_021829	TGAAA	2	10	2228358	2228367	60 %	20 %	20 %	0 %	525723046
41776	NC_021829	A	7	7	2228365	2228371	100 %	0 %	0 %	0 %	525723046
41777	NC_021829	A	6	6	2228379	2228384	100 %	0 %	0 %	0 %	525723046
41778	NC_021829	A	6	6	2228461	2228466	100 %	0 %	0 %	0 %	525723046
41779	NC_021829	GAA	2	6	2228478	2228483	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	525723046
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41784	NC_021829	T	6	6	2228701	2228706	0 %	100 %	0 %	0 %	525723046
41785	NC_021829	GAAA	2	8	2228711	2228718	75 %	0 %	25 %	0 %	525723046
41786	NC_021829	ATT	2	6	2228816	2228821	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	525723046
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41788	NC_021829	A	7	7	2228881	2228887	100 %	0 %	0 %	0 %	525723046
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41791	NC_021829	T	6	6	2229039	2229044	0 %	100 %	0 %	0 %	525723046
41792	NC_021829	GCG	2	6	2229085	2229090	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	525723046
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41795	NC_021829	ATT	2	6	2229172	2229177	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	525723046
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41800	NC_021829	TGA	2	6	2229363	2229368	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525723046
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41802	NC_021829	TAC	2	6	2229442	2229447	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525723046
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41818	NC_021829	GTT	2	6	2230286	2230291	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	525723048
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